BGIOSGA031939
| Gene Name |
BGIOSGA031939 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-046-A06, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031939, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA031939-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA031939-PA |
| Length |
11481 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:12588968..12600448 |
| Sequence Coding Region |
12600218..12600448,12598836..12598901,12598508..12598569,12598299..12598380,12598089..12598199 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:12588968..12600448 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:12588968..12600448 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCTCGCGGATAAAGGAGATGGTGCGGGTCGCCACCGCGCGGCTCGGCGGGGAGCCGTCGCCGCGTGGGGGCGCGGGGAACTCCGCGTTCGGCCGCGGGGAGTCGTCGAGGACGGCGCGGCTCGGCGGCGGAGGGGCCAGCCTGAGGCGGCAGCCGCAGCCGCAGGCGCCGTCCGTGCGGACCATCTGCTGCAACGACCGCGAGGCCAACGCGCCCGTCGGGTACAAGGGAAATTCTGTGTCGACTACAAAGTATAACGTCCTGACTTTTCTACCTAAAGGGCTGTTTGAACAGTTCAGGCGGGTGGCAAATCTGTACTTTCTCATGATTTCTATATTGTCGACCACACCAATTAGTCCAGTTCATCCTGTCACCAATGTTGTTCCACTTAGTCTTGTGCTTTTGGTTTCTCTGATCAAGGAAGCTTTTGAGGACTGGAAACGTTTCCAGAATGACATGTCAATTAATAACGCACATGTCGATGTGTTACAAGGTCAAAAGTGGGAAACTACTCCATGGAAAAGACTACAAGTTGGAGATATTGTGAGGACAGCAAATCTTGATGGGGAAACCAACCTGAAAATAAGGAAGGCTTTGGAGAAAACCTGGGATTACAAAAATCCTGAAAAGGCTTTTGAATTCAAAGGTGAAATACAGTGTGAGCAGCCAAACAATTCACTGTATACATTTACTGGGAATCTTATTGTGGACAAGCAAACCATGCCACTCTCACCAAATCAAGTACTACTAAGAGGGTGTAGCCTTCGGAACACAGAGTACATTGTGGGGGTTGTTATATTCACAGGTCATGAGACAAAAGTTATGATGAATTCCATGAATGTTCCCTCCAAAAGAAGTACATTGGAAAAAAAGCTAGATAAACTTATCCTTGCTCTATTTGCAACCCTGTTCACAATGTGTGTTATTGGTGCTATTGGGAGTGGTGTGTTTATTAATGAGAAATATTTCTATCTTGGCTTGCGTGGAAAAGTGGAGGACCAGTTTAATCCTAAGAACAAATTTGTGGTCACCATTTTAACCATGTTTACTCTAATAACTCTATATTCAACAATCATCCCTATTTCTCTTTACGTGTCCATTGAGTGCACACAGTTCATTAACAATGATCTGCATATGTACCATGCTGAGAGCAACACCCCAGCTTTGGCCCGAACTTCTAATCTGAACGAGGAACTTGGGCAGAGATATATGGAACTGGCATCACAGAGATCGAAAAAGGTGGCAGCTGAGCGAGCTGGAATCAAGATTGACGGTGATGAGGGTAAAAGATCAGGTGCTGCAGTACACGAGAAAGGATTCAACTTTGATGATGCCAGAATCATGTGTGGTGCATGGAGAAATGAACCTAATCCTGAAGCTTGTAAGGAATTCTTCAGATGCCTTGCACTCTGCCATACGGTTCTTCCTGAGGGTGAGGAGACACCAGAAAAGATCAGTTATCAAGCTGCTTCTCCTGATGAGGCTGCACTTGTGGCTGCTTCAAAGAACTTTGGCTTCTTCTTTTATAGACGTACACCAACTACAGTCATTGTTCGTGAATCACATGTTGAGAGGATGGGGAGCATACAAGACGTTGCATATGAAATTCTGAATGTTCTAGAATTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTTCTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGACATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGTTTGCGCACACTTTGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATTCAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGTGATAAGAAGCTTGATGAGGCATGCATCTTTTGGTTATTTTATTTGTATACTGTGGCTGAGTTGATTGAAAAAGACCTTGTATTGATAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTTCCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGATAAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAACAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCAGTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGTGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAGTTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCGTAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCGCCTTCGACTCCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGTGCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..231#1548..1613#1880..1941#2069..2150#2250..2360#2711..2807#2950..3056#4629..4694#4785..4906#5692..5776#5850..5927#6019..6117#6615..6692#6769..6873#7016..7158#7281..7382#7462..7525#7609..7854#8226..8391#8526..8605#9222..9461#9871..10092#10166..10333#10409..10771#10868..10974#11181..11481#ATGGGCTCGCGGATAAAGGAGATGGTGCGGGTCGCCACCGCGCGGCTCGGCGGGGAGCCGTCGCCGCGTGGGGGCGCGGGGAACTCCGCGTTCGGCCGCGGGGAGTCGTCGAGGACGGCGCGGCTCGGCGGCGGAGGGGCCAGCCTGAGGCGGCAGCCGCAGCCGCAGGCGCCGTCCGTGCGGACCATCTGCTGCAACGACCGCGAGGCCAACGCGCCCGTCGGGTACAAGGTGAGCGCGCCCCCTCCTGGCGGTTTGATCGATCTGTTGAGAGTTTCGTTTGGAGGAGGAGGAGGTGGCTGGTCTAGGTCTAGATCTCGTTGCTTTTCGCGCGTTCCTTGCTAATATGTGGTTGTGCTGGAGATAGGTGGGTCAATGAGCTGTCACAGAAGTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTTCCCTGATGCTACATGGTTTTGCTTAGTTTTTCTGGACTGGATTTTGTTAGTCATTTGGGTTGCATTAATGGAGAACTATGAGGTCATTGGGCAGATTTGAGCTTATCTAGCTTTTGGAATTAGTAATTTAGGTAGCTATTGCTAAAAATGAGATGTAGACACCGCTCGGTTTCTAGGCTTGAGGAATTATAGTACAAGAGCTGAACGATGCTATTCATTCTTGCCCCAATATTCACCAGATGCATGCTGTGTCGGCTACTGAACCTGGATCAGTCCGACCACAACTAGCTCACCCTCACCACTTGATAGCACCAAGCTAAATTAAATTTAGTTTTTACTTGTAAGACAACCTTATGTTTCAAATAACAAGATTGTGGATCATGCCCTGATATTGTGAGTGCATTGATGCCAAAATGCCTTAATGGAAGGGTGTTTCAGGTGTTTCATGGTCATACCAGAAAGTTCTCAATTTATTCTCTTTCATTTGGTTGAATCCTATCGGTCAAAATGTTCCCTTTTCCTCCCTGCGAAACTGCTTTGACTATGTTGTACTCCCTCCAGGTTGAAAACAATTGTGTTTATGGACAAGACTGATGTCAAACTTTAAAAACTGACTATGAATAACTTCTATAAATTATTTTCTTTAGAAACATGGAAACCATATGTATAGATTGATCTTAAAATATATTTCAATAAAATCATATATTTGTTGATATTTCTACATATATTGTAATTGAAAGTAGTGATCAAAGTTTGTTTTTTGGAGACCGTGTCCTTGCCCAAAACGACAATTATTTTCAACCTGGAGGGAGTAAATTGGTGTATTCATGAATTTTCTTTTCACCACAGCTGTATTTGCCCCCTTGTTTCATGTGTTGTCTCTAAGGATTAAAATGCATCAACACCATTGCTATATTGCTAACGTGGTTGTAGTTTGTTTGACCATTTATGCAGTTCTCTTTTTAATTGATTTTGCAGTTTCCCGCATTTTGGGTATCAAACTGTCAATTATGCAAATGCTAATATCAGGACGCTACATAGTTTTGGTTGTTTTGCTGTTGAGGAATTACTGATATATTTTTCTCTTTTTCTATAACGTGGTTTTTTACATTGCCTGTTCTCATTTGCAGGGAAATTCTGTGTCGACTACAAAGTATAACGTCCTGACTTTTCTACCTAAAGGGCTGTTTGAACAGGTATTACAACATTGTTTCTTTGTCCATTACATATGTTGCCAATAGAGAAAATTTAGGTTTAATCTCCTTTTGTGATGAATCTAGGTATTGTTACGAGCATCATAACCATCCTTGTCAAATCAATAAACGTTTACCACAGTGGATGTTTCCCATGGCTAGATTGCTGCTTTGCAGTTATTGCTGTGACATCAACTTTTTGTTCCATAAAAAAAATAATATCAACATGTGAACCTTGTGTAGTTTATCTGTTTATTTTGCTTTGACAGTTCAGGCGGGTGGCAAATCTGTACTTTCTCATGATTTCTATATTGTCGACCACACCAATTAGGTATCTCTATCCGACACACCCCTGCACGCACCTGTGCTACTTTTGGAATCCACTGGTTTCATATTGACATGTTGAGCACAGCACTTATTCATTGGTTAATTCAGTCATCGCTGTTTTCTTTTTGCAGTCCAGTTCATCCTGTCACCAATGTTGTTCCACTTAGTCTTGTGCTTTTGGTTTCTCTGATCAAGGAAGCTTTTGAGGACTGGGTTAGTATTCCACCATTCCTCAATTCTCTATTTTGTTATGCTTTCTAAACTAAGATAACCGACAGCCTTACCTGTTTCTTTTTGCTGTTTCTTATACAGAAACGTTTCCAGAATGACATGTCAATTAATAACGCACATGTCGATGTGTTACAAGGTCAAAAGTGGGAAACTACTCCATGGAAAAGACTACAAGTTGGAGATATTGTGAGGGTAATGTCTTAAATCTTCCTTACAACTACTTTTTTACCCATCTGTTTGTTTACGGAATTATTGCGCATTACTTCTTATTGTGTGCGGACTTTAACTCTGGCCTCAAAAGTAAATAAGAAAAACTAATAGTGATGGCATTTCTTTAGAGCAGATCAAACAAGATGGTTATTTCCCTGCAGACTTGCTCTTCTTGTCAAGCACAAACCCAGATGGTGTCTGCTACATAGAGGTTCATACATTCGTTTTTACCTTTTCCGCTATTCTGCACATTTTCAAAGTGTAGTAAATAAGCTACAGAGATATCTTTCTCTAAACTGAAGTTCTGTTGAATATATTTTTGTTCATCTTAGACAGCAAATCTTGATGGGGAAACCAACCTGAAAATAAGGAAGGCTTTGGAGAAAACCTGGGATTACAAAAATCCTGAAAAGGCTTTTGAATTCAAAGGTTTGTGCATTTTTGTTCTGTGGCAAGGTGGTTGTAACTTATAGTTGCTGCTTTGTTGGTTTGGAAACTTTTTCCTTCAGTTTCTCTGGTTATTCTTCCTTGGTGCTGTTTTGTACTTGACTTCCATAAAATGGGTTTACAGGTGAAATACAGTGTGAGCAGCCAAACAATTCACTGTATACATTTACTGGGAATCTTATTGTGGACAAGCAAACCATGCCACTCTCACCAAATCAAGTACTACTAAGAGTATGTTTATTCTTGCCGTTTAGTTCATTTTTGTCTTTTTTTTGTCCATTATAAAATATTTTGACCTATGTTTTTTGTGTATTCCTAGATTTAGCATGACATGTTTTTTTCACACTCCAATGTATATAAAAAAAGAGTGTTATCACTTATCACGGGATTCATGAGCAGATACGTGTAACTTACTAACTTTGATTAACTCTTTTATATGAATGTTGGCCACACAAAATGATGTCAGTATATTTACCACAGAAACCTCTGATGATTATACTCTGTCCAGAAATATAAGGATACGTAGAGTTTGAAATTTGTCAAAGAATACAAGGACACCCACACCTACTTCGTTATCTCAGCCAATTATAACCATCCCTCACCTCAACCTTAATCTCTCCACAAAACACGGGAGTACAAGTTTTGCAAATAGGATAACTGTGGTGCAAACACTTTCAAGTACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGGGCCTGTTTGGCACAGCTCCAGCTCTAGCTCCACCCCTCCTGGAGCTGGAGCTCAGCCAAACAGTTTCAGTTCCACCAAAACTAGGAGTGGAGTTGGGTGGAGCTCTCTCATAAAATATGCTAGAGTTGTGGAGCTGGGTTTTGGCAGCTCCACAACTCCACTCCAGACTCAACTCCTGGAGTTATAGTTAGGAGTTGGAGCTGTACCAAACAGGCCCTAAGACTTTCTAGCATTGCCCACATACATATAGATGTTAATGAATCTAAACACATACATATGTCTAGATTCATTAGCATCTAAATGAATGTAGACAATGCTAGAAAGTCTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAATAAAATGTATTTCAACTTCCTTCATGCAAACAATTTTGCACTTCTCAAGTCCCAGCTATATGATGAGTTGTGGATGATGAACTTAGCGCATATAAAATGCATAAGAACGATCAGTAGGATTTGGCTTAATTTGTTGAATGTAGACATGTACTGGATATATTTCCACCTATGAACTATATAGCCACTGTTGCAAATACAACACTAATTGAAACTAATACTGTGAAAAACAAACAATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTAAAAAAACAATTGTGCACAGCCAGAGTTAGGTTTTCATTTTCCATGTTGGAGGGTGTGAAGTACTTCCTCCGCTTCATAATATAAGACTTTCTAGCATTGCCCACGTTCACATAGATGTCAATGAATCTAGACACATGTAAGTGTATAGATCCATTAACATCTATATGAATGTAAACAGTGCTAGAAAGTCTTACATTATGAAACGGAGGGAGTACTTTGTAGGCTTTACTTGCATGGGCTCTTTTGAGTTTCTTATTTACCTTTTATGTTCATTCAAGCACCACAAGGAAGTGTCTTGCATTGAATGGTTGGATTCTAAGATGGTTTCTAATTGCCTACATTCTAATAACCTCTCCTTCCCAATATGTTCACATCAGACTGAATATTATCTTATCTACTTGTCTCTCCTGCTGTCTGTGTGCACACGTGCGTGCTCGTACATGCGAAAGAAAGAAACCAAAACTTACTGTTGCCTTCTTGCCACAGGGGTGTAGCCTTCGGAACACAGAGTACATTGTGGGGGTTGTTATATTCACAGGTCATGAGACAAAAG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| External Link(s) |
