Os02g0552600

From RiceWiki
Revision as of 02:34, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0552600| Description = Similar to 8-oxoguanine DNA glycosylase| Version = NM_001053642.2 GI:297599405 GeneID:4329639| Length = 5024 bp| De...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os02g0552600

Description

Similar to 8-oxoguanine DNA glycosylase

Version

NM_001053642.2 GI:297599405 GeneID:4329639

Length

5024 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0552600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:21697552..21702575

Sequence Coding Region

21701050..21701274

Expression

GEO Profiles:Os02g0552600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:21697552..21702575 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:21697552..21702575 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgaacagggcaaagtacatcgtcggcactgctaaaatattacaggccaagcctggtggaggcgagaaatggcttgcctcattgcgtacaagggaactcccggaggtgattgaggctctttgcacccttccaggtgttgggccaaaagttgcagcctgtgttgctttgttctcactcgatcagaaccatgctattcctgttgacacacatgtctggaaggtatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MNRAKYIVGTAKILQAKPGGGEKWLASLRTRELPEVIEALCTLP GVGPKVAACVALFSLDQNHAIPVDTHVWKV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1302..1526#gatgtttacagctttggagtgctcgtctttgagctgttcatggggtgtcatcctccccttccgaccgttgccgccgccgccgccgccgggatgccacctcgccgccgccgccgagtccggccgccgctcccaccctcccctcccctcctctcttccaccaccgcaacaccaccgccaaccccgcccgtgggcacccccaaatccgaggccgccgaccgccgccctcctcccgcccgccgccgcctccccctcgtctccgccgccgccgtcgaggaggaggacggagagtggcaccccctgccgctctccgccgccgacctgtccctcccgctcaccctccccacggggcagaccttcctgtggcgccgcacgtctctctccccgctccgcttcaccggcgccgtggggcctcacctcgtctccctctcccacctcccgtcctccgacggccgcctcgccttcctcctccacaacaacggcggctcctcctcctcctccgtccccgcggcggcccgcgccgcgctctccgactacctcaacgccgccgtgccgctcgccgacctctggcgccggttcgccgccgcggacgcgcggttcgcggaggtctccgcgcggctcgggggcggcggcgcccgggtgctcaggcaggaccccgtcgagtgcgtgttccagttcctctgctcctccaacaacaacatcgcgcggatcgagaagatggtgtgggcgctggccggctacggggagcggctcggcgaggttggaggataccaattccaccaattccccacgatcgagcggctcgcgcgcgtgtcggagcaagagctccgggatgccgggttcgggtacaggtcagttcacaaaggattttcatctatagtcattgttacttatgttggagtagtattggttgaagcatctataggttcattttgatgcttactttgtattttccaattaacccatttggcattggtaggatctagatcttgtgttaattataattcagacataatgggtgactaaattcgcgtgctatatcaatgtgctgataatagcagagctcgtagacgataaaacgatgatcctaccattactgtttatacgatgaatatgtagagaatctcaacttcacatttgtgtggtgaggtttcagctttggggaaataacattttgaatcaggcgtaacacttgtttggattgcttgaatcataactcagttctatcatattatgtatactacatttgatttgagatactagtcaatagcacactgatttgagcaaatgctgtgttctaataaatgaacagggcaaagtacatcgtcggcactgctaaaatattacaggccaagcctggtggaggcgagaaatggcttgcctcattgcgtacaagggaactcccggaggtgattgaggctctttgcacccttccaggtgttgggccaaaagttgcagcctgtgttgctttgttctcactcgatcagaaccatgctattcctgttgacacacatgtctggaaggtatgaaaatgagtactgctacacataataaaattttcttacaaaactcttatactaacaaatgtctcaaccgtttgatttaactagatggaagttgcaacaaatctagatttactcacggcttaccacattagagtttgtaagaattttgtaagaaaattttagtatgcatagacttttccatgaaaaattgttgataaaattaattaattcacatccatgtcagttccctcactatcattttacacattcttactatttgaatgggaacctgttttgcacattctaccctgatcatatttacttccaatttttgttgaaccataagctctgcataacaaggtttgccctttttcattttttttagttgggtgagggtgggactttcatcatttgaatgggaaatagtattcaatgtattcacaattgacttcactctctagacataaaaacaattaaagttgatgggaagtcttgtgaaggaggttttttcacatgagttttatatgacctacaaacaattgtattttgtttttaagcccttcctatatggatttaatgcaggttgctacacaatatctgatgccggagctagctggcaagagcttaaccccaaaacttagtgttgctgttgccgatgcatttgttgctaaatttgggaactatgctggttgggcacagaatgttctctttattggccagctgtctgctcaaaaactcatggttgctgaaactacaaacacttccacgaaacctactaaaaggaagcgtagtggaaacaatgtcaaaacatgacaagaaatatcacatgtagagacaatgccaaggttgactttacacgcggttttgtttcagtaaccataacatgtttgacattcactaactaaagttgtgttatttattgcggggatatcaaattatttaaccagtttgcactacattctgctctacgttacatcgagtaaaatatttgatttgacgatggatcattaacatatatggtcctgggatttctataatctcagtggcacaaagttctgataaatgtttccacatttcagaattgttcttagaacacaatggcaactctcgtggtagtaggatccaattcaaggtatattgaatattgattacattaaaaatgcttgttagcaacttctgggttatagccttagcaacttctgggttatggcctagtgacataggaatgtcgagtcatttattctgacttttttgaaacattgatagcttttttcctgagactttgttgacttggcctgcttgtcaaagatattgttcaaaatcttcaattttaattttgtcttgttatatgcatgaatgcccactgattttgacatagcaaagtttaaagttgttggcaacaaattagtgatctcatctgtataattgccaataaatagatattgttatgttgcacgagacatgcttggtagatgttgtatccctataatggtgctgtcgtgtagctaaggctgttggcatgagaataaatcacactggccctgtgtggtgtggattggaattgttttcatttttttttatgaacttatagaagttgcctcttttgtgggcttgatgttaagagtctcaagggcacatctgttgatgttaagagtctcaagggcttaatgatcaatttgggaaggagggagtagtattttgcattgcgcttactgtcttcatttatataaaacggcttgcatggcctgtttacaaagcgattataaaccaaagattggttattgatgcaaatgaaaataagtttctgaaacaatttaggtaacactactcaagagttgagagcaatgttaattcaaatgaaggattttgaaaagcagtgataggatctgaataatttttcaatttcactggattcttttataataatcattttcttcctagcatctacaacacaacagttcttttttcttaacttctttttaacatcatgtagcttggtgttccatacctttatgatgctttggtggttagtaccttacaacgaggcgttcaaatgccgagtaggtacggactgctgtgggcacatccacgatagaggagcacattcagaaaactggtattttgttgagaagctgataaaaaagaaaaagttcaagttgttctttagcgctcatatctgtttcatttttttgtggtttgcaggctgtgatttcgtattctatcctgtaccagctacctaccatggttttgagaagtgcccaaatttaattcttgccgacagactttctggtctctaggttgttttgcattggaagattattatggtaaatgagtctcctgaacattgcaggatatcttaccattgttagaactcatccctacgctattaatttgtgcgctgtttatttgaattaaccatctgcttatatctaagggaaatagcaggaatcccctatgagttcatcccttttctaccagcaccatttctctcttgtttttaaagttattttaactagtaatatgcacgtgcttttctaccagcaccatttctctcttgtttttaaagttattttaactagtaatatgcacgtgctaacgctacgactatattgatgtcaaaagataatacatgttttgacaactaagcatagaataatgtaaaatcaacaaactttagaaaactttaatatgtggcgaggaaggtaagtacgtgttttttttctcattttgatttggagtgtttaatttatccaaattctctatagtgtttatactgagtgatcaatttatccaagttctctatagtgtttagtgtttaatttaagttccaaacgaccatgaaaccttatattacttaggtggtgtttggatccagggacttaactttagtccctgtatttagacactaatttagagtattaaaaatatagattatttacaaaactaattacataaatgaaagctaatttgtgagataaattttttaagcctaattaacccataattagagaatgtttactgtagcatcacataggctaatcatggattaattagacttaatagattcgtctcgtgaattagtccaaaattatggatgggttttattaataatctatgtttaatatttataattaatatccaaacatctgatgtgatagggacttaaaagttttagtcccatctgaacagggtcttaggccgtgttcttcccccttctttctcaactcacttctctcgtttttcgtgcgcacgcttcccaagctattaaacgattagttttttcaaaaatttactatacgaaagttgtttaaaaaaagtcatattaatccattttcgaaaaaggctaatacttaattaatcaagcgctaacgaatcattctgttttgcaggttggagggattagttccctaacacagccttatatgacacaaatacacgctatggtttatgtctgaagacctcaaacttgtacagagagttatacatacatttgcatatatatacaattcgaaagtgaatgct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0552600, RefSeq:Os02g0552600