Os01g0967400
| Gene Name |
Os01g0967400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 (PsaA) (PSI-A) |
| Version |
NM_001185831.1 GI:297720796 GeneID:9266912 |
| Length |
8916 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0967400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:44457840..44466755 |
| Sequence Coding Region |
44463710..44464264 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:44457840..44466755 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:44457840..44466755 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>cttgcggtgagtttaatacttttgaaagttgttttatttgctcgcagtttccgtttgatacccgataaagcaaatcttggttttcgcttcccttgcgattggcttgggcgagggggaacatatcaagtatccgcctgggatcatgttttcttatgtctattctggatgtacaattccatttcggtagtcattttccatttcagttggaaaatgcaatcggatgtttggggtactataagtgatcaaggggtggtaactcatatcacagggggaaactttgcacagagttccactacgattaatgggtggctccgagatttcttgtgggcacaagcatcccaagtaattcagtcttatggttcttcattatccgcatatggtctttttttcttaggtgctcattttgtctgggccttcagtttaatgtttttattcagcggcatgcgttgctggcttgctgccatttttggaccattaattgaatggattattatattggcagtccctgcttcaattttgtttatcaacatatgggaattgttatactttcagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>LAVSLILLKVVLFARSFRLIPDKANLGFRFPCDWLGRGGTYQVS AWDHVFLCLFWMYNSISVVIFHFSWKMQSDVWGTISDQGVVTHITGGNFAQSSTTING WLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGMRCWLAAIFGPLI EWIIILAVPASILFINIWELLYFQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2492..3046#aactaccttctccttcctcgccccgccgccgtcctcgccttcccatccgccgcgtcgccccgctgcaggccgcccctcccggtccacatcgcgccgccccgccgccgtcctcgccttccccatccgcacgccgccactccgccgtcctcgccggccgcatcctgtcgccactccggtcctcctccgtcagccgcttctccggcaccctccgcgacggggcccgcaagtccggcgagcgcacgagggaccggacaaggaccgcgctggcgacagcggcatctcccgccgctgccagatcctcctcggattcctctgcttcagtgcttcgtcctcctgttcaccatcttctgcctcatcatctggggcgtcaaggtagcataccgtttactgcaaattgaacaacatatgcttatgctgtctcttgattagaggtaattgttcttagaacgttacatatatgaagaacaaatcttcagaatgttacatatatgaagacttcccatcagtggaataaaagataaatctaatagggaggagaaggaatttatcaaactcaggcgacatacataattgtttacatatatattctcttatgatatgcttctgataattagtttcatgcaacaataactcatgcttttttagaaaatgggattaacctggcctctacatccgattggatgtacacagccaacaataactcatgctgattgaaataattaccttttgtaattatggttaataacagggagtctcttgttgctcgctgacggctcgtgatcagccttcatctgagacagtctcctccaaaagttgaccttgaaggtacgcatactattcctaacaacataacaaggacatgctgatgatcatataaagataataccccccccccccccaatcatctatatcactgataatcacaaataccgccaaaacaaacaaggacaaggatcatagaaaaaacttatcatcacaacctgcagctgcttggtttacacaaatgtatcttgattattcgtgagaggctatggaagatttaggtggaaatatagatctcgccgatttgttggagatgcagttaggtcgttttcgttttggttagtatcggtgatcgggatgttggttcagatcgtgaagcgctgtggagttcgtgcgaaaaatttggtcatcgcacttgttggttacatgcaggtgttggttgggattagggcctttttatagttccgccgtattgaagctcctccctccccgtcacgcccccactcgccggcctccgctgcgcctccgctctcaccaatgccacgcatctggggaagaaggggaggagatagagaagagaaagggagatgatgaagtggaggaagtggggtccattatttttaatcttataatttgactgacatgtgggtctaaatattttgtttttatttttaaattgttaattttgcttcatatgccacatacctgttatatctgattttcagtttgaaggatgaaatcggattcgttgacaaattaagggacttaacttatagttgaagcagtaaaccagataaactgactagagtatatttttgcaagctacttaagaaggaaaatgtggaaatatattttttgttgcaagccattttacttgtgttttgtcagtgacactggctggcccagcatgcacccccccccccacacccaaccccacccaaaaggatatcactacaaattggttgaaaatggagggttcaagccaatgcatctgcttacatggtttaacgtcaggctggactcgtgaattttgttttgtatctatatgttttttcttcaataagttcagcacaaaattgtgagtgttcctttcttcgtctctcgccttgtacatttctaattgttatatgttatttaactgtataaacaattaataacaagaattgtgtataggtggcgcgtcccagtatctagtatatttgaatgttggtctaggtaccagaatttatccatttatctaagcatatgctgctgttattgtacccttcctgactccaatatgatgaaaatgtagatctttctacatagaattgaaatctcactacagtaaacatcatgctgtgattaattgttatgcatatgtcagtgtatgttcacctacacacatgtctcaaggacaacatagatagaaaaattgatctgctaatgattaattgttatgcatatgtcagtgtatgttcatgggaataaaatgtctgcctattcttatttttctgcagagaaataattgtactatgtgcttgtgcactgataatatgagtgtgcttgaaatctgttgttaattcatgggcttgaacttctaaacagaattatccacaccacagacacatggttattttactatggcagtaattacacctaggaactatgcatgttaatttgatgagtcgctcttcttcattgtagggtgaattggtcacagtgtatgctaacaattggagcaagataacttgcggtgagtttaatacttttgaaagttgttttatttgctcgcagtttccgtttgatacccgataaagcaaatcttggttttcgcttcccttgcgattggcttgggcgagggggaacatatcaagtatccgcctgggatcatgttttcttatgtctattctggatgtacaattccatttcggtagtcattttccatttcagttggaaaatgcaatcggatgtttggggtactataagtgatcaaggggtggtaactcatatcacagggggaaactttgcacagagttccactacgattaatgggtggctccgagatttcttgtgggcacaagcatcccaagtaattcagtcttatggttcttcattatccgcatatggtctttttttcttaggtgctcattttgtctgggccttcagtttaatgtttttattcagcggcatgcgttgctggcttgctgccatttttggaccattaattgaatggattattatattggcagtccctgcttcaattttgtttatcaacatatgggaattgttatactttcagtagcacattttttaaaattttattaaacaatggttgtattttaatacaaagtagacaaaggcatcctgttggtaaaagggcaagttcaccttcacaggttgaatctttatgattttgtatgtttcactgattaacctttgacattatttaattgaaattttaccatagtggaaatataattttttggggcatatttaccttctttgtgttaactttcttgatgtaaggcctgtcatgttgtagcaaaaagaacatttcaatatagaaaacatctggatttctttttgcattgctcattttactttcaggactttatttgaaaaaacataaatgcttgtattattgtttcaaccacagtgtgtggaaaaatacatgtttgcttacagcagtaaccttattgacactgaattggagatgttacatgttaacctttgaaatctgaacctgggatgtgtgtgtgtggtggtggtggtcaggccaagaagaagatggcgaggctgatacaaaggatcatccaggacaagagggcaaggagggccgccgcgggacgccatcgatgtcctcatcggagacggcagcaatgagctcaccgacaaactcatctctgacaccatgatcgacctcatgatacccgcaaggactccgtcccggttctcatcatgctcaccatcaagttcctcagcgagtgccctctcgcccttcaccaactggaagtaagcctgtatacctgaaacctcttacataaatttttttcagcttgatgacaacgcaataagcaaactaattggatcaatagctgcataactagatgaatcctgaacagaaaaaaaaaacaaaccctaggaagcaattaaggatcctctgttgttgggcatgggtaggcagcaaaaagggtccagaaccgaaaagagttggattttctttcttttttgtctgagaggaacatgaccaactattcattttgtcagagccatgtgttgtgcatgataatactactaccactgtctactacacacaatggcagaggatctgtgtccccaaacaaaaactagatcataaaaagcatacgaataagggagagatacgtaggtgggcagaagggatcagcagcacataaagggttgtgccaaccttggtccatccctttcttgttggcatcttagagctatcattattgtttgttatctatgtaccatctaaaaaaaagaactgctacttgtgtttgaaccaatctttgcaagatgatatgcgttgcatcattgtcaatgtcaggtccatacatatcattggaacagaggcgccttctcacaagagaaaagggttactatcatgatgtatcatctacttagttttttttctacacatctgcagggaatagtttttttggttgaagtatagagggttttttatcagctggggaaaaaacaaggttacataatttgtctatttattcggtgatgattagaaggcagcagtaatatttcctagctaggatgtcctattacaccagtagcattgtgtcatatactagattccatttacatcactacagtgctaagaaattattcatgtgtcgaccttgtttctgttttgatgcaatatattcttagatggaaatagtctagaataatgctctgttatattagtaacccatttagtgtttttccttgcatttgagactgaacatcagtctaattcttggatgctaaacagttgttgctttctttttcagatcaagcaggatgactaatgttgttgacgtgatgactgctatctggacttgcttatgatattgttttctgcctttccattctatgtaggtgagcttagctattatatgtagatatattgtttatactttgcatccctgtctcatctgaagtatcgtgatgggtattataccaataactgtcaaagagtcatttttctaggaggcatggtttggtgcggctaattttaagtttctacatgttgcatttacgatagaatgctaattttccttttcaggacaaggataattttacattgtttattttatgccttatatttacttaattaagataacttccttttaccctccctaattttgtgtaaaactgtcattgtgtgttccttaaatttttttgtgtttcttttttttctcttgctgaattcctgtaagaaagagctggccagttcaatgtttgcttgattccggcagtggtttgcttgattgttagctgacggggaattctcgtggtccaatttatggactttttttttttggtttcagttgctgcatgtgtctgcatttgcatatgtttccatcttcttttcgcttcctttgtttgctttgagtgaattgggtcatgcgctatgaatgtgttggctgtattgcaattctttttatacacagtttacatctttacttctttttaatgatagaatccatgcttcgtagagttcattaaatggctagaacattttagttttgttgcgaagaacttttccataacttgattcagtgagctgcagaggcaagcaattgcagatattaaagattaaagtggcattacaactgactttcatattaataaatgcagggtcattcattgatgcattttcctagcctgttaactgcatcacaacaccgagcccaaattggaaagagatcatggccatcctatcaagaagttcttgcaggaccttggccaggtccccaaagtacctatttttaccaccttgcaatgcaaattttctccaaatggtcagttttttctatgcaaactgtgcaaatttgtggtgttctctattttgtcacagcctgacagcaagctggtgagtttgccggacgaccgggcagacatggaaatcagcttcaagccactccaagtcaagcttgtcagagttcagtgctattttctcaactagattactgctttcattaatattttaagcacgtttgcattcctatatgcatggttggaaaagtaatgttgtaatttgacatttgaactttactggtatggtcaacagaatcctggtaaatcttcagtgttggatagtgtggtggggatggatttcttactaagtgattcaggtatgtttcaggaagtagttactgttgagttttgtgataccttccagttttatgtatttttaaaagctatgtttggattggaggatgctacctacaggcatctattatcttaaaaaaaaattataggtatcctcagccattcatcataggtggtgcaacctgcagcaagagatttatagattttttgtaagttatctgctcttttgtctttttctatctacgtgcttttgtatgctagctgataagatataattatattgaactagattatcaatccagtagctgattcctatgttggtcaaccgatgaatttgaggcttgcgtgctagtggcagagtaggttcttgtcactgtcaagatgacaggcaatgcgaggaaggcctgatgagaagaggagcatgcaagctacaattgctttgttacatgtatgaattggaagctgcggagagggttgtgcactggtaatgttgttcttccaccatattactacctattactattttgaatataggcatttgctacgtcaattttttttattcaaactgatgtcatgaaacccacctatgttgatgttgaattgctgtacatttctgtagcttttactaataactaagtatgcgtaaatataatttgttccaagcaattctatagtatcatttaggtagagttcatgtctttgtgtctaagattttaattcataaaaaaaatgatctttagtcaaatcatgaattcaatgacatgtgtgattggttatcttgaatgtagttgtgctttcttgcagtcaggactaggtaagcagtagaagtagtgaagcggctagggtgaaaatagtatggaaattttccgaccacatcgataccgtttccgcaaaactaatatgataataataattttactgactgttgctgtctaaaatttagcttttccaatttttgtcagagtggcattgaagttgacactaaatagttgaattcaagaaaatggaaatttcccgaccgtttccgtcaaaaacaataaagtaatgatattgttttcggccattttcatccctagaagcaacggtgcctcacataaagttatgggtgatggtggcagcgtagtacactgtacgcaacaaaaggatctttctctgtgtctaaaatttgattgtcatctatattctaggcttgatttccttcggttcttaagatagattaaagagtggtgctatcatattcataagctaggtggattctaatttggtctatttgttttctaatagattatgttgatcagtctgctttcttgcttagatacacaagatggcaattcatattaataggtttttttattatatattggacacaggttgaataaatctgttgtacattttgtggagagcatcaaagaaattatcgatgagaagtttggcaatgaaatgtaagatttctgcctattgcattctattttctatttgtccatgtaatacagagtcacgcgatacggttaatgaactgataagcttaggtttgtatatagtgagaactgatgtaaagtaagcacctttcactcaaaaaattatataaagccacccacccctggggtttcagtatttcgttgtctagatcaatcactatattctttcaatagtggtaattggtaacaggtggaaatgtgagtattaggatgcggactaatagtatgtatttaaaggctactgactgtgtaattttggtcgacatgcttatatcctttgcaaaaaaaataatgcattagggtaattgcttcctactgcagcatgtcagctatcgacttctactgttcggttgactaggtaggtgctgatggaaaaacaaggtacatggtgctgatggaaaagatcgtgtggtcacatttgatgggaaatatcttccatgtactatgcaggttagtgtttcctttcattgcttacttgcctccctattgttgttaagctcatcatttatgttgaattatttgccctctatatggacgattttggaattgaaatatgctaacatatcctatgccctgatcctatcaaatctggcacctatttgatccaattatgtgtgatttgttgttagtttgattgaatcttggctcatgtcaattgttcgatggctaaaagaagaaaaaaaatgcaggtccatgttgttggagaagagccagttgatatccgtgcgactattcccagagcccggctggctggacaaggagctcccactgctcgccagcttggttctgcgcatctcctaggtctgccctcctaggtctacccgccgcaccggtcttatatctcctctggtacgtcctggttgatatagatcttcgttgtagcatttgcacaatcactaggttgtgtatgttattgtggaagaaacatggatcgtctataatagcactcacatcgattgacttggaaacaaggttctttcgtgcatggtttcatttttgtgctaacttggccaaagtgttactaaggtgattgcatgtgatgctcatgaaactaatgtctcatttcatcttttactgaagagatttcaagagatgaagtgacgctgagtgtatccacacgaatctgaccgcatgggtctggctttctaagaatcgaccaattcactaattcaatatgactttttattatgacatcgctcttcatggtgtaaccaatgctcatactatacagacattaaagcaatctgtaagattaatattttttctattatttctaccttgttgtatacatgaaatgatttgtacgagtaagttatgcatgaaaatatcacgttcatac</dnaseqindica> |
| External Link(s) |