Os02g0169400
| Gene Name |
Os02g0169400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Argonaute 4 protein |
| Version |
NM_001052556.1 GI:115444482 GeneID:4328436 |
| Length |
6982 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0169400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:3748508..3755489 |
| Sequence Coding Region |
3748703..3748887,3749010..3749041,3749126..3749220,3749312..3749385,3749474..3749606 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:3748508..3755489 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:3748508..3755489 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagagtcagagaatgacctggctctacgatcgtcaccactccttgaaacataataaagctgaaagacaagccattctatcaacttatagattagcaaaacgtccaaatctctcttcagaaggtatgattggcgaaagttgcattgtgaggacaaattgtttcagtgttcatctggagtctttggatgatcagactatctatgaatatgatgtatgtgtcactcctgaggttggaatcaatcgtgctgttattagagagttggtaaaacagcagaaagattctggtttgggtggccgtcttcctgcctatgatggaaggaagaggctatacacatctggtccattgccatttgattcacatagatttcttgttctgctggatagtattgaagacagtcctgaagagtcaaggcacttgagagtgagagattttgtggtcactttaaaatttgctgcaaaaatttccttatggactttacgcaagttccgtggtgggaagccaaaccgagaaagtcgagcggccctgcgagcacttgacgttgttctaaaggaattacccactgcaaggtatacccaatttgctggttcattttactcacctaacttaggagaatgccgacaattgtgtaaggtcttggaaagctggcgtggttttcaccaaagaatacaagctactcagatgggacttcaactgaatatcgacgtgtcatcatcagtgttcatcaagcctgtacctgtggttgactatgttgcacagcttcttaacgaggacatcttattagacagaccattatgtagcactgagttcttgaagattaaggaggctctagaaggtctgaaggttcagattaatggcattttgttcaacacatatcatgtacaagaccttgtccatcaagcagcaagttttccagttaactttagtattcagtacccatctttgccttgcttgaaagtggctcattttggggagacaatatttctgccattggaggtctgtaaaattgctgagggacaatgtcaccagaaacagctcaatgcaaaacatatggctgctcttcttcaggtagctcgacagccccctaatgagcgtgactacaacattctgcagactgtgcatcagaacaaataccaggaggacccacatgctaaagagtttggcattaaaattgaggaaaaacttgtatcaattaaatctcgcatcctacctgctccttggcttaaattccatgacagtggcgagacgacagaattcttgccacaacttggcatatggaatatgatgcataagaaaatgatcaatggtgggagagtgaaaagctgggcatgtgttaacttttgctggagtgtacgggagtatgctgctaggaatttctgttatgaccttggctttatgtgccgagaatctgggatggtcttttcagttaaacctgtgcttcctctagtgattgctaaacctggatgtgtagaatctgcactcaggacacttcatgacgatgtcatggacatacttagaccacagggcagaaaacttgacctgctgattgtaatattgcctaacaacaatggatctctttatggtgatgtcaaaagaatatgtgagacagatattggactgatctctcaatgttgtcttgcaaaacatgttcttaagatgaacaagtggtatcttgcaagcgttgcccttaaaatcaatgctaagatgggcggaagaaatactgtactggttgatgctttagaaatgagactcccccatgttagggatacaccaactattgtatttggtgctcatgtcacccatccacatccaggaaaagctaatagttcttccattgctgctgttgttgcttctcaagactggcccgaggttaccaagtatgctggtttaatcagtgtgcaagcgtgccaccaggagtcaatacaaggtctttttaaagtccaggatgatccggaaagaggaaccacaactagcggaatgatcaaagagcatctcatgtctttctatcgagccactaaacggaagcccggaaggattatattttacagggatggtgtgagcaaaggacagctccctcaggctttgatgcacgaacttggtgccatcaaaatggcgtgtgcatctatgggacccgattataatccattagttacatacgtggtgctccagaagtgtcgccatacacgtctgtttgctgactactataatgcgaatactcatgattcaactgcaaacatacgggctggtactgtggttgattcaaatatttgccaaccaaatcagtttgatttctacttgtgtagccaccgcagcacgcagggaactaagcggcccaggtattatcatgttctgtgggacgagaacgacttcttggctggttctttccaagagctcacaaactacctctgctacacctccgcaacttgcacccaatccatatcagttgtggcccctgtgcactacgctcgtcttctgtcatcacgagctcgatgttacattaaaccacgctcgattggcgattcaacgagccacacctccttgccttctgaagaagatagcagcgcagcctcagagactggcagtcttcttcctataaaggataatttgaaaggggccatgtttttctgctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MESQRMTWLYDRHHSLKHNKAERQAILSTYRLAKRPNLSSEGMI GESCIVRTNCFSVHLESLDDQTIYEYDVCVTPEVGINRAVIRELVKQQKDSGLGGRLP AYDGRKRLYTSGPLPFDSHRFLVLLDSIEDSPEESRHLRVRDFVVTLKFAAKISLWTL RKFRGGKPNRESRAALRALDVVLKELPTARYTQFAGSFYSPNLGECRQLCKVLESWRG FHQRIQATQMGLQLNIDVSSSVFIKPVPVVDYVAQLLNEDILLDRPLCSTEFLKIKEA LEGLKVQINGILFNTYHVQDLVHQAASFPVNFSIQYPSLPCLKVAHFGETIFLPLEVC KIAEGQCHQKQLNAKHMAALLQVARQPPNERDYNILQTVHQNKYQEDPHAKEFGIKIE EKLVSIKSRILPAPWLKFHDSGETTEFLPQLGIWNMMHKKMINGGRVKSWACVNFCWS VREYAARNFCYDLGFMCRESGMVFSVKPVLPLVIAKPGCVESALRTLHDDVMDILRPQ GRKLDLLIVILPNNNGSLYGDVKRICETDIGLISQCCLAKHVLKMNKWYLASVALKIN AKMGGRNTVLVDALEMRLPHVRDTPTIVFGAHVTHPHPGKANSSSIAAVVASQDWPEV TKYAGLISVQACHQESIQGLFKVQDDPERGTTTSGMIKEHLMSFYRATKRKPGRIIFY RDGVSKGQLPQALMHELGAIKMACASMGPDYNPLVTYVVLQKCRHTRLFADYYNANTH DSTANIRAGTVVDSNICQPNQFDFYLCSHRSTQGTKRPRYYHVLWDENDFLAGSFQEL TNYLCYTSATCTQSISVVAPVHYARLLSSRARCYIKPRSIGDSTSHTSLPSEEDSSAA SETGSLLPIKDNLKGAMFFC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6603..6787#6449..6480#6270..6364#6105..6178#5884..6016#5725..5788#5480..5542#5247..5389#4995..5132#4799..4920#4527..4692#4310..4432#4094..4165#3899..4006#2644..2760#2450..2537#2237..2328#2000..2112#1363..1496#926..1281#629..841#atcgttgctcgaatatttccccgtccgctgtgcgtcgactccgactgctcgtgtgttcgcccgccgccgccgattcctatccatctcgcgagcgagcaggggcgccgtcgttcgtcctgctgcttccgccgcatccatcctggtgagcacccatccgttatacacgctctttccgatctctctctctacccacgcacttctactcgaatttgcgttaaaccctagcctctgttctgtaaatttgccctaaccttaatactaataacaatttgcctttactgtttttcttccttcatcttagctctggggggatcgatttcgtgtttgcctctctttagatagaatttttcccccaatgttcgagtgcatatattggtctggtcgggcaatcccttttatcttccttcattcatttacctgaaaacaacggcgtatcgtaccttttgcttttccctgtgctgttgtgaatacaagtgtggaggtcactgcaatgctgtgctgttcgtgaaaattgatgatgccactctagttttcaactgtcgatgtgtcttgatgcttcagtctctgatcattgctattcttaccgcttacagtgctaaagtttgtaccttgccttggaacattagtcatggagagtcagagaatgacctggctctacgatcgtcaccactccttgaaacataataaagctgaaagacaagccattctatcaacttatagattagcaaaacgtccaaatctctcttcagaaggtatgattggcgaaagttgcattgtgaggacaaattgtttcagtgttcatctggagtctttggatgatcagactatctatgaatatgatgtaagtttctgattcacataacttgtctataacatgaaatttatttgcgccattagtattcgtatctgatgttatttttatcaggtatgtgtcactcctgaggttggaatcaatcgtgctgttattagagagttggtaaaacagcagaaagattctggtttgggtggccgtcttcctgcctatgatggaaggaagaggctatacacatctggtccattgccatttgattcacatagatttcttgttctgctggatagtattgaagacagtcctgaagagtcaaggcacttgagagtgagagattttgtggtcactttaaaatttgctgcaaaaatttccttatggactttacgcaagttccgtggtgggaagccaaaccgagaaagtcgagcggccctgcgagcacttgacgttgttctaaaggaattacccactgcaaggttagctttcgttctcactgtgttccgttttccgtctttctgtattattattattcccattcaataattttgcatattcaggtatacccaatttgctggttcattttactcacctaacttaggagaatgccgacaattgtgtaaggtcttggaaagctggcgtggttttcaccaaagaatacaagctactcagatgggacttcaactgaatatcggtcagatcccaactattcatcgtggttttgtatttcagacctgagaatgagaatttctatgtcgccccttctgaaattgatcttgctttgattgagttgaacttcttataagtaataaggtacaagtggtaatgaagaaaaccgtaagattgttcatattgaaaccgtttcatatgttgtgtattaggaacacatgtcctcaataattaccgttcagtataaaatatggttacatgtttgtaccatttccgtaaatgcttgaagctgcaatatgaagtatgatacattgcagaaatcttaaggtttcctaatttatttctacttttttttgggaataatattttatttctactttaataagctcactagcattttatgcatgctaagggccaagaatgcatgttcactgtattcctatatacatcatatagtgggataagtacgtcttgaacttgcctctggtctttttccatgtcttgaggaagtttagtactctattgcagacgtgtcatcatcagtgttcatcaagcctgtacctgtggttgactatgttgcacagcttcttaacgaggacatcttattagacagaccattatgtagcactgagttcttgaaggtcaggtcgttttgtcatcctatttaatcacaaactgatcattgctattctgttacttagtacttgatttaaattcctgtgttcactccattacaagattcactttttttcccctctttgttagattaaggaggctctagaaggtctgaaggttcagattaatggcattttgttcaacacatatcatgtacaagaccttgtccatcaagcagcaaggtatttactgtatgcacttgctttcacacataaaaatattctcttgtgtctatagttctgctctaaataggccatctatgatgataataggttaatgctattttggtttttcctgcaacagttttccagttaactttagtattcagtacccatctttgccttgcttgaaagtggctcattttggggagacaatatttctgccattggaggttagtatcctgagcgaacatttattctacaatatccaacaatattaagaatggacacacactatcgtcttataaaaactgcttcttatcaccttctgtattctaggtctgtaaaattgctgagggacaatgtcaccagaaacagctcaatgcaaaacatatggctgctcttcttcaggtagctcgacagccccctaatgagcgtgactacaacattctgcaggtaacctgatacaaaaatttctacattcagtttatgtttgtttaggatttcttttaaatattttagccatgtcaataacattaagtggatcagttcaatctgcaaacttccacaagttagttataaatatcatatcatgtcatatcatggatttttttcgatgataatcaaaagacctacatgaggatgtgcttaaggtgatcatgctgtcatccttatgcacaagatttatgttatgctattaacatgtcatgagcagtgagcactagaagatcatacatatttaggagtataaactggcataatctgatctaaatgtggcacctaagccctttcgcaaacaacctaactcctagagccaccatagcagatgcttgaatacgtgcatgtatacgtgttgggaagaggagagtggtccttcactgattttttttaaaaatatttttggaggcaaccctaccactccgcctcagagtgagtatgggtcttatgggtggagaccttttatattagatggaacataaaaattatactaacatgaatgaaggcaaaaggtattggtttgactcaaaagtatttggggctaaaccggttgcctcaaatttgcataccccccggcttggcttaaagaatgatattgaggtaaacgaacatttacctcaaagtactgttcagaggctaacacattacctcagaatttaatttgaactttgaagggaaccaacttgtatgagccttaggatgcacctctgttgtgttctttgttgtagtgacatttttcattattgttagatttttgagattgtgcacacagatatttcttgtccatatgaaaataagctgtttgtcgcaccacttgtaatttgttttgtgatcttgaagttttattatctactatcatcaggcttcagttttctttatcatggccattgactattttcatgcatttgacatggcatatcaacaacccaaatttgcttaacaggtgcgattctaatatgaaaacagattatttaaagtaggccaccatatgcggattaaagtttccagttttacatgtaattagttatcatgttcttttggaaaagaacatattatgctctagattttcttatcatgttatgtctttggttaccagactgtgcatcagaacaaataccaggaggacccacatgctaaagagtttggcattaaaattgaggaaaaacttgtatcaattaaatctcgcatcctacctgctccttgggtatgtcttaacagtcatttacatatgctgattgcgatgtctgttgcatgtgttatgctgtaggtctgacttttctttttctatcagcttaaattccatgacagtggcgagacgacagaattcttgccacaacttggcatatggaatatgatgcataaggtactgaggtgacatatattgtgcatttctccttccaaattatttgtttttcagaactgttgtgattatattttacagaagtttctatctttggcaatattgcatacagctgcaaattaattttatggtaatgctttgttgtagaaaatgatcaatggtgggagagtgaaaagctgggcatgtgttaacttttgctggagtgtacgggagtatgctgctaggaatttctgttatgaccttggctttatgtgccgagaatctgggatggtaggttctctatgacccaaaaggtgattccattttttttacctcacagttattcacaattttgacctttcatattccctatgtctcaatgtaggtcttttcagttaaacctgtgcttcctctagtgattgctaaacctggatgtgtagaatctgcactcaggacacttcatgacgatgtcatggacatacttagaccacagggcagaaaacttgacctgctgattgtaatattgcctaacaacaatggatctctttatggtataccttttactttgtaacacatgtgggcagtttctttatgtaatacatgtgagcattgactgatcaattaatggtttttatttaatgtacttgtcatccacaggtgatgtcaaaagaatatgtgagacagatattggactgatctctcaatgttgtcttgcaaaacatgttcttaagatgaacaagtggtatcttgcaagcgttgcccttaaaatcaatgctaaggtttgttgtgctgtactatttgcttgactggtcattcatcaggtccttatttattcctttggttgtgtacgtagatgggcggaagaaatactgtactggttgatgctttagaaatgagactcccccatgttagggatacaccaactattgtatttggtgctcatgtcacccatccacatccaggaaaagctaatagttcttccattgctgctgtaagtgcacatctcactatttaagacgccgttgcctggaggcaggagtcctgcttatctataacttttaagtgtatatgtgtgctatatgtagcaattgcatgttttatgcaggttgttgcttctcaagactggcccgaggttaccaagtatgctggtttaatcagtgtgcaagcgtgccaccaggagtcaatacaaggtctttttaaagtccaggatgatccggaaagaggaaccacaactagcggaatgatcaagtacgaatgattgtgttaccttttagcatgtgaatactatacttgaaaggtctttgtagtctatgtacataagttttgtcttatatgcagagagcatctcatgtctttctatcgagccactaaacggaagcccggaaggattatattttacaggtattaatctatgtctggcgaattgcctcatcttttcattcttttcattttttagataagggagctttattgatcacaaacgattacaccgaggtgatagaatcatacagagaacactcctggccggactcatctcttctatgtctacatatttgacattattccacgactgctctcttcagggatggtgtgagcaaaggacagctccctcaggctttgatgcacgaacttggtgccatcaaaatggtgaagtttttatcccacattttctttctgaacatttttgtgatgagcactgcattctatttctttgaaatgataaatttgtgccataaaaacaggcgtgtgcatctatgggacccgattataatccattagttacatacgtggtgctccagaagtgtcgccatacacgtctgtttgctgactactataatgcgaatactcatgattcaactgcaaacatacgggctggttagttgccaatttttgtttgctgtactgcctatcttgtcaaacctaaaaccttcttcctaacccctgtgaatttgtccaacttcaggtactgtggttgattcaaatatttgccaaccaaatcagtttgatttctacttgtgtagccaccgcagcacgcaggttgagcttagttcttctttacccaaataattctttttctttttttttcatttgtaacacgctcctagctgattcaaaattttcccattagggaactaagcggcccaggtattatcatgttctgtgggacgagaacgacttcttggctggttctttccaagagctcacaaactacctctgctacacgtaagaatgccacttgttatgtgtttttacatttttgaaatcccttgaccggtttaacggacgagttgtcacctattattgcagctccgcaacttgcacccaatccatatcagttggtaagcacgagcccccacattctcctactatcatttactgtaggaaatgtgcttttcctctagcaaaagcatatatggttacgatatatattcacacctttttcttcttttgcactctgcagtggcccctgtgcactacgctcgtcttctgtcatcacgagctcgatgttacattaaaccacgctcgattggcgattcaacgagccacacctccttgccttctgaagaagatagcagcgcagcctcagagactggcagtcttcttcctataaaggataatttgaaaggggccatgtttttctgctagaactgctgccagcaagatctgctgtcattttgtacgtggtctgtacagtcccacagttcttggtagatttgactgagcagtcaaaactcattatcgttcagcgagattcaggtgtagcagctgtaggattactgataaacattgttcctgtaccgatactttagaagaaatgaattaattatatcttagaacagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |