Os01g0808100
| Gene Name |
Os01g0808100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Transcription factor HBP-1b(c1) (Fragment) |
| Version |
NM_001185683.1 GI:297720500 GeneID:9266109 |
| Length |
6774 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0808100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:36062389..36069162 |
| Sequence Coding Region |
36062677..36062823,36063371..36063619,36064122..36064127 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:36062389..36069162 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:36062389..36069162 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtggttactggcagggcaattagagcctcttacagagcagcagcttgctggcatagccaacctgcaacaatcctcccaacaggctgaagatgctctttctcaagggatggaagcactacaacagtcgcttgcagagaccctggcatcaggatctctcggccctgcaggatcttctggtaatgttgcaaactacatgggacaaatggcaatggctatggggaaacttggtaccctagaaaacttcctacggcaggctgataatctgcggcttcagactcttcagcaaatgcagcgcatattaaccactcgccagtcagcacgagctctacttgcaataagtgactacttctcccggcttcgtgccctgagttctctttggctcgcccgtccaagggaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MWLLAGQLEPLTEQQLAGIANLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSL AETLASGSLGPAGSSGNVANYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRLQTLQQMQRILT TRQSARALLAISDYFSRLRALSSLWLARPRE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6340..6486#5544..5792#5036..5041#acccaacccaacccaacctcaacctcaacctcaagctctcctcctccttcctcctctgctcctgctcctgctcctgctgctgccgtgtgctctgctggctgctcctgctggtgaggtggtggtctctctccccccacttcaccatctcctcctctccttcgccgccggcgcgcttgcttcctcctcagcacgccacctcctcgcccctcctcatagctcaatcagattactcgaccgtgcaaacatcctgaccattttctacagccccgcgctttagcgttcttgtttttttttttttggctgctgctgatttggtggcggcggctatcttggagagagatacagaatccgtgcttcttcttgagcgagctggttggttggtggcatgaggcgtggagagcttcagagtgagtgccatggcgcgtgttgattgctgttggtggtgagatggagggtggtaggctaggaggagcggcggcttcagcatcggcggcggcggcggcggacgcgcgcggcgggatgtcgggcttcgcggctcctcagcacgccatgtacgcacacctgcctctccatttcttgatggtttctcttctcccattctcctgctcatttctgcatgctctgtgctgtgtctttacttgtcttagcttctttttttttgttatttttctgagtgagtatgatcccctgattgctgattagttttgttaatcgagcatggatcgcggatgattgctcattctgcttttccagggaaaaaaaagttgactgctttttcagctgattagctcttgtcgatgagtggagtggtgccctttagctcaagtattgtaatgattagagagtggagtagctttagtactgctccttagtctaggtttttggttgctgctgttcttgttcttattatgcttgtggagtgcaaagaccttaagtagccatgcggcccatcactgatcactggaccacctatgtactatatatgttctgaaccaggacactggattagcaccactatggtaggccccagatctccaaaaagggtaaacaggatatgctgattgggcttgatcatgcatagtttgggttagctcataatagagtgaagcatggaccagggagtgtgacacattgtggtggaaaatggacttttgctgaactatgccaggtttctgtcataatcttcaaattcttaatcaacagatgttgaagaaccctttttttttgtattgctctgcagtctgaacaaatttgggttcttgactgctactgcatgcaatgggcatgcaagtttgcgaccaatgcaactgaatggtgtgctgttattcttgtatggaaaagaaatgataggttgcaccattgactgttgttgaatggacattgtgtgatgctcataggatgtatttgatatgtaagtttttgctgtgtagattcactattttctgttctgtaactgatctggtgtacaaaacttttcagccatacaaatttgaacaacgtgcaacctactcaagttactgattttggggcacttgcgcagtctgctggattccgaatagaagatctcgctaatctcagtacaagtatgttggcaatcaaatatgctagagaattccttttttccatatgttgttttcttgctttataaatttcaactgtgtcatttctacttttctgcaatggagttttcaccatacattgcacacagctacaatgctgtaccattaatgtcaataaaaatcccctataccttttctgtcgactgcctgtggcttgaacacttttgctttatttttcttatttccagatggtttgttcaatctgaagtcaaatgctcataccattatcaatgaccccctccaatttgagaattatgtaaaggtatgcaggccatgaacggataattcctcatgacagatctgatggtcttttataaagtaaaattccacccacaccaggaattcatgcagttttccctcctggttgcagtctatttctccgtctaatattactacaacagcaacagtaacagtagttgaccctcagacactggtcccacaaaagggagcacaactgaatttggtaactataaggactggtaacgttgagaattggggggagtcgactattgctgatacaagtccaaggactgatacatcaacagatccagacactgatgagaggaatcagatggtaataagacgcctatcattttgaaattactgtttatcatgatgatatgaatttgtttaaaactgttcataccaggtttgggatgtttgaattttctttcaaatacctttgtaaagaattgcctgaatttgtgataggtacagcctttataattctactattatatgcatgtggcgattgattttttatgtgttaaggactgatggttcataacttcatatgtgccattgagttcagattagctgatgaaacaattcagtgtagcactacttgtagattttgccttccctagactaatccttgcatgctgcctataacattcttggagcatgtggaagctttagtatatgtacattgatcctcaatcatgtaaataattgaattttcccattaacacaaccacttcaattattttgtattattttcactttatttatgcttttttggggttgaatgctaaatttatactcaatcatatcgatttattggctatatatacttaacagtttgaacaaggacagttagctgctcccactgcttctgattctagtgacaggtcaaaggacaaactagatcataaggtatgcgctgtatcaccacatacaatatgctttgatcatacatgcaatccaccattcaaagtaaatgactctttctcaacagacacttcgccgccttgcccaaaatcgtgaagctgctaggaaaagccgtttaagaaagaaggtgtgtttgtaactttgtatgatcttgaaatgttttatctgatattgttgttgaatttgaacttctactgagctacatatatattttctttcatcatctcctgtctaacaagctactttctttaagtagtgtgttacggattatttttaccctgaaattccattagtagcctataaacttgtcctaaaccatgatagtatttgcaattgtagattagataagcatttttttttaaaaaaaattagccctttttcttcagtttgtgctcttttggatgctttgtatggtttcatcatttattttctgcaggcatatatccaaaaccttgagagtagcagattgaaacttactcagatagagcaagagcttcagcgggctcgtcaacaggtagaagctcaatatttttcttgcaggatttatcagaagtttcaagagataaacatgtattcggtttaattgtccaacatgtgcttcagggcatttttatatcaacatcgagtgatcagtcccactcagcgagtggaaatggtaatagtgtactgacttttctctttttctagaattgttggttaatataagcagtgctgtctgttgtattttatcatgtgtcttttaatcatcatttttcttcggtattacttgggataaaggagacaaataaagagagaagaagatagacacgaacatgaccaactatgactagctatcacgatacactactttatacttaagagtcttgtgcaagaaaaaaaaacttctttaggtataataacaaattgtagatatcatggtagctagtttcagttgctcattgttaagtatccaatatactgccaatgcctttttatggtaatgtactgatgttttctaatctgtaggagctttggcatttgacatggagtatgcacggtggttggaggagcataacaaacatataaatgagttgagggctgcagttaatgcacacgctggtgataatgatctcaaaagtacagttgatagtattatggcacactacaatgaaattttcaagctcaagggtgtggcagccaaagcagacgtttttcatgtgctgtcgggaatgtggaaaacccctgctgagaggtgcttcatgtggctaggtggcttccgatcatctgagcttcttaaggtaagaatatactattattatattgcgcctacttattttgaagcctcacccggaggcaaaatgctgacctgaatatatattattttaattgatccaatatttttcttaggctctgttttttttgaaaggaatactaccaggcaatggcccagtagtgtattttatagaagccaacaaagtttttacagggaaaaaaagaaaaaatacaaaaggctacaaccccctatagaagctataaagtttgtaaccaattagaaaccaattgtctaagatcatcattcatcctacacatatgtagaagaatttcatgcttaaaagaattccaccagctgtcaaatgaaggatctatattctggaaaatctttccattcctttgcttccaaatgtgccaacacgcaatgaaataaatctccaagaatccttttttctgaaatctcaatcttgctagcaccagcatccttttttctgaaagaattctagagaagtgttccaagatattcccagcttctgccaacattttctactaaaagggcattgaaagaacaggtgagacaaagtttctctgtcatgcaaagggcataagacacaagtaagatcagcatttaggggggcgtattttctcctgtccaacatgtctctcgtgttcagcctatcagagaaaagaagccatatgaaaacttttatcttcatcacacatttgctcttccagatccatcggaaaggtctgggaggttgcgtggatgcaaaattcaacttgtaaaaagcttttgaggtgtaattgttcctgccccatataaaactccaattatccccctgctgacttgctaaggacagagcatccagctctccctttagcagcagaaattctgtgtaagcttcctgggtcagtggcaacttaaaacaatcctcaaaaggtttagcacaggtgacagccaaggaatcatttctggcaatggcatggccacatagatgtgggtaagtgatgctcctaatttggtcattccacatgtcgtcccaaaacaaaactgtgttacctgagataacctcacactttgcaattcccctgaagtaatctgaaagagaattttttaagagaattcccctgaagtaaactgtgttacctgagatagcctcaaaactgtcttaggctctgtttggaataagagaatttttctcgctcaatttctgtgtgaaatgaactatttcttgtgaaatttgttgcactcgaaacaggtcctttttgtctttgtgattaaataattgccttcatgacttttgaccgacttgaaagctagaaaagctcacgatctacatttctaattagatattatattgttttgctttgctttcccttttcttttataaaaaaatagtcttttgtggaattcaccaatctagttatccctatccacacagttcgtaacaaattcaagatgactgacatctagttccttttataccaacatttctgctgcagttactggcagggcaattagagcctcttacagagcagcagcttgctggcatagccaacctgcaacaatcctcccaacaggctgaagatgctctttctcaagggatggaagcactacaacagtcgcttgcagagaccctggcatcaggatctctcggccctgcaggatcttctggtaatgttgcaaactacatgggacaaatggcaatggctatggggaaacttggtaccctagaaaacttcctacggcaggtaacttgtatttgcttacctcctattttataacctggtttgtttgttcaatattgttcgagttggtttgtgcaatctatttggctcatgcattgtacttggacaactaacgtggcaccttttctgtactcaatagactgttctagctggtgctaatgcacataattaaatgggttaattagatccatgcctttgcaaatatgggttaaaagtgagattgcaacctctctctcatcactaattatattggctcattgtctaaaaattaattaattattccctctgtcccagaacatgatcattttcagcccctcccatttgtcccaaaacaagtttatttttaagcaatcattgcattgaaatttgtcaaagtaggggataaatacattgggaatagataaaaagataaatagacatgtttctgtgttgactaatacagaagggaaaataaccattaaacggaataccaagaaatagacatagagaaatgtatatttctgttgcaaattgtaacttttggtgaactataacgatgccttatctgcaggctgataatctgcggcttcagactcttcagcaaatgcagcgcatattaaccactcgccagtcagcacgagctctacttgcaataagtgactacttctcccggcttcgtgccctgagttctctttggctcgcccgtccaagggaataaataaattgaattgattcgtaagtaggatattgttaggtaatgtatctctagtgttatatcagataggaattgaggtattccctacttcctagattcttcacaatgttcatgtattggtgacagactcggatcactatctttccatgtatgtcttcaagtgaatgttcaatgcatattgtagtctgtatatgacatcatatgatgagttgttgggcaaatttgtaacatttttgagaaaagtggggatgtaaatacttgcagaataattttagagcttatccagtgatt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
