Os01g0856600
| Gene Name |
Os01g0856600 |
|---|---|
| Description |
Nsp1-like, C-terminal family protein |
| Version |
NM_001051382.1 GI:115441134 GeneID:4324750 |
| Length |
7770 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0856600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:38761595..38769364 |
| Sequence Coding Region |
38762219..38762311,38762832..38762930,38763001..38763088,38763950..38764009,38768534..38768682 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:38761595..38769364 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:38761595..38769364 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>agccccaaacccctccttccccttcctctcaagccggcgcggccgacgagcccgcggcaaaaccacgcaaaaaatctgccaaaagaagatcccccaaatccgccaccgcgctcacgccggcgcagccatggcgacctccttctctttcggctcttccgccgcgtcgggatccaccggctcctccccattctccttctccaccggcaccgccccatcagccttctccttctctcagcccgccgccgcacccggtctgttcggggccgccgcgtccgctgcttccgcgccaagccttttctctggcgccgccacgggctttggctttggctcagctgcgtcgggcaccaccactgccgcgaccgctgctgcctcgacaccgtctttcggcttcgggtattccaggatgaacggctgttgcttcgtgaagatgaggctgcttctgcaagagatacaatgtttgagcaatctgaaactgtggagaatgaattgcaacatatgacagaacaagtgaagtccatcattcagacattgaatgctactcagggtgctgagtttgagactgctgatagtatgacaccatttgatgttgctgtccggatactggataatcaactgcgttctttaatgtggatcgatgagaaggctaatgagttctcaagtagaatacagaggctacctaacaacagtgctgcagctgaacgtgactctggaatgccaaggttttggttaagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>SPKPLLPLPLKPARPTSPRQNHAKNLPKEDPPNPPPRSRRRSHG DLLLFRLFRRVGIHRLLPILLLHRHRPISLLLLSARRRTRSVRGRRVRCFRAKPFLWR RHGLWLWLSCVGHHHCRDRCCLDTVFRLRVFQDERLLLREDEAASARDTMFEQSETVE NELQHMTEQVKSIIQTLNATQGAEFETADSMTPFDVAVRILDNQLRSLMWIDEKANEF SSRIQRLPNNSAAAERDSGMPRFWLS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7054..7146#6435..6533#6277..6364#5356..5415#683..831#2..247#aagccccaaacccctccttccccttcctctcaagccggcgcggccgacgagcccgcggcaaaaccacgcaaaaaatctgccaaaagaagatcccccaaatccgccaccgcgctcacgccggcgcagccatggcgacctccttctctttcggctcttccgccgcgtcgggatccaccggctcctccccattctccttctccaccggcaccgccccatcagccttctccttctctcagcccgccgccgccgccgccgccgccgccgcctcctcccctgcccccgcctccgccccagccttcggctcctccctcttctcctcctcctcctccgccgccgctcccacttttggctcctccctattcgggtccgcccccgccgcctccgccgccgcccctgccacctcctcatccccatctccgtttggcttcggatccaccggcttctcgttcggccaatccaccgccgccgccgcgtccgccccatccatcttcggcgcgtcctccacccccgccaccgcgaccacccctagcgtattcggcgccgcatcatccgcggcatccacccccaacatcttcggcggcgccacctcctccccggcgaccaccccgagcttattcggcggtgcttcctccgcggctaccgcacccagtcctttcggcgccacctccgccgccgccgccgcacccggtctgttcggggccgccgcgtccgctgcttccgcgccaagccttttctctggcgccgccacgggctttggctttggctcagctgcgtcgggcaccaccactgccgcgaccgctgctgcctcgacaccgtctttcggcttcgggttgaacaccggggccgctgcatcgagtaccaccactacttcggcttcctctccggctctagggtttggagcaggcaccggctcggcgctgtttggatccactacctctgcaccactcttcagcaccaccaccgcctcgtccccagcgaccacggccacgaccacggcgtcctttggcttctcatcgtcgccagcgaccgccgcctctgctccgtcgttcggcttcacaccgtcatcggcaaccaccacgaccgcgagcaccgcccctgccttgttctcttctgcatcttccgctcccgccttctccttcacgaagagtagctctgctgctcccaccacgccagcgtctgctccatctactggcttctccttggccacttcgccggcagcacctgctccctcattgttctctaacaccagtgcagcagcaagctcgtctgccacttctctcagctttccgtttggctcatcttctgcttctgcaccggcatttgcttctgcttctgcaacgagcgcatccacaccgtcagcagctactgcttcccccgcgacatcagggtcattgttctcagtgccagcacctgcttcttctgctggtggtttcagtttcacagtagtaccatcgtcatcatcagctgcggctactacagctactaccacaacagtcacaagtgcatcgacatctgcagccatgacaacgccggctccttcagcaacaacaactgctacactatttagccagcagagaactacaccagcttctgcctcagctccatcaacacagacacagtcaatattgtcattcggtgagtgctcatgttcttgttaaaactattgttttattttcagtctaatttgaccataccatttacataccttgatttaccggcagtgaacaattaaatgtcaccctcatgcaagtaaccatttagctcataacatcgcaaataacttatttgtatcatcatttgaggacccgatcattgtgcatttgcctttcctatgcaatacaggaaattgttgttgtaacgcactgttttgactataatcattaccttgcaatctgtttcctaaatcttgaggtgatcacttttcagtctattttgattatcacttttcagtctattttgatgatgtccagatttatgttaagcgggtattttcaacaggtgtttctactgtagctgcaagtacttcaaccaccatcacaagcactagtcaggcaacttcctcagctgttcaagctagcagcactgggtttgtacaaatcccgtcgatttatctctagcatacttattaaagggtctgggctacaagatattgaccttgttcatggcctccctgttcttttggtgcagtcctacaactactgctatcactccagtagcatcacaggcacctaagctaccatcagaaattgttgggaaaaatgttgagcaggtactgcacctattctttgcggttataaggtgttgttttctactgcaacacttactttctagtttgactttgcattgtcttgttaattaccttgagcaacacagtaatattttaccgacgaacttatctatattgtagattattagggactggaataatgaacttcaagatcgcactgcgaagttccggaagcatgccactgcaatatctgaatgggacaggagaattctgcagaacaggactgttcttataaggcttgaggtatgttcttatttttacattttacagctcttcttttctagttctgttcatatgaacttttgcagctagatcaatatcagaagatttgatggttatatatttacttctttattgctgatttggttttgcaaagtcatttgcataaagacaatatttatgaaaaatgattacaattagttgaaagcagggtagaaggaagcctggttggatttgaatagccatgcttaccctatggactctagaatttatcactggtaatgcaaacttacaaagacttggaggtttcattcttagcagtagttttaaattgaacatgaaacatgaataattatttgattatctagtagatgattgtcttgcgcaatgcatgttgatttgacttattcatgtaaagccgatgtattgttgcttttaaaagtgtacatgattttttttatttatcctcacccttttgcatatattttatgtaatttagttttgattattgatggaatgagaaattaggaaaatgaaaaactaggaagtctgaaagtgaacgaactgctttttccttgctgttcactggtgagctttatcagtcgaatgtaaagcagggaaatgtgtatatcaatgccctatcactagtcagactgtgattgaagatgtaaaaactatgccaatattctgcctttgcgaaatacatgtgcaatgctacctctgatccaaataacttgtttcagctcccctaacttgattcaaatacttcacatgtgatatctcctatagttttttctaggatgctcttggtaaatattgatagctatgatgatctccctctcagctgcctatcgttcacattagattaatgcgagaagatatgttcatttcatgaatttcttcgtttagtactaattaagttagtgctgatgttgtcttcccaccattatcacctcttgagctggtgcttttctggatagatgtgtgttagcatgcatacatgtttatattactcaaaagaactttatataattagatcatttgctgtgatttaaaataaattttatgtcccttgcaggctgaggtggctaaagttgttgaaacacaaacaagcttggagaggcaacttgagttaatagaaactcaccagaaagaggtgggtatggatgcatatatttcatgtcttctgcatactctagttatgacttttgtttttgttgcatgcttgtttgctctttcatttgctgatccccatggatgacatcataatattgactagtgaattgctttcctgtaagctcattatttatatgctatgctgccagggatgcatcatatttcggctgtcatctccttttttacacaattgcgcacaatatggttaatgaagataggttgactgattttttttttaaggatgacaagctttcaactgccaagctgcattttagaatgcattaatatggaatgccttttctaagttttatgtcatctagaatacattacaattcttatattttataatcgtctctcataagctgggttattggtatggaggaattttttttccatggcatcgtgattatcctccctctggatggtaagatgatcttaagggggctactaaagtggcaagatgtgcagaggtgttgtcgctctgccttgcctcgcaggagaaagaaagggtgaaatggtaagatgttcaaggacagttgagtgttgatagttcaggtccatctcttccttgctccctccagcttagtgtcgcagaacttgcaccagtgccatcagactagctctagatcgctgccactgtatcatttctggcagtggcagtggtggacagctagacaagcggatgcattgaagctccacgaccggtaggcaaagatgtcaggctcccttgccaaggtggccagcagaagagtgcatattgatcttgtcagtggcctagtgctcttctcatagctgggagcgcacatgtctcaatgccgtcttttggtccaatggtttttttttccttttattttctctttcgcttgttaatttctttcccattttctcccataaccaggctgtgcagccactttatgtgtcatcgctttgccttatgcctcgcataatttggtgttgaggcagtgatatgttacctcatctagctttaacaccttaacaatcaggattgttccctatggttcaatgttcacggtttcatagatttgatgtgaccatcacatgctaaattcatcaaaactcttatttgaaattctggtagtatgggaaatccacgaattgaggtttcttcttaatgaaaagctgtggcccatgggggcagtcattcccccactggttgagtttttttaaatttctgtccgtatggccttttgggggcaatgtaaaccttgtacatgacatgtgatgcttttttgtttttgcttaagactaaattctgactatggtttaatgtgcaaagaaatttcttcgagaataatttgttgcagtgctaacagagttatgttttggttgtttacccagtgatgattgcagttgccatttaaaagttctgctgtagcctgtagtaatatgtttgttgtttgcttccatagttccatactatgatgctttggtctgacctctttaagtgggaaaaaaattaatcgcatatgctgtttgaacttcattgctacaaactgaactatcaatcaaaattttggtgttccataatttggtacttggctaaactgtgactattccgatattaaccaccaggtactggctagtgaacaactcgttatataattgcaggttgacaaggctctgcagagcatggaggaggaagcagagcgggtattccaggatgaacggctgttgcttcgtgaagatgaggctgcttctgcaagagatacaatgttagtcaccatttggattcagctacttccatctgtttgtatttagtaacagtaatgcaaataaatagtgcaccacacttcgggaacaaaaattaagacaattgctttaaaacgatttaggatgcattgaaatgtttgattggacagattatggatgattgcttatcgggatgaatttaaatattatatattgtaaagataacaaatggcttagaacaagttgtctagggctgaattcgtttgttgcagttgggaactaatctcctgtgcacgcaaaatggtgtaactcattagcacatgattaattaagtattagctatttttatttttgaaaaatggattaatatgattttttaaagcaacttccgtatataatttttttttgcaaaaaacgcaccgtttagcagtttgaaaagagtgcatgcggaaaacgagggaggtgagttgggaaagataacaaacgaacacagcctaggcatttaagcaattctgaaggcgacagtttttggagaagttccttttggaaacgtggcatgaataatctgcacatgatctaaaataaatgcagcttaagctaagtaaatgctgtgcattgcttaaaaatattcctgaatcgaataacatacgatattctttgtttcctgagtggcctgtctcaatagtggtgttattactcgaaatatgtgcataatctattctgccccactcagttgcttagcttggtttttctttttttgaggaattgccaaattggctgacaaagctgtttttttttgtttgtgaggacaaatgattatgttaatgttttattatatcataatatacatcatcagcttaacagaataattttgcaatgccaaggtttgagcaatctgaaactgtggagaatgaattgcaacatatgacagaacaagtgaagtccatcattcagacattgaatgctactcaggtaagtattctggttgcagtacttgtctagtgatgacttgtgtcttagacatcagcctcctccaatccagggtgctgagtttgagactgctgatagtatgacaccatttgatgttgctgtccggatactggataatcaactgcgttctttaatgtggatcgatgagaaggttggtaactcaagtataccactttatgctcatatttttgaggtggctttagttacttatcgcaggcttacagcctcacagtttgtgagggtatttgtgctactgtgctaggctgcaagcaataatattgatttgacgcagaatgatatttccagattttatgctaggctttagtagaatcctttcggcttaggaacttgatccccttttattgcactgttacatagaatcttgcctttgaccaaataatgaaagcatatccttctgcttttatatactgtcctgttgaatcttgtttttttttacctatgctctacttttcgcatggtttggtgaatcttacctttgctttgagcaaaagtgcaaaaccagagaaacttgatcccaattgtttttttcttcctttaagtgatatttggtgtatcaatgccacatgttttgcatagtgattatttggtggaattagttttcagtctttttttgcaaagtctgtaattgaccctttgtccatttttcataggctaatgagttctcaagtagaatacagaggctacctaacaacagtgctgcagctgaacgtgactctggaatgccaaggttttggttaagctgatgatccaatcctggatggacatttgcatcttgttctgatcgaagccagtaaacatgctatttttcggtggatgtgttgccccccagcaaaagtttcactgttcctctcattcaagtacatgatgtaccgaactgatgttattcgttgggattttaactgctgatgttaacaatgccttgtaacagtcgcgtacattggcttcagcaatcagtgaactgtttcaactcactttggtctttggacgaggaaacaagaggctttgcgagataccgttcattattggttccaggtgtgttcagatctgttgagctgaaaagtagatgctatatgatgcgttgggtgggctaagtacctggctacctgcatcaattgagctacgccttatgagcttcttaccagggaccagcggatatcttgagccttttcttgcgatcctgtaatctcaaatcgctgtcctccagttgcactagaaagcttcggggtcctgtaagattgcacgatttgcatttctaaactacatgctatatgttcgcctaactacttgtgcatggcgcgtgttcatgatctgccattatcagatcaagattgcgcctatacaagaaagataatataattctttacctc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |