BGIOSGA036832
| Gene Name |
BGIOSGA036832 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013081N02, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036832, complete gene. |
| LocusTag |
NPH1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036832-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036832-PA |
| Length |
14107 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:97224..111330 |
| Sequence Coding Region |
97224..97236,103166..103670,103743..103925,104026..104117,104235..104508 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:97224..111330 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:97224..111330 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTCCAAAGGCACAGAAGGAGGCCATGGTGGCGTGGAGAGAAAGGAGCAGCAGCAGCAGAGGGGTTACCAGCTGCCCCGTGACTCCCGGGGATCACTCGAGGTGTTCAACCCCTCATCCGCTTCCTCCTTCCGCACTGCTGCTGCCGCCCCCAAGTCCGCCTCCCCCTTCCTTGCTATTCCCGACAGGGAAGAGGATAATGTGGTGGCACAGCAGCGGGCAGCAGAGTGGGGCCTCGTCCTCCAGACCGACCACCACACAGGCCTCCCCCAGGGCGTCTCCGCACGACCCTCCTCTGGCTCTGCACGCACCAGCTCTGAGGACAACCCACAGCAACAGCAGAGCGCCGCCGCCATCCCACGGGTGTCGGAGGAGCTACGGGCGGCACTATCAGTGTTCCAACAGACGTTTGTGGTGTCTGATGCCACCCACCCCAACCACCCCATCATGTACGCCAGCGCTGGCTTCTTCAACATGACCGGCTATACCTCCAAGGAGGTTGTCGGCAGGAACTGCCGCTTCCTTCAAGGCTCTGGCACCGACCCCCATGAGATTGACAAGATCAGGCAATCCCTCGCAAATGGCTCCAACTATTGTGGCCGCATCCTCAACTACAAGAAGGACGGCACGCCATTCTGGAACCTCTTAACCATTGCCCCTATCAAGGATGAGGACGGCAGGCTCCTCAAGTTCATCGGGATGCAAGTGGAAGTTAGTAAATACACTGAAGGGAAAAAGGATACTGTTGTTCGTCCAAATGGACTTTCAGAATCACTCATCAAATACGATGCTCGACAGAAGGATCACGCCCGTAGCTCAGTGTCTGAGCTCTTGTTGGCTCTCAAAAATCCACGCTCATTGTCAGAATCAAGCAATAACACCTTAAAAAGAAAATCACAAGAATCCCTAAGCATGTCAATGAGCGAAGTTCCTAGTAAGAGAAGCTCTGAAAGTGGATCTCGCCGAAATTCTCGTAGCGGAACAAGGAGCTCGCTTCAGAAGATCAATGAAGTACCTGATCAAGTGAATAGAACTAGAAAATCTGGTCTGCGTGCATTTATGGGTTTTCTTGGTATGGGCCATGGAAGTGTAGAGAAGAACATGCTGAAACCTAGAGATGAAGATCCACTGATCGATAGTGATGATGAAAGACCTGAGAGCTTTGAAGATGAGTTTAGGAGGAAAGAAATGAGGAGGGGTATAGACTTGGCTACTACACTTGAACGTATTGAGAAGAATTTTGTCATCACAGATCCAAGGTTGCCTGATAATCCCATTATATTTGCATCCGATAGCTTTCTGCAATTGACAGAATACAACCGTGAAGAAATATTAGGGAGAAACTGCAGGTTTCTTCAAGGCCCTGAAACTGATCGTGCAACAGTTAGGAAGATAAGAGATGCCATAGATAACCAGGCAGAGGTCACAGTTCAGCTCATAAATTATACAAAAAGTGGTAAAAAGTTTTGGAACCTCTTTCACTTGCAACCAATGCGTGATCAAAAGGGTGATGTTCAGTACTTTATTGGGGTTCAATTGGATGGAACTGAGCATGTTCAGGATGATGCTGCAAAAGAGGGAGTCGTGCTGGTTAAGAAAACCGCAGATAATATCGATGAGGCTGCAAAGGAACTCCCGGATGCTAATTTGAGACCGAAAGATCTATGGGCTAACCACTCAAAAGTAGTCCTGCCAAATCCACATATGAAGGATACTGCATCATGGAGAGCCATCCAAAAGGTTCTCGAGAGTGGTGAAAGTATTGGTTTAAAACATTTTAGGCCAGTAAAACCATTAGGATCTGGTGACACTGGAAGTGTACACTTGGTAGAGTTGTTGAATACAGGAGAATACTTTGCCATGAAAGCTATGGATAAAAGCATCATGCTTAACCGCAATAAGGTTCACAGAGCTACTGCTGAACGCCAAATCCTTGATCTATTAGATCACCCATTCCTTCCAACATTATATGCATCATTTCAGACAAAAACGCATATATGCCTCATTACTGACTACTGCCCGGGTGGTGAGCTCTTTGTGCTTCTAGATAATCAACCTCTGAAGGTTCTACATGAAGATGCAGTCAGGTTCTATGCTGCCGAAGTGGTTGTTGCACTAGAATACCTACATTGCCAAGGTATAATATACCGAGACTTAAAACCAGAGAATATCTTACTTCATAGAGATGGGCACATCTCCCTTACAGACTTCGATTTGTCTTGTCTAACATCTTGCAGACCGCAGGTCTTTCTTCCCGAAAATGCTGATGAGAAAAAAGGGAGAAAAAACGGGAGTTACCCCATATTTTTTGCTGAACCTATGCGAGCATCCAATTCATTTGTTGGCACGGAGGAGTACATTGCGCCTGAGATTATTACAGGAGCTGGCCATACAAGCGCTGTTGATTGGTGGGCTCTAGGGATTCTTCTATATGAAATGTTGTATGGTTATACACCTTTTAGAGGAAAAACGAGGCAACGGACATTTGCTAATATCTTGCACAAGGATATCAGATTTCCTGCTAGTATATCGGTCAGCCTAGCGGCGAGGCAGCTAATGTATAGGTTGCTACATAGGGACCCTGCCAACAGGCTAGGGTCCTACGAGGGAGCCAATGAGATAAAAGGACATCCCTTTTTCCGTGGTATAAATTGGCCTCTTATACGCGCCATGGCGCCTCCAAAGTTGGAAATCCCACTATTTTCCAAGGATGACATGGAGAAGAAGGGACTAGTAACAAATAACCGCACGGATATGTTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASKGTEGGHGGVERKEQQQQRGYQLPRDSRGSLEVFNPSSASSFRTAAAAPKSASPFLAIPDREEDNVVAQQRAAEWGLVLQTDHHTGLPQGVSARPSSGSARTSSEDNPQQQQSAAAIPRVSEELRAALSVFQQTFVVSDATHPNHPIMYASAGFFNMTGYTSKEVVGRNCRFLQGSGTDPHEIDKIRQSLANGSNYCGRILNYKKDGTPFWNLLTIAPIKDEDGRLLKFIGMQVEVSKYTEGKKDTVVRPNGLSESLIKYDARQKDHARSSVSELLLALKNPRSLSESSNNTLKRKSQESLSMSMSEVPSKRSSESGSRRNSRSGTRSSLQKINEVPDQVNRTRKSGLRAFMGFLGMGHGSVEKNMLKPRDEDPLIDSDDERPESFEDEFRRKEMRRGIDLATTLERIEKNFVITDPRLPDNPIIFASDSFLQLTEYNREEILGRNCRFLQGPETDRATVRKIRDAIDNQAEVTVQLINYTKSGKKFWNLFHLQPMRDQKGDVQYFIGVQLDGTEHVQDDAAKEGVVLVKKTADNIDEAAKELPDANLRPKDLWANHSKVVLPNPHMKDTASWRAIQKVLESGESIGLKHFRPVKPLGSGDTGSVHLVELLNTGEYFAMKAMDKSIMLNRNKVHRATAERQILDLLDHPFLPTLYASFQTKTHICLITDYCPGGELFVLLDNQPLKVLHEDAVRFYAAEVVVALEYLHCQGIIYRDLKPENILLHRDGHISLTDFDLSCLTSCRPQVFLPENADEKKGRKNGSYPIFFAEPMRASNSFVGTEEYIAPEIITGAGHTSAVDWWALGILLYEMLYGYTPFRGKTRQRTFANILHKDIRFPASISVSLAARQLMYRLLHRDPANRLGSYEGANEIKGHPFFRGINWPLIRAMAPPKLEIPLFSKDDMEKKGLVTNNRTDMF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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