Os02g0517531

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Gene Name

Os02g0517531

Description

RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) domain containing protein

Version

NM_001186059.1 GI:297721250 GeneID:9271988

Length

8038 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0517531, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:19548819..19556856

Sequence Coding Region

19549724..19549825,19550070..19550115,19550657..19550977,19551468..19551886,19551972..19552130
,19552266..19552382,19552449..19552597,19553196..19553293,19553373..19553825
,19554128..19554782,19554881..19554965,19555063..19555131,19555379..19555558
,19556071..19556223

Expression

GEO Profiles:Os02g0517531

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccatctcaggtcatggatcagaggcatcacatgtcccagtacagccaccccaccttggctgcatcctccttctcggaggagcttcgtctccccacagagaggcaagttggattttggaagcaggagtcattacctcatcacatgggaagcaagtctgttgcatcttcaccaattgaaaaacctcaacctattgggacaaggatggctggtcgactagaacttctacaaccatataaactaagagaccagggagctgcatttagccttgagcacaagctattcggtcaagagaggcatgctaacttgccaccatctccttggagacctgatcaagaaactggccgccaaactgattcatctttgaagtcggcagctttattttctgatgggaggattaatccgaatggtgcctataacgagaatgggcttttctcaagctctgtatcagatatttttgacaagaaattgagattaacatccaagaatggtcttgtcggtcagtcaattgaaaaggttgacctaaaccatgttgatgatgagccctttgagttgaccgaggaaattgaggcccaaataattggaaatcttcttcctgatgatgatgacctgttatcaggtgttgttgatgaagttgggtatccaaccaacgctaacaaccgggatgatgctgatgatgatatattctacactggaggcgggatggaactcgaaactgatgaaaataaaaaactgcaagaatttaatggcagtgctaatgatggaattggtttgttaaatggtgtgttgaatggtgaacatctataccgggaacagccttcgagaactctttttgttcgaaacattaatagtaatgttgaggactctgaattgaagctcctatttgagcatttcggagatatccgtgccctttatactgcctgtaaacatcgtggttttgtgatgatatcttactatgatataaggtcagcgctgaatgccaagatggagcttcaaaacaaggcactgaggcgtaggaaacttgacatacattattccattccgaaggacaatccttcggagaaagatattaaccagggaactattgtactttttaacgttgacctatctttaacaaatgatgatctacataagatctttggtgactatggtgaaataaaggagattcgtgacactccacagaagggtcatcacaaaataatagaattttatgatgtcagagcagctgaagctgcacttcgtgcattaaacaggaatgatattgcaggcaagaaaatcaaattggagaccagccgtctgggtgctgctaggcgcttgtcgcagcatatgtcttcagaattgtgtcaggaagagtttggtgtatgcaaactggggagtccaagcacaagtagccctccaattgcttcgtttggttctactaatttggcaacaataacttcaactggtcatgaaaatggaagtatccagggtatgcattctggacttcagacatcaataagccagttcagagaaacatcttttccaggcctatcttctaccataccacaaagtttgtccactccaattggaatttcatccggtgcaactcatagtaaccaggctgcccttggtgagatcagccaatctctaggtcggatgaatgggcatatgaactatagttttcagggcatgagtgctcttcatcctcattctctgcctgaagtccacaatggagtgaacaatggtgtcccttacaacttaaacagcatggcacaagttgtcaatggaaccaactcgaggacagctgaagctgtggacaacagacatctccataaagtgggttccggcaacctcaatggacattcatttgatcgtgcggaaggagctcttggattttcaagaagtggaagttcttctgtccgtggtcaccagttaatgtggaataattcaagtaacttccatcatcacccaaattctcctgttctatggccaagccctggatcatttgtaaacaatgttccatctcgctcccctgcacaaatgcatggagttccaagagcaccatcgtcgcacatgattgacaatgtgcttcccatgcaccatctccatgtaggatcggcaccagcgatcaacccatcactttgggataggcggcatggctatgcaggggaattgacagaagcaccaaatttccatcctggtagtgtgggaagcatgggatttcctggtagtcctcagcttcactcgatggagcttaataacatataccctcaaactggagggaattgcatggacccaactgtgtctcctgcacagattggtggtccatctcctcagcagagaggttcgatgttccatggaaggaatcctatggttccccttccatcctttgattcacctggtgaacggatgaggagccgaagaaatgattcaaatggtaatcagtctgataataaaaagcaatatgagcttgatgttgaccgcattgttcgtggtgatgactcccggactacgctgatgataaagaatatcccaaacaagtacacctcaaagatgcttctagctgctattgatgaaaatcataaagggacttatgattttatttacctaccaattgacttcaagaacaagtgcaatgtaggctatgctttcatcaatatgaccaatcctcagcatatcattccattttatcagacgttcaatggcaagaagtgggaaaagtttaacagtgagaaagtggcatcacttgcttatgctagaatccaagggaaatcagctcttattgctcacttccagaactccagtttgatgaatgaggacaagcgctgccgccccatactattccattcggatggtcctaatgcaggagatcaggaaccattccctatgggtacaaacatccgagccaggtcagggagatcgcgagcttcctctggcgaagaaagccaccaggacatctcaatcacctcggttaattgtgacacttctaccaatggagttgatactacagggcctgccaaggactga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPSQVMDQRHHMSQYSHPTLAASSFSEELRLPTERQVGFWKQES LPHHMGSKSVASSPIEKPQPIGTRMAGRLELLQPYKLRDQGAAFSLEHKLFGQERHAN LPPSPWRPDQETGRQTDSSLKSAALFSDGRINPNGAYNENGLFSSSVSDIFDKKLRLT SKNGLVGQSIEKVDLNHVDDEPFELTEEIEAQIIGNLLPDDDDLLSGVVDEVGYPTNA NNRDDADDDIFYTGGGMELETDENKKLQEFNGSANDGIGLLNGVLNGEHLYREQPSRT LFVRNINSNVEDSELKLLFEHFGDIRALYTACKHRGFVMISYYDIRSALNAKMELQNK ALRRRKLDIHYSIPKDNPSEKDINQGTIVLFNVDLSLTNDDLHKIFGDYGEIKEIRDT PQKGHHKIIEFYDVRAAEAALRALNRNDIAGKKIKLETSRLGAARRLSQHMSSELCQE EFGVCKLGSPSTSSPPIASFGSTNLATITSTGHENGSIQGMHSGLQTSISQFRETSFP GLSSTIPQSLSTPIGISSGATHSNQAALGEISQSLGRMNGHMNYSFQGMSALHPHSLP EVHNGVNNGVPYNLNSMAQVVNGTNSRTAEAVDNRHLHKVGSGNLNGHSFDRAEGALG FSRSGSSSVRGHQLMWNNSSNFHHHPNSPVLWPSPGSFVNNVPSRSPAQMHGVPRAPS SHMIDNVLPMHHLHVGSAPAINPSLWDRRHGYAGELTEAPNFHPGSVGSMGFPGSPQL HSMELNNIYPQTGGNCMDPTVSPAQIGGPSPQQRGSMFHGRNPMVPLPSFDSPGERMR SRRNDSNGNQSDNKKQYELDVDRIVRGDDSRTTLMIKNIPNKYTSKMLLAAIDENHKG TYDFIYLPIDFKNKCNVGYAFINMTNPQHIIPFYQTFNGKKWEKFNSEKVASLAYARI QGKSALIAHFQNSSLMNEDKRCRPILFHSDGPNAGDQEPFPMGTNIRARSGRSRASSG EESHQDISITSVNCDTSTNGVDTTGPAKD</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0517531, RefSeq:Os02g0517531