BGIOSGA027013
| Gene Name |
BGIOSGA027013 |
|---|---|
| Description |
Phospholipase D |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027013, complete gene. |
| LocusTag |
OS08G0401800 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027013-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027013-PA |
| Length |
10814 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:20354201..20365014 |
| Sequence Coding Region |
20364892..20365014,20360712..20360780,20358353..20360204,20354201..20354670 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:20354201..20365014 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:20354201..20365014 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCACAGCGGTTGCTGCACGGGGTGATGGAGGCCAAGGTCCTGGAGGCCAAGCTGTCGTCAGTGTCCTCAGAGGCATCAGATTATGGCCATGGGCAGCCCAAGCTGGCTGCCTATAGCAAGAGTCAGAAGCTGCCGAGGACAAAGCTCTTGTCACTAATCATGAAGCTGCCGTTCATCTTCACCTGCCAGAGGTTCGACAAGTCCACTGACCAAGCGCACCACGGCGACGGCAAGTGCCTCGTCTACGCCACCATTGGCATGGACGCGGCGCGCGTCGCCCGGACGCGCGCCACCGACCAGCCGCAGTGGACTGAGGAGCCGCTCCACGTCTACTGCGCGCACGACGCCAGCGACATCGTCTTCACCATCGTGACGACCGGCGGCCACCGCGACGGCGATCCTGAAGATGGCACCGCCGAGGAGGTCGTCGGCCAAGCCTACCTGCCCGCGGACGACGTCGGCGGCGGCAAGGAGATCGACCGGTGGCTCCCGCTCTGCGACGAGAAGAGGAAGCCACTCGAAGGCCTTGACAAGGTTCATGTCCAGCTCCGGTTCACCGACGTGATGTCCGACGTCACGTCGCGGTGGGGCAAGGGCGTCGATGGTCCCGTGCCGCCGCCGCCGTACACCGGGCTGCCCCGCGCTTTCTTCGGGCAGCACCGCGGATGCAAGGTGACCCTGTACCAGGACGCGCACGTCGCGCCGCCGCTCGCCGGCAGCAGGTGCTGGGAGGACGTGTTCGACGCCGTCGCCAACGCCCGGAGTCTGGTGTACATCGCCGGCTGGTCGGTGAGCACCGACGTCGCGCTGGTGCGCGACCCGAGGCGGCCCGCGCAGACGCTGGGGCACCTGCTCAAGTCGAAGGCCGGGGAGCGCGTCGCCGTGCTGCTTCTGGTGTGGGACGATCGGGCGGCCACCGGCCTCGGCGCGGCGCGGCGGGACGGGAGGATGGGCGCGGCGCGCGGCGAGGACACGGCGAGCTACTTCCGCGGCACGGGCGTGCACTGCGTCGTGTGCCCCCGGGACGCCGTGTTCACGCACCACCAGAAGGCGGTGGTCGCCGACGGCCCGCGCGGCCTCGTCGCGTTCCTCGGCGGCATTGACCTCTGCGGCGGAAGGTACGACACGCAGGAGCACCCGCTGTTCCGGACGCTCGCCACCGCGCACCGCGACGACTTCCGCCAGCCCAGCTTCCCCGGCGCGTCCGTCGCCAAGGGCGGGCCGAGGGAGCCGTGGCACGACGTGCACTGCCGCATCGAGGGCCCGGCGGCGTGGGACGTGCTCGACAACTTCGAGCAGAGGTGGCGGGGGCAGGGCGGCGCCGGCGGCGAGGCCCTCCTCGCCCGCCTCCCAAGGAGCTCCGCCGCTCGCGAGGCGGTGGAGCAGGACAACCAGGAGTGGCACGTGCAGGTGTTCCGGTCCATCGACAGCCGCGCGGTGGACCGGTTCCCGGACACCGCCGGCGAGGCCGCGCGGTGCGGCCTCGTCACCGGCGCCACCGGCGACACCGTGGAGCGCAGCATCCAGGACGGCTACATCCACGCCATCCGCCGCGCCAAGTACTTCATCTACATCGAGAGCCAGTGCTTCCTAGGGAGCTCCTACGGGTGGAACCGTGACGCCGCCGGCGGCGCCGCCACCGCCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGTGGCGCCGCACACCATCCCCAAGGAGCTGTCGCTGAAGCTCGCAAGCAAGATCAGGTCCGGGGACTCGTTCAGGGTGTACGTGGTGCTCCCGATGTGGCCTGAGGGCGTGCCGGAGAGCGCCACCGTGCAGGCCGTCCTGGACTGGCAGCGGCGGACCATGGAGATGATGTACAAGGACGTGGCGGCGGCGCTCGCCGCGAGGGGCTCGACGCAGAACCCCAGGGAGTACCTCAGCTTCTTCTGCTTGGGCAACCGGGAGCCGTACGTCCCCGGCGAGCACGCGCCGCCGGAGCGGCCGGAGCTCGACAGCGACTACATGAGGGCGCAGCAGGCCAGGCGCTTCAAGATCAACGTCAACGCCAACATCATGATAGTGGACGACGAGTACATCATCGTGGGGTCGGCGAACGTGAACCAGCGATCCATGGACGGCGGCAGGGACACGGAGATTGCGATGGGCGCGTACCAGCCGCGGCACCTGTATCAGGCCACGAATTCGTGGCCGTACGAGTACTGGCCGAGGGGGCAAGTGCACCAGTTCCGGCTCGCGCTGTGGCGGGAGCACCTCGGCCAGTCGGCGTTCCAGGCCGCCACCACCGGCGACAACGTCATCTACCCGTCCCGTGATGGGTGCATGAGCCGGGTGAACCAGGCCGCGCGGCAGCATTGGGACATGTACGCGAGCGACAAGTTCCAGGGGAGCCTCCCCGGCCACCTCATGGCGTACCCCGTCGGCGTCGGCGACCGCGGCGAGCTCTGGGAGGCCGTCCCTTTCTTCCCGGACACCAACGCCAAGGTGTTCGGCCGCAGCTCCGACGAGCTTCCACCGGTCCTCACCACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAQRLLHGVMEAKVLEAKLSSVSSEASDYGHGQPKLAAYSKSQKLPRTKLLSLIMKLPFIFTCQRFDKSTDQAHHGDGKCLVYATIGMDAARVARTRATDQPQWTEEPLHVYCAHDASDIVFTIVTTGGHRDGDPEDGTAEEVVGQAYLPADDVGGGKEIDRWLPLCDEKRKPLEGLDKVHVQLRFTDVMSDVTSRWGKGVDGPVPPPPYTGLPRAFFGQHRGCKVTLYQDAHVAPPLAGSRCWEDVFDAVANARSLVYIAGWSVSTDVALVRDPRRPAQTLGHLLKSKAGERVAVLLLVWDDRAATGLGAARRDGRMGAARGEDTASYFRGTGVHCVVCPRDAVFTHHQKAVVADGPRGLVAFLGGIDLCGGRYDTQEHPLFRTLATAHRDDFRQPSFPGASVAKGGPREPWHDVHCRIEGPAAWDVLDNFEQRWRGQGGAGGEALLARLPRSSAAREAVEQDNQEWHVQVFRSIDSRAVDRFPDTAGEAARCGLVTGATGDTVERSIQDGYIHAIRRAKYFIYIESQCFLGSSYGWNRDAAGGAATAKNAAAAAVAPHTIPKELSLKLASKIRSGDSFRVYVVLPMWPEGVPESATVQAVLDWQRRTMEMMYKDVAAALAARGSTQNPREYLSFFCLGNREPYVPGEHAPPERPELDSDYMRAQQARRFKINVNANIMIVDDEYIIVGSANVNQRSMDGGRDTEIAMGAYQPRHLYQATNSWPYEYWPRGQVHQFRLALWREHLGQSAFQAATTGDNVIYPSRDGCMSRVNQAARQHWDMYASDKFQGSLPGHLMAYPVGVGDRGELWEAVPFFPDTNAKVFGRSSDELPPVLTT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..123#4235..4303#4811..6662#10345..10814#ATGGCACAGCGGTTGCTGCACGGGGTGATGGAGGCCAAGGTCCTGGAGGCCAAGCTGTCGTCAGTGTCCTCAGAGGCATCAGATTATGGCCATGGGCAGCCCAAGCTGGCTGCCTATAGCAAGGTATACATATAAGATTCGGAGAGATCTGATAACTTGTCGCTGTTTGTTTGACATCCCGATCTACTTTCGTTCACTCAGATGATCTCACATACTATTCTAGCTCACAAGTATCAATTAAAGCAAATTGGCAACAGGAAATTGTCAAATTATCAAATTTTTCTAAGAGACATTGTTTCGCTTGGAGCTGACTGTAAGACGTAATTGCTTATTAAGGACCAATAAATAATTTATGAATAAAATTTAAATATATATGCATTCTTAGTGAATCAAAAGCTTATATAAAAATAACAAAATCAATTATAAAATTAAGATTCAAAATTTAAATTTTGGATATGGCTAATAAGCTCAACAGCAAATGAATAGCTTGTACGATGGCACTTATGTATAATAACAATTATAGCTAGCCAACGAAACTACATGCTAGACAATTTCACTGATGTGAAAGAGGGAGAATAGAGATAGGAGGGGATTGCTAAACATTTGCCTGCTAGACGAAGTACTCTCTCCGTCCTAAAATATAAGTGAGATAGGAGGGGATTGCTAAACATGCTCCCTGTCCTGATTCGTAGCACTTAAAAAAATGTCACATCCGTTCAAAATCCCTTATATTTGGGGACGGAGGGAGTATATTTCAAGAATTTAAGATTCTCAGAAATATTGTATTTTTAGAATATTAGGTGTCACATCAATCATCTCTTGTTTGAAATTATCTTCATTTTACCCCTAACTACCTCCCACATCCAATTCATTATTTAATGAAGAGCATATATGTCATTTTTCTTCCTAATACTTTACCTTCCAAGTGTTAGAAATGCACTTGTAACATAATAACAGATATAGTACTATATGAAACACAATTTTCGAGGGAAACCCAGTTTCAACAGAAAACATGTCTATCAATGTAGCTAAAAATAACCATAGAGCCCATTGAAATAAATAAAGTGTACTCTTATTGGTGACAGTAAGTGCATTTCCAGTGGATAGTTTTATTTTGTGGTTTCCAATAGTGCAACATAATCCATTGAGGCTTGTAATTATGAATAAAATTAAATATCTCCAATACACTGTTTCATTTCGTGGTTTCCAATGATTTAGTCACAATGGACTTTCATTCTATTTCCAAGACATAGTTAAGTGCGTAAGGTGGTGTTTGGATCCAAGGACTAAACTTTACTCCATGTCATATCGGATGAATTTGGAGTATTAAACATAGACTACTTATAAAACTAATTACATAAATGAGAGCTAATTCGCGTGACAAAATTTTTAAGCCTAATTAATCCATAATTAGCGCATGTTTACTGTAGCATCACATAGGCTAATCATGGATTAATTAGGCTCAATATATTCGTCTCGCGAATTAGTCCAGCATTATAGAATGGGTTTTATTAATAGTGTACATTTAATATTTATAATTAGTGTCCAAACATCTTATGTGATAGGGACTAAAAAGTTTTAGTCCCATCTAAACAGGGTCTAAACCAAGTTAGTTTTAGTCCCATCTAAACAGGGTCTAAACCAAGTTTCATCTAGATGAAACCCACTTCTTGTTTCTCTTCATAAATTTCTTGAGTTTAGTTTATATGGCATTGGCATCTCATTTAATAAGATTGAAAACTATTATGAAACTTGCACCGGGAATGGCCTAATATCCATTGAGCCAACTCTTGTGTGTTATTTTAGGAAGTGGACTCTCTTAATGAGATGGAAGACTTAAGGCTGACTTTGGAAGTGAGTTTGGAATATGATCTTTCAGGGTGCGCAAAATGTATCAAGCCATTAGTGTATAACTAATTGAGTATCTATTATATTATTAGAACAGGTTTGAAAAGAGGCAACGCGTTCTGCGTGGACGCTACAAACTCCCACATTAATCAGAGAAAAAACAAGTTAAGTATGAATACATTTACAAATAGCTAAAATTAGAAATATTGAACAAAGAGTCCATATAGAACACTACTAGAGATTAATTAAAATTCGAAATAAAAAAATAAAAAAAATTGAAATTAGAAAAATAAAAATAAGAGTTCAAGTAGAAATATAATTTAGAAATAACTAAAATTCGGAATAAAAAATAAAGAATGTTGAGAGAATAGTCCAATTCAGAATAAAAATAAAATAAATTTCAAAATAGAAAAATAATAATAAGAGTTCAAATAAAAATACAATTTATAAATAACTAAAATTAAGGATAAAAAATAAGGACTATTGAAAGAAGACCATCTGCAACACAACATTATTTAAATTTTGGACAAAAGAATAAATTCTAAGATTAGATAAGTGAAAATGAGAGTTCAAGTAGCAATACAATTTAGAAATAACTGAAATTCAGAAAAATAAATAGTGCAAGAACAGTACATATAAAATACAGTATGAGGCTAAATAAAATTCAAAATAAATAATAAAATAAATCATGGAATTCGAATTAAAAATAAAATAAATTCTGGAATAAGAAAAAGTAATATAACAGTTGAAGTAAATACAATTTATAAATAAAAATGAGAGTAAAAAATAGAGTTTTAAAAAACAATAGTTCATCTAGAAAATAACGATGACAAATGATAATAAAGATGAAGGAGTAATGGGCTTATAAAGAAATAGAGTAGTGATGGTCGACGGGACATCTAAAAATATAAAATAAACCCCAAAAATGATTAGGTTCGATTTTTAGAATCCCAAACGATTAAAAATAGGACCGATGGGTAAGCCATTAAGCGACATGTATGCGACGGTTGGTGGGACTTCTAAAAGTAAAAAAATAAACCCTAACAATAATTATGTTCGATTTTAAAATGACAATAAAGAGGGGATGCCATAGAGGAATACAATGACGATGTTTGACGTGACTTCTAAATATAAAAAGGAGGCCAATGAGACAATGAATTCTAAAAGCTATAAGGTCCATTTTTTAAATGTTACAAGATAATGAATGTATATCCATTATATATATGTATGTGTGTATGTGAATCAAATAAATAGGTAATAAAGGAGTAAGGGATAGTGACAGGCGTGACTATTAAAAACTACTGCCTCCGTTTCAGGTTATAAGACTTTCTAACATTGCCCACATTCACATAGATATTAATAAATCTAGGCACGCATATATGTCTAAATTCATTAGCATATATATGAATGTAGGCAATGCTAGAAAGTTTTATAATATGAAACGGAGAAAGTATTAAATTAGAAACCCGAGATGATAACATACGATTTTTTAAAGTCCTAAGGCAACATTATAGCTATTTAACAAATTGTAAGTAAAATCGTTTGTAAAAAATAGATAACTTCGTATAGGTGCTAGCCACGCAATTGCGCGAGCAACCCAGCTAGTTAATTATTATAAGTTAAAAATAAGTTTATTTGATTCTTAAAAGAAACATCTATATTAAAAAAAGAGCAAATTTCACGAAACTATATGTATTTTGATCAATCTATCATAAATAGATTTAAGATATTGTATAAAAAGAAACTACAAATTAACATCAGTTTTACCACAAAAGTACAATTTTTGTTACCTCAATAATGCTATGGATATAAACTCTAAAATTTGTAGTTCTTTAATAACTTCATCACAAATTAAAGTTGTAGACTTGTGATACAATGCTTTAGATATGTGGTTGTATCATAAATTTGATGATAAATTTATAGTTAAATCTATAGTTTTACGATAGTTTGGTTAAAGTTCCTATAGTTATCTAAAATTTACTTAAGAGAAACATTGTTTAGCATTTTGGGAAGCGTGTGTGCTAACGAAAATCAAGCAAGCTGCCAATACGGGACCTTAGTTTTGGTTGGGCTGAACTAAATGGATATGCCCTTATAAATTGATAGTTGTTTATTCTCTCACAGTGCCATATAATTAATGGATATCTCAATTATTTCAAGTCCTTAAATTAATAGCTGATCTATGGTGTATTCTGTTCCTCTTATCTCCTTAAGCTACATCATAATTAATCTAAGGAACAAAATTGAATAGAACACGTAAAGCCAAACCCATTCACCACGTTTACCATTTTGTCATTTAACTTAAGTCACACGCATAGGATTTCGATCTAGTGACATATTATAACCGTGCAATTTGAGAAAAGAAATCGACTTGTGCTTGTACCAGAGTCAGAAGCTGCCGAGGACAAAGCTCTTGTCACTAATCATGAAGCTGCCGTTCATCTTCACCTGCCAGGTTCGAAAACTCTCCTGTCACTGGTCATGAAGTAGCCACATACGCCATCTAATTGTCCATTATTAATTATTGTACTTAATTATACAGTAATGCTTCTGTAACTAATTCCAGCTGATACTTGCCAGTACTATCTGCCTTCAATTCGTTGTTTAATAGATATATAGCATCGTTAATTTTTAAAGTTACCTCCTTCGTTCCAAGATAAATTAATCTAATATAAAATATGACACATCTTAATTTACGAATTTGGACACATATAATAGTAAGTTAATTTATTTTAAGAGGAGGAAGTATATCAACCATTAATATTATTAAAATTGTCCAAATAGAAAAGAAATGTGCTTTAAATATATTTAATGATAAACCAAGTTAATAAATAGTACGTACTATTTTAAATCAGACGAACAGTAGTTGTACATAAAGGTCGAAGGTATTTATGTATTGAAAAAACGGAGTAACTTCCTTGTAAAAGAAAATAATGATACTGGTTAACTGATGCACTCGCAGAGGTTCGACAAGTCCACTGACCAAGCGCACCACGGCGACGGCAAGTGCCTCGTCTACGCCACCATTGGCATGGACGCGGCGCGCGTCGCCCGGACGCGCGCCACCGACCAGCCGCAGTGGACTGAGGAGCCGCT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| External Link(s) |
