Os01g0198200
| Gene Name |
Os01g0198200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Casein kinase-like protein |
| Version |
NM_001048841.1 GI:115435095 GeneID:4327338 |
| Length |
6444 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0198200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:5328075..5334518 |
| Sequence Coding Region |
5328169..5328228,5328300..5328488,5328611..5328768,5329677..5329767,5330359..5330533 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:5328075..5334518 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:5328075..5334518 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>agcatgccagcgcgccgaggccgtggaaagcggaagcagcagcagccgccgccgccgccgacgggcccagcggacgcgaggcagccggaggggaagcagcgggaggaggagcggaaggggatggaagggtccgacaaggggggcgccggcgacgacgggagccccgcgccgctcccggagacggtacaaatcggaaattcaccaacgtataagcttgagaggaagcttggaaagggaggatttggacaagtatacgttggccggcgtatttcctctcctactcatggtaacagaaattctggtgcaaatgcattagaggttgcgctaaaattcgaacatcgaaccagcaaaggttgcagctatggagctccctatgaatggcaagtctacaatactcttagtggaaatcatggtgtcccacgggtacactacaaaggaaagcagggcgggttttacatcatggttatggatatgttgggaccgagcctgtgggatgtttggaataacaattcccactcgatgtctgttgagatggttgcttgtataggtatagaggccatctccatactagagaagatgcatgctaaagggtacgtccatggtgatgtgaaacctgagaactttttgcttggtcctccagatacccctgaagggaagaaactttttcttgttgatcttggactagctactaaatggaaagatgctggtacaggaaagcatgttgaatatgaccagagacctgatatctttaggggtactgttcgttatgctagtgtgcatgcccacttgggaagaactggatgcaggagagatgaccttgaatcccttgcatacacacttattttccttctccgtggccgcctgccttggcaaggattccagggagagaataaaggttttcttgtttgcaagaaaaagatggcaacctctccagaatctttatgtggcattggtccaccaccatttcgtcaatttgttgagtatgttgtgaacttgaagttcgacgaagagccaaactatgcaaagtgcattgctctttttgatggcattgttggtccaaatccagatggaagaccattaaacaccgatggtgcccagaagcttgtatatcaggttggtcagaagagaggccgcctcacagcggctgaagatgaggagcaacctaagaaaaagattagaatgggaatgccagcgacccagtggattagtgtgtacaatgcccgtcggccaatgaaacagagataccactacaatgtagcagatgatagattagcaccacatattcaaaaaggaaatgaagatggtttgtttataagttcagtttcatcctgttcagatctgtgggctttaattatggatgctggcactggttttaccgcccaagtacatgaactctcccattactttcttcacaaggaatggataatggagcagtgggagagaaattactatattacttctttggctggttcaaataatggaagctcggtggtgatcatgtcaacaggaacgccatatgcacagcaatcctacaaagtaagtgattcatttcccttcaaatggataaacaaaaagtggaaggaggggttctatgtcactgccttggccacagcaggaagccgatgggctgtggttatgtcccggaacgctggtttcacacatcaggtagtagaacttgatttcttatatccgagtgaaggaatccatcaacgctgggatagtggttatcgcataactgcaacagcagccacatgtgaccaggtggctttgatcttgagcatacctagaagaaagcctaacgatgaaacacaggagacactgagaacatctgcttttcctggccagcatgtaaaggaaaaatgggcaaaaaatctttatttaggctccatatgctatggaagatcagtgtcgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>SMPARRGRGKRKQQQPPPPPTGPADARQPEGKQREEERKGMEGS DKGGAGDDGSPAPLPETVQIGNSPTYKLERKLGKGGFGQVYVGRRISSPTHGNRNSGA NALEVALKFEHRTSKGCSYGAPYEWQVYNTLSGNHGVPRVHYKGKQGGFYIMVMDMLG PSLWDVWNNNSHSMSVEMVACIGIEAISILEKMHAKGYVHGDVKPENFLLGPPDTPEG KKLFLVDLGLATKWKDAGTGKHVEYDQRPDIFRGTVRYASVHAHLGRTGCRRDDLESL AYTLIFLLRGRLPWQGFQGENKGFLVCKKKMATSPESLCGIGPPPFRQFVEYVVNLKF DEEPNYAKCIALFDGIVGPNPDGRPLNTDGAQKLVYQVGQKRGRLTAAEDEEQPKKKI RMGMPATQWISVYNARRPMKQRYHYNVADDRLAPHIQKGNEDGLFISSVSSCSDLWAL IMDAGTGFTAQVHELSHYFLHKEWIMEQWERNYYITSLAGSNNGSSVVIMSTGTPYAQ QSYKVSDSFPFKWINKKWKEGFYVTALATAGSRWAVVMSRNAGFTHQVVELDFLYPSE GIHQRWDSGYRITATAATCDQVALILSIPRRKPNDETQETLRTSAFPGQHVKEKWAKN