Os01g0390300
| Gene Name |
Os01g0390300 |
|---|---|
| Description |
Nucleic acid-binding, OB-fold domain containing protein |
| Version |
NM_001049644.1 GI:115436701 GeneID:4325229 |
| Length |
11028 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0390300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:16700441..16711468 |
| Sequence Coding Region |
16700678..16700714,16700826..16700928,16701019..16701292,16701383..16701526 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:16700441..16711468 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:16700441..16711468 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtacgtgcttatttcagaccttatgtatggggacactgataaacggatcaaagcgagggtatctaggcaatgggactaccatgatctgaatgatgaaacaaagatctaccacactgatcttgtcttgctggatgaaaagggcaatagcatccatgttcaaatctatccacctgccatgattaagcttaggactcttctacaggaagggaaggtttactactttgactccttctctgtcagatatgcaaacagaacatataggccagttacgaaccctttgatgatctcattcactaaatggacaaccttagaagaatgcattgatgcttttgatgattttcctgccataactttttcattgacaccttttcaagacgccccgtctcttgtggacagaaatgctttctatgttgatattatgggtgtcataactgaaattggtgcaacagacactctacgcccaaaatcaagaaacacagaaactttgaaaagaacaatgcagatttgggatgcaagcaatgtcaggcaagcatccgagcacaattttcactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAYVLISDLMYGDTDKRIKARVSRQWDYHDLNDETKIYHTDLVL LDEKGNSIHVQIYPPAMIKLRTLLQEGKVYYFDSFSVRYANRTYRPVTNPLMISFTKW TTLEECIDAFDDFPAITFSLTPFQDAPSLVDRNAFYVDIMGVITEIGATDTLRPKSRN TETLKRTMQIWDASNVRQASEHNFH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10755..10791#10541..10643#10177..10450#9943..10086#ccgcgtgaaagaaaaaaaaagaaaaaaccaccgccgccacgccgctctcatctctctcgctctctcctgcccgccgcctggatctgccagcgcggtggccgccgcccgctgtcctcggagcgccgtggccgccgctcgcactcctccctacgcgccctgccattcgctgctccaaggggatgttgtggatgcacggtgtcatcgctgcgccctcgctgctggcggtctcgttgctacgccgccgccgacgcccactcgaaagggaggccgtgggtgctggatgcggcagccacgatttcctttccggcggatccggtcactcagagtggagggcgagcgctagcgcagaggctcatcaatggtgtcgacgccggccgttcttccgcagtggtgagttccacagggaaagggccagctcacccaccctttctttcttcacactttccctctctctgtttaatccagatccaaactgatggggaagttcgatgtggcacatccagggctatcgggtatgctgagctcggtggtggcggcagtagcagctcggcggcgatggaggaggtcaaagcgttgatgtttgccgccggcgtggatgctgctgagtcctcgcacattggccacgacccacggctgcaatcctggtcagtttggggctttgtggttgcttgccaccctatccgtttgatctagatcgtgtggcctttgttcgtcatagtttgtgcggtgtcgtccagttgcgtttgtgaattttcgttgtgtttgacggtgggcaatgcattatcgatgcaattggtctatggctttggtgccgctggcgtgtaggccatatggttagggttggtttcatacctaccatggaatatgcctatgtaatgaggcacaactgtgcatgcttgctcagggttgtcagcttggggagtgcggttgtcagcttgggatggggcaagctgcttgctgtgattggctcaatttttctcggttgcatcggtgcctattggtgaacctggtctatatactcctcctggctgtattgtggggccttatccgatgtagtattagcgaggcctctcatggtgtatagtccagggtgtttccttcgttacgcgagatgtattaggctattccactttcaggtggggttgaatgccatggggtccatgtatgctgcttccctattggtgggtatggttggtcctattagatgtgatgcacaagtctatgccttcttctctattatatattcctttgcagatgccgggagccatcttcttttctccgcttccctttcaaagttgcaccatcgttttcatcgctctatcgttttcatcgctcttttgctgcttgcgtcctcacgtgtactacttgatacatctatttgttgttgcttttgatcattgaatatggcacggtaagatgtaggcgacattgtagtttggttgtcagcgctattcgatgtcgcttttcctgtttttaggccttctaatcattctttgatttctggcttgatttgtagagggccggatttgcacgggctgaagcggtgcttcaagggttcttgattgattttgccaaggaatgttcgggctgctggttcaatcaagcaggttaggttctttctactgtatatatatgctttaaacgatatggaaatatcccctgtatttgtggtgccttctgtttcaggtttatgtttgctaacaatctttttctgttgcgcagctctggtcacctttattggtgaccgtccctttctaccctttcttctatttctcggtcaaggcctttgtcttctgtgggtatctttcttgcgtggcatcttcttggttacattgcttctgctgcgttgtcaacacattgggtgctgtttcgtataaggtatttccatctctctcataccctatttcagtatttccttttctgtttattgattactattttgcactattttctgcttcttttcaatattgtgcatttatggtgctttgtttgtcgctatattaatagcttatttctgacacttatcacttggtacatgcgtgttgtcggtttcctatgttattgcagccatataacggtcactgcagtgccttttgtagccgttgcataggttcttgtgcacacacttctcgcatagtactctctttctctttcctgatattttgtcccttgctgcccataacgatgttgcttccctccacctcatctttagttcttatcaaagtcggctaggtttttgctttgttgtccctgaactcatcttttcttgctttagagctattattgtgaaacttcctctttccatctaatatatttgctattcacatctcgcttgtcctgctttctaaatgttgttcacaacgtttcatgcttctagctctacctccctttatccaaagtaagattaaaactgtcattcgatagtttgtaaaatgtgcatttgacgttttaatcctacatggctgcacaacttctgcacattatctctgattttttttcggagaagttagtaattatttttaaggtaagctagccatatgaagttttaaaggtataacctctattattaagcattggttctctctggtaaaaaaaaatacaactaatcaatctgcgcactgcgacctcaaaggaaaagttttgcttctcacctgtcctcgcttttatacagattaaattgaaatctaaataaacacccagtgatttgcaggatggaaaacatacacatgtatggagtttatgtgacggctaggagagtgggagagtggcacagttgcttgcaagacatcttttcccttttgaaacaaaaaaaaaaatattttatatagtgcaagatatttggtcagcgagcaaataaaaatggactagctctgcactttgattaggcctttgcttttatatataaactctttttagcattctttttgtactgctgcttcggagtgacatttctcattcagctctgcacattatctctgattttttttttcagaaaagttagtaattatttttaaggtaagctagccatatgaagttttaaaggtataacctctattattaagtattggttctctctggtaaaaaaaatacaactaatcaatctgtgcacagcgacctcaaagcaaaagttttgcttctcacctgtcctcgcttttatacagattaaactgaaatctaaataaacacccagtgatttgcaggatggaaaacatacacatgtatggagttcatatgatggctaggagagtaggagagtggcacagttgcttgcaagacatcttttcccttttgaaacaaaaaaatatatatattatatagtgcaggatatttggtcagcgagcagataaaaatggactagctttgcactttgattaggcctttgcttttatatataaactctttagcattctttttctgctgctgcttcggagtgacatttctcattgagctttcagcgctgcagttgtcaaactattaaagcgacttgatagttctgcatcatgggtagtgtgcctttagactattatgtttttttttttgccttttctgcaagcttagttcaatttttttatgaaattgtgcaagatgttaggtcagatccatgcttactattgcacaaaataattttaaggcacctcttatatctatatttaggagtatccgtcactgcagttttttgctttagtgccatactgattacttcacattaaacatgcctcgtgcatgattaatttttgtattgtgcaattagtattcagtgcttctaaaacattgcgtattgatattggagtttggcttttgatattttatttatggttgctgtataatgtgaggctattactacaacatgctcccacaatttcatcatatatggctattcattcatgatactactgcttgtctgtatatacatacgattatcttttgaatccattatgaattctggagacattcatttgctgtatatacatagggttttgtttagtttcatcttatagtgtataaagagtagaatcagctgtatagcaatttaatcatcagaccagagggaggttcaatgccctgtaaagaaacattttctcatgcatcaggcttaatgtatgtccccgcttagagtgttttctctgtttcagttttgcctcaaaagtaaaggcctagcaaattgttggaaccttagttttcaaagactttgctttccattgtgtaaagtagattttttttttacaaatttatttgagccaaactactaatatattacagttgttctctgttcaatgacagcagtagtattttaacatgagacaatgtgattaaaagaggttttgtctgtcccaaaattttggttttttgtgtttctcaaacgtctcatagcaaaagtagccaagcatgcatgcatattgtggcttgtgcattttatcctagacaaactctaggtgtttcagacttgatggttggttgaattccttaactaggctgtgcgatagtgtgctggtcaatttgacacatactaaatgttgtgatctttgatgattgatttacttttttttataggtggaagaattggtgcaagcagacttggttttattctcctcatcttcagttcaggtcctcaacaacaggtaaccaacttcccgtgctaccataaagcttcaatttaggacgttgagtgtattgcttttatgtgtgtgtattgctggtataagtgtgttgctgggatatactccccagatgtcacaacagggtataaacagggttcagagggtacgtgcaagtcgagaaagacgagctgcaaacgctttgttacgtccatctgcaatgcacatagatactaccgtagtagcatcgcctcaacctgctcgagtagatcaaggcaaaaggccacgttcccttatggatttcacgcctgaattatcaaagttacatacacagcgacgttgttcgttgcgctcaaagatgcctcctgtgccaccggcacaaaatagcaatggtatgctgaaaaggtgttttttttattgtagtatactgctgctagaactgcataacttagatatggttaaaatatttattgactgcagttgcaaataggaaagccagtggtagttcatcccagacagataaggattacattcaatctttaaagggtttgtatttttctaataaaagcaaatcattttacatttattaaggaaaaaaactgacataatcaaatatgtatgttacagcatcatacccagaacgatcgtactactgacctccgacatatgaatgcccattttgtggtgccatcttttggtatcaagagagagttaaaaccctctctgctgtctcgaaaagaaaaatagtttacaacctatgttgcaaaagtggcaaaattgaattgcctcctttatgtcctctacctgaaccgcttgcaactttattgaatttcaatggtgatgcacgttccaaaagatttttgagacaaattcgatcatataattcgatgtttgctttcacctcaatgggtgcagctattgacaagtcaattaataatgggaatgcgccttatgttttcaaaatcaatggtgttgtgcatcacagaatttgtactcttctgccatcacgaggtgcaccacctaaatttgcgcagctatatatctatgattctgacaatgaaatccaaaatcgattaaatattttcgaaaatgattgcgacaatgctgatagaccagaccctgaaattgttagcgccttaacacgcatgtttgataccaataatgaacttgttaaaaatttcagatatgctagagaccgcctctctgaacatggtaatgaaaaaataactcttcgctattaggctgcaatgctaaagatgatgtgcagtataacctaccaacaagtggtgaaatagctagcataatagtaggcgatttttcagcaaaagaatataaatttggtgtgcttgttcacgataaagatcatggaatgcatcaagtgttttcattgcatccatcatatatggctttgcagtatcctttgctatttccatatggtgaacgtggcttccatctaggcattaaatatagaaattatgatggaactggtagaaaatatgctacaatgcttgaggtctacagataccttatccattatagactaaatgagcctaatcctttcacatgttatggctgactgagtgaccaaagtgttgttgatatcttttctactatcgaggctaataggatacaatacataatagatcatcaagctgatttgcgtgctgaaactgtagaaggaatcgtagatgcgattgatagaggtgttactaatggagattctgttggcaaacgtcagatacttcctgctagctttaccggcggtagaagatatatggtgatgaattatcaggatgcgatggcaatctgtcgtgtgtatggctcgcctgatttatttgtcacattcacttgtaactttaagtggcaagaaattgcagaaactattcgatttgaacctggccaacaaccatcagatagagctgatgtaattgtgcgagtatttaacatgaaagtaaatgattttatcactgatattagagaaagtaaatgattttatcactgatattagagaaggcagaacattcggaaaagtccttgcaggtagcacatatactttcttttccatatagtttttcccctatatatttctcataccttttcattggcttaaaccttcttagtgctgtatactgtcgagttccagaagcgtgggctgccacatatccactgcttagtttggcttgcagcatccactgctgatgtgtcagcatctgtaatagatggcttcatctgtgctgagatacctgactatgacacagatcgtctaggatatgaattggttagtgagttcatgatgcatggtccttgtggcgacgcaaacaaaaattgcccttgcatgaaaaatggcaaatgttgaaaacattatcctaaggacttccaggatgaaactattattgatgaatctggttttacaatatacagacgacgaaacaatcaacgatgcataattaaaaatggaattgcattggacaacagatcagtcgtgccatacaatcttgaattgcttaaaaaatacgaagcacacattaatgttgagtggtgtaacaagtcaaatctgattaaatatttattcaaatacattacaaaagggcatgatcatgcaaagatatactttgagactacttctaagacaggaaatatgtcactaaatcatgatctagctcctcggatgagatattagaatacatggatgctagatttctttccacgtgtgaggcacttcatcgcatatttgaatttgacatacattatagagtgccacctgttgagcgtctaacagtccatttagctggcaaaaattatgttagatatgagaaatgttcagatttgcgggcggtgctcgatagccctgctgcgaaacgatcaatgctgactgaatggttcgaagctaatagaaaatattctaaggcacggttgttaacatattgtgagtttccaaaggaatggtcatgggaatcatcatctagaacatggcgcgagcgaacaccaactgcaaaaataggtcgaatctattatgtgcacccaacctgtggcgaactctattacctcagaatgctcttgatgatagttaaaggcacacagaattatgctgatgtacgcacatacaatggcattgtttataacacattcagagaagcatgtgaggcgagaggtcttcttgaaggagataatgaatgataccttctatttgatgaggccatactatctgcatcttcgcgacaacttagacaactatttgtgaccgttattctttattgctctgttagtaatgtgcgatcattatttgataagtattggctttatatgactgatgacatccatagtagattaaagaatgcattagataatccacgatgcattattccacatgagcacttgcttagtctcctcctgcatgagcttacaattgtttttgcaaacaatggtggtaatataaaagattttgatttgccgattccaacatctgcttcacacattcctggtagtaatagattgattgacgaggagcttgcacctgatccccttatgatgtccttgcgcgcagattctttaatagcacagctaaatatcgaccagaaaaagatttttgacaccataacctcctcaatcagtgcaaacaaacctggatttttctttgtgagtggacatggtgggactaggaaaacatttctatggaacgctatgattgcaaaacttagatcacaaaataagattgtgctcgctgttgcctcatcaggtgtagcatctctcctactacctagaggtagaacagctcactcccgatttaaaattccaattgacattgatgaaactagcatttgcaatataaaacgaggaactatgttgcctgacctcctcattgaaagtgcacttattatatgggatgaggctccgatgacacgtaggcactgttttgaagcattggatcgcacattacgtaacattctttctgaaacttgtcctacaaattcaatcataccttttggaggaaaacctgttgttttgggtggtgactttagacaaatcttacctgttgttcctaaaggttcacgcctcgctgttattaatgcatcaattacaaatttagacctatggaaacatgtgacgttgttatccatgaatataaacatgagactgttaaatccaaccctaccagaaaacacaataattgaattgcatgaattcagtacatgggttctagctgttggtaacggaacattgcctatgattgcaaaagaaggtgaagctcaaccctcatggattataattcccgatgatcttcttgttgtaacagatggtgacaaaatcgttgctattgtcaacgaagtgtatccagactttcttgcatcatataaaaaccctacatatctatcttctcgtgccattgtttgccctgcgaatgcagtagttgatgaaataaacaattatactattgatttactcccaggagaatcaagaatatatcttagctgtgatacaatctcaaaatgctcagagcaaattccagatttcgacctgttatacccacctgaatttcttaattcaattaatgcaactaactttcctacacacaaacttgttttaaaggaaggtgttgttgttatgcttctgcgaaatttgaaccaatcgataggcctttgtaatggaacaagattattagtcactgctttaggggaaagaattttacaatgtacaatactaactagatcaatcatcggtgaaacagtttatataccaagaatcacattaagcacgtcaaaaatgaaatggccttttacattacaaagaaggcaattcccagttcgagtttgttatgtaatgactatcaacaagagccaaggacaaacacttgagcaagttggcatatacctcaagaaacctgttttcacgcatgggcagctctatgttgctatttcaagagcaacaagccgaacagggctcaaaatactgattgaaaacgatgacggatcatgtggaaaccaaacaagaaatgttgtttataccgagatactttctgctacaatggaagcggtgtgccctcactgccatattgcatatattttatctctatatttacctacattcttggtgtcacattgggcatcatttcctattgcaggcttggccgctccatgcgtagctttccctcctcagctaattgcaatggcttttgtatataaattttggagtaaatatattgtactcacatgtagtatatgctgtatcactgctgcaccaataggctactagatttctatgtgctgttttctcacttgcttagttcattacagtgatgcttcatatttacataaactaaatatcttcaatatttatttgcagccttccaatggcgtacgtgcttatttcagaccttatgtatggggacactgataaacggatcaaagcgagggtatctaggcaatgggactaccatgatctgaatgatgaaacaaagatctaccacactgatcttgtcttgctggatgaaaaggttatagtctaattaacactcatttcttctttattaatacttacatacaaacatggtactaacaaggtgctttatatacacaatatgcagggcaatagcatccatgttcaaatctatccacctgccatgattaagcttaggactcttctacaggaagggaaggtttactactttgactccttctctgtcagatatgcaaacagaacatataggccagttacgaaccctttgatgatctcattcactaaatggacaaccttagaagaatgcattgatgcttttgatgattttcctgccataactttttcattgacaccttttcaagacgccccgtctcttgtggacagaaatgctttctatgttggtataacctctttatcccttttttgtcttcctacgtttacttcttatacattagtggtttattgtttacatatatcttctctttaaccagatattatgggtgtcataactgaaattggtgcaacagacactctacgcccaaaatcaagaaacacagaaactttgaaaagaacaatgcagatttgggatgcaaggtaagctacaatatagactgaaatttccctttgttataaacttcctttaccttatattatccacactaactattgaatcatttgtttggctctttgaaacctttctaatagcaatgtcaggcaagcatccgagcacaattttcactgatcaagacgcagccattgcagcagcaattgcttttgtactcccggatataagtcattgtctttgtttgtggcacatttatctaaatggttgtaaaaatcttggtcatgtaattcataagcatcctaacaagtttctaactgattttaagagatgtgtctatcaggacagatcagagtatcatttcaacaagatgtagcatgaattgttgagtgaatacaagtttgaggataacgtatg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |