Os02g0528900

From RiceWiki
Revision as of 02:33, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0528900| Description = Similar to PDR9 ABC transporter| Version = NM_001186071.1 GI:297721274 GeneID:9268937| Length = 14179 bp| Definitio...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os02g0528900

Description

Similar to PDR9 ABC transporter

Version

NM_001186071.1 GI:297721274 GeneID:9268937

Length

14179 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0528900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:20264470..20278648

Sequence Coding Region

20266845..20266943,20266961..20267113,20267256..20267588,20267785..20267853

Expression

GEO Profiles:Os02g0528900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:20264470..20278648 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:20264470..20278648 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggtgttacctttctcaccacttacaatatcatttcaagatgtgaactactatgtagacacccccgtggaaatgagggagcaaggttacaaggagcgaaagctacaactattgcacaacatcacaggagctttccaaccaggggttctctcagcactcatgggagttactggagcaggaaaaacaactctacttgatgttcttgctggaaggaaaactggtggtgttattgaaggagatatacgagtaggaggttatcctaaaattcaacaaacttttgcaaggatatcaggctactgtgaacaaaccgatgtccattccccacaaatcacagtggaggagtctgttgcatattcagcttggttgcggctaccaacagaagtcgattcaaaaacaagaagagaatttgttgatgaagttattcaaacaattgagttggatgatattagagatgctttagtaggactaccaggggtaagtgggctatctacagagcaaaggaaacgtctcactattgcagtggagcttgtgtccaatccttcagtcatattcatgcttggatgcacgagcagctgctattgtcatgcgtgcggtgaagaatgtcgcagacacaggtcgaacagttgtgtgcaccattcaccaaccaagtattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVLPFSPLTISFQDVNYYVDTPVEMREQGYKERKLQLLHNITGA FQPGVLSALMGVTGAGKTTLLDVLAGRKTGGVIEGDIRVGGYPKIQQTFARISGYCEQ TDVHSPQITVEESVAYSAWLRLPTEVDSKTRREFVDEVIQTIELDDIRDALVGLPGVS GLSTEQRKRLTIAVELVSNPSVIFMLGCTSSCYCHACGEECRRHRSNSCVHHSPTKY</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>11706..11804#11536..11688#11061..11393#10796..10864#agcggcagcagcatccagaaattaagatgagccaattagaggtggttgagatggaggacaagaagcagcagcagcagcagcaacgagaagaagcagaagcagaagaagaagcaccagtagtgccttcatcgttgcgagctgcggcaacctgcaggagcctgtcgtccttgtcgtcgtcgttgcggtgggatcatcgtggggacgacgacgaagaggaagctgagctgagatgggcggccatcgagaggctgcccaccttggacaggatgcgcacgtcggtgctgtcgtcggaggcggtggacgtgcggcggctgggggcggcgcagcggcgggtgctggtggagaggctggtggccgacatccagcgcgacaacctgaggctgctccgcaagcagcggcggaggatggagagggtgggcgtccggcagccgacggtggaggtgcggtggcgcaacgtgcgcgtggaggcggactgccaggtggtttccggcaagccgctgcccacgctcctcaacaccgtgctcgccaccgcgcgggggttgagccgccggccgcacgcgaggatccccattctcaacgacgtcaccggaatcctcaagccttccaggtactattgatattagcctctcatgcatggtcatcgcgaggtgatcgatcatccatcgagatgtatgtgttgtgtgcaggctgaccctcctccttggacctcccggctgcggcaaaaccaccctcttgctcgcccttgcaggaaagctcgacaaaaatctcaaggttatttacttcttcattcccagccaattgcatgtgatccttccaccaattaagtatctaatcacaagtaaccagcctactagctgcagcgacatattttgatcatcaataatcggctactcactgtattatcatatcatcgcattgcataatgcattttgcattgcaggtgaccggtgaagttgagtataatggtgccaatctgaatacctttgttccagagaagacatcagcttatatttctcagtatgatcttcatgtccctgagatgactgtcagagagacacttgacttctctgcaaggtttcagggcgttggcactagagcaggtatatatagcacatttaattatctgtctcatgtttgtttacttactcaacttaaccaagtgtcgttatttttcttgtgcaaactagagatcatgaaggaagtcattaggagggagaaggaggccgggattacccctgaccctgacatagatacatatatgaaggtaaacattaaccacccatttatgtattcttttttttttctttccccttgtctctgttataggaatgctttcttttgtcatctctatctatctattatattattaaaggaatagaaaaagaaacctccacgttcgctctcatggcctagaaattctcacattaatcggagaaaaagaaaaagcagagtccatatagaaatacaatttagaaatagctgaatttcggaattaaaaaataaggaatattagaagaggagactagagtccatatagaaatacaatttagaaatagttcaaattcggaattaaaaaataaggaatattagaagaggagactagagtccatatagaaatacaattaggaaataactaaaattcagaattaaaaaataaggaatattagaagaggagactagagtccatatagaaatacaattaggaaataactaaaattcggaattaaaaataaggaatattagaagtagagtatagagtccatatagaaatacaattagaaaataactgaaattcggaattaaaaataaggaatactagaagtagagtacagagtccatatagaaatacaattagtaaataactgaaattcggaattaaaaataaggaatattagaagtaaagtatagagccatatagaaatacaattaggaaataactgaaattcggaattaaaaataagaaatattagaagtggagtatagagtccatatagaaataaaattaggaaataatagaaattcggaattaaaaataaggaatattagaagtagagtatagagtccatataggaatttaaaactaactaaaatttggaataaacataataaaattaaaagtagagtttagagtccgtataaaaaaataatttacaaataactaaaattcgaaattaagaaaaacatgggaagaagagtttaaagtcaatataggaatacaatttagaagtaactgaaattcgaaattaaaaattaaagaatattgaaatatgagtttagagtccacatagaaatacaattagaaataatgaaaatttagaaataataataaataatattgaaagaagagcatagagtctatatagaaataaaatttacagaaaattcggaattaaagaaaagaaatattaaaagacgagtctagagtccatacaggaatatatataatttacaaataactaaaatttgatattaaaaataattaataactaacacgtatataaaataaaatataaatattacacattagtagttttgtaaagttattgcaaaatttaaaattatgttgtcattttaatatatttgaataataaaatgataaaacatatatgctattatataagagaaaatataacgatgctagccgcgtaatcttcgcgggccaccatgctaattatattattaagacagctttgaaaagaggcaccacgttcgctgtgggggctagaaattctcacattaatcggagaaaaagaaaaggagagtccaagtagaaatacaattcaaaaatagctgaaattcggaattaaaaataagcaatattaaaagaagtatccatataagaatccaatacgagattagttaatattcggaataaaaataaaaataaaatctgaaattagcaaaaagaaaagaagagttcaagtaggaatacaatttaaaatcaactgaaattcataattaaaaataagcaatattgaaagtccatataagaagccaatacgacattaattaaaattcataataaaataatatccaaaattagaaaaatgaaaagaggtttcaagtaggaatacaattttgaaacaactggacttcaaaaaataaaaatattaaaaagaacactatacggtattaattaaaatttgaaaaaaataaattctgaaattaaaaaataaaaaagatttcaattaggaatacaatttataaataacaaaaattgatgataaaaaataaagactattgaaaaaaaaatgaccatctaaaacacatgacgagataaattaagtaacaggcctataaaagaatagagtggtggcggttgatacgacatataaaaactgttagtaaagcaccaaattgaatcctaatgatgattaaaagaagggacgacaggcaggccgtgaagcaaacgggtaaggcagttgccgggacttgtagaaagtaaaaaaaacccattgataatcatattcgatttttaaaatcttaatgacagcaaaaaggagaagtagcgtgcagcgtgtataggagtacagttgcagagccgccgatggttggtgggacttctagaaaataaaaaatgaattctaatgatagttatgttcgatttttagaatcccaatgacaataaataataggcggcggatgggccgtagagaagtatagtggcatcgtttgacggggcttctaaaaattataaaaaatgaaacccaataaaaactacaaggtccaatttttaaatattcggaactactaaaaagtaaaaaaaacaatgctaatcatgttcgattttaaaatctcaatgacaataaagaagggaggcagcggacgagccataaaggagtacaatggcaaaattgctgaaggtttggcgagacttatagaaagtaaaaaatgaaccggaatgataattatgttcgatttataaaatcccaatgataataaagagaaaagacagcggacgggccgtagaggagtataattcgtttgacgggacttctagaaattataaaaacgaaacccaacgagataataaactcaaaaaactatataagatccaaattttaaaggtttcaaggagaatgaatagaaatagtggtagaccgagcaagaaaataaagaaggatatgacagaagtaaggggtagcagctggtgtgacttttaaaaactatataattagaaatacggggatagctatttaataaatcttaagtaaaatcatactgaaatgttcatgattcccattatcaagaatagggttaatcctaaatgtaggtgcagataagaactagaaagcaccattgcatagggaagttctttgagtagtaaaaactctcaaatcgaataaaactctttagcaattggtctgacagaacggatggtaaggtgggggacccatacctttattctattcccgtgcttagagcgagtgaatgtttggatcatatgctgccttgcctgatcttactagagtgagtttccttctctaacgagatgatgcatattctcagtctggactattcccagatttacgaccaacaactagtcttatcttagtccatggagaggaaaaagcaaacgaagcatgcttctgtcgctccatccccgtatgggtggagaacccgtcgctgtctcggctgtgctaccggaggctctaggaaagtcggaggagagagaactcggagattcgtgctggaacgcccactttgcattttaaagaaaaggtacaaaaacatatttattccgaatcagatggggaaatgcactggagtaccgatgtttatcatgcgcccgaatatcaatatggtaatcttcgtcgattttgtgccgctacgcacatagataccaaaggtaaatctacacggaatgtggtgtaaatctacataaataagagataagtaaccctattgtctcttctccatttgtatatggtgaagaattcagtctacatgcagtgttgaatgacgagtcaaagttcaccggtttcggcctgtgatttataaatagcttcggcacaaaagacaaaacggtccctccaacgcccgaatccttgtagtactaagtcgtggcttacaagctagcccctactccttgtttgggaaagatctatatggtttaccaacctggcatagacactagatcctttttatcaagcacgctactggcgcttccaaaggcgaagctctcgtctttggcgaccagcaaactctgggctaaaacctgtagttttgaagcaagggatgagcgcgaaagccgttgcgcttccgtacacgcgcatacgttttcttgctccgtcgcgcgttagtaaaataatgcgcagccgttttcttgctgggcgggacacggatttctgcaagtacaggtacaaccacaaccgctcgggagttccatggttctaaaggaataattcctttcccatttcccttttgagacaattatacgttctagaaggcagttctaattgatcaataaaaatacaattcaatggaattctttttttgtttttctttagattagtgactgcggaggaaattagatgaagtactccagatacaaagtatggaaaagtatctagaacttctcccccgggccctactccccaacctagagtagctaagtgcggaagtaaaagcagcccctacacttctatgggttgttccagcctctgctcagtattccgcaataatatcgcacaatcctctagaatagtcaggccgcattttcgttttttcactcaaactcaaagggtaaactttgcttcttatctttttttttgaagatcgacgaatcaaatgatatttctgttctaatttctgccgcttcctctctctctgaatcaaacttttttttttgccataatgtgccgttcctactatctaccaagtatacggttctaatcctagatggaaaaataatctaccaagtatacggttctaatcctagatggaaaaataaatagaaaaagaaatctaagaaggtagatcctccccctccatcaagagtaatgaactaggtgctgatacagtcgtctagaagaaaaacggaaatttcgttttcatgatggtatgacagaacgacaattacttagatatgtacatattgctggaaaagcaaaagggttacgaggaagggcgtagcaagcgacgaaatgcttcggggagttgaaaataagcatagatccggagattcccaaataggtcaaccttttgaactgcctgctgaatccatgagcaggcaagagacaacctggcgaactgaaacataaaagccttagaattcattcataaaatgacaatgaacagtctttatggctgttttgctatatcgcctgaaagcactatgaccgttaaagatatgattttgtttgggtgctagccgcgcaattgcgcgggccacctagctagttgtgtaaaagaagccaatagtgatggtggtgactctgccactcccaccacctctcgagttgaagggaccttttgaggacaaatacatatttgtgtgtgtagcttaatatgttatgaactgatatttgattaggaattatataagacatttcaaatttaaaacttataacatactttttaaatttcattgcaacacattggtatttggatagtgtatctaaacaacagtgaaaacttgtctcattttcctcattcagtttggtgttggaaaaaatagtttggtgtttagccatttgtaatctaaatggcataagctctaccattacaattcaattaggtatttttgtatttttgtaggcaatatctgtggaaggcttagaaaggagcatgcagacagattacattatgaaggtaactggtccaatgaagaatgctcagtccaatgatcaatgctcagggatcttagtacataactttttaaccttatgtataatctatctcttgcttaatagattatgggacttgacatttgcgctgacataatagtcggagatataatgagaagaggtatttcaggtggtgaaaagaagagactaaccacaggtgatttaaccgtgtatatataccaataccaggatggcgtttgtatcatctcaattgaaatatagttgtaattaaattaaaacactcaattcaacaactaaaattccgcaattatgtatgggaggatctacacccttgtaaattccaatgctaaacataatactatagaactacactctagctaaccaacaaatacaggtagtgttccaataaaaaaacaaatataggtaatgtatactttctattcacaaaaacatgtatgctagccacctaactaaaggtatcaggctagcaagttttttccaaacaaaaaacaaaaggaatagggttatcttcatttatgccatacaaactcaatttttttgggacaagtcaagttgttaattcaatgcaagatgcttggttttccttttatttatatcgaaacatcatcttggaaccaggggagatgatagttggaccttcaagagcactattcatggatgaaatatcaactgggttggacagctctaccaccttccaaattgtttcttgcctccaacaagtggctcatatctcagagtctaccatactggtctctctccttcaaccagcaccagagacttatgatctttttgatgatattatcttgatggctgaaggaaaaattgtataccatgggtctaagagttgcattatgaatttttttgaatcatgcgggttcaagtgcccggaaagaaaaggagcagctgattttctacaggaggtacatgagaaaagtattattagttcaaaaagtcttgactaaacagcgaagtgagattgtttaaaatgaacactatcagcatcaagtacttgttggaaattaatgacttgaagtttaagtgtgtgtatttgagttggtgtgtatagctcccaacttgaaacaacatgagttaatggtttatttgataagatattggagaaagaaaaggagaaatacaagacacttgagccatgcattttatctaaattagtcaggcatgataagaagtgcatatttgagctttcataattctaatagaatctaccatgtcaattgtcctacttagggatttcgttcgatgcaatatggataaactaaattggacattttaggttctatagtattccaaatagccattgttttatagagacatgctcttttacttagtctctgcattttgtataatgtacttacaatgttggtacaagttcaagatacaactttttaatattaagcagttaagtattggttagtatgatgtgtctttgactttcttattattatttctcttctaaacttgcgtataggttttatctaagaaagaccaacaacaatactggagtcgtactgaggaaacatacaactttgttactattgatcacttctgtgagaaatttaaagcatctcaagttggtcaaaatcttgttgaagagcttgcgaatccctttgataaatcagaagtatacaataatgctttgtccttaaatatctactctctaaccaagtgggatctcctcaaggcatgttttgcaagggaaattcttctcatgagaagaaatgccttcatctacataacaaaagttgttcaggtaaggaagtagaaatatctcttttggagaaaatttcagttcaaatgttcatagttttgagaatagatgaatgcattctatgatacaaaacatccggtttttgacacctgatttatgatgttacactcattgtcacgtagctaagttttctcatgtttactatgtacaatttaggctacatatagtactatatcaacaccaaaaacaatggaggttgtaatatatcaaggtttccagttgaaatttgatatctttaaaatgcttcctatatttcaattgacacatgaattatattaactttggcattattatttttttcaaggaattgaggtttttgttagaagagtgtatcttgcataataccctcctccgttccataaaaaaatcaaatcctagctatgaaccttgtgtctaggttcgtagctaggattggtccttttatgggacatagtagtatataatatagttgtttagaattcggatgagccaaaactttagtttttgcattttctcaacaaattaacatattacatttttttcagcttggattacttgctgttattactgggacagtgtttctacggacacatatgggggtcgatagggcccatgctgactattatatgggttccctcttctatgcgctcattcttcttttagttaatggtttccctgagttggctattgcagttagcagacttcccgtcttttacaaacaaagagactactatttctatccggcgtgggcttatgcaataccttcttttatactaaagattccactttctttagttgagtcaataacttggacatcaatatcttactacctcattggctatactccagaagcatccaggttaaattacactctattgtaaaagtattgtacacatgaagtacgcatttgactgtatatattatcaactctttccggttgttcttatgtgtgaacctttcatacctacgagggccaccatatatagggcaaacatttttccagtctattcaagatatgcataggtgtatttatttttactatttgggtttcaatgatgttggctaccaaaataagactacaggatttctttatataaaactatctagactctattttagtgtttattcgtattacctcatctttaagatgcaatgactatgttgtgtgttaacatactcaatttctgtgttaggtttttttgccagctcctcattctattcctcgtccacactggagcattatcgttgtttcgatgtgtcgcctcatactgtcaaacaatggtggctagttcagttggtggtaccatgtcatttctagtcatccttctatttgggggctttatcattcctcggcgtaagccgctgtctcttttccataagccctactatgctaacaagacatcgttcagaatttctactaattcttgtgtacatggttatgtattaaacaatcattgctaattaaaaccatgtgtgtcatattttacagtatctatgcctaattggctaaaatggggattttggatctctccattgtcatatgctgagatagggttgactggaaatgagtttttggcaccacgatggctaaaggtacgtgttgttgcatccttagcctatcttttagataaggtgagtaccttctacttagattccaacattaaaagactattttttctatgttattagaccacaacgtctggtgtaacacttggaaggagggtactaatggatcgaggactagacttctctagctacttttattggatttccgccagtgcattgattgggtttattttgttgcttaatgtaggttatgccattggcttgaccattaagaaacgtaagtatgatatgtgaaataccattaaataatacatcccgagcacttcactatccatatttatcaaagcatatgttcatgttgatgtttttaaatagttccattctctcaagcgttattctgataccatatggacctcagctacaggaacttcccgagcaattatatctcgtgataagttttccacatttgatagaagaggcaaagacatgtccaaggacatggacaataggatgcctaagttacaagtaggaaatgctttggcacctaacaagactggttagttcaatatatacattctatgactaaatgcatctcatattaaatacatcaataatgtgatcttgtgcagggacgatggtgttacctttctcaccacttacaatatcatttcaagatgtgaactactatgtagacacccccgtggtaattctaaactcctaatagtcaagacaattactagtggaagaaaatcatgcttagttgttgactgttatgaatttcagtagtcaaagagagcaatatattcacttgttctattagcatgtgcttcatggttattcccatatatttagaagtataataggctgaaatcaatgttgagtgtattctcaatttttaggaaatgagggagcaaggttacaaggagcgaaagctacaactattgcacaacatcacaggagctttccaaccaggggttctctcagcactcatgggagttactggagcaggaaaaacaactctacttgatgttcttgctggaaggaaaactggtggtgttattgaaggagatatacgagtaggaggttatcctaaaattcaacaaacttttgcaaggatatcaggctactgtgaacaaaccgatgtccattccccacaaatcacagtggaggagtctgttgcatattcagcttggttgcggctaccaacagaagtcgattcaaaaacaagaagagtgagttatttcattgttgaaacaaattataaaaaaatgaaatatacatgtgtaaatcaatacaaaaatattattacagtgtaaattgcataattgagatggaactatgacctaacacatacatatttttttgccatcataggaatttgttgatgaagttattcaaacaattgagttggatgatattagagatgctttagtaggactaccaggggtaagtgggctatctacagagcaaaggaaacgtctcactattgcagtggagcttgtgtccaatccttcagtcatattcatggatgagccaacatcaggcttggatgcacgagcagctgctattgtcatgcgtgcggtgaagaatgtcgcagacacaggtcgaacagttgtgtgcaccattcaccaaccaagtattgaaatatttgaggcctttgatgaggtactttcaagttattgtgttacatatatagctcaatagtcttatctaggactaactatgaagtgtaaaggatagctctcatggaataaaaaatacgctttaaagtggtcatacattacattaattattcataggaattttagcagacttgttcaactacacacaccctctattactatattagatatgaagaaaaaaataatgatacatatttgtacgtaaacttactacgtcaacaatacatgtaacatgattacaatataggggtatttcaagttacaacttctatggagtattcatttacttttctagacaaaaacatcatgttgataactctacatgtcttcattaccaaaagtttcttaatttgctatagtacatagatctttacggcttaatttactgggctaagagcatacaactgtaacctttttaagcattcatggtgttggagaagttaagcatgaaatttccatatttttttcaataataacgggagatattttgtgtatatttaatgtgcattagtgatattaaaattctttagtttgcatgagtaaaataaaagtgaagtaccttataactaattatcttaaatatgtatttagcttatgctaatgaaaaggggtggagagttgatatatgctgggcctcttggactccattcatgtaacgtcatccactatttcgaggtatcaattaataacttgaacttgttcattgtatattgcttgtacaaaagtatctagctataaataaaatttgtttcgtatcaccattcatattatgtgatgaaaaccaattaaagttgacctagctagctacatctgatttcattattttcatgacctatatgtttttaagaagttacaaactaatcactagttatgatttttgtctgcatttccagtccattattttctatctagcatcatgtgcatgtgctataattaacggatccaaactaatatatattaagtctaaactacaaaattatattccattaaatccttaacatgtgtgcataattatgaggcaagttgaccagaaatgtatgtacatatgcaaagatgcaatactttcctacaaaagttttacaacaatacacatattcctacatatttacagccataaaggtttttaaatgggcgtgggtgaagaacatatcatcaccctcaactctctctacgtatatatataattgggtattgtatatgtagagcgcgttattcgtataaatccattctccagatgttgcatttccaatgtacattgcatatgatgaagcaagcaatgtggatattttgatttccttgataaatatatgtttttttgtattttcaataattaatttatttatgtcacattattcttacaattcccttctccaagcatcactatttccaatgtacattgtacattacatatatattacgtgtcattaaaaatttattctctggatgtcatgatttctaatgtctgtagtagatgatgggacgtgcaatataatcataaacacacttcttttgaaccgtagaataagaatatatcttttttttaacacacaaacatattattaagcaagaacagagtttaggggataaaccccagtacattgccaaaagataagatatgaaagcaaagagccacccttttgaaaagggaggagtacctaaccttttctctttgatttttcagacaattcccggggtacccaagatcaaggataattacaacccatcaacatggatgctcgaagttacttgtgcatctatggaagctcaattgggggtagattttgcccaaatttacagggaatcaaccatgtgcaagtaagtttttaaaaacccatcacatttggatctagtgccatttatatatccaaaacaagttacacataaaatgcaatggggcttgggtgccaagagtggtcttgataaaataattgaccaaatgatacttacgtgtgtcatcacgccacttgtaattaacaatactcttacctgtgggaaaaacaaacttggtatgatggtaagtaattggttattgaagggacaaggatgctctagtgaagagtttgagcaaaccagctctaggcacgagtgatctccatttcccaacacggtttccacagaagtttagggagcaactaaaggcttgcatctggaagcagtgtttgtcatattggagaagtccttcctacaacctagtgcgaattttattcataacaatctcctgcattgtcttcggtgtattgttctggcagcaaggtgacatcaaccacatgtatgtattgtgaaccatcactatgtccatccttgtaaatagatatagaggaagcatgttcatatgc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0528900, RefSeq:Os02g0528900