BGIOSGA027107
| Gene Name |
BGIOSGA027107 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA027107 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027107, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027107-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027107-PA |
| Length |
5020 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:17546367..17551386 |
| Sequence Coding Region |
17551382..17551386,17549553..17549739,17549306..17549456,17548792..17548826,17548519..17548687 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:17546367..17551386 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGTCGGCACCCTGAAGTGAAGTGGGCTCAGAGGATTGACAAGGTTTACATAACTGTACAATTAGCTGATGCTAAGGATGCTAAGGTCAATCTGGAACCAGAAGGTGTATTCTCTTTCTCTGCTACAGCTGGAACTGATGGGAACTTATACGAATCAAAGCTAGAGTTGAACGACAAAGTAAATGTTGAGGAGAGCAAAATAAGTGTAGGTGTTAGGTCCATATTCTGTATTGTAGAAAAAGCTGAGGCCAAATGGTGGAAGAAGCTTGTTCGAGATGATCAAAAGGCACCACACTTTGTGAAAGTTGACTGGGACAAATGGGTTGATGAAGATGATGATGGTGCTGATGTCAACGTGGATGGAATGGACTTTTCGAATTTTGGTGGCATGGGTGGAATGGGTGGAATGGGCGGAATGGGTGATATGATGGGTGGCATGGGTGGTATGGGTGGCATGGGTGGCATGGCTGAGATGATGGGTGGCATGGGTGGTATGGGCGGTATGGGTGGCATGGATGAGTTCGAGGACGAGAGTGACGATGAAGAAGAAGTGTCTAAACCTCAAGACGCAGAGAAGGCTGCTGAAGCCGGAAAATCCCAGGAGTCGGACGCTAAAACCGAGACAAACATGGAGGCGGCGATGGATGAAGACATGGCCGAAGCAGGAGATGGTTTGTCGGTCGCAGCAGACAAAGCAGGAGGCGCCGTCGCAGGGATCGCGGCCACCACGGCCAGAGCGAGAGACGACTTCGCGGCCGGAGTGGGAAGCGACATCGTGGCCGTAGCGGGATGGTCACGCAGGGTCGTCGAGCGGCTGGGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSRHPEVKWAQRIDKVYITVQLADAKDAKVNLEPEGVFSFSATAGTDGNLYESKLELNDKVNVEESKISVGVRSIFCIVEKAEAKWWKKLVRDDQKAPHFVKVDWDKWVDEDDDGADVNVDGMDFSNFGGMGGMGGMGGMGDMMGGMGGMGGMGGMAEMMGGMGGMGGMGGMDEFEDESDDEEEVSKPQDAEKAAEAGKSQESDAKTETNMEAAMDEDMAEAGDGLSVAADKAGGAVAGIAATTARARDDFAAGVGSDIVAVAGWSRRVVERLG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..5#1648..1834#1931..2081#2561..2595#2700..2868#3803..3883#4824..5020#ATGAGGTGAGCGATTGCTCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCCATCATCACTTCGGCTCCCGATTCGGCGGAGAAACCCATACTCCGCGCCGCCCGCACGCGCCGTCCAGCGCCGGGAGCGGTTAGATCTGGAGGGGGCAGCCGCTGTGCACGCGGGGGGAAGATCCCCGGCAGCGCGAGAGGGCCCGTGGGGTCCCTTCCGCGGGCGTGGGCTTGACGCTAGGGTTCGTCGTGTTTTGATTTCTGTGGGATCTGTTTGTTGCTAGGGTTGGGGGGTTGGGGGTTGGCCGTAGGAAGTTTAGATGGTTTTTGGTGGTGCGCCTCAGTTCACGGCCATGTCCCCGCGCACGTGCGCGGGTTGCCCCCAGCTATCGGTGTGTTGGTAGATCTCTCTGCTTTGGTTTCCCACTGTGTCGGGTTGGTTAGTTATGCTTGTGCGGCAGCTACTGTTTAGGTGTAGCTCGTGTGGTTTATTGAGCTAGCCAGGGTTTTATTTGGTTAATTGGAGGTGATCATCTGCTCGTATAGTCCTATAGTTAACGAGGATAACTTCGCACTGACGACCAGGAGTTTAATAATAAAGTAATAATAAGCTCAAGTTTAATAGTGGGCTATAAGCCAAGTAGCCAAATGTAAGCTTATGTGGAAGAGAGAGTTTGAAAAATGAAGAGGGTTGGGTCTCAGTCTCATGTAAGAGCTATCCATTCACATACTTTAAGATGGATACGTTAATTGTATAGATGAGATAGAGAGGAGAAGAAAAATATAGATAAGCTTATAGCTTATCTACTATGCATGTCAACTCTAATATGTGCTATAAGTTCATAGTTGGCTTTATTATTAAACTTGCTCTAAGTTGGTTCATGCCATGGTGCGTGCAGCTTCTGATAACTGTTAGGAGGCAATTAGTTTATCTCTTATTCCTAGATATCTCTTATTAGTAGATATTTCTGTGCCTTTGTAGTTTTGTCTATCGATTGTGATATTTTTAAGAGATTGAAATCTGGTTTGTAATACATTTGTGCATTAGTGCTTTCTCATTGTAAGTGTTAGTTCATGTTCAGTTGTAGGTAACTCTGATACTGATGCCAATGGCAATTGTGTCTCGGTATTCTCTAAGGATTCTTTGTTGGTTTTGCTTTATGATAGGATTACCAGACACCACCATTTTATATTCATTAAGAAAACTTTCATTTTTATCAGTATTTTGTATAATACTCCCTGTGTTTCACATTATAAGTCGTTTTGACTTCTTTTCCAGTCAATTTTTTTTAAAGTTCGTCCAAGTTTATAGAAAAATATGGCAATATTTCCAACACAAGACAAACATATTACCAAAATATATTCAGCATTACATTTTAGTGAAACTAATTTGGTGCTGTAGATGTTGCTAAATTTTTCTATAAATTTGGTCATACCTAAAGAAATTTGACTAGAAAAAAAGTCAAATATGATACGAAGGGAGTACTTGTCACTTGTTCATATAGCATGGATATTACTGGCACACAGTAAACTTGTGGATTTTTGTAGGCTGCTGATGTATTTGTATTGGAGTTTAACCTCAAAGGGATCTAACCCTCATTCTTTTGCTTCTTGTAAGGTGCTCAGAATTGAATTTTTTTATGGTTTTCTTTTTGTTTCCTGTAGTCGGCACCCTGAAGTGAAGTGGGCTCAGAGGATTGACAAGGTTTACATAACTGTACAATTAGCTGATGCTAAGGATGCTAAGGTCAATCTGGAACCAGAAGGTGTATTCTCTTTCTCTGCTACAGCTGGAACTGATGGGAACTTATACGAATCAAAGCTAGAGTTGAACGACAAAGTAAATGTTGAGGTAATACATGCTCGTGCAATAGCTATATGACTGCAGTTTCCTCTATATTAAAATGCGTGGTTCCTTATCCTGTGTTTATTTGTTTTGATTCTACAGGAGAGCAAAATAAGTGTAGGTGTTAGGTCCATATTCTGTATTGTAGAAAAAGCTGAGGCCAAATGGTGGAAGAAGCTTGTTCGAGATGATCAAAAGGCACCACACTTTGTGAAAGTTGACTGGGACAAATGGGTTGATGAAGATGATGATGGTAAGCTATGCACTTCTTTTGCGGTGATAAACTGTGGACTTGTTTTCTCATGTTTGACGCAACTAGTAGCAGCATAATGAGAACAAGTGAGATGAAGCAAGTGCGCCTAACATGTTAGAATGGAGTATCATTTGATCATAGCACATAATGACATGTTTGAATTTGAAGAATGTTCCATATATGTTTCTCTTTAAGGCATTCCATTTGTTTTTCAACTGGTCATGGTGAAAAAAAATCATGCGCAGGACAAACTGTTATTACTCGTTATGTTGGATATAAACCTACATTGTCTCACTCGTTTAGATTCCACATTCAAGCCCCAAAACTAATATCAGTTTAGGGACCTAATCTGCTCTTATAATATATTATTTTTAACTTAATTATATAGATATTCCAGGAAATTTAATCTGGCCTTATTAATGTAAATAAGCCCTTGTTCCTTATCCAACGTTTTGATATGCATATATTTTATTTTTTAGGTGCTGATGTCAACGTGGATGGAATGGACTTTTCGGTAATTAGTTCTTTTCAGATTTCATGTTTATTCCTAGATTTCCTTTTTGCTCATGCATCTATTGTTTTTTAAACTAATGTTTTTCTTTATGTCTTTTTTTATAGAATTTTGGTGGCATGGGTGGAATGGGTGGAATGGGCGGAATGGGTGATATGATGGGTGGCATGGGTGGTATGGGTGGCATGGGTGGCATGGCTGAGATGATGGGTGGCATGGGTGGTATGGGCGGTATGGGTGGCATGGATGAGTTCGAGGACGAGAGTGACGATGAAGGTTTGTCTTCCTTTATTGTGTCCACAGATTCTCATTAATATCCGGGGGTTTCTATTAGCTATATGATAGCATAATATGATTCTGTGAAAATATAAATTAAGGAAGCATTATTTTTGCAGTTTGGTAAGATTAGTATGGTTTAGTTTGAACTGCCTGACCAGATGAGTGATCTGACTCATGCATGTGACAAATGCCATTAATTGAAAGGCCAATTCTTGAAAAATCTGCAATTGTGTGATTCGTACTCTTAACAGCAGTGATCAAAATATTGCACCTTTCATGCTTGGCACATATAAATGCAACTCAATAGGATAAAGCTATTTTTTTCATCATACAGGACTGTTTCTTGATATTGTGATTGTAGAAGTAAAAGTGCTATTTAATGGTTCTCCTGCACATTTTGGAATAGTTTGGCCCGAATTATGTTGTTCATGCTGTAACTATTATGGTGGTAATTAGTCTGATATGTTTCTTACCTGCATTGATTTTGTGATAGGTATGATACTAACCTTAATCACATGCATCAAAAGTTTCTTAACCATTATACTTACATACTGGTTAGGAAACTTTTTGATGCATGTAAAGTTAGTGTCACTAGGTGCAGATTAAGGTTAGTGTCGCGTGTACTCGTATTCATCATATTGTACTTACGGCTAGAGAACTGAAGCACATTCCCAAGAAATTGCAAATCAGTTTGTATTCATCATATTGTACATAAATCTAGAGATTTGAAGTACCTCCAAGAAATTGCAGACTTGAAGTACATCTAGGCATCAATTACAAGCAATTTAAACAACTATGTTATGTCAATTAAGTTGATATAAGAGTGCCAGTTATCTTTGTTTTTTTATATATCTTAGTACCTTTTAATTGTAATCTTGCTTGTTAAAAGTCCTCATGCCATCTTTTTTGACTTTGTTGCTCCCTTGTTTAGAAGAAGTGTCTAAACCTCAAGACGCAGAGAAGGCTGCTGAAGCCGGAAAATCCCAGGAGTCGGACGCTAAAACCGAGACAAGTTAGAGCAATCGAAGGCCCCTCTACATAATTCCTTTCTCTGTTGCATCCCGTCTTTTATGGATCTGGTGAACTGAAGAAAACATTTTACGTTATGACGGTAGGGATGGGTGCTCCCTTGTAGAACGATGCTATGAAACTGGAGCTCCAACTGAGTACGCAAACCATTCTTGGATTGTTTTTCTTAATGCGCTTTGATGCTTCATCGCTCTGCAATCATATATTAAGCTTTGGATGCTTTAATCTGCTTTTGTGAGATACTGCTGTGCCCGTGCTAGAGTCCACTGAGCATGCAACAATTCATGTGATCTGACGATGCTTGTGCTAGACGAGTGAGGCAGTAGCACTGTTAGTTCCCAAGCTTGTTTTGAAAGGATGCATAGTGAATCCCTATTTATTTGTTTCACAACTCTGTTCTGCGCTAATTGGTTGACCGTGAGACCTTTTGGCCAGCGTAGAACGACTACTACCTGTTTGCATGTGGTCTTACGGTCAACGTGCATGGCAGGATGTAAGTAAGGTCCCTGACTCCTGCTATTAACAGAATAACAGGAACAGGGCTTTTCCAGAAAAGCCCGCATTCATCAGATTGAGGCGAACGTGAACAAACGTTTTTAATTGAATTCAGATTAACCAACTTGTTAGTGCTTGTTCAATTCAAACGTAATGCTAAAAAGGGGCCTAACACAACATTTAGGAGTGTTGATAAGAGTGTCACCCTATTAGTACTGATTTATTCCCTCTGTTTCGATTAAAAATAATCGACGTATTGTAGAAAACCAAAAATTATCATCGTCGTACTTCAAAGGCAGCACCCGACACATCTCGCATATGCGCTTCGTTTTCTTATCCTCGCCGCTTCGTATGCCAAAAACCTCTCGGTGTTTCGTATGCCAAAACCCAGCCGTGGTGTTTTCTGTTCTTCTCCCACCTTTGGAAAGACATGGAGGCGGCGATGGATGAAGACATGGCCGAAGCAGGAGATGGTTTGTCGGTCGCAGCAGACAAAGCAGGAGGCGCCGTCGCAGGGATCGCGGCCACCACGGCCAGAGCGAGAGACGACTTCGCGGCCGGAGTGGGAAGCGACATCGTGGCCGTAGCGGGATGGTCACGCAGGGTCGTCGAGCGGCTGGGATGA</dnaseqindica> 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