Os02g0116000
| Gene Name |
Os02g0116000 |
|---|---|
| Description |
The start codon is not identified. |
| Version |
NM_001052211.1 GI:115443792 GeneID:4328076 |
| Length |
6082 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0116000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:853795..859876 |
| Sequence Coding Region |
854108..854302,854399..854542,854658..854893,855036..855315 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:853795..859876 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:853795..859876 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>agatcgttcatttgcccacttgaagactgccctttcagctacattaggaaagatcacttgaaccgtcatatgcttaagcatcaagggaagttgtttacctgctctatggatggttgtggtaggaagttcagtataaaggcaaatatgcaaaggcatgtaaaggaaatccatgaggatgaaactgctactaaaagcaaccggcagtttgtttgcaaggaggagggctgtaacaaggttttcaagtatgcttcaaagatgaagaaacatgaagaatcacatgtgaaattggactacgtggaagtagtctgctgtgaaccaggctgcatgaagacattcacaaatgttgaatgtttgagggctcataatcaggcttgccatcaatatgttcagtgtgatatctgtggggaaaaacacctgaagaagaacattaaaaggcacctacgagcccatgaggaggtgccatctactgaaaggataaaatgcagttttgagggctgtgaatgctctttttccaataaatcaaatttaaccaaacatataaaggcgtcccatgatcaagtaaaacctttcgcatgtcgattcacggggtgtgaaaaggtgtttccatacaagcatgtcagggacaaccatgagaaatccagcgctcatgtatacactcaggcaaacttcacggagatggacgagcagttactctcgtgtccgagaggtggacggaagaggaaagctgtgactgtcgaaactcttacgcgcaagagggtgaccatgcacggcgacgcttcgtcgttggacaatggaactgagtacctgcgctggttgctttctggtggggatgatgattcgagccaaactcattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>RSFICPLEDCPFSYIRKDHLNRHMLKHQGKLFTCSMDGCGRKFS IKANMQRHVKEIHEDETATKSNRQFVCKEEGCNKVFKYASKMKKHEESHVKLDYVEVV CCEPGCMKTFTNVECLRAHNQACHQYVQCDICGEKHLKKNIKRHLRAHEEVPSTERIK CSFEGCECSFSNKSNLTKHIKASHDQVKPFACRFTGCEKVFPYKHVRDNHEKSSAHVY TQANFTEMDEQLLSCPRGGRKRKAVTVETLTRKRVTMHGDASSLDNGTEYLRWLLSGG DDDSSQTH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5575..5769#5335..5478#4984..5219#4562..4841#ctcactccccgccgccgccgccgccgctccatcctcctcacggagaagcgcgggaaatcacacctcgtcgcagccaagatctcctccagtccaaacgcatcaaagattccaaggtgggcatccaatcctcgcttgcaaacacaaccaccatgcccaaaaccgatgcctacttaggagttaggaatatgtttcttcgatttggttatcgcgttggtaattcttcgctttcgatttgagcagttaaaagcatgagatagtattaaccaaatcgatcctgatctgtgcgtttagattctgggcttgtggtcagtgttcgttgaaacagcacgaaattgttaatagtctaagcagtgtggatgtcgtatgagttaattgtagctttttttcctagtaattttagctctaattccaggttgtgctgttcgggagagcttcttgcgttgaggagaggggggatgaatagaagcgtttgccaccaccttctcacccagtgcaaaaccataagagagctccaaagaatccacgcccaggccctcacacacggcctccaccccaaccagcagtccatctcctgcaaaatcttccggtcctatgccgagtttggccgaccggctgacgcaggcaggttgtttgatgaaatcccccaccctgacattatctccttcaccagcctcatgtcccttcatctcaagttagatcaccactggaaagctatatccgtgttctctcacgccattgcttctggccaccgccctgatggctttgctgctgtcggtgccctctcggcctctggtggattaggggatcagcgtattggtagcgtggtgcatggcctgatttttcggtgtggattggactctgagttggtcgtttgtaatgctttggttgatatgtattgtcgatgtggcaagtttgagcctgcacggactgtatttgatagaatgcttgtaaaagatgaggtcacttggggtagcatgctgtatggttacatgaagtgtgttggtgtggattcagctttgtcattcttttatcagatgcctatgaagagcactgtttcttggacagcactgatcactggtcatgttcaagacaagcagcctatccaagctcttgagctatttggtaagatgcttttggagggccaccgtcctaaccatattacaattgtaggggtgctatcagcttgtgctgatattggtgctttggatcttggacgtgccattcatggatatggaagcaaatctaatgccaccaccaatataattgttacaaatgctctgatggatatgtatgcaaagagtggaagcattgctagtgcattttctgtatttgaagaagttcagatgaaggacgcattcacatggacaactatgatttcaagtttcactgtccagggtaatgggaggaaagctgttgagctcttttgggatatgctaaggtctgggatacttccaaacagtgtgacattcgtctcagttttgtcagcatgcagccatgctgggttaatacaagaaggcagagagttatttgataaaatgcgtgaagtctaccatattgatccccggcttgagcactatggatgcatggttgatctgttaggacggggtggacttctagaagaagcagaagctctgatagatcatatggatgtcgagcctgatattgttatttggaggtcacttcttagtgcatgcctagctcatggcaatgatagattagctgagattgctggaatggaaattataaagagagaacctggggatgatggggtttatgtgcttctttggaacatgtatgccttatcaaacagatggaaagaagctttggatatgaggaagcagatgttgagtaggaaaatatacaaaaaaccgggttgcagttggattgaagttgatggtgtcgtccatgaatttttggtagaggacaagacacatgatgctagaagggaaatttatgtcaccttggaaatcatggctaggcatctcaagatggatcccataccatctccattagtgttaactgatggagaacacatgctctagaaacacatattgtcctttttttttctttcctttgatgacctctaaccgaactgaggatgatatgctgatatttttttctttttgttagtgacaaggcaccatagttttgttttgatttgtttgattaaccaattagtgatagccagttgtaacacactgatgttatttcattgaaaatgcagaattgtagagatttattttagatgtcgacctgcagatatgctatacctgtattttgtttggtcactctgtcaaaaaaagagtaaagactgcaatgcgtcccagttcatgttatggacttctcctcattttacagctatcttgctgactacatcgctacctctgaatgttttacttgtttacttttttttatatataaatgacttatttatgtgtgccgaatttctaactatctgatttgcctactattagatgtgctctggagatgatattgatggagacatgagggttgaagcaacacaacacagggatataaggcgctacaagtgtgaattttgcacggttgttaggtccaaaaaatgtctcatccgagctcacatggttgctcatcataaggtataaaactacttagatattttaggaatatgggccatattatgccttatgttttaaagacaatgtggactgtattaattaaattgagttatttgaccgttatggttctctgattggagtttaggtccatcaatcaatatatttgtgcttttgtcaattccttctgctcttatccatttgaatcattatatgaatatctgatgccctcacttcaaatttatctataggaagaactggacaaatcggaaatctacaagtcaaatggggaaaaggttgttcatgaaggtgaccacacctgccaagagtgtggtgcttctttccagaagccagctcatctgaagcagcatatgcaaagtcactctgatgaggttggcatttctcatatgtgcatacaacatgatattgcttttttgttggaatggtgctgggattagtttttttggaaacatttaaacataacattcttgtatggtttttctccgtccgctgatctggttgtcaaagaaattgttcttatctacttcaatttgctaaaaacaagtgttttgcaggatatagattcttaactgtgtgaagcattggatcccaaagaactccaaaatgcgatgaggcatatttaatcttgtctggactagtaacaggttgggatgaccacctgtgaagctccaacaggattgcctcctcacgctctttcaggaggtttgtccttgcttgtattagttcttttcttttttactattttgattattattcaacttcatgggatagcctgcatctccttgtttccaattaagtactaatgtctcctttgttgtatgcacatgtgctggaattcattgtttatcaatttgccttgtggtatgctatacatgatatctttaatttttattagtaacaaggttttttacagcatacatatacataaatagtgtttttttacagcatgcataaatggtgaaaactgattactgcttaattattgactagttgctggctattttacatttttttgatattgcaaatcttgtgaaatggatccatgcagtgaatttgggaggttatcttctcctttgttctaatgttctctctcactctctttgggcttctggaacctggttttggaggtccttagttggaacaaagaggggatccaagatcaaaataccatctcagaaagctagggccttctgtaataggttcatttagctcgctatggtgttgatatctccatcatatacaaaactacaatatgttccgttgcaaattatatatgaattgttttagctgataaacacctgtgcacaactttttgctgataaatagtactacttctatttcaggttataagatgttttgactttggtcaaagtcaaactgctttaggtttgacttagtttgtagaaaaaaataataacattttcaacccaagacaaatttattatgaaaatatattaaattattgatttaatgaaactaatttggtattataaatattactatatttgcctataaaattattcaaacttgaagtagtctgactttgactaaagtcaaaacttcttataacctgaaacggagggagtaggcattgaatagaataggttatggatcctttggagaataaggttagcaaatatccttcattcatcctactatttctttggatctccttttgggagctttgagaagaggtgagaggatccaacatcaaaatgtcacctcagaaagctaggactattcatcattggttctcagctcgctatggtgattatactcccttttatctctatcatcttaatggaaaacactgaacatttaggtattcgttgcatattccgttaaccagtttactagataatttattttagataatttataagtatgaaagaaatgtgtaagcttacagcagcttcagttttgactcgttcccttcttgactgtagagatcgttcatttgcccacttgaagactgccctttcagctacattaggaaagatcacttgaaccgtcatatgcttaagcatcaagggaagttgtttacctgctctatggatggttgtggtaggaagttcagtataaaggcaaatatgcaaaggcatgtaaaggaaatccatgaggatgaaactgctactaaaagcaaccggcagtttgtttgcaaggaggagggctgtaacaaggttttcaagtatgcttcaaagatgaagaaacatgaagaatcacatggtatctcctcagttacttatagtagatcaggcgctgccttgtaaatttcagaactaaaaaactgcagctcaatccatgcattatataattaatcatgctaatggtatccccagaattaaattaatttgtgctgttctggcagtgaaattggactacgtggaagtagtctgctgtgaaccaggctgcatgaagacattcacaaatgttgaatgtttgagggctcataatcaggcttgccatcaatatgttcagtgtgatatctgtggggaaaaacacctgaagaagaacattaaaaggcacctacgagcccatgaggaggtgccatctactgaaaggataaaatgcagttttgagggctgtgaatgctctttttccaatgtaagtctattatccccaaatgttctgatgcattgtttgttgtcttcctcttgaactgtagctttagtcgtatctggtgtggattgaaacttgttacctgtccctcctattgcagaaatcaaatttaaccaaacatataaaggcgtcccatgatcaagtaaaacctttcgcatgtcgattcacggggtgtgaaaaggtgtttccatacaagcatgtcagggacaaccatgagaaatccagcgctcatgtatacactcaggtgagttttgctaaccgatctttagctcttctgcgcgcgtcttgtgcttgcccaaatcatttgagtgacaaactgacaagctttaaccacatccaggcaaacttcacggagatggacgagcagttactctcgtgtccgagaggtggacggaagaggaaagctgtgactgtcgaaactcttacgcgcaagagggtgaccatgcacggcgacgcttcgtcgttggacaatggaactgagtacctgcgctggttgctttctggtggggatgatgattcgagccaaactcattagccgtatcatctttgcatctgattgtgatggtcatggtgtcaatggctcaatgctttgtcgtaaaggggtgtgctagcccactcacgttggtagttagatggccgtggtgtttttgttgtaagtagttggtctgaatttagaaagtgcagcagttttagaggaagcctactagtagtatatatttgtagcataatggcgcagtttgagttgtgagttgtaagtattttgattctttactgttttgaccactgttcttggaacctcaaaattatttgacttgttgaatgcaaaaaatgatgtgattacaagtttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |