Os01g0148400

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Gene Name

Os01g0148400

Description

Brix domain containing protein

Version

NM_001048555.1 GI:115434523 GeneID:4325215

Length

5212 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0148400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:2631618..2636829

Sequence Coding Region

2631637..2631882,2632715..2632788,2632874..2633006,2633091..2633172,2633471..2633580
,2633659..2633751,2633854..2633904,2634013..2634105,2635257..2636129
,2636204..2636316,2636436..2636448

Expression

GEO Profiles:Os01g0148400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MDGGGGGDPGGRVGEAKADATRAANKRRAPSPAGGGGVEAKRRR KDAMGSSVSGSRSGGGGGRRLRHGRGRRARAFRRKLEEENKNSNNRPRASNVVIAYTP NLIRRYGTLLRNISFLLPYDGQGKAYACPSDKINVFLKWSRCNFCLFFEWAEGDQMMI CHMFNTLKEIHISFLINPAFLDESMEVKVTNPLLSFSSNFVEDETWALVKEMLMMMFS PVQEDERAASDLYVFTKSRDSVYFRIFKITSIPAGESENSLVLDEVGLNFCLKLLDVH GAFVGSDCDQALDGLQSQTRNELKLSPDIYYCVPNDKLGCCTLHSVALNNQNYLFFLE NGLDLSHFEGFCLTLEEFLERNSFLKIKHIVGSRNDEECNFVRNIAKAIIRSMLSHLV NLFSLGKCLRMGTDLLRRRKILLKGSDVKFFQLEVIAYEEDEAINNVLQVVELVKSCF VGEMIPADLQGDLHDLKENPLKRLESVIDSSSLMSAKEKKGLLVNLHTEYKTNISPAI SEDDRDSLFKHIPYLDCWMNRTEDNEYLKLVANLDSKKVALKVNKVGTDKRKPSKNGI LQFDFMRNSDVHIPEKALKDGITPFRLSWTDYILTSRYPTYLRAIQKSLEPYMKSRKK LK</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0148400, RefSeq:Os01g0148400