BGIOSGA027556
| Gene Name |
BGIOSGA027556 |
|---|---|
| Description |
DNA binding protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027556, complete gene. |
| LocusTag |
P0583B06.20 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027556-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027556-PA |
| Length |
12889 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:4875295..4888183 |
| Sequence Coding Region |
4888095..4888183,4887966..4888020),complement(4887780..4887877,4886253..4887693),complement(4886066..4886185 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:4875295..4888183 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGAGGAATTGCAGAATGTGGTGTGAACATTGATCAGAAAGCTTCGCCACGCCGTGCGGCCATAGAGAAAGCTCAAGAGGAGCTTAGGCAAGAATATGATGTCCGTGAAGAACGAAGAAGGGAGCTTGAATTTTTAGAGAAGGGAGGTAATCCCTTGGATTTCAAACTTGGACATGTAGCATCACTTAGTGTCCAGTCCACTTCTGTTGCAGATCATATAACCGAACAAAATGTGATAAGTGAAGCTAAGGGCAGCTTTGCGTTTGCTGCCTCACCCCATGGGGATTCGGTTGAAAGTAGTGGCAAGCCAGGAAGTTCATCATGCCGTGATGCCAACACAGCTGATAATCTTATGCTTTTGGATGGAGATACCAGCAACACAGGTGGGGAGAAACTTGTCAAATGTGGTACTAAACGAACTAATGTATCTCAACCTGATGTGTCCCTGCGCTGTGATGGTCAAAACAATGTAAAAGAGGCTGAAGATTCTAGTTTGTTCCGCCCTGGGGCAAAGAACCAGGCGTATGCTCGTCGCAGATCAAAATCAAGCAGGGAGAATGCCACTGCGTCTGTTGGGTCTCTACCAGTTTCCCCACTATATTCTCAAGGGAAAGATGCAAAAGGGATAATACAAGAAACAAAATCAGAAGATCATGGTGCCTCATCTATTGGCAACTCAAAACCAGCAAGTCCAGATCGGAACAACACATCAAAGGTTGCTTCATTAGGTGATCATGATGCGATGGAGATGGACAACACTAATGAAGGAAACCAAGCAGCAACTCATGAAACAACAAACATCAAAGATGGTGTTGAAACACCGGAAATCTCACCAAACAGTGTGAATGGTAATTCACAGCTTATTGGAGATGGTTTGGTAGTTACTGCAACTACTTCTGCAGAATCCCCTGACACAAGTCCAAAAGAAGCTGCTTTAATGGCAACTTCTTCATTTCCATCTTCATGCAATGAAGTCTTGGAAGAAGCATGTGCTGCGGAAGAAGCAGGTAATGGATGCTCAGATAAAAATTTGGTTGTTCCTGCAGATGATATGGTTAGCAAGAGTTCTGTTCCTCCCTCCGAGGTAGAAATTGCCAGTTTGAATGAAAATGAAGCGGATATACCATGTGCAGATGTGTCTAAGACCGTTGATGAACGTCCTGGAAAAAGTGAGAACTTATCAGGGAAGGTGTCTGATGAAGATTTAGGTGATGCTATACCTTCTGACAAGGATGGAAACAAAGATGGTCAACCAGAAGGTGGTGACATGCCCACAGTTGTTGATGGCGTTTCTAATTCTGTTCAACCAGAAGTCAGCAATACCATTTATGCCAAAGATGACGTTGATGTCCATAACAAGATGGTTGATGCACAAAAGGATACAGGGAATCTTGCTACTTCTGGTCTTGACAAAGTCGATAAGGAAGCATGTTCTAATTTGAAAAAAAATAATAAATGTTCTCCTGATTCTAATATTGCTGATAAGTTGGATTCTGTTACTGTGGCGTCTGGTTTGCTCATGAAGGACGTGCCTAGTTCTGTGTCATTAATGAACCCTGACAATGATGTTAATAAAACTGGTGAAAATATTCCAATGATGGAAAAGAAGGAATGCGAAGATTCTACTGTTGCCAATAAGGAACATGAAGATACTATCCTTAGAAGGGCACGATTAATAGAGGTCAATATCAAGAAAGCTGGTGAACGATCTCTCTGCAATATTTCTTTGGAGAAGAAGCCAAAGAGTCACTGGGAATTTGTCCTGGAGGAGATGGCTTGGATGGCAAATGAATTTATGCAGCAGCTTCCCAGATGTGCCACTGGATGCCTTAAGTGGTCGAGCAACATTGAGGAAGCAAACATTCAAAGGAAACAGAAATCAATTGCTAGAATCCTAGCCAAGAGTATCATGAAGTTTTGGTGTTCAGCTGAGACTTTACGAGCTACCAGTGGTGAAATGCGTAAAGAGAAGCAAGCAGAGGAGTCAATTGGGATTGGGGAAACAAAGCTGGCTGGAATCAATGCAGAAAAAGAACAGTGTAACGAACCTCTGGAACAAGAGAAGCTTCAGTCTCCTATTCAAAGTTACGCACTAAAGTTTCTGAAGGACAACTGTAATATATCTGAGTGTCTGTCGTTAGCTGAAGCACCAGCTACTCCTGACAGGCTGAATGATTTTGGCATTTTGAAAGTGCCAGACCAGCTTTCAGAAGCAAACCTATTTTATGGCGTAGCCCCTGGTGCGATGCAGGCATACAGAGAGTTTGTGGAGGGTCCTTTTGTGGCTAATAAGGCAAGGACATGCTCTCTGTACTCTGATGGCTTTATAATAAAAACCAATAACTCTCGACAGAAGAATGATTATGAGCCATCTACAACAGGCTCTGTTGCAGATGCACATAGGGGACATGCATATGAAGATGATGATGTCGAGGCATCCACTTATGTATTGCATGGTACATATGATGATGGTTTGCCATCAAAATCGAGTCACAAAAAGAAACACCTTATGCAGCAGAGGATGAATGGCACAAGGCATTACAGTACTGGTGTTGACATGCCTTATGATCCATATGTGGAGAGCAAGCCAGGAAACCAGCCATTTTTATCAAATGGAAAAAGACCTTCAGATTTCTTTAATATTCCTACAAAACGCATCCGGACAGCTGCTAGACAACGAGTTGTAAGCCCATATCCTGCTAATGCTTCTGGAGCCACTGCATTCACAAGTAAAACAGATGCTTCTAGTGGAGACACAAACTCTTGTCAAGATGACCAAAGTTCATTGCATGGTGGATCTTTTCCAAGGAAGAATGTGGATATTGAATCGACAGTTGATTTTGATAGACAATTGTATGATGGCAGTGAGGTATCTACTAAGTCAAAAAAGAAGAAAAAGTCTAAGCACCCTGGATACAAGACACCTCAAAGTGTCGCTGAGTCTTGCTCTTTGATTGCTGGGAAGGGCATTGCCTGTGATCCTAGACCTCAGGTTGATTTGATTGCTCAATATGAGCAGAAGGATTATTTGAAGAAGAGATCAGAGGTCCATCAATTCGATTCAAATGGAAATATTGTGATAAATGGTCAGCATGCTGCCAAGAAACCTAAATTGATGAACCAAGCACCAGATGTTTCATTAGAAGCACTTACACCAGTTGGCCCAATGGTATCTCCTGCTGCTTCACAAATGAGTAATATGGCAAATCCTACTAAGATTATAAAGATCATTACAAACCGGGATCGTGGGAGAAAAAATAAAGTGCTCAAGAAACGTATAATTGCTAATACAAACAGTACTTATAAATCACCAAAACAAATGAGTAAACCTCACAATCATATACTACCAGTAAAGCTACACAGCCTTAAAGCAGCAGTTTTAGAGAACTGCAGTTCATTTTGCATAACTTTATCCAATTGGTTGGGCTTGCTCGTCGATATCACAATCCTACCATTTTATATTAACAAGGTTCCAAGCACCGGTGGTAACCGGTCTGAAGCCAGTGACTGCGGCGGTGCGAGCGGCCGCCGCTGCTCTGAGCGAGGGGGACACAGTGGTGCCGTGGCAGTGGACCTCGCCAATGAGTCTGGTGCCGAGATGGCTGCTAGTCACTCAGGCCCTGGAAGTCCATGGTCGAGCTTTGAGGATCAGGCTCTTGTTGTGCTTGTACATGATATGGGTCAAAACTGGGAACTGGTTAGTGACGCACTGAACAGCATTGTTCAATTGAAGTGTATATATAGAAGGCCTAACGAGTGTAAAGATCGCCATAAACTTCTCACAGAAAAAGGTTCAGGTGATGGTGCGGATAGCGCAGATGACTCGGGCTCATCACAACACTATCAGTCCACATTGCCTGGCATCCCAAAGGGTAGTGCTAGACACCTGTTCCAGCGCCTTCAAGGACCGTTCGAGGAAGAGACTCTTAAGGCACACTTCGAGAAAATAATATTCCTTGGTCAAAAGTTGCATCCAAATCGTAGAAAGGGTGAGAGCCAAGAGCTCAAGCAGATAAACCCACTCCATTCTTCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGATGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTATTGGTTACTCGGGATCTCATGCAAGTGGTTTAATGCTTCCAAACCATCCCAGTTCCATTGGCCCCACCCTTCCTACTGGTAATATGAATACTAGGCTACCAGGGTCTCCTGGTATGGTTTTAGGCAATACTTTGCCATCACCTTCAACACCAAATACTCCTAGGGATTCTCAGAGGTACGGAATGCCTAGACCTACCTCTCTGCAGGGTGATGAGCAACAAAGAATCCAGTACAATCAGATGCTCAACAGCAGAAGTCTTCAGCAACCTGGGGTGCCTGTTCCTGGTGCGCCTGCTGGAGTTGATCGTGGTGTTCGGATGATGCCTGGTGCTCATGGTATGGGGGTGATGACTGGACTAAATCGTGGTACTCCAGTGACCAGGCCGCCCTTTCCAAGGCTTGGTTCCTCAGGAATGCTAAATATGGTTTCACCTGGAAACATGCTTCCCAACAATGGGCAAGGCATGCAAAACACGGTGAATGTTCATCCTGGTACCATACCTGGCCATGGAAATATTATGTTGAGGCCACGCGATCCAATGCAGATGCTTCGGCCTGGCCAGAACATGGAAGAACATAGGCAGATGATGCAGGAGTTTCAGATGCAAGTATCGCAGGGAAATAACCAGTCCATTCATTTCAGTGGTACTCCATTTTCCAATGTCGGAGCATCTTCACCTGGTCAACCTTTTCCAGTTCAGTCATCCCAACCACATCAGATGCCACAACAGTCACACGTGCTTGGAAATACACATCACCCCCATATTCAAGGAACAACCCAGTCAAGCCCACAGCAGCAGGCTTATGCTATGCGCTTGGCTAAAGATAGACACATGCAACAATGCATGATGACCCAACA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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGIAECGVNIDQKASPRRAAIEKAQEELRQEYDVREERRRELEFLEKGGNPLDFKLGHVASLSVQSTSVADHITEQNVISEAKGSFAFAASPHGDSVESSGKPGSSSCRDANTADNLMLLDGDTSNTGGEKLVKCGTKRTNVSQPDVSLRCDGQNNVKEAEDSSLFRPGAKNQAYARRRSKSSRENATASVGSLPVSPLYSQGKDAKGIIQETKSEDHGASSIGNSKPASPDRNNTSKVASLGDHDAMEMDNTNEGNQAATHETTNIKDGVETPEISPNSVNGNSQLIGDGLVVTATTSAESPDTSPKEAALMATSSFPSSCNEVLEEACAAEEAGNGCSDKNLVVPADDMVSKSSVPPSEVEIASLNENEADIPCADVSKTVDERPGKSENLSGKVSDEDLGDAIPSDKDGNKDGQPEGGDMPTVVDGVSNSVQPEVSNTIYAKDDVDVHNKMVDAQKDTGNLATSGLDKVDKEACSNLKKNNKCSPDSNIADKLDSVTVASGLLMKDVPSSVSLMNPDNDVNKTGENIPMMEKKECEDSTVANKEHEDTILRRARLIEVNIKKAGERSLCNISLEKKPKSHWEFVLEEMAWMANEFMQQLPRCATGCLKWSSNIEEANIQRKQKSIARILAKSIMKFWCSAETLRATSGEMRKEKQAEESIGIGETKLAGINAEKEQCNEPLEQEKLQSPIQSYALKFLKDNCNISECLSLAEAPATPDRLNDFGILKVPDQLSEANLFYGVAPGAMQAYREFVEGPFVANKARTCSLYSDGFIIKTNNSRQKNDYEPSTTGSVADAHRGHAYEDDDVEASTYVLHGTYDDGLPSKSSHKKKHLMQQRMNGTRHYSTGVDMPYDPYVESKPGNQPFLSNGKRPSDFFNIPTKRIRTAARQRVVSPYPANASGATAFTSKTDASSGDTNSCQDDQSSLHGGSFPRKNVDIESTVDFDRQLYDGSEVSTKSKKKKKSKHPGYKTPQSVAESCSLIAGKGIACDPRPQVDLIAQYEQKDYLKKRSEVHQFDSNGNIVINGQHAAKKPKLMNQAPDVSLEALTPVGPMVSPAASQMSNMANPTKIIKIITNRDRGRKNKVLKKRIIANTNSTYKSPKQMSKPHNHILPVKLHSLKAAVLENCSSFCITLSNWLGLLVDITILPFYINKVPSTGGNRSEASDCGGASGRRCSERGGHSGAVAVDLANESGAEMAASHSGPGSPWSSFEDQALVVLVHDMGQNWELVSDALNSIVQLKCIYRRPNECKDRHKLLTEKGSGDGADSADDSGSSQHYQSTLPGIPKGSARHLFQRLQGPFEEETLKAHFEKIIFLGQKLHPNRRKGESQELKQINPLHSSHLHALSQACAPGVILMPLDLCDAMTPNPDALSIGYSGSHASGLMLPNHPSSIGPTLPTGNMNTRLPGSPGMVLGNTLPSPSTPNTPRDSQRYGMPRPTSLQGDEQQRIQYNQMLNSRSLQQPGVPVPGAPAGVDRGVRMMPGAHGMGVMTGLNRGTPVTRPPFPRLGSSGMLNMVSPGNMLPNNGQGMQNTVNVHPGTIPGHGNIMLRPRDPMQMLRPGQNMEEHRQMMQEFQMQVSQGNNQSIHFSGTPFSNVGASSPGQPFPVQSSQPHQMPQQSHVLGNTHHPHIQGTTQSSPQQQAYAMRLAKDRHMQQCMMTQQQHPLSGASAVSTVQNGSQMQQQSQGPASSAIPSSQSQHKQQHPAQNSLDSSVPPNQPVNTSHKQKKQQGQQQSRQNQQQRNQGSQQAKLMKSLGRGNMMHQSSPVDATQASGISTTSKNQVSDKSMVQQGPGYFAGNKGLVPSVVQPGNQPKIYGSQMPHSPIQTSDVGSQSSMQGSPNQTMLTSQQAPLHSSSPLAQQQQQRYMNPSHNNIQRLVMQQNRHMNTDGRIESPVDQVQHNQAIPSTSIAKSTDSGSPGGVSSINQRRQESSHDPTTVPSTSQLASSPQDTFVGNEMLLSVSSQGMLQRQMSGGVPIHGHGIGGQRQQLQSRQQQQQKPAVQGSVYAHPSNSGPG</aaseq> |
| Gene Sequence |
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