Os01g0858000

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Gene Name

Os01g0858000

Description

WD40-like domain containing protein

Version

NM_001051393.1 GI:115441156 GeneID:4324762

Length

8605 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0858000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:38836136..38844740

Sequence Coding Region

38836136..38836410,38836480..38836699,38836788..38836834,38836992..38837164,38837749..38837826
,38838339..38838401,38838477..38838549,38838738..38838777,38838890..38838956
,38839086..38839217,38839307..38841060,38842214..38842310,38842629..38842666
,38842809..38842935,38844532..38844740

Expression

GEO Profiles:Os01g0858000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MAAPPEATGAPPQTEGEEVKDGVEVCVFDESPEVFSRAVHAISE LTTGEHEPNFPDAEVERLASSITFLREWRHFSYEPKNVSFTCDARSAPSRVDTHKINL PQFSSASVPQITHLDNGKAKTDRSSMKHEMRDLNLILKALQTCLKISVQSPKLLRYLA VAAHPPGSSYHKIGMPLIGRGIIQVWCLLAPSEEGHPHQSLVACNKYNPSNQPKQRGR PRKTITTSDDHLEPSVKRPRGRPRKYPLPIAKVEDSSQNDRSQEFALIYPLVSPAVVS CDIAIAYPMPTVNPVESTPRKGRGRPRKKPVEIKGLSGIKLTEDLSTALSPIALTCME PKKKRGRPRKYPAPSNSKHLPGTDTELGNDSVCQPGSIDFGLGPTENTGSGANITHAA VDAASPVPLSGQRGREQPEKEVIHIENSMQSGQSDIGSMLPTYILPESGNKSNSTGLR RRGRPRKKPFPSTTSCVFVPGTETPKKGSTLTNSNNLVVLAKSNCDILANDIGPSSCA IENSVHLSVGTSHAATPAQGICLAKCKEESSAKKGRGRPRKQPISTECGCSKACRGEE QKTQTIPKSSDNASLVENCKKESCPGKGRVQDKKKSVSNERSSVVLSVEAQNMDGSSA STAYTSCCTPACNFENAETNQAVSVPSENSAQVIDELKDTEVARFKESTKDDNMICSA EKTLSRVPKDISLPRVVLCLAHNGKVAWDVKWKPPSANQSEHKSCLGFLAVLLGNGSL EVWEVPSPSMIQKIYSSSSKEGTDPRFLKLKPVFSSAKVKCGNRQSIPLTVDWSPSHD MILAGCHDGTVALWKFSANLSFQGSKPFMCVTAESAPIRTVSWAPSVSKENVNTFVTA GEDGLKFWDLRDPYRHLWELTTAPRAVISLQWLKDARGVVISLEDGTLKFVSLSRIAN DVPFTGRPFVGTKTQGVSTYQLSEYLIWSVHASEITGYAAYCVADGTAVCFELTPRFW EKEPGRNRVPYFLCGSLSEEGTTIKIGIALPNSPLSNVPLGTKRATKTCKDVAQLHVI EEGKLLTNSEYNGAINPSIRDGQQDEPDEGQETGAIVLAAPSMQENFDTSTSRGSESP ENFEVFPPKAVALHRLRWNMNKGSEKWLCYGGAAGIIRCQRI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8331..8605#8042..8261#7907..7953#7577..7749#6915..6992#6340..6402#6192..6264#5964..6003#5785..5851#5524..5655#3681..5434#2431..2527#2075..2112#1806..1932#1..209#atggcggcgccgccggaggcgacgggggcgccgccccagactgaaggagaggaggttaaggatggcgtcgaggtctgcgtatttgacgagtcaccggaggtcttctccagagcggtgcacgccatctcggagctcacaaccggggagcacgagccgaacttccctgacgccgaagtcgagcggctcgcctcctcaataactttcctcaggtgagaaactccctccttgctctgtctaatccggtacctaatcaccgcggcaaaattggtaactttctgttgttggcctatttagctgggtggagtggacgaatttgtgtttaatagtagcgtttatcagcaaagcattaatttgttagtcattgatgcaatttcacggagctttcaatgggaaaatttatgtggcatgtaagctctctgtagtttattcattgccttatgtgccacacacggtggcaaattttattggaatttgttaatttagatcctaagacatcgctgccacacaaacagaaaaaaagcagttgtcacaggaatgctttggtgccgtttcattattcctgttgtggctattagaattcatttggcttttgccactgcaattggccatattcttacttccagtgtccttaggtaacaatattagctcaatgcacaattctgtttttctattgattagaacgatacaaggattttttttttcatgtcatgaacaaaatgcagttgcactgttacttgttttattactaattcactaagtttaagtcacttttgttctggtagatatatttccttaatctgtactcatttgttgtttgatgactctgatcgatgatcatttatgcacattgtgactttctagcttaccatttgatgttatggtttaaggcacagaggagtagcgaaacttgatcccctttatctataagtcactaagtcagtgagccccacctttatttgtgcagactacttgttagctgttactttgtattcaggattggcagtttcagtaacagctttagttattagcaacctatagtagcatgctataactagttagtactctttgatttaatcaccaattaaagtagaagaaaaaatttatgtgcccagtgttcaccagaaagatttttttttttaaaaagcaccactcactgtgttttagcacccaccaatataaggatgttaaactcaactgagactgatcagctggtacagccatacaaaggctgctcagaaccttagctttctagtatcatccatctcactgtaagctgatttgcatcaattggaactgcatagtttcaacgtgctgcattgttggttctcctccatgcccattttaaattttactgactaaaatttctacattgtcacatatacttgctccctaagtgcaatgcattggtttttatccaaatgtgtcaagtgtcaactattagcagttcacattagataaattatctgcatttattataaccattagccttttgtccaaacagactatctgcaatgattgaatttgtccactgatagtgttagaccactttccttggcatagtatagtctatagttgggtcagattttaggttcgccgtgttcagctcgcttatgcacatgaggacgactcctttcagcaccaagagtaacagattgtggaaagttctaacagtcattctgagcatcaattaaatggaattcacaagctgctttttcatttgtctaatctgattgccttctttttttttaaaaaaaaaatcaatattatttagtacctaatctgctagttatttcatatctttgcagagaatggaggcacttctcttatgagccaaaaaatgttagtttcacttgtgacgccagatcagctccatccagagttgacacacacaagataaacttaccacagttctcgtctgcatctgtcccccaggttattactcagttgctgttggtgccttgcgctaagttcttgaggctatttttttgttgtgttcagctgaatgagatttcttatatcatcttttgttccttttggaccatattctcataattaagttcggatcacactgcagatcacacacctagacaatgggaaggctaaaacagacaggtattgtttatggagttctttctgtactactttagaatcttgtcaatctagttatcttgttgtctgttttttccccatatttgtcaataaaggtcatactgttagtggagataggctatgttaagtttctcagttgatattaggaataacccaagatgtctgcttatgtattattttagctcctttggcaattcactagttgataatttgctgtaacatgaccaataagcagactaattgtcaacatatattgtattcctgctattggttagtagttttcaggtttcagggaatacctcctttgatctctttgagtaggtcttctatgaaacacgagatgcgggacttgaatcttattttgaaagccctccaaacttgtttaaagatttcagtacagtctccaaaactactaagagtatgctagttattaaggtttcttaaattgactgcacacacttcaaaactactaaccacatcaacttgggagtagtgggtcattcttttggtccagaagaacaatcgtacattgggtttggcaaacgtgccaaaccttcttccttttctttttttggggttgggggttgtggggggttgctttttttttttgtgattgatgaaaatagatctgatctaatactatttttgtgcctttgcacttctcattttatttagtacctgcctcacagtgtgataaacactgttaatacttttttacctgccatgtatatattctttcacttctccttgcttttcatacccatttgactctatgaagccatcttgattaaattatgtttaataattttttagcttttgcagctcagatttcgttatatttgccggaggcaatgtttgggcgttggactggtgccctaggttgtgtgacaggcctcattctcccataaactgtgaggttataactatgataatactgaaagttttctcttgttgtggcttcaaaattgtttatgcatcagcatattttttgttccaatatccactacttgctgtgactatgagtatgatgagtgctctttagttcatatgtcaatgggaaaattaacatgtttcactgagtgacatactttatggtgacatgaatttaaagacatctcttgcagtactccccacgtttacttttattaggcatatttggttttctgtatttgtttttcccattttagatgctcacaggaatcaaagtaaaatttctcatcttttccaactcttgttaaagcagtgaatctggttcaacatttccagttctatgtgctgtgcattgcaggacgataaaatggcagtttacttcttttttacttaataaaaccttgcgctgagataaagcatgtataagaaaatgaccgaagggagttcttcccaaggacatctttgcatgcagactaattgcatgattgcattgaatgtgcggtgtctatgaaattagtattatgttctttttatggtttatatcttcaagtatttgctggtttttgaaaaaaagtatatgactaagagtacaagttattgagagctgataaccttatttgcacgtctcctatacattgcagtatcttgctgttgctgctcaccctcctggttcttcttaccataaaattggcatgccgttaatcgggagaggtataattcaagtttggtgtctcctagcaccatctgaagagggtcatcctcatcagtcattggttgcatgcaataaatataatccatccaatcaaccaaaacaaaggggtagaccaagaaagaccatcacaacttctgatgatcacttggaaccaagtgtcaaaagaccaaggggcagaccaagaaaatatccactgccaattgccaaagtggaagattcatcccaaaacgacagaagtcaagagtttgctcttatttatcctcttgtcagtccagcagttgtttcatgtgacattgcaatagcttatcccatgccaactgttaatcctgtggaatcaactccaagaaaaggtagagggcgacctaggaaaaaacctgttgaaataaaaggtttgtctggcattaaactaacagaagacttgtctacagctctatctccaatagctttaacctgcatggagcccaagaaaaaaagggggaggccccgaaagtatcctgctccaagcaacagcaagcatcttccaggcactgatactgaattaggaaatgattctgtctgtcagcctggttcaattgattttggtttgggtcccactgaaaatactgggtctggtgctaatataactcatgctgcagttgatgcagcctccccagttccattgtcaggtcagaggggtagagaacagccagaaaaggaagtaattcatattgagaattccatgcaatctggacagtctgacataggatccatgttgcctacgtatattttacctgaatcaggcaacaagagtaactcaactggtctgaggcggaggggacgacctaggaagaaaccatttccgagtacaaccagttgtgtatttgttcctggtactgagaccccaaagaaaggttctactctgaccaattcaaataatctcgtggtcttggccaagagtaattgtgacattttagcaaatgatattggtccatcaagctgtgctatagagaacagtgtccatttgagtgttggaacatctcatgctgcaacaccagcacagggcatatgtcttgcaaaatgcaaggaagaatcaag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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0858000, RefSeq:Os01g0858000