Os01g0742200
| Gene Name |
Os01g0742200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Elongation factor EF-2 (Fragment) |
| Version |
NM_001050746.1 GI:115439862 GeneID:4326544 |
| Length |
4770 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0742200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:32748257..32753026 |
| Sequence Coding Region |
32749775..32749865,32750413..32752802 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:32748257..32753026 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:32748257..32753026 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggttaagtttacggttgaagagatgcgcaggattatggacaagaagcataacatccgtaacatgtctgttgtcgctcatgtggaccatggaaaatctacccttactgattcccttgtggcagctgctggaattatagcccaggatgttgctggtgatgttcgaatgactgatagtcgttcagatgaagcagaacgtggtattacaataaaatctactggtatctctctttactatgagatgagtgatgagtcactcaaaagttacaagggtgacagagatggaaatgaatacctaatcaacctcattgactcacctggacatgtcgatttttcttcggaagtcacagccgcacttcgtataactgatggcgctttggttgtggttgactgtattgagggtgtctgcgttcaaactgaaactgtgcttcgccaagcccttggtgagaggattaggcctgtcctcactgtgaacaagatggatagatgttttcttgaacttcaagttggtggtgaggaagcttatcaaactttctcccgtgtcatagagaatgcaaatgttattatggcaacatacgaagatgcactccttggtgatgttcaagtctatccagaaaaagggactgttgctttctctgctggcttgcatggatgggctttcaccttgtctaactttgcaaagatgtatgcatccaagtttggagttgatgaatctaaaatgatggagaggctttggggtgagaactactttgaccctaccacaaagaagtggaccatcaaacacaccggttctgatacttgcaagagaggttttattcagttctgctatgagcccatcaggcaaattatcaacacctgcatgaatgatcagaaagataagttgttgcctatgctgcaaaagcttggtgttaccatgaaggacctaactggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacttggcttcctgcaagtaatgcacttcttgagatgatgatctatcaccttccctctccagcaaaggctcagaggtaccgtgtggaaaacttgtatgagggcccccttgatgatatatatgcatctgccattagaaactgtgatccagaaggtcctcttatgctgtatgtttcaaagatgattccagcatctgacaaggggaggttctacgcttttggtcgtgttttctcagggagagttgcaactggcatgaaggtccgtatcatgggccccaattatgcccctggccagaagaaagatctgtacgtaaagaatgtccagcgaactgtcatctggatgggcaagaagcaggagtcagtggaaggtgttccttgtggcaacactgttgctatggtgggtttggaccagttcatcacaaagaatgctaccctgacaaacgagaaagaagttgatgcctgtccaatcaaagccatgaaattttcagtgtcccctgttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcctctgaccttcccaagcttgttgaaggtttgaagcgtctggccaagtcagatcctatggttctctgtactgttgaggaatctggcgagcatattattgctggagctggcgagcttcaccttgaaatttgtttgaaggatctgcaggaagacttcatgggtggtgctgaaattactgtctcccctcctgttgtctcattccgtgagactgttcttgagaaatcttgccggactgtcatgagcaaatccccgaacaagcacaaccgtctgtacatggaagcccgcccaatggaagagggtctgcctgaagccattgacgagggtcgtattggcccgcgtgacgatcctaaagtacgctccaaaattctatccgaggagtttggttgggacaaggacctcgcaaagaagatatggtgttttgggccagagaccacaggccctaacattgttgtggatatgtgcaagggagtgcagtatcttaacgaaataaaggattccgttgtggctggctttcagtgggcatcaaaagaaggtgcactggctgaagagaacatgcgtggccgtggcatttgctttgaggtttgtgatgttatcctccattctgatgctattcatagaggtggtggccagatcattccaacagccaggagggtcatttatgctgctcagctcactgccaagccaagactgcttgagcctgtttacttggtggagattcaggcccctgagaatgctcttggtggaatttacagtgttctgaaccagaagagaggacatgtgttcgaggagatgcagaggcctggtaccccactctacaacatcaaagcttacctccctgttatcgagtcatttgggttcacaagcacccttagggcagcaacctctggtcaggccttccccctctttgtatttgatcactgggaaatgctgtcagttgatcctttggagcctggcaccagacagctaaccttgtcctggatatccgcaagaggaagggtctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVKFTVEEMRRIMDKKHNIRNMSVVAHVDHGKSTLTDSLVAAAG IIAQDVAGDVRMTDSRSDEAERGITIKSTGISLYYEMSDESLKSYKGDRDGNEYLINL IDSPGHVDFSSEVTAALRITDGALVVVDCIEGVCVQTETVLRQALGERIRPVLTVNKM DRCFLELQVGGEEAYQTFSRVIENANVIMATYEDALLGDVQVYPEKGTVAFSAGLHGW AFTLSNFAKMYASKFGVDESKMMERLWGENYFDPTTKKWTIKHTGSDTCKRGFIQFCY EPIRQIINTCMNDQKDKLLPMLQKLGVTMKDLTGKALMKRVMQTWLPASNALLEMMIY HLPSPAKAQRYRVENLYEGPLDDIYASAIRNCDPEGPLMLYVSKMIPASDKGRFYAFG RVFSGRVATGMKVRIMGPNYAPGQKKDLYVKNVQRTVIWMGKKQESVEGVPCGNTVAM VGLDQFITKNATLTNEKEVDACPIKAMKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPKLVEGLKRLA KSDPMVLCTVEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLQEDFMGGAEITVSPPVVSFRETVLE KSCRTVMSKSPNKHNRLYMEARPMEEGLPEAIDEGRIGPRDDPKVRSKILSEEFGWDK DLAKKIWCFGPETTGPNIVVDMCKGVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGALAEENMRGRG ICFEVCDVILHSDAIHRGGGQIIPTARRVIYAAQLTAKPRLLEPVYLVEIQAPENALG GIYSVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIKAYLPVIESFGFTSTLRAATSGQAFPLFVFD HWEMLSVDPLEPGTRQLTLSWISARGRV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1519..1609#2157..4546#agttgtccaggaggcgacggatggcgtccgtgcgtggccggccagccccaagcgagcgagattcaggctggcacccggtctacaatctacatccatgcctcccgaggccgcgggaggtatacaccatccgttacctccaatggatcccccgccttcccctgtatgctctcgtattgcgtattcccgtggccgtgcgcccgtgcctcactgcctctgctgtatgcccgtacttattccgtttgtatgatggttgaacgggtcggtactcggtagtaatgcttgctaggtgttcgttgttttgcctgacaagaagagtcgtggccttggcccgagaagcattagttacatttcgttttacagttctcagttactgaatttgttttgctgccgtacctctctgaattcccaagtacaactagtgagaaattgaccatggtttgcttggtggtaggtgccatgtctactattgtattcatattagtctttttttttctattcttaattgatgtgtagttccttataggtgccacaccaaatatgtgtagcgttgatcaaacattttagtctgacacatgacagatcagtgctttatctaattatctgttgtcttaatgatatcgaaaattccaaattgttgctctgattactattctgtgtagtacttctactcctgtcagttttccacaaacagatagttcattaggttggataagtggttaaatttagttgcaaactctgggagagatgcaactgttatcttaacaaacattggatcaggggaagcacatggagtgtagaagataagtcaaacttatgtcagattcccaaggaacatgatatcatgatacacatgcttccagtatagttatacattagcacctggctgcttcgccatttgttgtggtgatgctcatttattatagttttttgagcaagatgcacagttctattaagtcatgtaatgcattttttcattatgcacttgacagctgctgaattttaaattgactttcagtagaagtactattgatcttagactcaatatttttcttaacgcgtgcttgccattctgaaacacaatttctagtttacctgcggctgttattaactcactgcaagttattttctgaacacgaacttgtaagcaattgttctagtacaaattcatatggccatgcattatgtcagcattaatattagtgaaagtgggcaaatggatgtcgaaagaattaaaattaacactttataccatgaatgaacttccttctccatagctttattattctgattttacattaactgtgaagtttcacctgtgccaaatgtaaaagcaagataggttacttttcaaatgtttataaatgctcttccaaatttatttagcatgctgctttatctttcattttcactgtgaggtttgctaatcgaattctttttactgggatattcctggattctgactagattgatcatttcaaaacaggaaataagtttggtgtaaattgaaaatcactcacaatggttaagtttacggttgaagagatgcgcaggattatggacaagaagcataacatccgtaacatgtctgttgtcgctcatgtggaccatggtatgtttgagtagagtgctctaagactgttatacaactattatctttttcctgatatgccacctgttatgttgtcattattatttatactcatgcaaaaaaaaaaaaactactattcctttttgtagtagtgactgtcagtgctcctgccttttttttttcagaaaaagggcccatgctaagaacttttgctctttatcatctgtagttaatgtgttattgtcatatttatttttgcttgatatgaaatgtctgtaagcaaattaactgtatctgccttttcatttgcatgatctcaaaattaaaagctagcattttatagtatcaccttcatgtgtgcatccttcatcctgctcactgtttgtgctttttcgttaattaataaagtaacttacttgtttggtctgttatcacttctttgtttaacagagggttcctgatttcctgaatatattatgctcttgttttcctatttgtttgctgattcaacatcttgagttatatttgatgcaacaatgatgtttgatctgttatgatttctttgcaggaaaatctacccttactgattcccttgtggcagctgctggaattatagcccaggatgttgctggtgatgttcgaatgactgatagtcgttcagatgaagcagaacgtggtattacaataaaatctactggtatctctctttactatgagatgagtgatgagtcactcaaaagttacaagggtgacagagatggaaatgaatacctaatcaacctcattgactcacctggacatgtcgatttttcttcggaagtcacagccgcacttcgtataactgatggcgctttggttgtggttgactgtattgagggtgtctgcgttcaaactgaaactgtgcttcgccaagcccttggtgagaggattaggcctgtcctcactgtgaacaagatggatagatgttttcttgaacttcaagttggtggtgaggaagcttatcaaactttctcccgtgtcatagagaatgcaaatgttattatggcaacatacgaagatgcactccttggtgatgttcaagtctatccagaaaaagggactgttgctttctctgctggcttgcatggatgggctttcaccttgtctaactttgcaaagatgtatgcatccaagtttggagttgatgaatctaaaatgatggagaggctttggggtgagaactactttgaccctaccacaaagaagtggaccatcaaacacaccggttctgatacttgcaagagaggttttattcagttctgctatgagcccatcaggcaaattatcaacacctgcatgaatgatcagaaagataagttgttgcctatgctgcaaaagcttggtgttaccatgaaggacctaactggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacttggcttcctgcaagtaatgcacttcttgagatgatgatctatcaccttccctctccagcaaaggctcagaggtaccgtgtggaaaacttgtatgagggcccccttgatgatatatatgcatctgccattagaaactgtgatccagaaggtcctcttatgctgtatgtttcaaagatgattccagcatctgacaaggggaggttctacgcttttggtcgtgttttctcagggagagttgcaactggcatgaaggtccgtatcatgggccccaattatgcccctggccagaagaaagatctgtacgtaaagaatgtccagcgaactgtcatctggatgggcaagaagcaggagtcagtggaaggtgttccttgtggcaacactgttgctatggtgggtttggaccagttcatcacaaagaatgctaccctgacaaacgagaaagaagttgatgcctgtccaatcaaagccatgaaattttcagtgtcccctgttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcctctgaccttcccaagcttgttgaaggtttgaagcgtctggccaagtcagatcctatggttctctgtactgttgaggaatctggcgagcatattattgctggagctggcgagcttcaccttgaaatttgtttgaaggatctgcaggaagacttcatgggtggtgctgaaattactgtctcccctcctgttgtctcattccgtgagactgttcttgagaaatcttgccggactgtcatgagcaaatccccgaacaagcacaaccgtctgtacatggaagcccgcccaatggaagagggtctgcctgaagccattgacgagggtcgtattggcccgcgtgacgatcctaaagtacgctccaaaattctatccgaggagtttggttgggacaaggacctcgcaaagaagatatggtgttttgggccagagaccacaggccctaacattgttgtggatatgtgcaagggagtgcagtatcttaacgaaataaaggattccgttgtggctggctttcagtgggcatcaaaagaaggtgcactggctgaagagaacatgcgtggccgtggcatttgctttgaggtttgtgatgttatcctccattctgatgctattcatagaggtggtggccagatcattccaacagccaggagggtcatttatgctgctcagctcactgccaagccaagactgcttgagcctgtttacttggtggagattcaggcccctgagaatgctcttggtggaatttacagtgttctgaaccagaagagaggacatgtgttcgaggagatgcagaggcctggtaccccactctacaacatcaaagcttacctccctgttatcgagtcatttgggttcacaagcacccttagggcagcaacctctggtcaggccttccccctctttgtatttgatcactgggaaatgctgtcagttgatcctttggagcctggcaccagacagctaaccttgtcctggatatccgcaagaggaagggtctgaaggagcaaatcacccctctgtctgaatacgaggacaaactctagatatttaatcatgttattatgcttatagtgttatatcgctttataattggtagtggccatctatgtgagcagtgagctgctatttcatgtataatattatgtcgaacggttgtacggtagcatgggatgatgatcaggcgatattgttataatttgttatggtatttaccatcatatcat</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