LYLGSICYGRSVS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6291..6350#6031..6219#5751..5908#4752..4842#3986..4160#3777..3916#3011..3229#2804..2933#2649..2715#2457..2551#2298..2369#2157..2212#1965..2034#1784..1857#1565..1699#202..384#cttactacacaacacggctgtggtaccaggatttttttcaccacgcgccctacctcgcaatctccccctcctcccgtctcgtcgtcgtcaccgccgccggctcaccccccacccgtcgccgccggcgcggaggccaagccctagccccagcgcggccgatcgcctcgatcccccggcgagccgatgggcgtgcgccgctgaagcatgccagcgcgccgaggccgtggaaagcggaagcagcagcagccgccgccgccgccgacgggcccagcggacgcgaggcagccggaggggaagcagcgggaggaggagcggaaggggatggaagggtccgacaaggggggcgccggcgacgacgggagccccgcgccgctcccggagacggtaatcgcggattatctatccccccttggctcccccgctgcgtgacctagatatggctgtcgatttttttttagggggcgttttgtttttttggtttagggttctattgattgaatagacgctgccgctggtgtagatgaactgattgatctatgcaaactgtacacgcgggatgggatggtggagttttacgcttgtggcaaaataactactagttgttctggattcttagcttactttcaattaactctgatccaactggtgacaagagaaggggaggatagcagatgtattgattacaaatagcagctgcacagaactgattttgtagagaattgtgtggaactaaattagaacttttgactaaatgtgaatgaagaatgcttattgtgtaaatctaggatagcatcagtacgggtgatgttgaccagaagcttattgtgcatttcaagcagaaaactgatgagatagctaacatcttgagttctagactccatctagttaatctctagcatttgatggcacttataattagtgtgccatgaatataccatttctggtgtttggtgtgtgtttttactgaacgtagatcttgtcggttgcttaattatgttcatttctgccatgtatacgaaattcaattggttagctgagtgttgttactgtttcatgtattctctgttcctgttttattcctaacatttgttgaattcacatgctgagtgtttgtgttaaattccaagcggagatttgattgagcatcggtctgttaggattagctaccatcatgcagataaaagatctgcctaggaacgggagaatctaaagtgccttaattttattgcgcactatgttgagccatattgtagatgctactgtataggcattctttaggataatggtagctttccattagatcaaagcaggattagtcattatacaggatttgttgcaagaatgaaggtgcctcatgtcacctgcactcagagttgactgcttgaaacctgtttagctcacaaaagatcagaaatgttgcaatggctgttctgatgatgaaattttgtatcattttattacgcatggaatagctgacctgtctcctttttcacatgtttataggattttacatcatgttatcataaccatatatttattttgggcggttgtgtgcttggaccaggtacaaatcggaaattcaccaacgtataagcttgagaggaagcttggaaagggaggatttggacaagtatacgttggccggcgtatttcctctcctactcatggtaacagaaattctggtgcaaatgcattagaggtcagtgtatctccttgaatgattgaagtagttggaactgagactattcgtacttgcgtcagtactcatgttcatttctgtcaggttgcgctaaaattcgaacatcgaaccagcaaaggttgcagctatggagctccctatgaatggcaagtctacaagtaagtatttcttcttctggctctctactgtgtaagtttttctttgtgaataccaaattatttggatacgtttacattgattacttatgataaaccttctcttgcagtactcttagtggaaatcatggtgtcccacgggtacactacaaaggaaagcagggcgggttttacatcatggtaatggagcatgaactagatttttttttttttttgctttccggtttatggtttgattggtttctttttctcttaagaattatcaactacgttttttctaaccatacacatttttcatgcaggttatggatatgttgggaccgagcctgtgggatgtttggaataacaattcccactcgtgggcatcttttgactcttcctaattaatcttgacagttcaatgcagccttttcaattttttaatttgtggccttcttttacaggatgtctgttgagatggttgcttgtataggtatagaggccatctccatactagagaagatgcatgctaaagggtaactcgacctgctcttcagatgttccgtaagagtgtttcacatggcgtctctgaagttttagctaataaattttgtttatgacaggtacgtccatggtgatgtgaaacctgagaactttttgcttggtcctccagatacccctgaagggaagaaactttttcttgttgatcttggactaggtaattcttaatcaacttttatctttatattgtgtcaatttgttgtcatgtaattatttatgttgcttccttatgaacttgttttgttccaatgcagctactaaatggaaagatgctggtacaggaaagcatgttgaatatgaccagagacctgatatctttaggtttgaatagaaagtttattacgatgcctatcattttgcacattactttattgatgcgctcttcctgtttgtctgctactgtaaacaggggtactgttcgttatgctagtgtgcatgcccacttgggaagaactggatgcaggagagatgaccttgaatcccttgcatacacacttattttccttctccgtggccgcctgccttggcaaggattccaggttaattttgattgattttatgacttttttgttgctacatgcactaatttcgttttgtaattcatgaatgaacttagggagagaataaaggttttcttgtttgcaagaaaaagatggcaacctctccagaatctttatgtggcattggtccaccaccatttcgtcaatttgttgagtatgttgtgaacttgaagttcgacgaagagccaaactatgcaaagtgcattgctctttttgatggcattgttggtccaaatccagatggaagaccattaaacaccgatggtgcccagaaggtacattattccttcaaccattttaatctgcgtctgtatcatctgtcagaaaaaatgatcgtgtaggaatctcagttccaattccctatttctcggatcaaaattcaaagcactagtaaataattaaagttacctgattctatccttgggcttgagagtcatcactagtgttataactaatattatttcccaagaattccaattagttcaatgccaaccttgtgcttttaggttttagtgaaggaaatctatgtcccactatgaaacaactcaattgtgaacctgcctttgaacttcctgtcctagctttctgtaatatgaaacaccaaataacgagtatgacctgcatagactaaaacatagtcaatgtcctgccattaagaccacatgatcagattggtctttagagacagtgacatattcaatatcaaatgtattttggtggtaaaatagttaactggcaaaatctagtgacatattaaataattccttatttctttatgtaatagcgggctacctgcataatgctttgttggattgctgccagcttgtatatcaggttggtcagaagagaggccgcctcacagcggctgaagatgaggagcaacctaagaaaaagattagaatgggaatgccagcgacccagtggattagtgtgtacaatgcccgtcggccaatgaaacagaggtatggcacagtaatctgcttggtagcagtaaaataatactctattgtctgaccacatttatttttcagataccactacaatgtagcagatgatagattagcaccacatattcaaaaaggaaatgaagatggtttgtttataagttcagtttcatcctgttcagatctgtgggctttaattatggatgctggcactggttttaccgcccaagtacatgaactctcccattactttcttcacaaggtaaataattgcgtgtcatcctactattgagtatgtattttttttcctatctgtggttggttactaatcaagcatactcagctctatcctaattgccatctcatggtattgttttctactccctccgtcccaaaatatagtaacttcttgcattcaaaatttgtctcaaaatgttgctacttcacccattccatcatctcaactaatcaccgccatctcttatttaatttctccatctacttcctcatctcaaccaatcacaaccatccctgttttaatttcacctctccttaaccccctgaagaactctagaattgcctatattttgggacaacaaggtgccaggcactagtccggcggctggggggcgcctaggttaggctaactagtcaaatccaagaaattagcaagcatattgcataaaaacaagactatataacactaaaatagcaaggaaacaccacccaagttagttcagcctcttaatgcaccatctaatgcctaatcgcggcggctaaccggcgcctggagctgacttttagaacactgagataaatgtataatcacaactttaactgtgcgctttgataggaatggataatggagcagtgggagagaaattactatattacttctttggctggttcaaataatggaagctcggtggtgatcatgtcaacaggtatacagtttcattttgatgcctttagtcctgaatttgcatgttcggtgccaggatcattatgtaacaagcgcaacgattcatctcagagaagaactacagtaaactcatcaaatgtgtactgaaacacgtaatcgaatactaaaagaactggatattaatcaaaaccatgataaatatttgattttaataaagaaaaattctcaaacaaatgttctctttggggtaaatcaacactatgctaagcagcatatagttgataacattagtacatgacatgggtttaatatataaaatcaaggtttcattggttggcctaataagccaaagcaaaagccaaaatttgaattttcaaacttaattttgaagttaattttaagatattttgaacatagtttttttaatattggcttttaagttgctaagaacacatatacaattttttacctataaattaatttttattttctaataaatcattttggcttattaggaaatatgggcaaccgatgaggctgtcaatcttttgcccctagctatgatgaaatcactataaactgctagacaacatttggataaacataccacttaatattgttaccttgaccaagataatactggatgaggtgaaatttgttaaatgttgatgcatcaaagtattcagaaagtaccaccgttaatatgtgtagtgagaagccattcacagcgcaaacacttgggtatcctgtaatgtttactgttgaggtgaaatttgttaaatgttgatgcatcaaagtattcagaaagtaccaccgttaatatgtgtagtgagaagccattcacagcgcaaacacttgggtgtcttgtaatgtttactgttggtatttattatgagcaagaagccaagaactgacttgaatgcttctcaggaacgccatatgcacagcaatcctacaaagtaagtgattcatttcccttcaaatggataaacaaaaagtggaaggaggggttctatgtcactgccttggccacagcaggaagccgatgggctgtggttatgtcccggaacgctggtttcacacatcaggtacgtttggagtgtccaagagccttgtaaaattgaattcattttagcagcaagctacactgactatcaattgaatatgtaaaagtcttgagattttattatctcgcatatctcttttgtaggtagtagaacttgatttcttatatccgagtgaaggaatccatcaacgctgggatagtggttatcgcataactgcaacagcagccacatgtgaccaggtggctttgatcttgagcatacctagaagaaagcctaacgatgaaacacaggagacactgagaacatctgcttttcctggccagcatgtaaaggtgactataccttcttcttgtgccttgtttgaactccacataacaaataaatctgataaatctatttgcaggaaaaatgggcaaaaaatctttatttaggctccatatgctatggaagatcagtgtcgtgaagtgcattttcccgagctggtcctttgtaagattaagatctaataatatgaacaaccggttttgtgacaagataatggggggattttgaagtgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |