Os01g0875400
| Gene Name |
Os01g0875400 |
|---|---|
| Description |
Ubiquitin domain containing protein |
| Version |
NM_001051498.1 GI:115441366 GeneID:4324776 |
| Length |
4880 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0875400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39742714..39747593 |
| Sequence Coding Region |
39742933..39743175,39743259..39743433,39743526..39743589,39743668..39743782,39744850..39744994 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:39742714..39747593 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:39742714..39747593 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggaggcgtcctcgtcctcggcggcggcggtcccgccgctggacccggaggcgattgccgccgtggcggaggcagcgccaccggaggagatgacgctggtggcgaagtggaaagggaacgactacacggtgcgggtggtcggggacgacacgctgggggagctgaagcggcgcatctgcgaggtcacgggggttctccctaaacggcagaagctgctctaccccaagttcaagctcaacgagtgcaaggactccgagctcatctcctccatccccttcaagcccaacgtcaagatcaacatgatcggcactgttgaagatgaaatatttgtggaccaagaagatgatccagagatactcaatgattatgaaataggccagaatgaagttactgctatcaaggataaagatgtctacaagcaaaaactaaaacggcgtgcaagtcaatataagatcaagatattgaatccatgccgcaaagggaaaaaactgcttgtcttagacattgattatactctattcgaccataggtccgctgctgagaaccctatcgaattgatgcgtccatatctacacgagttcctctctgctgcatattcagaatatgatatcatgatatggtcagcaactagcatgaaatgggtggggatgaagatggaccaacttggagttcttggcaaccccaactacaaaattactgctcttatggatcacttggcgatgataactgtgcaatctgaaaacctgtcagaaaagaaaacttttgattgcaagcctcttggtgtcatttgggctcagttccccgagtacaatgaaacaaacacaatcatgtttgatgacctcagaaggaactttgtcatgaatccacagaatggtcttgtgatcaaaccatacaagaggacccattcaaacagaggcactgatcaagagctggtgaagcttacacaatacctgcttaccattgcagagctagaagatttgagcaagcttgaccatagtgcatgggaatccttcacagaagaaaatgccaagagacgcagacacaggtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEASSSSAAAVPPLDPEAIAAVAEAAPPEEMTLVAKWKGNDYT VRVVGDDTLGELKRRICEVTGVLPKRQKLLYPKFKLNECKDSELISSIPFKPNVKINM IGTVEDEIFVDQEDDPEILNDYEIGQNEVTAIKDKDVYKQKLKRRASQYKIKILNPCR KGKKLLVLDIDYTLFDHRSAAENPIELMRPYLHEFLSAAYSEYDIMIWSATSMKWVGM KMDQLGVLGNPNYKITALMDHLAMITVQSENLSEKKTFDCKPLGVIWAQFPEYNETNT IMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPYKRTHSNRGTDQELVKLTQYLLTIAELEDLSKLDHS AWESFTEENAKRRRHR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4419..4661#4161..4335#4005..4068#3812..3926#2600..2744#25..335#cttgtttcttcagaccccaagccgatggcggaggcgtcctcgtcctcggcggcggcggtcccgccgctggacccggaggcgattgccgccgtggcggaggcagcgccaccggaggagatgacgctggtggcgaagtggaaagggaacgactacacggtgcgggtggtcggggacgacacgctgggggagctgaagcggcgcatctgcgaggtcacgggggttctccctaaacggcagaagctgctctaccccaagttcaagctcaacgagtgcaaggactccgagctcatctcctccatccccttcaagcccaacgtcaagatcaacatgatcgggtaagcgcaataccctccttcctcctcgaaccctacacctccatgtgccgtcccgtgtctactctcgctcgtgttctgcagatacctgactgcgaaaacatttggttactcgtcgttgaactggatgattagctcgtaattcgggggaatgttggatttcggttggtgattcgaccgatctattcgatccagtggcatcgcgttgttcatgatttgaaattgttgtttatttcctatgggttctcagatgctgggaacggtatttgaagtttgggattgacatccagtagcagtatgtggagacgtttgtctattagattagtttcacgaatggacgtggagtaacgtggagtgactgaggttatgtggtgttcatctgagaggaaggaataaccttctcaaaccttgattcctcacagtttgaacacattcgggagtgctgtagttgcaatggaatcatccgtggagcatgtgaatttattgttaaattgatgcattagtgttaccaatggctgcaaaatgattatggattagtgggttttttaaatagaaaaacagcaggatgttgtttttcttaaatctctagaggcccgttatcgtttcttttctgatgtgtttctgatagtgatgcgaaattggatggtggttgatgttatatgttcagttggcatgtttttggtggtgattgaagaacctgaatgatgatccaggggcaaactagttagtctgtttgtacagtaccatttaagcctatgatctgtgttgatgtgttctaatctgaaagtgtgctttgttgaacttgaactttaaagaaagtctgtttcgagtttggacaataccatttaggccgggagatcagatcatttaccgtttagatggaaaattgaggatttaccctcctatgccaatgacatgtttgagtcatctaaggtcatttacatgtgggtcagcagggtgaatcctcaatttcaatcaaaacggagggtatatggtcaaaattttcgtttagggtatagatctgtgtcctattctgaaagtttgctttgttgaacttgaaaccctacctatggacataattcgattagcttccttttattctgttttataatgtgaagttactcattatgctttgccacttatgtgaatgttatttcttggtaaaatttgcaaactaatttatatgtcagtatgttcttgactgttaaatgcttatgtgctatgtggtttgagccactgatgtaatccgatattctgcacatggttggatcatgattcgttattgctaactaaactcatgctttgcaacagatctcaagtaaatataccagaagagctaaacatgaaaagttgtatatgtttctcagagaacatatatacttccaaccataaatcaatgagataaccctattacagcacatgtgcacaaatgagctatccacaaaaacccaattagttcaagaggttccttattatccgcatgaatcgcaccaactcaaggaatagtattgtgatggcagactcaccaccaccaccactaatatgtcccttttatgtagtagagatcttaattatacacagtaaggttgtatagctggcaaattgtaaattgggtgtagattgattattattgttcattcatgtgataaccttctaatggtgtagaagactaggaggatcttatgctatttatattgggacggctgttacaaagaactttcatttgacacacctttttgtttctaatattttgtccactccatagtacttccatttgtaggatcagtagtggatgcttggatggtgagaaaaatgcatgtaattgcgctaattatgaacacttgtaatgtagtattcctctttagggaaaaaaacatgccttatggagggcttgcagaggaagtttgtgaagcatttaccttgaatatactttggtgtgacacttgtggtttttctagtgaggcactgtgaggtgagagctttgatacctttcctgattcagatctgtttttatcatttccaagatgaaccatgggagatggacctcctcttaatattgatttagcactctggctttactcaacagtcaacagcagcatattcaagttttcagggttttttttttcaatggttcaaatcactcttttgctgcgttacatctcaaagataatggttctgtttgaaaatttgaatttgtacaccatgtacttatgtcccatttgaaggtgctttctatttactttgcattaattttgtatatctttcagcactgttgaagatgaaatatttgtggaccaagaagatgatccagagatactcaatgattatgaaataggccagaatgaagttactgctatcaaggataaagatgtctacaagcaaaaactaaaacggcgtgcaagtcaatataaggtatattcccgtgtcattttcgtttcctgtcatatgcttcttccttatccatgcttttatggttccacaatatcctgtttgttctgacagcctgagccacatcttagtgcttgttcctttgacctacatgaagttggtaatatttcctagcgtggttcaggttgttagtatgtcagcatgtcgattctagaaatattttgtggtttcacttgctcatagaccaaagccataacagtgacgagggttattctctctcttgtgtggtgctgattgaagccatagccagaaacttcttttcttagcaatgatccataagtctaagcccctaggggaggtagtttttgtggatagagattttggacatttgtgggcgctatagcgattttcaggttactgcaatgtgctactatgttccacaagttatcgtcaattcctcatctagctatgtagatgtactagttttacttctaattgttgttttgcatgcttgggatttgtagtagatgtcttattgtgctgaaaggtatcatataggcacttggagtagaatagtaagtagtttttgaaattcctctataggctggcatctgctctattacccactatctgttgtcaccttgtctatttgctactccctccgtttcatattataagttgtttgatttttttcctagtcaaactttatcaagtttgaacaagtttatagaaaaattcagcaacatttaaaatatcaaattagtttcattaaatctaggattgaatatatttagataatatgtttgttttgtgttgaaaatactattatatttttctataaacttggtcaaacttaaagaagtttgattagaaaaaaagttaaacgacttataatatgaaatggagggagtattttttatctgactctggcgtgtgtcttctacttaatgtaataatctactactcatacaagtatagtgctttttgatgctgttggttgtgaaagcaggtcactgatctaattgctatcttgttaaatgtacatagacgtcgaatttattatttatcttttcttcttcctatttctgtagatcaagatattgaatccatgccgcaaagggaaaaaactgcttgtcttagacattgattatactctattcgaccataggtccgctgctgagaaccctatcgaattgatgcgtccatgtaagggcatctcccatcaccactattatgttttccaatgagctgtcatgaggattgatgccatattcctcttcacagatctacacgagttcctctctgctgcatattcagaatatgatatcatgatatggtcagcaactaggtaagcgttttgtgatcctgatctatcagttaactggttatggttgtgctgtgaaacaagtaaagaaaaatacaattggcctttgaatgcagcatgaaatgggtggggatgaagatggaccaacttggagttcttggcaaccccaactacaaaattactgctcttatggatcacttggcgatgataactgtgcaatctgaaaacctgtcagaaaagaaaacttttgattgcaagcctcttggtgtcatttgggctcagttccccgaggttagtagtggcgtggtactgtgaatttgtgactgattctcattgaattatttgctcattgcttctgtttctttcatatgcagtacaatgaaacaaacacaatcatgtttgatgacctcagaaggaactttgtcatgaatccacagaatggtcttgtgatcaaaccatacaagaggacccattcaaacagaggcactgatcaagagctggtgaagcttacacaatacctgcttaccattgcagagctagaagatttgagcaagcttgaccatagtgcatgggaatccttcacagaagaaaatgccaagagacgcagacacaggtagttttttctcagtgtattgatcagcaggaaagaaaagttcgccctcctttttgatcactgctattaactgcatagactagaatatcttggattgaccatgacaaccacaatgctacttagaatactctacatatatccctgcgttcgatctgcacaaaaacatttccaaactgcaacagttattttttaaccttcctgtgtgcatttcaacgttaaacct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |