BGIOSGA036918

From RiceWiki
Revision as of 08:30, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA036918| Description = BGIOSGA036918| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036918, complete gene.| tag = | tid = BGIOSGA036918-TA|...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA036918

Description

BGIOSGA036918

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036918, complete gene.

LocusTag

'

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA036918-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA036918-PA

Length

2102

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:1436879..1438980

Sequence Coding Region

1436879..1437029,1437157..1437467,1437733..1438980

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:1436879..1438980 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:1436879..1438980 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCTGCCCTTCCACCAGGCTTCCGCTTCCACCCCACCGACGAGGAGCTCATCGTTCACTACCTCATGAACCAGGCCGCCTCCGTCAAGTGCCCCGTGCCAATCATCGCCGAGGTCAACATCTACAAGTGCAACCCATGGGACCTTCCTGGTAAGGCGCTGTTCGGCGAGAACGAATGGTACTTCTTCAGCCCGAGGGACCGCAAGTACCCCAACGGCGCACGCCCCAACCGCGCCGCCGGCTCGGGGTACTGGAAGGCCACCGGCACCGACAAGTCCATCTTGTCAACTCCGACGAGCGACAACATCGGCGTCAAGAAGGCCCTAGTCTTCTACAAGGGCAAGCCCCCCAAGGGCGTCAAGACCGACTGGATCATGCACGAGTATCGCCTCACAGGCACATCAGCTAACAACACCACCACCACCACAAAGCAGCGTAGAGCATCGTCCATGACCATGAGGCTGGACGACTGGGTGCTGTGCAGAATCCACAAGAAGAGCAACGACTTCAATTCCTCTGACCAACACGACCAAGAACCCGAGGGATCAACCGTCGATGAACAGCTTGAAGACATCCATGACAACAACTCTTCCTCTCAACAACCTCCTGCTCCACCTGACATGAACAACCAACAGTCAGATTTCCAGCCCATGACGGCGATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACGGAAAGACGGCGGCAGAGCACGTTGCTCAACGGAGTGGTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPALPPGFRFHPTDEELIVHYLMNQAASVKCPVPIIAEVNIYKCNPWDLPGKALFGENEWYFFSPRDRKYPNGARPNRAAGSGYWKATGTDKSILSTPTSDNIGVKKALVFYKGKPPKGVKTDWIMHEYRLTGTSANNTTTTTKQRRASSMTMRLDDWVLCRIHKKSNDFNSSDQHDQEPEGSTVDEQLEDIHDNNSSSQQPPAPPDMNNQQSDFQPMTAMXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNGKTAAEHVAQRSG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..151#279..589#855..2102#ATGCCTGCCCTTCCACCAGGCTTCCGCTTCCACCCCACCGACGAGGAGCTCATCGTTCACTACCTCATGAACCAGGCCGCCTCCGTCAAGTGCCCCGTGCCAATCATCGCCGAGGTCAACATCTACAAGTGCAACCCATGGGACCTTCCTGGTAACTAACTAACTAATCACCATACATATATAAACTATCCATGTATCAATTAAACTCGATCAAATTAATGCCTTCAAACTGACCAAATTTAACTTTGTGCTTTGAAAATGGATATGGGATGTTGCAGGTAAGGCGCTGTTCGGCGAGAACGAATGGTACTTCTTCAGCCCGAGGGACCGCAAGTACCCCAACGGCGCACGCCCCAACCGCGCCGCCGGCTCGGGGTACTGGAAGGCCACCGGCACCGACAAGTCCATCTTGTCAACTCCGACGAGCGACAACATCGGCGTCAAGAAGGCCCTAGTCTTCTACAAGGGCAAGCCCCCCAAGGGCGTCAAGACCGACTGGATCATGCACGAGTATCGCCTCACAGGCACATCAGCTAACAACACCACCACCACCACAAAGCAGCGTAGAGCATCGTCCATGACCATGAGGGTGAGATTCATTTAATTACTTAATTTTAGTTCATTATTAATTTGTTTTTCTCTTCGTCGTACGTCTTCTTTGAAAGCTACGTCGTTGTTTGAATTGGCATATTGAAGGAAGCAAACGTGCATGTTGCTCTTAGTTAACTCACTCTACAAAGTCAAATTTGTTGATGTTGATTGAGCTTGTGTTTTATTCTTTATTTTAAAAATAAATAAAGCAAGTTTGCACACTTCTAATTATTGTTTACTGCATTTGTGATATTGTTCATCAGCTGGACGACTGGGTGCTGTGCAGAATCCACAAGAAGAGCAACGACTTCAATTCCTCTGACCAACACGACCAAGAACCCGAGGGATCAACCGTCGATGAACAGCTTGAAGACATCCATGACAACAACTCTTCCTCTCAACAACCTCCTGCTCCACCTGACATGAACAACCAACAGTCAGATTTCCAGCCCATGACGGCGATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACGGAAAGACGGCGGCAGAGCACGTTGCTCAACGGAGTGGTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA036918