BGIOSGA025843

From RiceWiki
Revision as of 06:35, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA025843| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025843, complete gene.| tag = OsI_262...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA025843

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025843, complete gene.

LocusTag

OsI_26273

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA025843-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA025843-PA

Length

3919

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:18686028..18689946

Sequence Coding Region

18686028..18686206,18686282..18686344,18688441..18688557,18688772..18689027,18689223..18689366
,18689504..18689655,18689784..18689946

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:18686028..18689946 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:18686028..18689946 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGTAATGGCGGCATTAAGGCCTATGCGGCCATTGTTCTGATCAGGCTCATGTACTCTGGTATGCACGTCATGAGCAAGGTCGCCTTGGATCAAGGCATGAGCCCTTTCGTGTTTGTGTTCTATCGGCATGGCAGTGCTGCACTCGTGTTGATCCCCGCTGTTCTTATACTGGAGAGGCCAAAAGCTAAACAAGTGACGCTAAAAATTGCAGCAAAAATGTTTGTGCATGCCTTATATGGAGTGACAGCATGCGGTTTCTTGTTCAACGTTGGTCTGAATTATGCCTCAGCAACGTCATCATCGGCATTGTACAACGTTCAGCCAGTGGTTACATTCATCCTTGCTGTTGTATTTGGGATGGAGTCTATGAAGCTCAAGAAGCTCCATGGCAACGTAAAAGCGGCAGGCATTCTCTTCTGCGTGACCGGAGTCACCGTGCTGGCCTTCTACCAGGGGCCAATGCTGGGATCGTTCAACCATCACCACCTCTTTCAGCAAGCCAACAGCAGCGACGACCCTGAAGGGAACGCGCACTCCAAGACGCAGTGGGTGCTCGGGATTTTTCTCATGACACTCTCCAACGTTTTAGCTGGCTTATGGACAGTGCTTCTGGGGCCACTGATAGAAGAAACGTCCAAGCTGATGAACACAGCGTTACAGATCTCATGGGCCGCGGTCCAAGCCTTCGTTGTGGCTGTTGCAGTCGAGAGAGATTTCAACAAGTGGAAGCTAGGCTGGGATGTTGAACTCGCCACAGGTGTGGTCGTCACCGCACTTTCGTACTACATGCAAATGTGGACGATCACAAAGAGGGGGCCGGTGTTTCTTGCCATGTCAATGCCACTTACTTTTATATTCACAATCATCATATCCTCGTTCATTTTAGGGGATCCAACTAGCCTAGGGAGTATTTTTGCTGGGACTCTACTGATAGGAGGCCTCTATAATGTTCTGTGGGGGAAAAACATTGAGGAGCAGGATGAAGTGAACGACATAGTTGCAGATAAACCAGAATTTGAGATGCAGGGCAAAGAGGCTCAAATGCCTGGTGATGCTGGAACAAAGGTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGNGGIKAYAAIVLIRLMYSGMHVMSKVALDQGMSPFVFVFYRHGSAALVLIPAVLILERPKAKQVTLKIAAKMFVHALYGVTACGFLFNVGLNYASATSSSALYNVQPVVTFILAVVFGMESMKLKKLHGNVKAAGILFCVTGVTVLAFYQGPMLGSFNHHHLFQQANSSDDPEGNAHSKTQWVLGIFLMTLSNVLAGLWTVLLGPLIEETSKLMNTALQISWAAVQAFVVAVAVERDFNKWKLGWDVELATGVVVTALSYYMQMWTITKRGPVFLAMSMPLTFIFTIIISSFILGDPTSLGSIFAGTLLIGGLYNVLWGKNIEEQDEVNDIVADKPEFEMQGKEAQMPGDAGTKV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..179#255..317#2414..2530#2745..3000#3196..3339#3477..3628#3757..3919#ATGGGTAATGGCGGCATTAAGGCCTATGCGGCCATTGTTCTGATCAGGCTCATGTACTCTGGTATGCACGTCATGAGCAAGGTCGCCTTGGATCAAGGCATGAGCCCTTTCGTGTTTGTGTTCTATCGGCATGGCAGTGCTGCACTCGTGTTGATCCCCGCTGTTCTTATACTGGAGAGGTCAGCTTGTTAGCTATACCCCTCCCCCTTTTTTTTTTCTATTGAGCTTCACATTTTTATTTTTTATTTTTGCAGGCCAAAAGCTAAACAAGTGACGCTAAAAATTGCAGCAAAAATGTTTGTGCATGCCTTATATGGGTACGTATAGGTTTGTTCTAGCTAATATGAAGTCAATTATTCTTGTGGCTCTGCTTAGTCCATGGCTAGCTCATGCATGGCTTGTCCTTGCCATATGTTACAGTGTGTTTTCAGACACACTGCATAATTAATTTGTGTTACACATTTCGCCAACAAAATACTGTGTGCTCAGGAGAACACTGAAAAAACAGAGAACCTAAAGTTTCGCCATTCATAAATGATTGATTAGCCCCATTAAAATATGGCCTATGCGGTGCCCACAGAAATTTTCATGTTTTCCGAAAAGGAAAACCCTGTGGAACACTCGGAAACATTAAAAATAATATTTTGTCTCACAAAGTCACAATAATGCGGAATTTACATTTGCTAAACGAACACGCGCTACGAAAGTTATTTGGTCCACACCAAGATCCTTTCTAGCAACCACAATTTCTATGATTATTGTCCAGTGCAGTTTGCATGGGCTCTTTGCATTACATACTTTATTATATACTAGACTTGCTTTATATATTTAACGATATTAAACAATCTAAAAAACATAATTTGAAAGTTGTACATATGAAAATACCCTCTCCGTACTCGTAAAGAAAGTCGTTTTGGAAAGCGACACGGTCTCCAAAACACAACTTTTAACTTCTTGTTTCTATAAAAATATTTATTAAAATGTGATATATGTATACTTTTGTGAAAGTATTTTTCAAGACAAATCTATTCATATAATTTTTACATTTTTAAACTCAACAGTTTGAGAGTTATTTATGATTTATATTCCCAATGTTTGACTTAAACATTGTCCTAAACGACTTCCTTTATGAGTACGGAGGGAGTACATATTAAGTCCCCTCTAACAACCTTTTTTATCGTTTTCTCCTTAATTTAATAATTCCGAAATATAGCATTAATAAACCAAATCTGGTGCTATTTCTGTCCTCCATGAGCATAGCCAACAAAACCTATATTTAAGGGCGAAGATGGTACCAGCCGTAGAGCATTAATTAACTTTTGTTTTACGTAATTAAAGTTGAACTCGATTGAGTATCAATTATAGCTTTCATGATTTAGTAATTATGATATTTGAAATTAAAAGATAGTGATTCAAATCATACTATTACTACTACTATTGTTAGTTTTGTTGTTTTTGTTGTAGTAGTAGTACTAATACTACTACTACTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACTATTATTTGCTTTGACTCTGAATTTTAGTTCTTTCAATTAAATATTCCAGAATTCAGTTTTGGTTGGTTTGAAGTATAACATCTTGGATCTAAATTTAGATTCTTATTCATTTAATTGTGAAATTCTAAATTAATAATTAACCAGTTGTAATTGTTGTGTGGTCTTCTTTAGTCTTACCCATTATATTTCTTCTGACCTATCCCATAAAATTAACTTGTCTCACCTAGATGGAGGATCTAGTTTATTGACAGTTTGTCCAATTAATGTTGGATTTTTTTGGGGGAGTATTCAATTAGTATAGGTATGGATGATGGACTGATAGATGGAAAAATGTGTAGATAAGTCGGAACTCATCACTTGGCATTTCTGTTAATAATATGAGATCTTCCGTGCATATTTCTACTGCTATGCATTAAGCTGCTTCATGTCACAATTGCTTAGATAGCAAAGCAGAGAGTGTGCAACAAAAGCCTTTATATACTCCCTCTGTTCCATTTTAAGTGCAGTTGTGGATCTCCATTTCTAACATTTAACCGTCTATCTTATTTAAAAAATTTATGAAAAAATTAAAAAAATAAGTCACGCATAAAAGACTATTCATGTTTTATCATCTAATTAATAGTAATAAAAGTATTATTCATAAAAAATTTTAAATAAGATAAACGGTCAAATGTTGGATACAAAATTCATAACTGCACTTAAAATAGGATGGAGGGAGTACACTGTATGCAATTTGATTAACTGTTGAGGCTTTTTATTACCAATTAAGTTATGAAGATATTTAATATACACCTTGGCTCTAGACTGGTCTAATTCCTGATATTGTTTTTTTCTTTTAAATCTCAGAGTGACAGCATGCGGTTTCTTGTTCAACGTTGGTCTGAATTATGCCTCAGCAACGTCATCATCGGCATTGTACAACGTTCAGCCAGTGGTTACATTCATCCTTGCTGTTGTATTTGGGTAATGGATATGCAACTTTATCCCACGCAAAATCCAGACCTCCTTATCCTATATTCTATCATGATAGTTGCAATTTAAACTGACTTAGCGAACAGAAACTCGTTACTCAAAGTAATTGCAAAGGAAAGTGTTTTCAAAAACATACACTCATCTGTCAGAAGTTTTCGAAAACGTGCACTTCGTCAGAAGATTGAAGTTACACACCTTGTTACAGGATGGAGTCTATGAAGCTCAAGAAGCTCCATGGCAACGTAAAAGCGGCAGGCATTCTCTTCTGCGTGACCGGAGTCACCGTGCTGGCCTTCTACCAGGGGCCAATGCTGGGATCGTTCAACCATCACCACCTCTTTCAGCAAGCCAACAGCAGCGACGACCCTGAAGGGAACGCGCACTCCAAGACGCAGTGGGTGCTCGGGATTTTTCTCATGACACTCTCCAACGTTTTAGCTGGCTTATGGACAGTGCTTCTGGTATATATCAATCCAAACTTTCAGATTTCATGGCCACTAATTCAGAACTTGATTTTCATGGAGAATTTTTGTTTTTGCAAACTACACACAAAAGGCTTGCGCATCAACATATTAGACGAAAGCAATCAAGTTACAGCCGACCTCGTAAGGGCCTCAATGGAGAAATTTTTCTTAACATGATGTTGTGTTTTTCAGGGGCCACTGATAGAAGAAACGTCCAAGCTGATGAACACAGCGTTACAGATCTCATGGGCCGCGGTCCAAGCCTTCGTTGTGGCTGTTGCAGTCGAGAGAGATTTCAACAAGTGGAAGCTAGGCTGGGATGTTGAACTCGCCACAGTAATCTACAGTGTAATTTGAGCTAGCTCTCTCTGATGCAATGTTATCTTCGATTTCAAATATTGCAACTCAAATGATGCTCAAGCTGAATCCAAATATGCTTATCCATGAAACAAATAATTTTTTTTTTGTTGCAGGGTGTGGTCGTCACCGCACTTTCGTACTACATGCAAATGTGGACGATCACAAAGAGGGGGCCGGTGTTTCTTGCCATGTCAATGCCACTTACTTTTATATTCACAATCATCATATCCTCGTTCATTTTAGGGGATCCAACTAGCCTAGGGAGGTATGCTATGCACAAGGATATGATGAATTACTCACAGATTTGTAGTACACAGGACAATTCAGATTTTTCTCTGGTGCTTAATTATTATTATTTTTTTGCTGATGCTGTTAATGTAATTGATTGTGCAGTATTTTTGCTGGGACTCTACTGATAGGAGGCCTCTATAATGTTCTGTGGGGGAAAAACATTGAGGAGCAGGATGAAGTGAACGACATAGTTGCAGATAAACCAGAATTTGAGATGCAGGGCAAAGAGGCTCAAATGCCTGGTGATGCTGGAACAAAGGTGTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA025843