Os01g0843300
| Gene Name |
Os01g0843300 |
|---|---|
| Description |
Ras small GTPase, Rab type family protein |
| Version |
NM_001051310.1 GI:115440990 GeneID:4327503 |
| Length |
6235 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0843300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:37978195..37984429 |
| Sequence Coding Region |
37978195..37978399,37978504..37978631,37978723..37978869,37979760..37979936,37980057..37980305 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:37978195..37984429 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:37978195..37984429 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgctcgcggcggcgcccgcgaatctggcgggcaagcagagcttgcgagtcgtcgtcatcggcgaccctggcaccggcaagtccagcctcgtcgtgtccgccgccaccgaggcgacgtcccccgcgtactgccccccacccgcctccccgtcgactacttcgccgaccgcatccccatcaccatcgtcgacacctcctccagagcagaggtcgaagctgatcgccgagtgccagtcggcggatgtggtggtgctcacctacgcctgtgaccaacctgcgacgctggagcggctcagctcattctggttccccgaactccggcgcctccagttggaggcaccggtgattgtcgtgggatgtaagctggacctgaggggtgaggagcagggaactcttgatgccgtgatggcacccatcatggttgcattccgagagatcgagacctgcattgagtgctctgcgcttcgccagatcctggtttatgaggtcttctattatgcacagaaagcagtgctttacccaacagctcctctatttgatcaggaggcacagatgctaaagttacgctgtatgagggctttgaagcgtatatttattctatgtgaccatgacagggatggagcttttagtgatgtggagctcaatgattttcaggtcatatgcttcaatgctcctctccaacctaatgaaatcataggcgtgaagagaaccatccaagagaaattgactgaaggtgtaaatgaaaatggccttaccttgactgggtttcttttccttcatacccttattattgggaacggaaagctggaaactacttggaccgtgttgaggaagtttggctatgataatgaactcaagcttagagatgacctcattccagcaattaaacgagctcctgatcaagatggagctttgcaacctgctgaaatcaatgatcttttttcaaccgcacctgaaaatccgtggtcttctcatctgtacgagaactgtgctgaaaataatgtcttgggtggtttgtcgtttgaagggttcatctccaagtggactcttatgacacttatacacccgtcaaatagttttgccaaccttatatatgttggctatcccggcgattttgattcggcatttaccaccacgaggaaaaggcgagtagaccgtaaaaagaagcagactcagagaaatgtgttccagtgttatgtttttggtcccagacatgccggaaagactgcattgctacaatcattccttaaaagatatcactccatagggactagaaagacacttgtgatgcgagaaatttctgaaggtgatgttggaccattactatcagataaggaatctttggcaccctgtgatgtagcagtaattgtttatgatagtggtgatgaagtttcttggcaaagagcaagagaattgcttgtacaagtggccacacggggaaaaaacactggctatgaagttccttgtctgatagttgctgctaaggatgacctcgaccaatctccgttggctctgcaggactcaactagagtgagccatgacatgggaatcgaaacaccaattcctattagtgtaaggttgagggatttgaacaatattttctgccggatagtccatgcggcgcagcagcctcatttgagcatcccagagactgaagctgggaaaacacacaggcaataccgtcaacttctgaaccgttccctcacggttgtctcagtaggagcggctgttgcagttgtgggcgtagctgcttaccgggtttacgcagctaggaagaacgcgtcatcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALAAAPANLAGKQSLRVVVIGDPGTGKSSLVVSAATEATSPAY CPPPASPSTTSPTASPSPSSTPPPEQRSKLIAECQSADVVVLTYACDQPATLERLSSF WFPELRRLQLEAPVIVVGCKLDLRGEEQGTLDAVMAPIMVAFREIETCIECSALRQIL VYEVFYYAQKAVLYPTAPLFDQEAQMLKLRCMRALKRIFILCDHDRDGAFSDVELNDF QVICFNAPLQPNEIIGVKRTIQEKLTEGVNENGLTLTGFLFLHTLIIGNGKLETTWTV LRKFGYDNELKLRDDLIPAIKRAPDQDGALQPAEINDLFSTAPENPWSSHLYENCAEN NVLGGLSFEGFISKWTLMTLIHPSNSFANLIYVGYPGDFDSAFTTTRKRRVDRKKKQT QRNVFQCYVFGPRHAGKTALLQSFLKRYHSIGTRKTLVMREISEGDVGPLLSDKESLA PCDVAVIVYDSGDEVSWQRARELLVQVATRGKNTGYEVPCLIVAAKDDLDQSPLALQD STRVSHDMGIETPIPISVRLRDLNNIFCRIVHAAQQPHLSIPETEAGKTHRQYRQLLN