BGIOSGA027320
| Gene Name |
BGIOSGA027320 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027320, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28531 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027320-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027320-PA |
| Length |
4170 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:11387513..11391682 |
| Sequence Coding Region |
11391315..11391682,11390243..11390776,11389936..11390142,11389119..11389652,11387774..11388401 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:11387513..11391682 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:11387513..11391682 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGATGATATTTGGACCTTGAATTTATTCCGTGATGGTGTTGTTAATGGCCTGATGCATGTGCAAAAAAAGATGGACATAGATATCATTTGCTACTTCAATTTGGTTGGACTGATTGTGGACATTGGCTACTCAGAATGTGATTTTATCTACTACAGCAAAAAAGATGGGAGGGGTGTAGCTAGCATGGTTGCTATAGAAAGTGATTGGCAAGTGGATGAAATGTGTAAGCAATTTGAGAGTGAAAAAGTTGCAAACTTGTACATCATCCAGAGACAAGGTGTATCTCAGTCAAGCAATCTGCATGGCCCAAATACTGAATTGGTTACAAACTTGGGTGATGCAATTGCCGAGGTGGATGACTTATGGGCACTTAAGAGCTACCACATTGTCAATTGTAGAGACCACATGTATCTTAGAAATGATAGTGATAGAGTAAAAGTATGCTGTGTGAATGATTCTTGCCCATTTTACATGTTGGCCTCACAAATTGCCAATGAGAAAACTATTGCCATCAGGAATATGGTTGGTCCTCACACATGTGGTACAACTATGGATAGTAGTAGGGTGAGTAGTGAATGGTTAAATAAAGTGTATGAAGAGGACATTAGAAGTGACCCAAACTGGAAAATCACTTCTATGATGGATGCTGTTATGAGGAAATATGGAGTTGACATATCAAAGATTATGGCTTATAGGGCAAGGAGCAAGGCGGATGAGGTGGTGTTAGGGAACCACAAGAAACAATACCTAAGGATCAAGGATTACTTGCAGACTGTACTAAATAAGAACCCAGGTAGTCGATGCATTGTGTCTACCTATAATCCGTACCCACCTGGTAACAATCCTAGATTCAAGGGCCTCTTCATATGTCTCAATGCACAAATAGAAGGCTTCAAAGTAGACGGATGTTTTGTCAAGCTTACTAATGGGGCTCAAGTACTTGCCGCATCTAGAAGGGATGGCAATGATAATCTTTTCCCCTTAGCATTTGGGGTGGTAGGAAAAGAAGATTACGAAGGTTGGTGTTGGTTCCTACAACAATTGAAATATGCTCTTGGTGGAGAGGTTGGCCCATATGGAAAATGGACAATAATGTCAGATAGATGGGCACTTAAGAGCTACCACATTGTCAATTGTAGAGACCACATGTATCTTAGAAATGATAGTGATAGAGTAAAAGTATGCTGTGTGAATGATTCTTGCCCATTTTACATGTTGGCCTCACAAATTGCCAATGAGAAAACTATTGCCATCAGGAATATGGTTGGTTCTCACACATGTGGTACAACTATGGATAGTGGTAGGGTGAGTAGTGAATGGTTAAGTAAAGTGTATGAAGAGGACATTAGAAGTGACCCAAACTGGAAAATCACTTCTATGATGGATGCTATTATGAGGAAATATGGAGTTGACATATCAAAGATTATGGCTTATAGGGCAAGGAGCAAGGCGGATGAGGTGGTGTTAGGGAACCACAAGAAACAATACCTAAGGATCAGGGATTACTTGCAGACTATACTAGATAAGAACCCAGGTAGTCGATGCATTGTGTCTACCTATAATCCTTACCCACCTGGTAACAATCCTAGATTCAAGGGCCTCTTCATATGTCTCAATGCACAAATAGAAGGCTTCAAGGACAAGCCCATTGTTACAATGTTGGATCTTATTAGAACCAAGTTGATGGGGCGGTTTAACTCGAATAGAGAAGGTATTGCTTCAGCACAATGGGAAATTACTCCTCATTATGCAGAAAAGATAGAGGTGGAGAAGAGAGATGCTAGGTATTGTAGGGCTGTTTGTGCAGGGAGGGGGATATGGCAAGTAACTTGTGGTGAAATGACATATGCAGTAAATATCCATGATAGGACTTGTGGTTGTTTCAAATGGGATGTCACTGGTGTTCCTTGCAAACATGCAGTGTCAACCATTTACAAGTCAAAGCAACACCCTGAAGATTTTGTTCATGATTTCTTTAAGAAGCTAGCATACCAAAGAGCATATCAACATAGCATATATCATGTCCCTAGCTCTGATGACTGGACCAAAACGGATACACCAGATATAGACCCTCCTAAATTTTCAAAACATCCTGGCAGGCCAAAAAATAACAGAAGAAAGAGGGGAGATGAGCCATCACAACCTAGTGGTAGAGCAAGAATGACTACTATTACTTGTTCTAATTGCCACAAACAAGGCCACAAGTGCACCAGTTGCTCACGTAAGCTTAGACCAGATCTCCAAATTAGGAAAAGCAAGCATAAGGCCAACAGATCCATACCTGCTGAGTCAAGCCATGTGCAAGAGCCAAGATTTGTTGCTAATTTCCAAGAAGGTTTTGGTGTTAGAGTTCCTAATAGCCCAATAGTTGACAGAGGAAGAGGTAGACTAAGCAAGATGATATCTAGAAGAGACAGGGGGAGAGGCAGGTCAACAAGTGGAGTTATGAACTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEDDIWTLNLFRDGVVNGLMHVQKKMDIDIICYFNLVGLIVDIGYSECDFIYYSKKDGRGVASMVAIESDWQVDEMCKQFESEKVANLYIIQRQGVSQSSNLHGPNTELVTNLGDAIAEVDDLWALKSYHIVNCRDHMYLRNDSDRVKVCCVNDSCPFYMLASQIANEKTIAIRNMVGPHTCGTTMDSSRVSSEWLNKVYEEDIRSDPNWKITSMMDAVMRKYGVDISKIMAYRARSKADEVVLGNHKKQYLRIKDYLQTVLNKNPGSRCIVSTYNPYPPGNNPRFKGLFICLNAQIEGFKVDGCFVKLTNGAQVLAASRRDGNDNLFPLAFGVVGKEDYEGWCWFLQQLKYALGGEVGPYGKWTIMSDRWALKSYHIVNCRDHMYLRNDSDRVKVCCVNDSCPFYMLASQIANEKTIAIRNMVGSHTCGTTMDSGRVSSEWLSKVYEEDIRSDPNWKITSMMDAIMRKYGVDISKIMAYRARSKADEVVLGNHKKQYLRIRDYLQTILDKNPGSRCIVSTYNPYPPGNNPRFKGLFICLNAQIEGFKDKPIVTMLDLIRTKLMGRFNSNREGIASAQWEITPHYAEKIEVEKRDARYCRAVCAGRGIWQVTCGEMTYAVNIHDRTCGCFKWDVTGVPCKHAVSTIYKSKQHPEDFVHDFFKKLAYQRAYQHSIYHVPSSDDWTKTDTPDIDPPKFSKHPGRPKNNRRKRGDEPSQPSGRARMTTITCSNCHKQGHKCTSCSRKLRPDLQIRKSKHKANRSIPAESSHVQEPRFVANFQEGFGVRVPNSPIVDRGRGRLSKMISRRDRGRGRSTSGVMN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..368#907..1440#1541..1747#2031..2564#3282..3909#3982..4170#ATGGAGGATGATATTTGGACCTTGAATTTATTCCGTGATGGTGTTGTTAATGGCCTGATGCATGTGCAAAAAAAGATGGACATAGATATCATTTGCTACTTCAATTTGGTTGGACTGATTGTGGACATTGGCTACTCAGAATGTGATTTTATCTACTACAGCAAAAAAGATGGGAGGGGTGTAGCTAGCATGGTTGCTATAGAAAGTGATTGGCAAGTGGATGAAATGTGTAAGCAATTTGAGAGTGAAAAAGTTGCAAACTTGTACATCATCCAGAGACAAGGTGTATCTCAGTCAAGCAATCTGCATGGCCCAAATACTGAATTGGTTACAAACTTGGGTGATGCAATTGCCGAGGTGGATGACTTGTGTGTTTTGGAAAATGATGCCATGTCAGATAGCTCAAATCCATCATCGGTTGATGAAGATTTTCTATAACTGTAAAATAATAATTTAGAGGAGAAGTTAAAGGAGATTAAGAGGCAAAAAGAAGATCCAGATGAGCGTCGCGAGGGAGATACTGATGTGGAGGACATATTTCCATTGGCTATTAATCTACTAGACACAGGATCTGCACCTATAGCTAGAAGGAATGGCAATGAAGTTGCAGTTCAACATGAGAGTCAACCAAGCCCTCTAGTTGTTAATTCCCCTCTAGTTGTTGTCGATTCATCCAGAGCCAATGTAGCCAGCATATAGCACCATCTACAAGGAAGGGCAGGAAGACAATGAGGGTGACTTGTGACTTATGTTCCAGTGATGATGATGGGCATGAAGCAACACCTTGTCGAGCACCGAATAAAAGAAAAAGCTTTCAGTACAAAGAATTTGGTATGATGAGAGCATGTTTCTTTCTTCTGATGCATTGTGTGAGAAAATGTGTTTTCGAGATGTTCATCAATTTAGATGGGCACTTAAGAGCTACCACATTGTCAATTGTAGAGACCACATGTATCTTAGAAATGATAGTGATAGAGTAAAAGTATGCTGTGTGAATGATTCTTGCCCATTTTACATGTTGGCCTCACAAATTGCCAATGAGAAAACTATTGCCATCAGGAATATGGTTGGTCCTCACACATGTGGTACAACTATGGATAGTAGTAGGGTGAGTAGTGAATGGTTAAATAAAGTGTATGAAGAGGACATTAGAAGTGACCCAAACTGGAAAATCACTTCTATGATGGATGCTGTTATGAGGAAATATGGAGTTGACATATCAAAGATTATGGCTTATAGGGCAAGGAGCAAGGCGGATGAGGTGGTGTTAGGGAACCACAAGAAACAATACCTAAGGATCAAGGATTACTTGCAGACTGTACTAAATAAGAACCCAGGTAGTCGATGCATTGTGTCTACCTATAATCCGTACCCACCTGGTAACAATCCTAGATTCAAGGGCCTCTTCATATGTCTCAATGCACAAATAGAAGGCTTCAAGTATGGTTGCAGGCCCTTCATAGACTATACTATTTTGGGTGTTATTATACGACTTGCATGCTTTTTTTTTTATTGAACAGTCCATGTGTAATTATGCAAGAGTAGACGGATGTTTTGTCAAGCTTACTAATGGGGCTCAAGTACTTGCCGCATCTAGAAGGGATGGCAATGATAATCTTTTCCCCTTAGCATTTGGGGTGGTAGGAAAAGAAGATTACGAAGGTTGGTGTTGGTTCCTACAACAATTGAAATATGCTCTTGGTGGAGAGGTTGGCCCATATGGAAAATGGACAATAATGTCAGATAGGTAAAAGGTAATGTTCATTTCTATNATCTACATGGCCTTTTAAGTTTTCCACTATTTATTTAACTAATGTATCACTTCAATGCAGGGTCTTGTTGGTGGGATTAAAGATGTATTTCCTGCATGTGAACAGAGGTTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCATTGTGTGAGAAAATGTGTTTTCGAGATGTTCATCAATTTAGATGGGCACTTAAGAGCTACCACATTGTCAATTGTAGAGACCACATGTATCTTAGAAATGATAGTGATAGAGTAAAAGTATGCTGTGTGAATGATTCTTGCCCATTTTACATGTTGGCCTCACAAATTGCCAATGAGAAAACTATTGCCATCAGGAATATGGTTGGTTCTCACACATGTGGTACAACTATGGATAGTGGTAGGGTGAGTAGTGAATGGTTAAGTAAAGTGTATGAAGAGGACATTAGAAGTGACCCAAACTGGAAAATCACTTCTATGATGGATGCTATTATGAGGAAATATGGAGTTGACATATCAAAGATTATGGCTTATAGGGCAAGGAGCAAGGCGGATGAGGTGGTGTTAGGGAACCACAAGAAACAATACCTAAGGATCAGGGATTACTTGCAGACTATACTAGATAAGAACCCAGGTAGTCGATGCATTGTGTCTACCTATAATCCTTACCCACCTGGTAACAATCCTAGATTCAAGGGCCTCTTCATATGTCTCAATGCACAAATAGAAGGCTTCAAGTATGGTTGCAGGCCCTTCATAGACTATACTATTTTGGGTGTTATTATACGACTTGCATGCTTTTTTTTTTGTTATTGAACAGTCCATGTGTAATTATGCAGGAGTAGACGGATGTTTTGTCAAGCTTACTAATGGGGCTCAAGTACTTGCCGCATCTAGAAGGGATGGCAATGATAATCTTTTCCCCTTAGCATTTGGGGTGGTAGGAAAAGAAGATTACGAAGGTTGGTGTTGGTTCCTGCAACAACTGAAATATGCTCTTGGTGGAGAGGTTGGCCCATATGGAAAATGGACAATAATGTCAGATAGGTAAAAGGTAATGTTCATTTCTATTATCTACATGGCCTTTTAAGTTTTCCACTATTTATTTAACTAATGTATCACTTCAATGCAGGGTCTTGTTGGTGGGATTAAAGATGTATTTCCTGCATGTGAACAGAGGTTTGCAAGCGCCATATACACCAAAACTTTTGCACCGCATGGTTTGAGGGGTGGAGATCTCAAGGCATACATGGACTCTGCTGTATATGCATATACTAAACATAATTTTGAGATTGCGATGGAAGAACTGAAGAAGGAGAGGGAAGGTGCATGGGAGTGGCTTACCAAAATACTTACTAAGCATTGGGCTAGGCTGCATTTGACACAACATGCAAGATAGATTTAGTGGTCAATAACATAAGCGAAGTATTCAATAACTACATCATTGATTACAGGGACAAGCCCATTGTTACAATGTTGGATCTTATTAGAACCAAGTTGATGGGGCGGTTTAACTCGAATAGAGAAGGTATTGCTTCAGCACAATGGGAAATTACTCCTCATTATGCAGAAAAGATAGAGGTGGAGAAGAGAGATGCTAGGTATTGTAGGGCTGTTTGTGCAGGGAGGGGGATATGGCAAGTAACTTGTGGTGAAATGACATATGCAGTAAATATCCATGATAGGACTTGTGGTTGTTTCAAATGGGATGTCACTGGTGTTCCTTGCAAACATGCAGTGTCAACCATTTACAAGTCAAAGCAACACCCTGAAGATTTTGTTCATGATTTCTTTAAGAAGCTAGCATACCAAAGAGCATATCAACATAGCATATATCATGTCCCTAGCTCTGATGACTGGACCAAAACGGATACACCAGATATAGACCCTCCTAAATTTTCAAAACATCCTGGCAGGCCAAAAAATAACAGAAGAAAGAGGGGAGATGAGCCATCACAACCTAGTGGTAGAGCAAGAATGACTACTATTACTTGTTCTAATTGCCACAAACAAGGCCACAAGTGCACCAGTTGCTCACGTAAGCTTAGACCAGATCTCCAAATTAGGAAAAGCAAGCATAAGGTAAAACTGAACTTTAGTGCTACAAATAAGAATACATATATCAATTACATGTTTTTTTTTTCTTTTCTTTAGGCCAACAGATCCATACCTGCTGAGTCAAGCCATGTGCAAGAGCCAAGATTTGTTGCTAATTTCCAAGAAGGTTTTGGTGTTAGAGTTCCTAATAGCCCAATAGTTGACAGAGGAAGAGGTAGACTAAGCAAGATGATATCTAGAAGAGACAGGGGGAGAGGCAGGTCAACAAGTGGAGTTATGAACTAG</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
