BGIOSGA033127

From RiceWiki
Revision as of 05:06, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA033127| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033127, complete gene.| tag = OsI_340...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA033127

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033127, complete gene.

LocusTag

OsI_34023

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA033127-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA033127-PA

Length

6626

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:16546670..16553295

Sequence Coding Region

16546670..16546822,16549259..16549370,16549802..16549901,16550813..16550918,16551061..16551151
,16551462..16551603,16551881..16552028,16552108..16552217,16552640..16552796
,16552948..16553073,16553155..16553295

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:16546670..16553295 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:16546670..16553295 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGTGGAGGCGGCGAGGAGGGACGCGGCCACGCTGGACCCGGAGCTGCTGCAGCTGCCGGAGCTCTCGCCTGGCGCGCTCCGGGAGAACCCCGCCCTTGCTGAGGCGCTCTACTCGCAGTGGCTCGCACTCCCCGAGACATCCAAGCTGGTGAACTCTTTGATTGAAGATGCAAAAGCTGGTGCTACATTGAATGTTACTGGGAGCTCTGCTAGCACAAATGCTGCTTCAAGTGGTTCTTTGCCATCAATGTTTCCGGCTGAATTTAGATCAGTCACAAAAGATATATGCAAACTTCCATCGTTCTTCTCCAGTGTTCTTTTCAAGAAGATCGATGCTGCAGGCTCTGGAACTGTCACAAGGGATGCGTTTGTTGATTACTGGATCAATGATAACAAGATTACAATGGACACAGCTAGCCAAATCTTTGAAATATTAAGAAAGCCGGATTACAATTATCTCACTCAGGAGGACTTTAAGCCTGTCTTAAAAGAACTTCTGGCAACTCACCCTGGATTAGAGTTCTTGCAAGGCACCCCTGAGTTTCAGGAGAGATATGCTGAGACTGTAATATACAGAATCTTTTATTCCATAAATAGAGCTGGAAATGGCCATCTTACCCTCAGAGAGCTAAAACGTGGGAATTTAATTGCTGCGATGCAGCAGCTGGATGAGGAAGAGGATATCAATAAAGTGTTGAGATACTTCTCATACGAGCACTTTTATGTGATATACTGCAAATTTTGGGAGTTGGACACAGATCATGATTTTTTGATTGATAAAGAGAACCTTATCAGATATGGAAATCATTCATTAACCTACCGAATCGTTGATAGAATCTTCTCACAGGTCCCAAGAAAATTCACAAGCATGACAGAAGGAAAGATGGGTTATGAAGATTTTGTTTACTTTATTTTGTCTGAGGAAGACAAATCATCCGAGCCTAGCCTTGAATACTGGTTTAAGTGTATTGACCTTGATGGAAATGGCATTTTAACCACCACTGAAATGCAATTTTTCTATGAGGAGCAATTGCACCGGATGGAGTGCATGGCACAAGAACCTGTGCTTTTTGAGGACATATTATGCCAGATGATTGATATGATTGGACCAGAGAACGAGTGCTACTTTACACTACGGGACTTAAAACGGTGTAAACTCTCAGGGAATATATTCAACATCCTATTCAATCTCAACAAATTTATGGCATTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGAACGTGAAAATCCAACTTTAACCGAGTGGGATCGGTTCGCACATAGAGAGTATATTAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCAAATGGAAGTGGTGATGTGTGGGATGAATCGCTTGAAGCTCCATTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEVEAARRDAATLDPELLQLPELSPGALRENPALAEALYSQWLALPETSKLVNSLIEDAKAGATLNVTGSSASTNAASSGSLPSMFPAEFRSVTKDICKLPSFFSSVLFKKIDAAGSGTVTRDAFVDYWINDNKITMDTASQIFEILRKPDYNYLTQEDFKPVLKELLATHPGLEFLQGTPEFQERYAETVIYRIFYSINRAGNGHLTLRELKRGNLIAAMQQLDEEEDINKVLRYFSYEHFYVIYCKFWELDTDHDFLIDKENLIRYGNHSLTYRIVDRIFSQVPRKFTSMTEGKMGYEDFVYFILSEEDKSSEPSLEYWFKCIDLDGNGILTTTEMQFFYEEQLHRMECMAQEPVLFEDILCQMIDMIGPENECYFTLRDLKRCKLSGNIFNILFNLNKFMAFETRDPFLIRQERENPTLTEWDRFAHREYIRLSMEEDGEDASNGSGDVWDESLEAPF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..153#2590..2701#3133..3232#4144..4249#4392..4482#4793..4934#5212..5359#5439..5548#5971..6127#6279..6404#6486..6626#ATGGAGGTGGAGGCGGCGAGGAGGGACGCGGCCACGCTGGACCCGGAGCTGCTGCAGCTGCCGGAGCTCTCGCCTGGCGCGCTCCGGGAGAACCCCGCCCTTGCTGAGGCGCTCTACTCGCAGTGGCTCGCACTCCCCGAGACATCCAAGCTGGTAGCGGCCTCATGCCCCCTCACTCCTCCCCCCATCTCGTTGCTGGTCTGTTGCTTTGGATTTCGTTCGTAGATTGGCGTGGCTCGTGCGTGGATTTTTGCGTGGCCTGTGTGATCTCGTGCTGGAACTCGTGAGAGGTGTCGTTTGGAGTGCTTCGCTTGGTGCCTCTTCTCTTTTTCTTTTTCGTCTGTAGTGGTTTAGACTGTCGTGATCGTATTATGCTTGCGAGCATGAGTTGGGGATGCAGTATACCGGGGGTTTTGGTAGATCAAACGGCTTGGTTCGGTGAATTTTATCTAGTAATTATATAAGTTGCTTGCCCTGTAGGCTGTAGCTCGTTTAGATGGTCCGGATTATCCTTGTTTCCATATAACCTTGCATGTTTGTGATCTCCTGTTTGGAACCTGCCAAGATGCAGTTAGGTGGCATGAATACTGAAAGTTTTACTTTGCTTGTTTCTTAATTGCTGTAGCGTGAGGTCTTGACCAGTACGGAATATGTAGTTTAGTGACTTCGCAAGTCGAAAACTCGAAATGGCAGTTGGTAGCTAATTATTTGGTCTATCTATTGATTTAAGCCAAAAGAATCTTGGCACAAATCAAGATGATGTGTTAGTCCAGGAGTCGTACTATCTAGTTTTGGGTTGTTTGAACTTCGAACCAGCTCACTGTGGCCTTATGAGCTATCTTTGCTGTTGATAAATACGTGATAATCAAGGAGATGGTATGTTTCTGCGATAAGTGAGTGTTGTGTTGGTCTGCAGTTTAGCAGAATGTTGAATTCTAAGAAGCGTATGTACAGAGTTTCTTCATTGAGTTCGATTTTGCAGTTGTATGATCTGCTAAAAATACTAGCTTACACTATCTGTTTTTTCTTTCTTGGCGTACTTTGGATGGTACCTGTGATTGTAAGTTAGTATATTGTTTTCACCAATCAGTTTGCTTTTGCAGTAGTATGCTGTGTTAAAAAAAACTAGCTTAAACGATCAGTTTATTCTTTCTATAAGTTGTATATTGTTCCAAAAAAAAACTAGCTTACACTACCAGTTTCTTCTTTCTTGGTTTACTTTTAATGGTACCTATAAGCTGTAACTGTTATATCTTTGTTCGTTGCAATCTGTGTGTGCCTTGGTTGATGACTGATATGAATGCCCTGGATTTTTGAGTGAGAGGAGCTGTCATATCTATTGATTGGCTATCTTTTAGTGTCCCGTCGGTTGCTAAATTTATCTGCACTTGTATAGATATTTTGCCTTAATGATTTTTCAAGGGAACATATGCAACAACAGATTGTACAGGTCAAACCGTGTGATAATGACAATACATATATTTTACCTAACAGCATTTCCAGAAGTAAATGTTGTTGGCACATTGATTACCAGCAACTTACTCTGTTTTGAATTCTTAAATTCTATTTGCCCGCAAGATAAGTCCATGATAAAAAATGTGGATGTTCATTTGCAGATAGAACAGTGTTAGTAACATTGTTAAGAAGATGCATGGTAATGTGGCACCTTAGGAAAAATAACTCGTGTTGACAGTATCATGCATGATTGCAATCTGAGTAGGATTATCATTTATCAATGGCTCAATGTGTAGCCAGTTTATACCACTGTGGTATTACTGGTCTTTCCTAACTATGCTAATGTTTCTTCTTGTTTTGCTTCACTTTGTTATGTGGAATGGCTTCTTTCAAGTACTTTTTTTATGTTATCTTATATATGAGTCTCTTCCTTTTTGCACAGCTGTGCTTGGTATGTTTTCAATGTTCATGCCTGTACTATTCATAGTGTTACTGGGACAAGCGAGCTGGTTTTCTTTTTAACTGTATCTGACTAGGTACGGTACATATCTATGGGAGTCCAAGTTGCAGCTGATCCGTGCTACCATATATATATATTTCTACTGCTTTACCAACTATTTTGTGTTATTTGATAAAAATATATATAATAATTAAATTTAAAATTATATACATTAGACGAATCCTTGAATCCTTTTTCTTAAAGCTTGCTGAATGGGCAGTAGAATTTAAGTCGGATTTTGGCACCTATGTCACTGGTAACACAGAGTCATACACATTCTTAAGCAACGGACATCCATTTTTGAAGTACAATGTTTGGATTTCTTTGTGATTATTCATTATTAGCATTGTGCATAGCATAAAAATGGGTGGACATACTGAATTATTGATGAAGCTATGCATGAGGATGTCACAGGGACATGGAATTCTGAAATGTTGGATTCCAGGTTATACAAAACATAGTTTCATATGTTCATAGCAATATATTTCCATATTTTGGAAAGTAAAATTGTATCTGATTCTTTTGGTGAAGAATCATGATAATTTGTTTATTTAGAACACATGATTAATTTGTACAATGTGATTATGGGCAATGCATCATCCTTACAAAATTTATTGTTCATGCCTGGCTGCCAGGTGAACTCTTTGATTGAAGATGCAAAAGCTGGTGCTACATTGAATGTTACTGGGAGCTCTGCTAGCACAAATGCTGCTTCAAGTGGTTCTTTGCCATCAATGTTTCCGGCTGGTAGTGCTCCTCCCCTTTCTCCTAGAAGCACTTCTGGCTCCCCCCGTGTTATGAGGCGAGGATCTGGAGCTGGACCATCATCCTTGGGATCTCCACTAAAAGTAGTTAGTGAACCAGTGAGGGAGGTTATACCCCAGGTACTTCTTATCTATTTTTGCAGTTAGTATTATTGTTGCGTTATTTCTGTTTGTCATCATTCGACCATATATTTATTTCTAATACTTCTTTGCATGCTATATGTTTTCAGTTTTACTTCAAATATGGGCGCCCTGCTCCAAAGATTTGAAGGAGCAATGCTTATCTAGAATAGATCACCTCTTTTTTGCGGGGAGGACTCCAGATTCGAGTTGATTGCTTTGAGGATTTCATTTCTTGATTTTACGCATTAAAAATACATTTCTAAGTTTGAATATTATATTTCTCCATATCAGAATTTAGATCAGTCACAAAAGATATATGCAAACTTCCATCGTTCTTCTCCAGTGTTCTTTTCAAGAAGATCGATGCTGCAGGCTCTGGAACTGTCACAAGGTATATTGTTCATTTCAATATCTGTGTTGATGCAATATAATGGCATCATTGGCATGTGCTAGAAGTTTATGGACCTTAGCTGTTAATCTGTTATCATGTTTGGAAGACACGATCAATATTTTGTAGATGGACTGTTATGTTATAGCATAATTGTTCATTCCACAGGCTGTTCAAATTCTATACACTGCTTCATGGTGAAGCAATATCTGTGTTGATTTTGTTCTATTTATGTGGTTCTTTGTACTTGGAACTCAATCTGTTATACCTAGAAGTAAGGTATTCTTGGTTGGATCCTTCATTGCACAATTGGCTTTCTGAATCTGTTAGCTCGTGCTACTTTTCACTTGTCCTGGCTTTTGCCAGGAAATACAACATTCCAGACTATTTTAAGATATTATAAATACCAGTTTTGATAACCATCCTTATGTGTTATTCTATGGACATGATATTTGATCCTTCATTAGTAACTCTTAATTTTTATGCCACTAGAATGTGCTTTGGCACCATGTGTTTCTTATGTACCTCATTATATTTGCTTTGTAATTGTTTTTGTAACTGGACTAGATTATCATATACCCTTAGCTTTAACGGTTGAATTTATTGATAACTACACATGAAGTGTTTCATATGTATTATTAAACAAATTTTGAACAATTTCATTTGTTTTTCTGGCTCATGCAGTCTAGCGGTGTTATGATAACTAGAGTTCTGATGTAAAATATCCCAGTTCACAAGTTTATCTCAGCCCCACTGCGCTGTTGAAGTCCTGAAACTTGAATTTAAGTGTACTTCCCATACATGTAGATGATTCCCCTTTGATGCATGTAGATGATTCCCCTTTGATCTTCATACTAAAATCTAATGTTTTCAGATTTGACATGGGTAAAGTATGAATTTATTTATATATTCAGGGATGCGTTTGTTGATTACTGGATCAATGATAACAAGATTACAATGGACACAGCTAGCCAAATCTTTGAAATATTAAGAAAGCCGGATTACAATTATCTCACTCAGGTATGTAATTCTTGTGCTGGTTCTTTGTACCCTCACACCAGTATATTCGACTACAATTGGCAAAGATGTTCTTATATGTTGCTCATTTTCTTTGATGGGATCACTAGTTTGTAATTTCATTGATTTTGTGTAATTCCCACAGGAGGACTTTAAGCCTGTCTTAAAAGAACTTCTGGCAACTCACCCTGGATTAGAGTTCTTGCAAGGCACCCCTGAGTTTCAGGAGAGATATGGTACTTTCTGCCATCCAGTAGCAATGTTGTTGTGTATCTCTCGTTCATTTTGGTGACAATCAAAATACTGATTTTCTTCTCATATAGTGATGTATGACACTGAATTTTTTTAGTAGTGTATGGTGAATGTTGATATGTAAAAATATAAGCTTGTGTGTGTTCTAACTAGAGATTGCCATAGTAAAAAACAACTAGCTATTGATTATTTTATGAGGATTCTACGATTGGACCTGGTCAATGACTATTGGTAGTGATTTGCTGGATGCCTGCATCTCATTCATCTGCTAATCGTTTATTATGTAATTTTCAGCTGAGACTGTAATATACAGAATCTTTTATTCCATAAATAGAGCTGGAAATGGCCATCTTACCCTCAGAGAGCTAAAACGTGGGAATTTAATTGCTGCGATGCAGCAGCTGGATGAGGAAGAGGATATCAATAAAGTGTTGAGGTAATTAACATATTTGATTGTTAATGTATCTGCGATATCCATTCTTGCATGCATTTGCAATATATCTTAGCAGAATGGTGGCACTGATTATAATAATATTAATAATTGTGATTTAATTCCTTACATGTATTTTTGTTGTTACCTGTAACAATCTATTACTGGGTCCTGGGGATCCTCACGAATTACTTGGATTCAAGTTATATTATTTATGTGCGAATCAAACAAGATTTTTTACATTTTTTTTCCAAATGTGTTAATTTTCTGATGCCTAATGCAGATACTTCTCATACGAGCACTTTTATGTGATATACTGCAAATTTTGGGAGTTGGACACAGATCATGATTTTTTGATTGATAAAGAGAACCTTATCAGATATGGAAATCATTCATTAACCTACCGAATCGTTGATAGAATCTTCTCACAGGTTAGTATGTTCTATTCTGCATACAGAACTGAGATGCTGCCTTAGTTGGCCTAAATGTTGTTTCCTATATGTTACTTAGGTCCCAAGAAAATTCACAAGCATGACAGAAGGAAAGATGGGTTATGAAGATTTTGTTTACTTTATTTTGTCTGAGGAAGACAAATCATCCGAGCCTAGCCTTGAATACTGGTAAGTATGTTCTATTAGCGTAGATAATTGTCCTTGGTAGGCACTTAGTTTTTATCTTCTATATGCATTTGTATATTCTGTCTCACTTAGCTTGATTAAGCTATCACTATCACTGTTTAATTTCGAGTGCAAATGTGTGGTGGAACCAGCTATTGTCCTGTTTTATGTCCAGGCATTGAAGACTACAGTGAACTCAAAGATTTTTATTTTTACAGCTCACTTTGTTTTGCAGAATTTTAAGTAACAAACAAATTTCCAAATAAGATATTTTTGGATACAACTTATGCATCTACTTTTAACTGGTATGGGGCTAGCAAGGAGCTTGCCTATTGAGTTTTGCCTTACAGTGGCTTTAATATTGTAGTATATTTTACAACTAATTATGTTACTGTATTCATTGAACATATGAACCAATTTTACAGGTTTAAGTGTATTGACCTTGATGGAAATGGCATTTTAACCACCACTGAAATGCAATTTTTCTATGAGGAGCAATTGCACCGGATGGAGTGCATGGCACAAGAACCTGTGCTTTTTGAGGACATATTATGCCAGATGATTGATATGATTGGACCAGAGGTAGCATCTTGGACAGAATTATTGATGCATTTTAGGCCTGTTTGGAACAGTGGAATGTCAGCATGTTGAGGAATTGCACCATTTAATGCAAAATTCCTGTGTTCCAAACAAGTCCTTAAACTGAATTTGATAAATCTTTTCTTTTCCACAGAACGAGTGCTACTTTACACTACGGGACTTAAAACGGTGTAAACTCTCAGGGAATATATTCAACATCCTATTCAATCTCAACAAATTTATGGCATTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGTGATCACAACTTCTTGCCATAAAGCAGTGAATTCACTGTTAATCATCTAAATAACAAGTTGGATCATCTTTTTATTTCAGGAACGTGAAAATCCAACTTTAACCGAGTGGGATCGGTTCGCACATAGAGAGTATATTAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCAAATGGAAGTGGTGATGTGTGGGATGAATCGCTTGAAGCTCCATTTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA033127