BGIOSGA029962
| Gene Name |
BGIOSGA029962 |
|---|---|
| Description |
' |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029962, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0017I18.21-2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA029962-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA029962-PA |
| Length |
8564 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:8745585..8754148 |
| Sequence Coding Region |
8754090..8754148,8753799..8754071),complement(8753486..8753606,8752328..8752416),complement(8752166..8752250 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:8745585..8754148 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:8745585..8754148 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGACGCCGGCGAGATACACGCGCTCGGGGGCAGCCTGCGGCGGGAGGCGTCGTCGGCGCGGTCGGGGGACGCCGCCGTGTTCTTCTCGCGGTCGTCGACTTCGAGGGATGAGGACGACGAGGAGGCGCTGCGGTGGGCGGCGCTGGAGAAGCTCCCCACCTACGACAGGGCGCGAACGGCGGTGCTGGCCATGCCGGAGGGCGAGCTCCGGGAGGTGAACGTGCAGCGCCTCGGCCCCCAGGAGCGGCACGCGCTGCTGCAGCGCCTCGCCTGGGTCGGCGACGACCACGCCCGCTTCCTCTCCAAGTTCAAGGACCGCGTCGACAGGGTTGGGATCGAGCTGCCGACGATCGAGGTGCGGTACGAGAACCTGAATGTGGAAGCGGAGGCGTACGTTGGTAGCAGAGGTTTGCCCACCATCCTCAACACCTACGCCAATGTGCTGGAGGGTCTGGCAAACACTCTTCACATAACACCAAATAGGAAGCAGAAAATATCGATCCTTCACAATGTCAGTGGGATAATCAAGCCTCACAGAATGACCTTGCTTTTGGGTCCTCCTGGCGCTGGAAAAACCACACTTCTTTTGGCCTTGGCTGGAAATGTCCCTTCAGGTCTAAAGGTATCTGGACAAATAACATACAATGGCCATACCATGGATGAATTCGAGCCCCGGAGATCAGCAGCTTATGTTAGTCAACATGATCTACATATGGGTGAATTGACGGTTCGTGAGACAGTCAATTTCTCTGCAAAATGTCAAGGAATTGGCCACCGTTACGATCTGCTAATGGAACTATCAAGGAGAGAAAAGGAAGAAAATATTAAACCAGATCCAGAAGTAGATATATACTTGAAGGCTGCTGCAACAGGAGAGCAGAAAGCCGAGGTGGTCACAAATCACATACTAAAGGTCTTGGGATTGGATATTTGCGCTGACACAATCGTAGGCAACAATATGTTGAGAGGCATATCAGGGGGGCAGAAAAAGAGAGTAACCACAGCTGAGATGATTGTCACCCCAGGACGAGCCCTTTTCATGGATGAGATATCAACTGGACTTGACAGCTCCACAACATACAATATTGTGGACTCCATCCGGCAGACCATCCACATTGTTGGTGGAACAGCAGTCATTGCTTTGTTACAACCTGCACCAGAGACATATGAATTGTTTGATGATATAATCCTCCTCTCAGATGGTCAGGTCGTCTACAATGGTCCTCGTGAACATGTGCTAGAATTCTTTGAATCAGTGGGCTTCAAATGTCCTGAGAGAAAAGGCGTAGCAGACTTCTTGCAGGAAGTTACTTCAAGGAAAGATCAGCGGCAATACTGGATGCATGGTGATGAGACATACCGATATGTTCCTGTTAAGGAGTTTGCAGAGGCATTTCAGTCTTTCCATGTTGGTCAGGCAATAAGAAGTGAGTTGGCAATCCCATTTGACAAGAGCAGGAGCCACCCTGCTGCCCTGAAAACATCAAAATATGGTGCTAGCATGAAAGAACTGCTTAAAGCGAACATTGACAGAGAGATATTGCTCATGAAAAGGAACTCCTTTGTGTATATATTCAAGGCAACTCAGTTAACACTCATGACATTCATTGCGATGACTGTCTTTATCCGCACCAATATGCATCATGACTCAATAACAAATGGGGGAATATACATGGGCGCACTCTTCTTTGGGATCCTGATGATCATGTTCAACGGATTGGCAGAAGTTGGTCTAACTATTGCAAAGCTCCCTGTTTTCTTCAAGCAAAGGGATCTCCTCTTCTATCCAGCATGGACATACTCCTTACCATCATGGATCATTAAGACTCCACTCTCCTTGCTCAATGTAACAATATGGGTCTTCATAACATATTATGTCATTGGATTTGATCCCAATGTAGAGAGGCTTTTTAGACAGTTCCTGCTGCTTTTAGTAATGAATGAGACATCATCTGGACTGTTTCGCTTCATTGCTGGGTTTGCAAGGCATCAGGTTGTTGCAAGCACTATGGGTTCATTCTGTATACTCATTTTTATGCTTTTGGGAGGATTTATCCTGTCAAGAGAGAACGTGAAGAAATGGTGGATATGGGGATACTGGATATCACCCCTGATGTATGCACAAAATGCCATATCAGTAAACGAATTTCTAGGTCACAGCTGGAACAAGACAATACCCGGTTTCAGGGAGCCACTTGGAAAACTAGTTCTTGAATCCCGTGGAGTTTTCCCTGAGGCCAAATGGTATTGGATTGGTGTTGGTGCATTGCTCGGATACGTCCTGCTATTCAATATCCTCTACACAATCTGCCTCACATTCCTCAATCCATTTGACAGCAATCAGCCAACAATATCTGAGGAGACGTTGAAGATAAAGCAAGCTAATCTGACCGGTGATGTTATAGAAGCATCCTCGAGAGGACGAATTACCACCAACACAAACACTGCGGATGATAGTAATGATGAAGCAATTTCCAACCATGCAACAGTGAATTCTAGTCCAGGCAAGAAAGGAATGGTTCTCCCTTTTGTACCTCTCTCCATCACGTTTGAAGATATAAGATACAGTGTTGACATGCCAGAGGTAATTAAAGCACAAGGTGTGACAGAGAGCCGGTTGGAGCTATTGAAGGGCATCAGTGGTTCATTTAGGCCAGGAGTACTTACAGCTCTTATGGGTGTCAGTGGTGCTGGAAAAACAACATTGATGGATGTGTTGGCTGGGAGGAAGACCAGTGGATACATAGAGGGTAACATTACCATCTCTGGCTATCCAAAGAAGCAAGAAACTTTTGCTCGTGTATCAGGATACTGTGAGCAGAATGACATCCATTCACCAAATGTTACTGTCTACGAGTCTCTTGCATTCTCTGCATGGCTCCGATTGCCTGCGGAAATTGATTCTGCAACAAGAAAGATGTTTATTGATGAGGTCATGGAACTTGTGGAGCTTTCCCCCTTAAGAGACTCCTTGGTTGGATTGCCTGGCGTTAGTGGATTATCAACAGAACAAAGGAAAAGGCTAACAATAGCAGTGGAGCTAGTTGCTAACCCATCTATCATATTCATGGATGAACCAACATCTGGACTTGATGCACGAGCAGCAGCCATTGTCATGAGGGCAATAAGAAATACTGTGGACACAGGAAGAACAGTTGTTTGCACAATTCACCAACCAAGCATTGACATATTTGAATCTTTTGATGAGCTATTCCTGATGAAACGAGGAGGTGAGGAGATTTATGTAGGTCCAGTAGGTCAGCACTCGTGTGAATTGATCAGATATTTTGAGTCTATTGAAGGTGTCAGCAAAATAAAACATGGCTACAATCCATCAACATGGATGCTGGAAGTGACTAGTACTGTACAGGAACAGATAACTGGGGTTAACTTCAGTGAAATATACAAGAATTCTGAACTGTACAGGAGGAATAAAAGTATGATAAAGGAGCTAAGCTCACCTCCTGATGGTTCAAGTGACCTATCCTTTCCAACAGAATACTCTCAAACTTTCATCACACAATGTTTGGCTTGCCTATGGAAGCAAAGTCTGTCCTACTGGAGAAACCCTCCATATACTGCTGTCAAATACTTCTACACCATTGTAATTGCACTGTTGTTTGGAACAATGTTCTGGGGTGTTGGCAGAAAAAGGAGCAATCAACAGGACTTGTTCAATGCCATGGGCTCCATGTATGCGTCAGTTTTATTTATGGGAGTGCAGAATTCTTCTTCCGTTCAGCCAGTTGTGTCTGTTGAACGCACTGTGTTCTACAGGGAACGAGCAGCTCACATGTATTCACCTTTGCCATACGCCTTGGGACAGGTTGCAATTGAACTTCCATACATCCTTGTTCAGTCCTTAATATATGGTGTTCTAGTGTATGCAATGATTGGATTTGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTTTGGTACCTGTTTTTCATGTATTTCACTTTATCATACTACACATTTTATGGCATGATGTCGGTGGGTCTGACTCCAAGCTATAACGTGGCCTCTGTTGTTTCCACTGCATTCTATGCCATATGGAACCTTTTCTCAGGATTTATAATACCAAGAACTCGAATTCCAATATGGTGGAGATGGTACTATTGGGTCTGCCCTGTTGCGTGGACACTCTACGGGTTGGTAACTTCACAGTTCGGGGATGTAACTGACACGTTTGATAATGGTGTCCGTATATCTGACTTTGTTGAGAGCTACTTTGGTTACCATCGTGACTTCTTGTGGGTGGTTGCCGTGATGGTGGTCTCATTTGCCGTCCTCTTCGCCTTCCTTTTCGGGCTCTCAATCAAGATATTCAACTTCCAGAAGAGATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDDAGEIHALGGSLRREASSARSGDAAVFFSRSSTSRDEDDEEALRWAALEKLPTYDRARTAVLAMPEGELREVNVQRLGPQERHALLQRLAWVGDDHARFLSKFKDRVDRVGIELPTIEVRYENLNVEAEAYVGSRGLPTILNTYANVLEGLANTLHITPNRKQKISILHNVSGIIKPHRMTLLLGPPGAGKTTLLLALAGNVPSGLKVSGQITYNGHTMDEFEPRRSAAYVSQHDLHMGELTVRETVNFSAKCQGIGHRYDLLMELSRREKEENIKPDPEVDIYLKAAATGEQKAEVVTNHILKVLGLDICADTIVGNNMLRGISGGQKKRVTTAEMIVTPGRALFMDEISTGLDSSTTYNIVDSIRQTIHIVGGTAVIALLQPAPETYELFDDIILLSDGQVVYNGPREHVLEFFESVGFKCPERKGVADFLQEVTSRKDQRQYWMHGDETYRYVPVKEFAEAFQSFHVGQAIRSELAIPFDKSRSHPAALKTSKYGASMKELLKANIDREILLMKRNSFVYIFKATQLTLMTFIAMTVFIRTNMHHDSITNGGIYMGALFFGILMIMFNGLAEVGLTIAKLPVFFKQRDLLFYPAWTYSLPSWIIKTPLSLLNVTIWVFITYYVIGFDPNVERLFRQFLLLLVMNETSSGLFRFIAGFARHQVVASTMGSFCILIFMLLGGFILSRENVKKWWIWGYWISPLMYAQNAISVNEFLGHSWNKTIPGFREPLGKLVLESRGVFPEAKWYWIGVGALLGYVLLFNILYTICLTFLNPFDSNQPTISEETLKIKQANLTGDVIEASSRGRITTNTNTADDSNDEAISNHATVNSSPGKKGMVLPFVPLSITFEDIRYSVDMPEVIKAQGVTESRLELLKGISGSFRPGVLTALMGVSGAGKTTLMDVLAGRKTSGYIEGNITISGYPKKQETFARVSGYCEQNDIHSPNVTVYESLAFSAWLRLPAEIDSATRKMFIDEVMELVELSPLRDSLVGLPGVSGLSTEQRKRLTIAVELVANPSIIFMDEPTSGLDARAAAIVMRAIRNTVDTGRTVVCTIHQPSIDIFESFDELFLMKRGGEEIYVGPVGQHSCELIRYFESIEGVSKIKHGYNPSTWMLEVTSTVQEQITGVNFSEIYKNSELYRRNKSMIKELSSPPDGSSDLSFPTEYSQTFITQCLACLWKQSLSYWRNPPYTAVKYFYTIVIALLFGTMFWGVGRKRSNQQDLFNAMGSMYASVLFMGVQNSSSVQPVVSVERTVFYRERAAHMYSPLPYALGQVAIELPYILVQSLIYGVLVYAMIGFEWTAAKFFWYLFFMYFTLSYYTFYGMMSVGLTPSYNVASVVSTAFYAIWNLFSGFIIPRTRIPIWWRWYYWVCPVAWTLYGLVTSQFGDVTDTFDNGVRISDFVESYFGYHRDFLWVVAVMVVSFAVLFAFLFGLSIKIFNFQKR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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