Os02g0554400

From RiceWiki
Revision as of 02:34, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0554400| Description = Hypothetical protein| Version = NM_001053653.2 GI:297599412 GeneID:4329651| Length = 8074 bp| Definition = Oryza sa...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os02g0554400

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001053653.2 GI:297599412 GeneID:4329651

Length

8074 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0554400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:21796021..21804094

Sequence Coding Region

21796021..21796296,21796412..21796726,21800562..21801269,21801830..21802077,21802226..21802367
,21802501..21802569,21803966..21804094

Expression

GEO Profiles:Os02g0554400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:21796021..21804094 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:21796021..21804094 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggctgcaagaggaaccaagaggaaatttgaggccgctgaacctctgatctgctcctccccttcttcggcgtcgcccatcgacgtcggtaagctgggagaggagtccgtggagctggaattgagcgaagattcgaccaaatcttacctcttcgacgctgcatccggagccactgcacaagacgatgtggagcttgtcactcgtgcactctcctccgtagctgcgaagtcccccgaagccgtccggcagttcatccgccgcctcaccccggagaagatggccggcggaggtcacactcactggactgaggacgaactccatgcgttcttggaaagctgcatggaggaaatagaagctcgcaacatcacttcgtcatgccccaagactcaggggtatgccaacttgcaggccaagatgctgtccaaggcagggaagcatgtcagcaagcagcaagtgaagaacttctggggtgcttgtcgccgccgtttccagacctggacatggttggaatcgatggctacagggctgggaacaaacccgtacaccggcagcattgacgcctccccagagtggtgggaagcaatggaagggatgagaaaatgtgctaggtctttcaggaatgcacctctcagattcattgctgagcaccatgctgtcttcagggggaggtgtgttgtcggcaaccgttcaagtgtcccaggcactgaactggaacagcagttgcagccagccaacgcagaactcctcgatgttgaggaccttgtcgacgtgccagatgcgccacagtcacctgatccaccatcacggtcaaggccaaccaggggtaggggcaaaagggtggcaacaccggctagtgggtctaggggttccaaaaggacccgcagtgactccaccggtgaggctttgcataggctcgctgatctgagggttaagtctagtgagagtaaggcacaaaagcagcgagaacgtgaggctatgagtgctcgtgcatgcattgagttggtcaagtctgatgggcacttatttagctcagatgtttaccacatgggggttttgctctttagtgacccatacttttgcgagttcttcctaggtgatgccattaccccggagatgcgtgagtactacattaggttccactatgccatgaagtttcctaatggtggaggatttttccctccaccatcttgctcagggggttggtttccacctggtggtacacggtttgatgggggtgatggggggaccctggggatgatggtgctgggggagccgacggagctgcagtgtgttgagtggatgagcaccacctcagggaacacttcagggtctaaagatggatacacaagcgaggaggatgaaacaattatggagttgttggctgatgcttttcaaaggaatgtaagcacacgagcaccaagacgggtacctcagcagtcgggcatgcaatgggttatggaaacaatgaacaacccagagcagtgccataacatgtttcggatgagagcggaccagattcacgctctctacaatctccttgtgagcagggtgttgaatgctgtcaatgagatggcagccgacatcatcaaacaagttgatccaaacaacttcccgcagcattaccggcttgcccaagatgatgcattccttccctttgctggtgttgtaggagcaatagatgggacgcactacacgaccaaagagttctatcggaggcagttcgccgctatccatttgcttttccacggttgccatgggggtggatctggcaatggagctagagctgatgttgctaggaagatgaaggaggttgatcatctattggcaaaattagaaaatgagggagtggagataaatggcaagatagctagtattattgaagattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAARGTKRKFEAAEPLICSSPSSASPIDVGKLGEESVELELSED