Os02g0244300
| Gene Name |
Os02g0244300 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein |
| Version |
NM_001052950.1 GI:115445270 GeneID:4328857 |
| Length |
8224 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0244300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:8164121..8172344 |
| Sequence Coding Region |
8165373..8165695,8166067..8166457,8166540..8166927,8167017..8167171,8167263..8167351 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:8164121..8172344 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:8164121..8172344 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgctccaaccaagggaatccgatgtgcctgtactatttgttgtatttattgtacttccggtgatagcttattttcttcttggaagatggcatgatgctgtaagtaagaaggcacgggtaagtgtgctggcccagcgagctgcagaagaaaccttcaaggtggaaacaatggcgactccagacgttatattgccaggaccttctttaagacccatgccttatatgagatctgcaccttctgcaagacccgaataccatgagtgtgctacttgccacgggcctgctaagactcgctgctccagatgcaagtctgttagatactgctctggaaagtgtcaaataattcactggaggcaaggtcataagcaaacatgtcagcaatggaatggttttggtactagcagctctggtggactacctcctactgagaatactgaacagatgccattcttaagtaacctgaactcacctcttcgagggagcgatgttcatctgcatgacatggatttcgataccatgtcagagccatcctttgtgacaacagatagctataatcttgataccagcccatttctgtcagaccgaagcaacatgaataaaccaaaccaatttctacatacaagtgaaaatggtgctgccattggatcttatgagaagaacgactatagtattgatggagaagtcccttcttctgagattctgtcaggaaataagggtttaaataacagttctggttcaggtgaaaactgcggaaaccgtgatgtaatttatcctctcaatagtgtggtacatcaacccaataattatgcccctgaaataagaaagcggcccaaagcaagcatcacggtttatgaatctgataaaggcgtgtatttaacttctgatatgatcagttctggtgaggggccatatgcttctgctgcagagtcactacaaagaagtaactcgtctggaaatgttaccggaaaaggaaacatgatacataagaaaccaccatacccatctggtaaagtgtcatcatcacaaaaatcacaggagaaggtgttgacatcacatcaatatgatgggcatgaaaagaatccccacaacaaaaatgagcaaagatctaccaaaacagctgtttcaacaaacagcagtttgcaaggatgcaatggcatctcaaaagcaggagcatcaaaggttgaagccctgaagaagccttcaaaatttctcaaaaccagtctggtgggtttgatcaatgataacaagaggagtaaggtactgttcccatatgaagatcttgttaagttttttcagtatgaagtacggggcatctcacctagaggtcttttcaattgtggaaatagttgctatgcaaatgctgttctacaatgtctcatgtgcacaaaacccctgatgatctatctgcttctgagactgcattccaaagactgttgctcaaagaattggtgcctcatgtgtgaacttgagcaatatgcttcaactttgcgtgaaagtggtggccctgtttctccaagtagaatcctttctaatctgaggaatattggatgtcgcttgggtggtggaagtcaagaagatgctcatgaatttttaaggcatcttgtgatgtctatgcaaggggcatgcctggatggacttggtggtgagaagcaggtagaagcaagcttgcaggaaactacactgatacagcagatgtttggtggccgtcttaaatcgaaggttaagtgcctcagatgctaccatgaatctgaaagatacgagaatataatggatcttactttggagattcatggttgggtcgagtccttgcaagatgctttgacacaattcactgctcctgaagatttggatggagaaaatatgtataaatgtggaaggtgttctgcctatgtcaaagctaggaaacaattaagcgtgcatgaggtgccaaatatattaactgtagttcttaaaagattccagacagggaaatatgggaagatcaacaaatgtgttacttttcctgatatgttggacatggttccgtttgtgactggagctggtgataatcctcctctttacttcttgtatgccgtggttgtacacgtggatacagaaaatgcatcattctctggacattacatatcatatgtcaaagatatgcagggcacatggttgagaattgatgattcagaggtccaggctgtttcactgaatcaagttatgtcagaaggtgcatatatgctgttctacatgagatcttttcctcgcccaccgaagatttacattgagaagggcctatcatcagttcctacatgttcaaagcgccattcatcaaaatcctccaagggttctaagcaagacctgaatcatactgagtcactctttgcttccagtgatcaaacctatggaatatacgatttcagaccagacaacggctatatacaagatcagcatgctgctttgagaaccagaaatttctatcataccgatgatgcttttgcagattcaattagcacagacttctcagatgctacatcaagcgaatggtcactgtttaccagctctgatgaatcctcatttacgactgaaagcactagagattcattcagtgttgtggactatggtgacaatgctggccttgatccaatttcctctatatttgggccttattatgctcaagaccatcctcctggcagttttgcctcgtgtacaaggttgtcaccttccaatccacaaacaaggtacttccaagagaacacaggctttgtctcagattcttccatgccggctcacctgcccggcaatgtacatagaggaagatatccagacagggcctgttcttcttcagctgaacctcctgcttcagcaaatccgcgaagcgtatatggtaggtatggccttagtagagaaggttttgttcaaacatctggattttgtcaaatgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLQPRESDVPVLFVVFIVLPVIAYFLLGRWHDAVSKKARVSVLA QRAAEETFKVETMATPDVILPGPSLRPMPYMRSAPSARPEYHECATCHGPAKTRCSRC KSVRYCSGKCQIIHWRQGHKQTCQQWNGFGTSSSGGLPPTENTEQMPFLSNLNSPLRG SDVHLHDMDFDTMSEPSFVTTDSYNLDTSPFLSDRSNMNKPNQFLHTSENGAAIGSYE KNDYSIDGEVPSSEILSGNKGLNNSSGSGENCGNRDVIYPLNSVVHQPNNYAPEIRKR PKASITVYESDKGVYLTSDMISSGEGPYASAAESLQRSNSSGNVTGKGNMIHKKPPYP SGKVSSSQKSQEKVLTSHQYDGHEKNPHNKNEQRSTKTAVSTNSSLQGCNGISKAGAS KVEALKKPSKFLKTSLVGLINDNKRSKVLFPYEDLVKFFQYEVRGISPRGLFNCGNSC YANAVLQCLMCTKPLMIYLLLRLHSKDCCSKNWCLMCELEQYASTLRESGGPVSPSRI LSNLRNIGCRLGGGSQEDAHEFLRHLVMSMQGACLDGLGGEKQVEASLQETTLIQQMF GGRLKSKVKCLRCYHESERYENIMDLTLEIHGWVESLQDALTQFTAPEDLDGENMYKC GRCSAYVKARKQLSVHEVPNILTVVLKRFQTGKYGKINKCVTFPDMLDMVPFVTGAGD NPPLYFLYAVVVHVDTENASFSGHYISYVKDMQGTWLRIDDSEVQAVSLNQVMSEGAY MLFYMRSFPRPPKIYIEKGLSSVPTCSKRHSSKSSKGSKQDLNHTESLFASSDQTYGI YDFRPDNGYIQDQHAALRTRNFYHTDDAFADSISTDFSDATSSEWSLFTSSDESSFTT ESTRDSFSVVDYGDNAGLDPISSIFGPYYAQDHPPGSFASCTRLSPSNPQTRYFQENT GFVSDSSMPAHLPGNVHRGRYPDRACSSSAEPPASANPRSVYGRYGLSREGFVQTSGF CQM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1253..1575#1947..2337#2420..2807#2897..3051#3143..3231#3403..3488#3585..3747#4826..4949#5204..5361#5453..5537#5874..6086#7094..7155#7246..7936#gcccattcgcacacgagacgacgcagcgatcgagcagcgcagcgcacagtagcagcagcagcagccgagcgactgagcgagcgagagagccctactccgcctccgcctccgcctccgccgccgccgctcgccgcggcgcctccctctccggccgccgccgccgccgccgcctgcagcgccgttcgcgtgggcgcctctcgatctctcgaggaaaaaagcggggaggcgcgggcgctgccgcgtccctttttgctgcccggagatccgccccggggtggggcggcggcattccttcgcctggtaaaaccctagactcccttcgattcgggttccccctttgcctcgcgccgcggaggaatcgggcgttttctgcggcgggggttccgctcggtccgggggctccttgcgcgggcggtgttaatccgtttgctcgctgggtcggggtgggtgggggtgggttcgtgcgccgacacctgtagcgggggcgcccgcgtgtggggggaatttgggcgtgggggagttcgcctccccctgcgtggttgggatctgggggattgtagatttcctcattcttttgttaggctagagaactggtagtactattttggcattgatgtggtcaatgtggtgcgcgcgagttaggtcttatgcaacaggatgtttgtggggagatatgggcggaatgtattgcataagattgtggatggatttcagcgctttgcatgaatgtttgggaatgtaatgatacgtttcaggtattctaatgccttcttggctagaaattttgggtatattacagtgaagatgtgactctaccaacttgtccttttttgggtgggtttgagtatttagccattcacagataatttttgtttccaccagtatggtagtgtctggtatagcttcagcttatgtgcttgtaagctcatgtcgtcattctgaagctaccataaaacctttttgcgccctggaaacgccaatcaagctttggcctgagagatcgatcttctaatgcatataaatgaggccccaatagcttgtttgtcaagaagcttaatgttctcatagcccctaaatctttgaatggtttatgttatgattgtcattttccactttcgtgatagtgcaaagtggaaaactctaaacttaatttttgttatgctgcttccgtaggtcaatcagcaatttggaatgatttttcaagctgaagcagagaattatcgaagttggatgataatattctgttagggacatgctccaaccaagggaatccgatgtgcctgtactatttgttgtatttattgtacttccggtgatagcttattttcttcttggaagatggcatgatgctgtaagtaagaaggcacgggtaagtgtgctggcccagcgagctgcagaagaaaccttcaaggtggaaacaatggcgactccagacgttatattgccaggaccttctttaagacccatgccttatatgagatctgcaccttctgcaagacccgaataccatgagtgtgctacttgccacgggcctgctaagactcgctgctccagatgcaagtctgttagatactggtaagatactctgtttctcttctccatcatgtgctgtctattcattataatcaatctgtgtaccaaataaactgtgcccctcgcatgctattgagtattgaaatatggtaactattactcttttatgtccttaatagtaccgtagtaggtatttggaagtggcaatttgactgtatatgactatagcaattctgataaccttaacagctggtatttaaaaaaaaaaagctaaattcagtatttgccactcctcaagttgcccttgcaccacatctctctctatcatgtagcctatccacatctctctctatcatgtagcctatctgattgtgttaattaatgtacatattatgacttttgatgttcaacagctctggaaagtgtcaaataattcactggaggcaaggtcataagcaaacatgtcagcaatggaatggttttggtactagcagctctggtggactacctcctactgagaatactgaacagatgccattcttaagtaacctgaactcacctcttcgagggagcgatgttcatctgcatgacatggatttcgataccatgtcagagccatcctttgtgacaacagatagctataatcttgataccagcccatttctgtcagaccgaagcaacatgaataaaccaaaccaatttctacatacaagtgaaaatggtgctgccattggatcttatgagaagaacgactatagtattgatggagaagtcccttcttctgagattctgtcaggaaataaggtagcttagccaagctcttaactacaattttcttttacaagatttgttttaagtaatccaatccattacattatcttttcagggtttaaataacagttctggttcaggtgaaaactgcggaaaccgtgatgtaatttatcctctcaatagtgtggtacatcaacccaataattatgcccctgaaataagaaagcggcccaaagcaagcatcacggtttatgaatctgataaaggcgtgtatttaacttctgatatgatcagttctggtgaggggccatatgcttctgctgcagagtcactacaaagaagtaactcgtctggaaatgttaccggaaaaggaaacatgatacataagaaaccaccatacccatctggtaaagtgtcatcatcacaaaaatcacaggagaaggtgttgacatcacatcaatatgatgggcatgaaaagaatccccacaacaaaaatgagcaaagttagtgcataatttctttattggataaaatggccttgctttgtcatatggttacttcgttgatctcatatatttactacattttgcaggatctaccaaaacagctgtttcaacaaacagcagtttgcaaggatgcaatggcatctcaaaagcaggagcatcaaaggttgaagccctgaagaagccttcaaaatttctcaaaaccagtctggtgggtttgatcaatgataacaagaggagtaaggtttgaatcatccacaatatatctcgagttagttatttcagagtttctgtatcaaaatgctgagggtattgtttctaaattgacacttcaggtactgttcccatatgaagatcttgttaagttttttcagtatgaagtacggggcatctcacctagaggtcttttcaattgtggaaataggtacttaacattgttcattgagtgttcattgtaatgagttctgcaaataacagaacctaagaatcttaacagaaaatatgactcttgtttcttccattctcatctccatgttctaaacaattgtttgttcgcatgtcactatctgattgttattgctccttttttttgcagttgctatgcaaatgctgttctacaatgtctcatgtgcacaaaacccctgatgatctatctgcttctgagactgcattccaaagactgtaataccaaaactcaagcccccaccctccttggtgtagttgtgaaatctctcaccatctctgatttctttgacattgattgctttattcttttaggttgctcaaagaattggtgcctcatgtgtgaacttgagcaatatgcttcaactttgcgtgaaagtggtggccctgtttctccaagtagaatcctttctaatctgaggaatattggatgtcgcttgggtggtggaagtcaagaagatgctcatgaatttttaaggtgctgtaactgttacatgctacttctagttttcatttgtgattgcttgctaccttttttaggttgttctagtgataagataacttcagtagaagtgggagtaatgcttaggaaaccctgccaaaacttctattccacattattgcttcatcactatcaaaatttattgaaatatttcctcatgtaagagaagcaatttttgcatacacctatcctggagctaaaaggaatcgttgctatttggggtatgcaaaataaaagggcgaacaaatgcgaagaaccatgactcggagggttcctttttcttatttgaacatggccagtcagaagttaatgaaatttctcgactaacttgaaattgatctaaaaagttccaaatctgttttttcttatggcctattttgcttctgatgattatatctttttctttaaaaaagaaagattatatctattgttgacttgtactttagcatagctacctagttattatttgccacataaatggttttttggcatggtaatgtggggttgagagaagcggccactgatgctagtataaccatttactatttcttgctctagccaaaaaataaaaaataaaaatccataatagtatgtgcaatggaacttcatctgttgatattgttgatcacatttacgcgcgcacacacacacacacacactggtgtgcttcagttgaaatttcgtgaagttcacatatttgtccctagccttctttgattggacatgtattaaggggtgcactcagggtgtgcatgtgtgtttgagttttctatgtaacaggagagaaaaaaaaaggaatttctcccattgtccaagtgaataattgattactgtctcccttaaggctgtaatctggaactgtaatgcactaatgtatctgaatatttgagttttaatgtgtccttttctaagaacctcatgctccagtatgttcacgctctatgaaatagattaatgaaaaagggaaattataattgaagtatttggaatctgaaaagagttccattatttgtgaccatgcactcacattatccttgatttgctaaattaccaggcatcttgtgatgtctatgcaaggggcatgcctggatggacttggtggtgagaagcaggtagaagcaagcttgcaggaaactacactgatacagcagatgtttggtggccgtcttaaatcgaaggtaacttaataaattgctgacttctcaggtgtaattttgaagatagctgctagtttgttcagtgtcgtactgtttgttatcctgtgtagttgctgtgaatatgttttccccacttgtaaaaagatgcagtttttccccacttgtaaaaagatgcagttttgtcacttaagatttctcctcttcatgtcaattatcttactagttggctgttcattgtgttttactatgctaactgatttagttaatgaaactaggttaagtgcctcagatgctaccatgaatctgaaagatacgagaatataatggatcttactttggagattcatggttgggtcgagtccttgcaagatgctttgacacaattcactgctcctgaagatttggatggagaaaatatgtataaatgtggaaggtactgttgcaactaatatatttatccatcatttccattggatcacaccatcacaacatattgaacttatcttttaattcttttaatgcaggtgttctgcctatgtcaaagctaggaaacaattaagcgtgcatgaggtgccaaatatattaactgtagttcttaaaagattccaggtactatttgatttcacgccatattgataaattcccagtaattgcttataccaggtctactgtttagctagatattggaagcattttcttgcacatttatgcagtactgtagtttgcatgcgatatttgcgtaactatttgataacatccagttaaaaacgactaatttctattatatgatgtaagcacatttcgggaaaaattgaagcatacaattcgttagctggatcacttgatatacgaattacattggcctatttagctactctgaagagacgctgttgcataattttcccctcaatatgatgaaattaagtgaatattttattgctccagacagggaaatatgggaagatcaacaaatgtgttacttttcctgatatgttggacatggttccgtttgtgactggagctggtgataatcctcctctttacttcttgtatgccgtggttgtacacgtggatacagaaaatgcatcattctctggacattacatatcatatgtcaaagatatgcagggcacatggttgagaattgatgattcagaggtatgtgatacaaaaatgtgaagaaatgtggttctgatgattccttatttaaattaagaacctgtttaggtgttgctttaagaaattacttatgagtttggaccctatagaactgcatatgtctagatttattatggtatcatgagattatcttccagtgggccataatatactctgtactctgtttctcctaatgcagttatggtgttaacttaaactatatattcaattatgtttgcccttgtccttttaattttcaagttcagtttttatccatccatatatctataaaaaaatcactccctccagtcacaaaaggacactgtttttgacttttcaaattaaacaatgcataactttgactacttaattatgctgcataaatcttgaaaagttattcaagtgtaatattatgaaaagtacgacgaacttgagtacatcatttttcatatgctcaaaacctacattttaaacaatacttacggtcaaatttaacttgctttgaccgtacctatcctaaaaaagacattcttttgactggagagagtatttgtacaaagaacaaatgttatatcatatgctgtgtttttttttagaaccatttgaaagtatatgctcacaaattatgctttatgtgtccaaactatcttactgtatgggataaggacaggcaactttcaatttctaggtgttcaatgactataataaaatttcaataccagtacattactattaaaagatgtgacagatgtactagtctatttgatataactagattggtaaaaatgcactattaggatcttggactatggtatatgattgcacagtacgatcctatgggagcatctttgattcaactggaaattctgatcctcacaaagagtgctttgtgtcgagaatttcatgtctttttagcatgtgatatcacgtttcttaggaggctgctatatgtgcatttgaaaatctgaaaatcaaatgagctgatatgataatttggatgaatgtaggtccaggctgtttcactgaatcaagttatgtcagaaggtgcatatatgctgttctacatgaggtatatacgaactgtgatgtctgtggtatctatattatcagataaaattgttctgtgcctgtagcaaactcatatttatgtaaccttcagatcttttcctcgcccaccgaagatttacattgagaagggcctatcatcagttcctacatgttcaaagcgccattcatcaaaatcctccaagggttctaagcaagacctgaatcatactgagtcactctttgcttccagtgatcaaacctatggaatatacgatttcagaccagacaacggctatatacaagatcagcatgctgctttgagaaccagaaatttctatcataccgatgatgcttttgcagattcaattagcacagacttctcagatgctacatcaagcgaatggtcactgtttaccagctctgatgaatcctcatttacgactgaaagcactagagattcattcagtgttgtggactatggtgacaatgctggccttgatccaatttcctctatatttgggccttattatgctcaagaccatcctcctggcagttttgcctcgtgtacaaggttgtcaccttccaatccacaaacaaggtacttccaagagaacacaggctttgtctcagattcttccatgccggctcacctgcccggcaatgtacatagaggaagatatccagacagggcctgttcttcttcagctgaacctcctgcttcagcaaatccgcgaagcgtatatggtaggtatggccttagtagagaaggttttgttcaaacatctggattttgtcaaatgtaattgtctacatttcatagttttagctggagtttggcagttgtggttaccactgccattaaataccgcctcatgttcttttatttcagatgaggcatatttaattttagctgcatatcctaggttagttgagtgagtgactcaatgtagcaggccagcagggtaattagatttgtctaggtgcctagcatttcaggagatatatgttagaacacagtgacaggctttgtgccatccattgttcaaccaaaagccagtcatatcatttatctagttgcacaaaattgtacc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |