BGIOSGA037518
| Gene Name |
BGIOSGA037518 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037518, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0536200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA037518-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA037518-PA |
| Length |
4543 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:17011313..17015855 |
| Sequence Coding Region |
17011313..17011388,17011583..17011669,17011980..17012026,17012106..17012163,17012749..17012868 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:17011313..17015855 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTTTGCATGTCTGGACATTTTCAAATGGCTTCTGTGCTGAAACTTGTTATGATGGAAAGTCATGCAACACCAGATGACCTGACCAGTGATAAGGGTGCTGCACAGATCCTACACAGGCAACTTTTTGATGCACATCAACCAAATTTACTTGATGAAGATGATATGCATATATTTGGATCCAAACCTATGGCTGATCCATTGGACCTGGTCTGCTGTAATACTTGCAAGAAACCAATAAAGGCCAGCCAATATGCAGTTCATGCAGAGCGATGTAGTTCAGGGAAGGTAAACCCAAATGATTCAATGGGAACAGGTATAGATGATGATTGTGGTACCAAGAAGCCTCCAAAGAAGGGGAGAAAAATAAAGCTGACAAGTAATGGAAATCAAAAGGTACATATAAAATTGAAAGCAAAGTCTCAATCTGAAAACAAGAACATTGCCAATGGTTTTGAGTTGGACAATGTACTTGCCAACAAAGTACAACCTATAGGTTCCACCATTGATCAAAGGTTGAAATCATCTGCCAACAATCCAGCTCTCACCAGTGTACCTCAAGGTCACCATAGAGATGCCCCAGTTCCTCTTGCAACAAAAATGTACCACTCACAGGGAAACTACCGGCTTCGATTGGAACTCGGTCAGCTTTACCGCCAATCATGTTCAGAGCATTCAGGCAGCTATTCAATTCCGAACTCATCACAGGAGAATGGCTTGATGGTCTCGCATTTATCACCAAGAGATAATTCATCATTAAATGTTGCTCAGAAGAGCTTTGTTCCTCAAACAAAGTCTATGGACCAGCTTCTTGCGAGCACACCAGAATCATGCCCTGTAATCCCGCAGCAAGTAGCAGCAAGTGTGCCAAACAGACAAGCAACAAAATCTCAGAAAGCAGAGGTTCAAGTATCTGCAGTAAAAAACGAAATGGCAAGAAGCAGATGCAGCAAAGATGCTGTTCGGCATTCAAAAAACACAGGTAATAAGAAGGCCCATCAGCAAAGAAACGGAACGGTACCTGTGATTAAATCCTCAGTAGACTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVCMSGHFQMASVLKLVMMESHATPDDLTSDKGAAQILHRQLFDAHQPNLLDEDDMHIFGSKPMADPLDLVCCNTCKKPIKASQYAVHAERCSSGKVNPNDSMGTGIDDDCGTKKPPKKGRKIKLTSNGNQKVHIKLKAKSQSENKNIANGFELDNVLANKVQPIGSTIDQRLKSSANNPALTSVPQGHHRDAPVPLATKMYHSQGNYRLRLELGQLYRQSCSEHSGSYSIPNSSQENGLMVSHLSPRDNSSLNVAQKSFVPQTKSMDQLLASTPESCPVIPQQVAASVPNRQATKSQKAEVQVSAVKNEMARSRCSKDAVRHSKNTGNKKAHQQRNGTVPVIKSSVD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..76#271..357#668..714#794..851#1437..1556#1734..1859#2504..2563#3347..3567#3655..3841#4479..4543#ATGGTTTGCATGTCTGGACATTTTCAAATGGCTTCTGTGCTGAAACTTGTTATGATGGAAAGTCATGCAACACCAGGTAAACTATGACTAATGTTAGCTTCTTTTGTGCCTTCATTTTATTTATTCACAAAGTATAGCCAGCCTTCAAAGGACTCTAATACCTATAGCTACCAGAGCAAAACCATGCATTAAGTCTAATTTGGGTACAGTACACATAGTATACCTGCTGTGTATTCGAGATTGAACATATTTGTCCCTATTTTTTTGCAGATGACCTGACCAGTGATAAGGGTGCTGCACAGATCCTACACAGGCAACTTTTTGATGCACATCAACCAAATTTACTTGATGAAGATGGTGAGTATCCTCCTCTAAACCATGTATTGCAGTTATTTCCTCGATGACCCCCACTTGTCCATACCAAATGGCACTGTTTTACTAGATAGATTTTTTTATTGCTGTCAGCATTGTCCAGTATGTATTCATTTGTTTGGATGTGATTCCTCTGTTTCTTTAATTTGTTTCTAGGTATCATGTTTAGTATTCTCTATTTCTACTAATTGTGTTTGCTTTGTAAGGACGGTGCTATTATACCATATTATTGTTGTTAACTCTTACCTTTTGGTGTCACAACTTATCTTTTTAGTTATTCTATTATGTTGTGCAGATATGCATATATTTGGATCCAAACCTATGGCTGATCCATTGGACCTGGTATTTTTTTTATGATGTTCTGTGTGGGTCTCTATTTACATTTGTTTCATTCAAGTTGTGTTGACATCTTATATTTAAGGTCTGCTGTAATACTTGCAAGAAACCAATAAAGGCCAGCCAATATGCAGTTCATGCAGGTATAACACCAGCCGTTATTTTGGTGCAAATTCAGCGACTTGATTTTGTAATTCTTTATTATTGTCGCTGTAACAGAACTGTGAAGTGTGAACATATAGTTTACAGATCCGTACTCTTAATTTTGCATGAATCCCGAGTTCCCGAGTTGTGAATGTGTAAACTACATATGTTTCAATGTGCATATGCAGAAGGCTCTAAGATATTATTACTATATCATTTGATTTCATCTATGACAACTGGTGCACGATTGTTCATAGACTGGAAAAATAATCAGCACCCATAATACTGTGGAATCATCTTACACCTATATCTCTTGTTAGACTGGTAGTAGTTTGTTTACTATTTGGTAAATTTGATTGGAACAGCCTATGTATGTGAAACTTGTATTTAAAATATTGGAGTAATTGCACAACCAGCTAATATAATAACCTTAGTCAGCATGGGCTATGCATTTCAAGTCATACATCTGATGTGTTGAGTAGGAATCTATATTTCTGTTAACCCTCCTTCCTCCTCTTTGAAAAGTGTTCCAAGGAAGCAGATAGGTCGAAAATTCATTGATAAGTTTCTTTCGACTTCTGCAGAGCGATGTAGTTCAGGGAAGGTAAACCCAAATGATTCAATGGGAACAGGTATAGATGATGATTGTGGTACCAAGAAGCCTCCAAAGAAGGGGAGAAAAATAAAGCTGACAAGTAATGGAAGTATCCTATTGCTTGACAAGAAACTGGTTGTTTTTATTTATTTTACTTATTGTCATGAATGCCTACATGATGCTAGTTGCATTCTTATCATCTTGATGTGGAATATTTTCCTTCTTATCCATTGTTTTTTAACTGGACCCTCCATGTTGTGAGGTTTGCTACCTTGACATCTGATAGATCAAAAGGTACATATAAAATTGAAAGCAAAGTCTCAATCTGAAAACAAGAACATTGCCAATGGTTTTGAGTTGGACAATGTACTTGCCAACAAAGTACAACCTATAGGTTCCACCATTGATCAAAGTAAGCACTACTTTCTTTCTCCTCCCTCTGGTCACAAACAAGTTTAATCTTTGACTCTTTGACATTGTCCTAGCCCAGAAAAAGTAATTTCGACCCTCAGTTGTATCACGCTAACATAGTAGTTTTAGCCTATCAAATAATGTTGTACTGTAATATTTCAGTATAGCTAATGTAAATATCCTTAAAGATGTTCAAATTTAAAATAGTCCTTCTGCATTTCTTCTATTTTTTACTTCAGGTAGTAGCCCAATCCTGCTATTGGTTGGCCAATAATTTATTCTACCTTTTTGGTTGAATTCTTTCTAGAATGTTACTTTATTGTTAGTGTATCCATACCAAGAAATTTTGTTTTCTGACATTTATTTCGCTACATGATTGTTATAAATACGTGGTCCTATTACAGCTACCTGGAATCTATTAGATAAGGACCAGGGATGGTACGTAGGTGCTGCTTCCCTTGACCCTTGTATATATTTTTAATTGAACGATATAATTTGTGTGGCTTCTCAGTCAAAACCGCCCATTAGTTTATAGATGCGATTGGATTGTGGGTTTGTGGTAGAAGCCAAAACACTGCTGTTTTTGGTTTTGTCATGTACTTATGCTAGGGCTTATTTGCATGTTTTTTCTTCTTTTGTTTATAGGGTTGAAATCATCTGCCAACAATCCAGCTCTCACCAGTGTACCTCAAGGTCACCATAGAGGTACAAATTGCTTCTCAGTAATGAAGCTGTTGATTTAGGCATGGATACTTTCATGATTTAGTCATTTTCTTTGTAGTGAGATACCATTTAAGTATTTAATTATTTCAGTGATCAGGGCTCCTATGCTGATGTTTTTCTAAAAACTTGGTTATTGCACAACGTTACTATCTTCTACAGAAGCAGTTTATATATTTCAAAAAACCTTAACTTGTCAGAAAGCTAACTGTTATATTTATATTCAGAATATGCTTGATATGCTGGGGTGGGGATTCAAAATCAAGTTCTCTAATGTGGTAGTAGTAATGTAGGGCATTTGGCATGCATGCAACATTGCCTGTAAAATTCTTGCCAAATTAAGTCATGCGGTATTCATGTGGCATGTATTTGGGTCCTATGCCTTGTCAGTTGAGGGTAGAACTTTGTCCTTTGGTGAATTAATGGAAGTGGTACCCTGAAACACAAAAAGGGAAACATATTTTGTCCTTGGTAAAATACTGAAAGTAGTAGCCTGAAAGATAAGAAAGGAAAGCATATGTTTCCTGGTACATGGTGCAATTGTTTACCTACCATGTATTCACACAATTTGGACCAAATAAAACTCACTCCTTAACTTCAACAGCAGTAATTGTAAGGTTGATCTTCTATTCACCTGTGACTCTTATTGAGGTGCTTGTTTAATTATTAAAATCTTGTTTTTGCTTCCGTTTATTTTTCTTATTCAGTTTCCATTTTGCTGTTGTATGTGATCCAACGGTGTTGTAATTCTCATTTAGTCTTTAACAGATGCCCCAGTTCCTCTTGCAACAAAAATGTACCACTCACAGGGAAACTACCGGCTTCGATTGGAACTCGGTCAGCTTTACCGCCAATCATGTTCAGAGCATTCAGGCAGCTATTCAATTCCGAACTCATCACAGGAGAATGGCTTGATGGTCTCGCATTTATCACCAAGAGATAATTCATCATTAAATGTTGCTCAGAAGAGCTTTGTTCCTCAAACAAAGGTGAAATGAAATGCCTCTTCCCTGCGAGCATGGAGTGTATCTGCATGTTCCTTACTGAAAAATGCATGTTCTTGTGATGCTTCTCAGTCTATGGACCAGCTTCTTGCGAGCACACCAGAATCATGCCCTGTAATCCCGCAGCAAGTAGCAGCAAGTGTGCCAAACAGACAAGCAACAAAATCTCAGAAAGCAGAGGTTCAAGTATCTGCAGTAAAAAACGAAATGGCAAGAAGCAGATGCAGCAAAGATGCTGTTCGGCATTCAAAAAACACAGGTAAGAAAATATCATTCTCCTGTAAGTGCTGATTAGATTCTTGAAACAGTTGCGGGTGATATCTATATATTTATGTAACTAGTATCAGTTTATGGCTATTATGTACCTGGTTACTATTTCTTAGTGCACTTCTATCTTATACCCTAAAAGCAATCTAGGAAAATGGATGACATTATGGAATTTACGATCCATCAGGTGAACGAAAATGTATAGGGAACTTAGGTATTTCAAATATTATCAGTGAGCAGACTAAATAACAAACTCATATACTTTGGTTCTTCAATGAATTTTGTGTGAAGTCTTTTGTTTTTCAGTGAAGGCTTCTACTCCCTCCGCATTTTAAGATTCAACTATCTAAATATTTGACCAATAAATAGTTTATTATAAATTAAATTTTATTTGATGAAAATAATATCATTGGATTATCATTTAAATTTACTTTCATATGATTATGATTTTGTTGCTACAAATGTTATAGTATATGAGAAATTTATTATTGAAGATTGTGCCAAGTTTGACCACGCCTTAGTGAATGGGACGGAAGGAGTATATCAGTACCTTTGTATGATGCATAGAAATTTCCTCAGGCAAAATGAGGCATGATCATTTTACCTAACTAGAATTTTCCATTATGTAGGTAATAAGAAGGCCCATCAGCAAAGAAACGGAACGGTACCTGTGATTAAATCCTCAGTAGACTAG</dnaseqindica> |
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