STKSYLFDAASGATAQDDVELVTRALSSVAAKSPEAVRQFIRRLTPEKMAGGGHTHWT EDELHAFLESCMEEIEARNITSSCPKTQGYANLQAKMLSKAGKHVSKQQVKNFWGACR RRFQTWTWLESMATGLGTNPYTGSIDASPEWWEAMEGMRKCARSFRNAPLRFIAEHHA VFRGRCVVGNRSSVPGTELEQQLQPANAELLDVEDLVDVPDAPQSPDPPSRSRPTRGR GKRVATPASGSRGSKRTRSDSTGEALHRLADLRVKSSESKAQKQREREAMSARACIEL VKSDGHLFSSDVYHMGVLLFSDPYFCEFFLGDAITPEMREYYIRFHYAMKFPNGGGFF PPPSCSGGWFPPGGTRFDGGDGGTLGMMVLGEPTELQCVEWMSTTSGNTSGSKDGYTS EEDETIMELLADAFQRNVSTRAPRRVPQQSGMQWVMETMNNPEQCHNMFRMRADQIHA LYNLLVSRVLNAVNEMAADIIKQVDPNNFPQHYRLAQDDAFLPFAGVVGAIDGTHYTT KEFYRRQFAAIHLLFHGCHGGGSGNGARADVARKMKEVDHLLAKLENEGVEINGKIAS IIED</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..276#392..706#4542..5249#5810..6057#6206..6347#6481..6549#7946..8074#atggctgcaagaggaaccaagaggaaatttgaggccgctgaacctctgatctgctcctccccttcttcggcgtcgcccatcgacgtcggtaagctgggagaggagtccgtggagctggaattgagcgaagattcgaccaaatcttacctcttcgacgctgcatccggagccactgcacaagacgatgtggagcttgtcactcgtgcactctcctccgtagctgcgaagtcccccgaagccgtccggcagttcatccgccgcctcaccccggagaaggttgcacgctcgctggactaggacctcctcgaatcggacaaactaagaaaggtaataccttgctctatttgtgtttcctcatgattattttggtatgctcaatttgtgtgcttagatggccggcggaggtcacactcactggactgaggacgaactccatgcgttcttggaaagctgcatggaggaaatagaagctcgcaacatcacttcgtcatgccccaagactcaggggtatgccaacttgcaggccaagatgctgtccaaggcagggaagcatgtcagcaagcagcaagtgaagaacttctggggtgcttgtcgccgccgtttccagacctggacatggttggaatcgatggctacagggctgggaacaaacccgtacaccggcagcattgacgcctccccagagtggtgggaagcaatggaaggggttagtcctccctttctcttcctttttgctttaccgaaaccatgtgttcagacttagtttcagaacaaatagtgctgcaaatgttaacttagtttgacatgtaaatatttagatcttagtattacatgcacatggcaacttagttttgaaacttgctttgagatgcaaatgttcagattttagcattagatgcacatgccaacttagttttagatgcaaatgttcaaacctagtattatgtacatggcaacttagttttgcaagttacatagtcacatagatattttaaatagctgtattcaatatttcagatgtaagcttgtcaatttgttaagttagcaagtgtgctgtacaaatgtgcctttttccaatgagaagtacacatggagattgcaatgataagtacacaaacatgtcagttgtcaagtgtattacatccatttaattggtaacctcacaatgtgttagaatcattgcaaaagggattatttcttatttaccattttttagctgggtcatcatgttgataagtacaaatggtgatgtggacatcactacctcggatacatacaacaatcctccaacggtcattcaaaaaccgatatcaagagctcgtgcgcgacaattaaatttagaggtgagctcgttcctatgttcttctttgtatgaattcaagaatagattgctaccgaatgattatattgtgattagtaacaatggaggggacaaggagacacttggagaaagacttagagccatggaggattatcgaggtgttcacagtgaaatttggtaagcctggagtagtcatcggcttagagtcagcatcggcttcgaagtcctgagattagccgatgagagttgtcaagtcgtcagttgtcggattcttgctatattcggttaaggaaattgatctactaaaggaagcttatccagaagagaccgagttcaaagagaatgcggcatgacaagttatctattaattaggaatagtttgttagttttcttttatctttaggaaagtgtgtttagtgtcctataaggactttatcttttccttttatctttaggaaagtttctttcttgtccgacaaggacttgtatcaacccataggtataaatatgtacactcggggtctatgtaatctatcttcacgatcaatacaattcggcgcatcgccaccttttaccttttctactttattttatcgtccgaagggacttggcacctgatgcggggctgcatcggtgttcgatctctggctaaggggtaagtccaatgttccgtcggcccaggtaattatatcgtttacgtcggtgtcgttcaaggctgcatcagtacattcgacctcttggattgctctggtttggatgatatatttgcctacctatttatcatatgtctttgttaatctagtcttagcatatcaatttagctctatcggctgcttctcgttttagggtttctgccggtatcggttaaatcacattgctagattagattagcttagacatctaccaccctgaaaactcagtcaacggcttgattgtctagatattatgtttcttttcatacttagtgctgcatcagttaagtttgatctactaagtcgtgcttagaaccataatctctagcctgcttcttgattgccaataagggtttcatcggggttttagccggtgagttatctggacgttgcatcggctcataaggattgcatatacatataagttggatttagccgatgacaacaaaggtttcactgtttaatctaatcttgtggatttcatgacatcggacctccagccgatgtgtgctttaaccttcggatcgatacttatttatcatatcattgctagccgattggtttatactggattatattgttattttattatatcatcatcggcagattgccaatatatcattatccacattggacatatagccaattgcttaatccctatcgctatcggctggtatcggcatcggctattatcggctatcggctggaactactccatcggcttgtcagccgatcggctattttgatctactatttgcatatcttgtcagttgcaggatcaaactaactggcacgctcgcatctcatcaatctttggacatgcacaggagttaagcagatctcccaggccggtgtgttcgattttttcgtcaacacgaggacgtccaagtcaaggtggaggcccaaaccaatttgacctcgggtgcaattcggagtccaggaccagtctgcactaaaacaggcgcccaggtcgcatacgtgctcgcattggggcgttctttatatggatggaaagctaagaagataacatttccaatggttctggtcccacgcccaaattctttccgagtcaatgggaatcgaccgaacaagttgacgtccagaatctgtcccggtgctgcgtcaccgtatttgggcctttgggccatgtatcgtgttggaacccattagggttgtatcgagagggggttgcacgaccctaaactctatatatcagtaccgccgccatctttaggtttttgggttttgcttagattattctgtcgagagcagtttcgctgttagatcggtttgtaagaccccaactcgtgagcttaatcattcatatgcaattttggttgttttctatctcgttcttgtttgtgttcttcgattggcaaacagggattagccttctcggtgaggtcatccgcgtttcgacaagggtgataaccagaggagatgtggtgctgcgattgcggggctcaagagcgtgcgcgttcaagaagccggatcgatttgtgtcgcgactccacccaaatcgttgtttatcagaacctttcggaagatcaggaaccctagtgcacatcaaatggattcacatatgcatgcttgggattctgtcaggacataatttgtagtgagcaattatattgttaagaacttagacatccctttgatgatacctttggtaatttataaaatgaaagatgatatagtagtaccaactagagtacaagtgttgttaacaacattccaaaagttgctaatatatttcaatagtacatacctctactttcatctcattaactgaacaccaccttcacttctcactgcatgtataatgttaagtaccaccttagtgaaataaaacaatggctgtaacaactacatttgcttaccaccaaaaaaattgattgttatacccaaatactcagttatattgtccttgctgattttacaatactttgcgctaagcaatatttggtcaaatctgtaatatgcatatgcacactttgatgttttaaatactctgaaagcattttccatattaatttggcagctaaatggactttgcagtagttatattcagtgttgtgaatgtatgacatgtggtataatttagtgaatcatatgagacttgttcacagctgtggtgagtgcttgtggagtagtactactgcctggataacacatgacatttgcatatttacatgaagctgaagcaaattgaaattaatacttccctgctgatgttgttttattaatattgcaatagcaatcgtaattatctgaaaatgtcggcttgttatttaacttaccacttgataataattgcaaccacttgataagctatgttgttgctaatattatgggcagttaggttgcagccattccatgtgtgcttgctgtgtgcatcgtactgtactttatgcaatacatatatgcctgtgtgcttgtagtttggtagcttctgtactttatgcaatacatatatgcatgtgtacttcttgttcactctagtttgtttctcttttgctgaaatgcagatgagaaaatgtgctaggtctttcaggaatgcacctctcagattcattgctgagcaccatgctgtcttcagggggaggtgtgttgtcggcaaccgttcaagtgtcccaggcactgaactggaacagcagttgcagccagccaacgcagaactcctcgatgttgaggaccttgtcgacgtgccagatgcgccacagtcacctgatccaccatcacggtcaaggccaaccaggggtaggggcaaaagggtggcaacaccggctagtgggtctaggggttccaaaaggacccgcagtgactccaccggtgaggctttgcataggctcgctgatctgagggttaagtctagtgagagtaaggcacaaaagcagcgagaacgtgaggctatgagtgctcgtgcatgcattgagttggtcaagtctgatgggcacttatttagctcagatgtttaccacatgggggttttgctctttagtgacccatacttttgcgagttcttcctaggtgatgccattaccccggagatgcgtgagtactacattaggttccactatgccatgaagtttcctaatggtggaggatttttccctccaccatcttgctcagggggttggtttccacctggtggtacacggtttgatgggggtgatggggggaccctggggatgatggtgctgggggagccgacggagctgcagtgtgttgagtgggtatggtgcttctgctagtgctattgtgtgctgttgtgtgctagctgtgtgttatggccgtgctgtgtgtgcctctgtgagttgctactgagtgactgctgctaagttttgctgctgctggtgcgactgaagctgaagttggttgctctgcctttttattccatcgttatgttagtgaaataatgtgttcgatttttaaatcgaacatagttatgttatatgcaggttgatttgtattgatgtaagaacaattcggcacacgttgcgtattaatctaagttggttgttctaatggaataatttattttacactcactgctaatgtgcaatattttttgttaagttataaacttgtgtttcatttattgtacagtcactgcacctctcagattattatctaacttttattttcatattgtgcattttttgttcctttcacatacactaacgacaacattatctcagtttgcacttgtattacactgtttatgttatgaacatcagagatatgattttttttgtacatgctacaacaactttccatttcatgacctaccaagatgagcaccacctcagggaacacttcagggtctaaagatggatacacaagcgaggaggatgaaacaattatggagttgttggctgatgcttttcaaaggaatgtaagcacacgagcaccaagacgggtacctcagcagtcgggcatgcaatgggttatggaaacaatgaacaacccagagcagtgccataacatgtttcggatgagagcggaccagattcacgctctctacaatctccttgtgagcaggtaggtaccacttgcatggtacctatgaggtatgtcctatggaagcaattggaatgtttttgtacgccatggcaggtggtcattccgtgaggagcgtcaacaataggatggttcgttgcaacgctactatgaatagatattttcacagggtgttgaatgctgtcaatgagatggcagccgacatcatcaaacaagttgatccaaacaacttcccgcagcattaccggcttgcccaagatgatgcattccttccctttgctggtgttgtaggagcaatagatgggacgcacgtaccgcttcttgtgcgtagagataattcaattccacataggaaccgccacaatgaaacttctagaaatgtgctaaccatcattggttgggacgaacgagttatgtttgtagatgttggttggcctggttcagtacacgaccaaagagttctatcggaggcagttcgccgctatccatttgcttttccacggttgccatggggttagtacagtgatctaactaagcttgtgttatagttttcataattacaaattttcatttgtgtcgactagtaacacttccaattatttatatttcagggaaatatctgcttgttgactctggctatcccagtaggtacggtttcctaccaccgtaaacaaatgttagataccatgttgatgatttcgaaggcaacgaagctccaccaccggttggaaaggaagagactttcaactacatgcactctgccatgcgtaatacagttgaaagagattttggggtgatcaagagtcagtggagagtcctgcggggaattcctttatatggagaggaagctgctcagacgaagattatagttgctacttttgctctccacaactttatgactgatagtaatgacccccacttcatgacacagaaccctttgtacaacgggtacccccgtgtgccacaggcgccacccctccgcagttggtacgactccccccaacagcgaggaagctatgtcgacttatcgtgagactattgcgaatcagatgtaccacgggtagaagtgtatgttcaatatttattttaacatccattttcgaaatggatatgtatcctactatttatgtctccttccttccatcgaaaactatttatgtatcggacgcatttatgtgcaatatttgtttcactttaattgttgtgctttgtcagcagaaaaaaaaaactcaaatttcgccaggccgttagctaatcctaatctgcagcattaatttctaagtgcaatgcgcgtgtgcttctagctttaattttcttttccccaccgttatctcctccatacgtgacgccgtgcctgcgacagccatccatcaggtccaacagtcgccgtccctcagctccaacggcaaccgtcatcagccgctattcaatttttcaaagtgtgcagctgctgcaagccctgacatgcggctgcagtaatttagattatttctgatactccacgcaacactttggaatgcagcctaattccatgatatatgggcgtttgatttacttggggcgaagaagagtattctatcctcattttattttttttcccttagtgaccttttgtgtttctcgaaatataattttgccactactttgtagcttatataacaatgatttttctatattgtactgttattaaagcatatccaaaaacaagtatagtaaatataaatttcatacagtcagacatactggtggtcaaacttttgtaagtttggtcgtataatttctcaaaggactacctttagctaattgcagccatgctctctcattagcatccactaacatgcatgaatagctgttttaattagcttatgcattaccattccaactatatttctctaattaatcctagcagggtggatctggcaatggagctagagctgatgttgctaggaagatgaaggaggttgatcatctattggcaaaattagaaaatgagggagtggagataaatggcaagatagctagtattattgaagattag</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0554400, RefSeq:Os02g0554400