RSLTVVSVGAAVAVVGVAAYRVYAARKNASS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..205#310..437#529..675#1566..1742#1863..2111#2758..2813#3033..3114#3654..3878#4312..4424#5232..5382#5746..5932#6162..6235#atggcgctcgcggcggcgcccgcgaatctggcgggcaagcagagcttgcgagtcgtcgtcatcggcgaccctggcaccggcaagtccagcctcgtcgtgtccgccgccaccgaggcgacgtcccccgcgtactgccccccacccgcctccccgtcgactacttcgccgaccgcatccccatcaccatcgtcgacacctcctccaggtcctccactgcccctcacgctagatttgcgggtgtatttttttttgttgggggatttgtggattttgattcgttgacaattctgaattgctgattcagcccagagcagaggtcgaagctgatcgccgagtgccagtcggcggatgtggtggtgctcacctacgcctgtgaccaacctgcgacgctggagcggctcagctcattctggttccccgaactccggcgcctccaggtgaggctctgcactcactgccggaattgattggtaattttgtggattaattttgtccgctgtggctcatgttttgttctgcttggctcagttggaggcaccggtgattgtcgtgggatgtaagctggacctgaggggtgaggagcagggaactcttgatgccgtgatggcacccatcatggttgcattccgagagatcgagacctgcattgagtgctctgcgcttcgccagatcctggttaatatgtctgcagtcataattttgtgttgataggttgctctgagatagggatgcttggcacattgctgcacataattaagttaatagctacaacactagctagatcataattttattgtattctaggcatgaacttgttgtacttttactgggcaatacttttattatgtactgtgtttattagctaaccagtagcaccaagttggacagactagagtaatattaccaataataattagagcagttttaaaaattatgaaatatacaagaaagtattacacgatattctgaatacacagggacattctctctgaatttgggtttctttctcagaaaaacccaggcaactctattattctttgtttatataaataaaagtcgtattatgttttgggccataatttattttacaatataatattgacatctagggaattaacattcatgtgaaagtactttgcaatagaaatgcaatggtatcatcttgtatggcagtaaacatagtaacatactatatttgttaagtcaatagttataaattttgaattttccaaattcatgtgtgacttgtagttatcaatggagggagtacatgataattctgtctgatgctgttaggcttgagtccatggcctttctcatccatgactggctgttgtagcgagtccagcacgctgcgcgcgctatggcgtgtttccctcacctgcctagtctcccgatacttgtttccacaaatcggttgatgaaatttggcaggtgttggactgtttgtatcagttgtacaatgaattagttaattatcgcatgaattatttgaaccatcagatgcattaaaagtccagacattgtgctagtctctagctaactataattgcgtatgtttgcaggtttatgaggtcttctattatgcacagaaagcagtgctttacccaacagctcctctatttgatcaggaggcacagatgctaaagttacgctgtatgagggctttgaagcgtatatttattctatgtgaccatgacagggatggagcttttagtgatgtggagctcaatgattttcaggtttgtagccactaaagctgccttggtttctttgattagtgtaaggcaaactaatgcttgcactatcattctattaatacttctggtgatgttaagaatctccttttggctgctttacaggtcatatgcttcaatgctcctctccaacctaatgaaatcataggcgtgaagagaaccatccaagagaaattgactgaaggtgtaaatgaaaatggccttaccttgactgggtttcttttccttcatacccttattattgggaacggaaagctggaaactacttggaccgtgttgaggaagtttggctatgataatgaactcaagcttagagatgacctcattccagcaattaaacgagctcctgatcaagtaatgttgcccttttgttgcttccagctatcctgtgtactatctgtataaactagagtaattgtacatgtgcatgatcttaacactgatagttaattgttttagattctataaattgagttgctctgaattcagattttagaggtgaatttatgagaatttagggtaattgatcgtttgttatgctttttatttacagtttatatatacaccctttggtattttcatcactaacattactactgtggtaaaatatccgcactcttaagaactcctaaactgctctagaaaatgtgcttgtaatttgttagtcattcaatttgatgcgaatctatggtgttagcttcactaagcatcttcatgtttgatatttatcatacttctggtttattatatattttgctgataattaatttaaagtcaaatcattttttttgttccaaaccttggaattgaaaagtcaagtcattgatttcttgagagggatcttcaacatgtttgacacagacaatgtaagttctatgcactgatgtgattgttattctcctgaatcgtattcaactctttgttgtactgagcattttttgtaataaaaactgtcattttacattgataatttgaaaatgccttttggtataatatccaggatggagctttgcaacctgctgaaatcaatgatcttttttcaaccgcacctgaaaagtaagaagctgatagaacgccctttcatgtttaataacttgatactttcattgtaacaaaaagttaggttaccaaaattgttaaatatttcttgtattaatttctctattggacttgatgtaatgaagattctttgcattagaagggtgtgaagaattactatttaataatctgtctgttgatatttcctgtatcaatactcttctattggaatttcagtccgtggtcttctcatctgtacgagaactgtgctgaaaataatgtcttgggtggtttgtcgtttgaagggttcatctccaaggtattttctcaaactttgcatgataagagttgacacaacaattgacaaccctgtatttttttgttgatggattgaccttttagcaaattattatttgttgattggtttcaaaacaagaaagagaagccctttctctattcagaactcacacgcattgtatttattggtgtggctgtcctgtagcactgtgcaagattctttcatgactctaggaaaccccatattgttgttcttttaatctctatattcattgatctgtgcattctgagcatcaaaactaggtatggaatagattgcttacagtgcatgtaaagtattaagcaaattaatctgggagcaatcatatcttgtataaggagcacgcagtgtttaatatgaactatataatttgtcttgacaaacctgtgggggtgttgttaggcagaaaattgatctttgatttctagaattttattgttgctttaatcttgcgtttggaaaatactgaatttccttattggtctgttttcttttattgactaattattctgtaattgcagtggactcttatgacacttatacacccgtcaaatagttttgccaaccttatatatgttggctatcccggcgattttgattcggcatttaccaccacgaggaaaaggcgagtagaccgtaaaaagaagcagactcagagaaatgtgttccagtgttatgtttttggtcccagacatgccggaaagactgcattgctacaatcattccttaaaagatatcactccatagtattttatatcatgaactttgtttgccatggttatttcttctgatattctcactttcactcttggtccttgcaataggcaaccttccgatgctcctcctgtcaatggtgaacaatttgcagcaaatactgttgaactgcctgatgtaagtattcgaaattcttgatttattttgctcacaccatatgcaaccattttgatagttttattttgaacagtgcaacatttactcatgtattcgtaagtattctacagtctgagatgacagatactctttaaacaatccatattcttgtttattaaaaaataagtaactagcaacatatttatatgaaaccataattgatctgcatcttaacacttgataatgtgtgtcacaaacaagttagtttctaactgtttggtctgattcaataattttcttccactgaaggggactagaaagacacttgtgatgcgagaaatttctgaaggtgatgttggaccattactatcagataaggaatctttggcaccctgtgatgtagcagtaattgtttatgataggtatgctatccactgaattatccccctctttattcatggccataagttttgtcagttgcatttttctttcatggtcactgaattcttcctttttattcatgacaaaaatcctcaatacacagttttcagtagcagcactcctttcccattagctatagcagtatgatttgtttataaacctggcatactatgagagaactttatttttgctttagatgaaatcaattttgttgttgtgatgcatttgtattaaccccagtgacaaaaacagaaaccaactgccaacaaaaagagaaatttcagtcccccaaaaaataaaaaacagaaatttctcttgttttagagacacgtcaacatcttgtggtagctatcaagggatctaaacaaactagcagtaactggaggtccacagtttggtaggactggcaaataacatatgctgatggtaatctaaatatagacttgaaaccaacagctaactgcctgggtactggtatgggatgttcatctccacaaggaatatgaattagcagtacaccacttaaatagaataaccgactacacgatactgtcaattggctcgttgaagtgactgactttaatcctttatcctgtcaattggtttaaatattcgttgttctatgcgagccctcctgctgacagttcacagattcaggattgaaccaatgtagtaattcagaagttcgacacataaatattgtttattcagatgtacctctctctatattatctattcagttgtacctaattttctgcacacaaaatgtgatgctgttgaaatggcagtggtgatgaagtttcttggcaaagagcaagagaattgcttgtacaagtggccacacggggaaaaaacactggctatgaagttccttgtctgatagttgctgctaaggatgacctcgaccaatctccgttggctctgcaggactcaactagagtaagcttcaatacaatattgattcatttttaaactgttatattttatttacctctgagaatcatttgtcctttttggcacagttggttggttgaactggaattagatatttgaatgaatcagtccccccacccttttttttttcttttgcttttgctaattggagaccaccatgccagtggttgtttctgctgcctcatggaaaaactcttgatcaaactgtgtcgttccaagtcaacattcatacaaatggactgatttgtcaatattgtctactattgccaccagttttctttatgtctgatctctacagctatggattattttcagttgttttaattcaataaaatcatgtacttgtaggtgagccatgacatgggaatcgaaacaccaattcctattagtgtaaggttgagggatttgaacaatattttctgccggatagtccatgcggcgcagcagcctcatttgagcatcccagagactgaagctgggaaaacacacaggcaataccgtcaacttctgaaccgttccctcacggttgtctcaggtaagttagtgtcaagcttctgcctctaaagtgtgtttctgtatttgcctttatgctctggcacaaatcgatcatgccaattactacagaatagtaagagcacaggtttagtaagacaataaaatctaaaagtaatagttatttatgattttgagttgaaactgaatagtggttttatcttaagttggttgagttctaacacaactgatggtgtgccaataatttgcagtaggagcggctgttgcagttgtgggcgtagctgcttaccgggtttacgcagctaggaagaacgcgtcatcttga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
