BGIOSGA030026

From RiceWiki
Revision as of 09:35, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA030026| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030026, complete gene.| tag = OsJ_287...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA030026

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030026, complete gene.

LocusTag

OsJ_28786

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030026-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030026-PA

Length

8010

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:7149332..7157341

Sequence Coding Region

7157303..7157341,7156940..7156999),complement(7156683..7156807,7155831..7155895),complement(7154408..7154460
,7153728..7153787),complement(7153606..7153652,7153400..7153536),complement(7152713..7152839
,7152543..7152591),complement(7150482..7150565,7150321..7150400),complement(7149588..7149677
,7149332..7149455

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:7149332..7157341 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:7149332..7157341 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTCTTCCACGGTTGAGATGACCCCAAGCTTCTTAGAGCCAAAATTTCTGGAGGATGACAGTTGCTTGACATTTTGCTCTCAGAAGGTTGATGCTACTGGTTCATTTCAACTGCAAGTTAGCATATCTGCTCAAGAGGCTGGTGCAAAAGACATGTCCGAGTCTCCTTATAGTGTTTATTCATATAATGATGTGCCACCTTCGTCATTGACACATATTATAAGGTTGAGATCTGGCAATGTGCTTTTTAACTACAAATACTACAATAATACTATGCAAAAAACCGAAGTCACTGAAGATTTTTCTTGCCCATTTTGCTTGGTACCATGTGGCAGCTTTAAGATATCTGAAGAGTGCCAGGCTGTTAATGTTAGTCTGAAGACTGATTCTTGGAGAACAGAGCTTTTGGCTGAGGGAGTTGATCCAAGACATCAAACATTTTCGTACCGCTCAAGATTTAAGAAGCGTAAAAGGGTGGAAATCTCAAGTGATAAAATTAGGCATGTACATCCACATATTGTGGATTCAGGATCACCTGAAGATGCCCAGGCAGGATCTGAAGACGATTACGTGCAGAGGGAAAATGGTAGTTCTGTAGCACACGCTTCTGTTGATCCTGCTAATTCATTACACGGTAGCAATCTTTCAGCACCAACAGTGTTACAGTTTGGGAAGACAAGAAAGCTGTCTGTTGAACGAGCTGATCCCAGAAATCGGCAGCTCCTACAAAAACGCCAGTTCTTTCATTCTCACAGGGCTCAACCAATGGCATTGGAGCAAGTTTTCTCAGATCGTGATAGTGAAGATGAAGTTGATGATGACATTGCTGATTTTGAAGATAGAAGAATGCTTGATGATTTTGTTGATGTTACAAAAGACGAGAAACTTATTATGCATATGTGGAATTCATTTGTTCGGAAACAAAGGGTACTAGCGGATGGCCATATTCCCTGGGCATGCGAAGCATTCTCGCAGTTTCATGGACAAGAACTTGTACAAAATCCAGCTCTACTATGGTGTTGGAGGTTTTTTATGGTCAAACTCTGGAACCACAGTCTACTGGATGCGCGAGCCATGAATGCCTGCAACACAATTCTTGAAGGCTACCTGAACGGAAGCTCGGATCCAAAGAAAAATTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSSTVEMTPSFLEPKFLEDDSCLTFCSQKVDATGSFQLQVSISAQEAGAKDMSESPYSVYSYNDVPPSSLTHIIRLRSGNVLFNYKYYNNTMQKTEVTEDFSCPFCLVPCGSFKISEECQAVNVSLKTDSWRTELLAEGVDPRHQTFSYRSRFKKRKRVEISSDKIRHVHPHIVDSGSPEDAQAGSEDDYVQRENGSSVAHASVDPANSLHGSNLSAPTVLQFGKTRKLSVERADPRNRQLLQKRQFFHSHRAQPMALEQVFSDRDSEDEVDDDIADFEDRRMLDDFVDVTKDEKLIMHMWNSFVRKQRVLADGHIPWACEAFSQFHGQELVQNPALLWCWRFFMVKLWNHSLLDARAMNACNTILEGYLNGSSDPKKN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..39#343..402#535..659#1447..1511#2882..2934#3555..3614#3690..3736#3806..3942#4503..4629#4751..4799#6777..6860#6942..7021#7665..7754#7887..8010#ATGTCTTCCACGGTTGAGATGACCCCAAGCTTCTTAGAGGTATGGCCGACTTTTCCTAGTATTAAGCTCAGCTGTTCTTAAAGTATGTACCATAACTTATCCATAGTATTTAAGAAAAGTATACATGAACCACCACCATTTGCATCATATGAAACTTGCTTTTGGGAAAATAGAACACCTTAATCTGTATATTTTTGCACATCATATTCCAAAAGTACAGTTGGTAAAATCCCAAATCAAACAATTAAGTTAGCATGAAATAACCAGTGCAATTTGGGTTCTATACTTCAGCTATTTACAGAAATTGTTCTGCACATCATATTCCTTTTGTTATGCATGCAGCCAAAATTTCTGGAGGATGACAGTTGCTTGACATTTTGCTCTCAGAAGGTTGATGCTACTGTAAGGCCCTTCATGTCTCTTCCTGTATTGTTTATTAATAAAATCATTTCCATCAAAAAAATTATATGGGTCAGACAATAGCGAGTTTATACACCACCGCTTTTCTGATATTGTTGAGTTTTACTATTGCAGGGTTCATTTCAACTGCAAGTTAGCATATCTGCTCAAGAGGCTGGTGCAAAAGACATGTCCGAGTCTCCTTATAGTGTTTATTCATATAATGATGTGCCACCTTCGTCATTGACACATATTATAAGGTAGCAATCATGAGTTGATAGTTCAATCCTGCAGTTTATTGTGTTTGGGACTTTGGTGCCTCAATCTTCCTGTGTGCTTTATTTGTTTCCATCTTCTAGTTTACATGAGAGAAATTCTATGTTTTGTCATTGATAAGTGATCGCTTCAACAAATTGGCATCAACGAATGTGAGTTCTACAAAATTCCATCGTGCAAGTGGTTCTTCTTTCCTTTTTGCTATCACCATCAGCTGACCTTTGTTTACCCCATGCGAAAAGTCTATTTTTACCCCTAGAATATATGAAATGCTTCTTAGGATGATAGTGCACTTCTAAGGGTAAAATAGACTTTTTCCATAGGGATTAACGGAGGTCAACTGACTGTGATGGCAAAAGAAAAGGCAAAAAAACCGCTTTTGAGATGGCATTTCATAGAACTGATCACTTGACACGACCTTGCATACATGATTCTCCACATAATGTTTATGTTGCAATGAGGCTTCTATTTTCTCTTTAAAATTCAGTACAAAAAGATATGCTGGTCACCTTGAATGTCTCGGTATGTTTGACCAACATATGCATCTGGACAGAAAGCTGGGCTTTTACTATAGCCGAGGGGAATATAATGGGATTTTTCCAAAATAATATTGCACATATACTTGTCTAGCGCTGGGAACCTGGCCTTTTGGCTATTGAATATTGGAGCCTGTTGAAGTCAGCCTAGCCAAGCCTGTCCAGGGAGTTTGGATTACTTTAGTGAAGAAAATGTGTTTGCATTTGATTAATATTTTCTGTTCTGTTTTCACAGGTTGAGATCTGGCAATGTGCTTTTTAACTACAAATACTACAATAATACTATGCAAAAAACCGAAGGTAACCCCCCCCCCTCCCGGCGCGTTTTTTTCTCTCTTTCATCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTGTAGTTGAATTTCCTTTCATTCTATGTTGTTGCTTTTTGCACCCATCTGTTGCTATTTGTTTTTAGCTTTGCAATTAGTAATGTCTAATTCGTCTGATGTACAAACGACCAAAGTTCTGGAATGCTCACCAGGAAATTATTGATTTCACAATTTGTCTCAGCATATGCCTAGTGCAATGTACAGGAGCCAGTTTTGCCAAAAACAAGCTCTAAGAGCTGAAAATATGCTTACCTTATTAAGTTATTATAATGGTTTTGATGCTGTAACATGCTTTGAGACAATAAATAATGTGTTACACGTACAGAAGACAAAACAAAAAAAAAAAGCCTTTGTATAAGTTCGAACAATAGAATAGTGTATTGATGAATACGGAATTCAATGGGTTTTCTTTTGGGGCAGAAGTCATGGACGTTTTTTAATAGAAACATTATGAAACATGTGAAATATTTCCCAGGATGTAAGGGGAGAGCAAAGAATGTTTGGCCCTGTTGTGAATCAGAACTTTTCCTGATTCCTGTGGGATTGGACTGTTTCCTTTGGAATTCTTTTATTCTAGACGAGCCAAAATATATGACAGTTGGTGTGATATACATGTATGTGTTCTAAACAAGCCACAAAACAATTGATGAACCTGTCAATCATTATCTCCATTAGTCTCATGTTTTGACAGGGTAGGGAGTCAAAAGTGAGCTAGGGTTGTATAGGCTGTGTTCTTTCCTCATGATTGGGAACACAACCCTCCAGCACGGAAAACGGAGCAGACCATTAGCATGTGGTTAATTATGTATTAGCTAATTTTTTTAAAAAAGATGGATCAATATGATTTTTTTTAAACAACTTTTGTATAGAAACTTTTTGCAAAAAATACACCGTTTAGCAGTTTGAAAAGCGTGCGCGCGGAAAACGAGAGAGAGGGGTTGGGAACCCTGGGGAACGAACAGAGCCATAGATGGTCTCATGCTATTGCGGCCCACTACGTTGAATAGCAGCCCGCTATTGTGTCCGCTAAGTCAAATAGCGGCCGTTAAGTTCCAGTCTGCTATGTCCAGTCCGCTACTCGTAGTGGTAGCAGTAGGGGGCCGCTATGAATGCTTATTACCTTGGTTAGCCCATCATTTTGACTGCTAGCTGTGGCAAAGCTGAGTTAGATACCTTGCAAACATTCTGTTCGGTTTTGAATTAATGTGTGGCATTTGTTATTGGAGATAATACTCTTAATGGGTTCTTGATTCTTTGCTCTTTGTGTTGACTTTTCTGATATTTGTTCTTTGATGACTTCTTTCCAGTCACTGAAGATTTTTCTTGCCCATTTTGCTTGGTACCATGTGGCAGCTTTAAGGTAAAAGTCTTGGCACAAATTTTCTTCTGTCTGAGTTGATTCAGATGTCACTAACTACTGCTAACAGTTGGTCCCAAGGTTCATCTCACCTGATATATTTATGGTACTCCCAACATCAAGCACTTCTGGAGTTTTTTACGGGGATTAAGGATAGGTGAAATTAAATAAGGGATTGTTGTAATTGGTTGAGATGAGGAAGTAGGTGGAGAAATTAAATGAGATGGTTGTGATTGGTTGAGATTATGAAGTAGGTGAAGTAGCTATATTTTGAGACAAATTGAACGCTAGAAGTAGCTATATTTTGGGACTGAGGGAGTAACACCTAGTATTATTTTGTTATTTCATTTGTCATCATTGCATCGTTGCTTATTCCAAACCCAGTGAGTAAATTATGTCCATGTGCTTTTTTATCCTCTTTCTGCAGACTTGCATTTCACTTATTATCAAGTCATATCTAATGTCGTGATTTTTGTTATACTAGGGTCTAGGATGTCACCTAAACGCATCGCATGACCTTTTCCATTATGAGTTTTGGGTTGGTAAACTTCTGGAATCTCCATTGCAAGATCTTATTGCTCCTTCGCATAGGTCATTTAACCTTTCTTTTTATGTTTGCACAGATATCTGAAGAGTGCCAGGCTGTTAATGTTAGTCTGAAGACTGATTCTTGGAGAACAGAGGTAAATTAGTGGTATGAAACATCAAAACATTCCATTTTAATTGTCTAGATAATTCATAATACCAGTTATTTTCAGCTTTTGGCTGAGGGAGTTGATCCAAGACATCAAACATTTTCGTACCGGTATGCTTTCTTTATATATTTTGACAATGCTTCATTCTCTGTTTGATTTTCCTCACTGTTTTCCATCAGCTCAAGATTTAAGAAGCGTAAAAGGGTGGAAATCTCAAGTGATAAAATTAGGCATGTACATCCACATATTGTGGATTCAGGATCACCTGAAGATGCCCAGGCAGGATCTGAAGACGATTACGTGCAGAGGGAAAATGGTACTTTCTCACTTTATGGTTTCATACTGCCACACAACATTACATATGAATGGTGAAATAGTAAAGGCCCCGGTTTTTCCCCGTCTATAAGTGGACATCTGTTTGCTCTCTCCCTTCATTTGCTCCTATAGTTTATTAAACAGATTGACAGGCTGCACATCCTTTTAACATATATGTGCTATCTTCTTTTTTAGCTTCATCGGAAATTATCATATTCTGCAGATAAGCCTTTCTGAGTACTTGATGCACTGCATGCTAGGATTAGTCAAGTTCAAAATAGCTCTTGGGATGGACGGCTGAGTTCTTGCCACGTCTATTAGTCTGGTTGTTTCTTGATTTTCGCTTATCATTCCATATGGCACAAAATTGGACCCTACTTTATTCTAGAAACTGGCTGGTACCGGGGAGGATTTTGGCTACTTTTTGGCACTCTTGGGATTTTCCACAATTTTTTTGTGACTGAGAAAACTTTCATTGTTTCTGATTTTTATTATTCTGCCATGTTCCAGATCCAGCTCCCGATCTTCTTTTTCAACTTTGTTGATTGTCTTAAATTTCAGGTAGTTCTGTAGCACACGCTTCTGTTGATCCTGCTAATTCATTACACGGTAGCAATCTTTCAGCACCAACAGTGTTACAGTTTGGGAAGACAAGAAAGCTGTCTGTTGAACGAGCTGATCCCAGAAAGTAATCCTTTCTTTTGATGCTCTTGATACTGTGTTAGTCATACTAACATAAATGTTTCTTGAGATTTCTATTAGAACTAACTTATTATTTTTTTATTTTATTTGCTTATATTATTTTGCAGTCGGCAGCTCCTACAAAAACGCCAGTTCTTTCATTCTCACAGGGCTCAAGTGAGTGAATCGATACCTTTCATCTCTCTTCATCTATCTTCTGTCTGCATATATTTGTAGCAGAATCAGTGTTGTTACATTGGTTGACTTCACTGTATGATCTTTACTTGCCTTTACACTTGCATACATATACCTATTGGCAATTCCTGCACACACCTGAGATTTTACTGTATGCTCATTTTATTGTTTCTATACTTTTTTGAGGCACTTCCTGCACGCACTTGAGATTTTGTAACTACATTCACACTTTATTTAGGTGCCTGGTGCTGCTGAAGTTAGATATTTTCATATTTTATATGGACTACAAATGCATAACTGTTGCGCCTTTAATCTTAGTATTTGATTTCTATACTTTTTTAGAAGAGGTCTAAATTATAAAGTGTCTGAGTACTTGAGGTTTGTCTCCTTAAAAGAATGCTGGGAAGTAATGCGCTATTGCTCTGTTTCCTTTACTTCTAGATTCCCTCTTGAATTAAAATTTGATTATCTGGAAAGATATTGCAGAAAAACAAATAGATGAGTAACAGTTGGAGTTAATAAAGGGTTATATAGATGGTGAAATTTTCTATACGTCAATCAAAAGTTTCCTGCTATCACTCTGGATGGTCACGAGAGAAACATCAGAAAATGTCCTCCCTACTCTTCTGCATTTCTCATCTAAAAAACTAATCGATTTCTTACTACTACCTCCATTCCCAATTGATCATCATATTATAAGACCAAGACCAAGGAAAGCTAATAATTCTCTCATACTACATTTAATTCGGTAACAAACTTGCATGCACTATCCCCAATACTTCCTAGCCACTAACAAATCAAAACATTGCATGTTGGTTGTAAAGGATTGTATGCATGGACGCATGCACCAATGTCCATCTACTCCATGCACAGAATAACGAACAGACTTAGTGAATGAATACTGATATGATGATCATTTGGGAATAACCTTAAAAAAGTTATATGATGATCAGTTGGGAAATTGGAGGGAGTAGTAAGTTACGTAACCAAGAATAACCAGGGTTTTTGGACTAGTTACTGGGTCAACAAAATAGAAATAGAGAAAAAGGATGAACTGTAGGAAAGGATCAGAACTGACTAAGTGCCAAATCAAGCTTGCCGATGACTAAGGCATCAGGGACCTGGCTGCCAGAAAAAGAATCCATGGTCTGGGAAATGTTTTCCCTTTGAAATATAGCATTGCCAACTTGTATCACCCTCCCATGGCTTACTGCCACTGTTGTACTCAGTGGGATCTTTCCCTCCCTCCCAGTCATGTCACTTGGCATAGGGCTGGCATGACCATCTTCCCCAAGTCTGGCTGAACACCTGATTCACATTTCACTCCATTTTGGTGAGGTTTCACCCGAGACTTCCCATGTTTGAGGATCAAGTCAACACAGATATCACACGTTGCCGTTGACACAGCAATCACTGGTTTGAACCACTGCTATCCCAAGGGGTGAGCATGGCAGCATCTTAGCCCAAGTAACCCCAGCAACGTTATGCTGTAGAAGAGCTCAATCCTGTGGATATGGCAGTAACATGGATGCTCATCATGAGTCCATGCGGGTAGCTCAGCCTTGGTTATAGCCACCATGTGGATCTAGTGCATGAGGCAAATTTTAGTTGTGGGGGCCCCCATGGCGACAGGAAAACAATGAATTAAGGATAATGGAGGAATAAGAAACAGGGGTGATTTGGTCCAAAATTATTCACAATGGCATATTTCACATTCACTGGCATATATATATTATCAAACTTTGCAGTAACAGATTTCAAAACCAGCCACTTTGGAAACGCATGCATATCTAGCTAATCTTATGTGGAGAATCTATGGTTGGATGGCCAAACTTGAGCCCCTCTTCCCCTTTTGTCATTTTTTTTTTAATTATGAAGACATGATCTTTTTGCATCCGTTTGAAGTCTAGCTCAAATAAAATTGAAATCTAGCTTGACTACATAGTTACACTGTTGTAGCCAATGGCATTGGAGCAAGTTTTCTCAGATCGTGATAGTGAAGATGAAGTTGATGATGACATTGCTGATTTTGAAGATAGAAGAGTAAGTTTACTATGCTTGCTCTGTTCTCATACATAAATGTGTCCAAATTCTTGATACCTTAACTTCCCTGAGTAAATGCAGATGCTTGATGATTTTGTTGATGTTACAAAAGACGAGAAACTTATTATGCATATGTGGAATTCATTTGTTCGGAAACAAAGGTCAGGCCTTCCCCGCTATATCCATTATCTATTATTGTGGTATACAGCTTGGTGAACAGACATTTATATTCATTTGCATACCATGTCTGAAACTATCATGAAGGATTTCTTCCATGAAGATGTTGCATGTTATTTTTTTTTAAGAATTGCATGGGTTAAGAGCCATGAATTACAACTTGTAATGTGCCAGGTGTTATGGCTCTGATTGTTATTTTCTTAGGACGGAAAAACTAATACTAGTAATGCCTTCTTCCTCCTTGCTGCTAACCTTTACTAAGATGCCATGATTGTCAGCACCTCTGTTTCTCGCACCTTTGCCGATGCCACCAACACTACTCCCAGTCGCATTTGGGCATCCTAAGCGCACATATATCACCATGCTGTTGTTGCCTGTGGCGTACGTAATCAACCATACATTGTCGTGGGCTAGCACCCCTCATCTACATTGAATCCCACCTCTATCTCTACCAACTATATGCCCAAAGGATTGTTTTTACTTTTTTTTCTTCTTTTTTCCATACCAAGAGTTAAGCAGTGACATCAGAACTGCAAGGGCACTTGATTCCTTTTACATATGTGCAGTCATTTTATTCATTATCTACTGCATATTTCAACCGTCTTACTGAAAAGTGGAAAATTGCAGGGTACTAGCGGATGGCCATATTCCCTGGGCATGCGAAGCATTCTCGCAGTTTCATGGACAAGAACTTGTACAAAATCCAGCTCTACTATGGTAAGTGGCTGATTATAAGAATATAGTATTGATCAATGCCTTGCCTTGCGTGTGTAGCTTGTTGCCTACAGATGCAGACACCTCTCTTTAGCTGTTTGTTTCATTTGCAATTTTTTATCGCTGGATGAACAGGTGTTGGAGGTTTTTTATGGTCAAACTCTGGAACCACAGTCTACTGGATGCGCGAGCCATGAATGCCTGCAACACAATTCTTGAAGGCTACCTGAACGGAAGCTCGGATCCAAAGAAAAATTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030026