Os02g0621100
| Gene Name |
Os02g0621100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Su(VAR)3-9-related protein 4 |
| Version |
NM_001053993.1 GI:115447356 GeneID:4330010 |
| Length |
9211 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0621100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:25565935..25575145 |
| Sequence Coding Region |
25568719..25568765,25569551..25569746,25569900..25570284,25571800..25572896,25573089..25573354 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:25565935..25575145 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:25565935..25575145 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccaaacccaatggcaaagagaaaacgggtgacacgggattgtcgatggctcctccaaagatttccaaggatagatttgatgctgctatcagagccatggctgatattggtatcctaaaggaaactgctgcgcccgtgttgaataatctactaaacttattcgattacaactgggtgcatatagaagctgataattatctggctcttgctgatgctatattttgtgattcagatcccaaagaaggacagaaaaggcaagctaatgagacaaatcttgatgcagaccaatctaacaagaagcttaagacaaaaaagcgttctcaaaatcctacatccaagatgcatggcaatgacaatagagagtttgttgaagctccaccacagcagggacgaggcacactgtctgcccgaactgttaatgggaagaaagtcaccagggcccacttggagttgccttcttcacaattactgatcaaggaaccacatacatgccctagcattgcaaagaatacaacaattgttgaaaataattctgctgtattatgccatggtcaagaccttcaaacttttgaggtcccagtagcaactacttgtccgcaagttgtagcccccagtactcgcaaagatgcacgtaggacttctggtgctcgccatgatcagaagcatgaaggtgtatctggtgcgcatgaaaggaacagggctgttgcgtgtagcaaccaggaaattgtaagcagcaaggattctccatccaacattgaggtagttttgtcaaattatggagctgggaaactatcattcacatacaactcttccctggcaaaccgttctgattttcatctgcctgacattaaattaatttgcaagaaaatggaggctagatgccttaggaaatacaagagcctagaacccaatttctcttttaagaatcttattaaagatacttgccagtgtattgttgaatctagtggacctagacatgaaggcatcatacaaactgttcctgccctggacattctgtccaaaccttcagtgccgcaaatattgcagtcaaatcaagctaattccgcttttatgccacctaataatgtcatgagccttggtggtacttcttcctcttgcactgttgctggagttagccagaattctagtaatatgccggttgttccgcatcaactacatattggtgccaacagaccacctcatgatgtcaatgatatcacaaaaggtgaagaacgtttaaggattccaattattaatgaatatggcaatgggattcttcctcctccatttcactacataccacacaatatcacactccaagaagcctatgtaaacatctcccttgctagaatcggagatgacaattgctgttctgattgtttcagagattgtctggcacaatcacttccttgtgcgtgtgctgcagaaacaggaggagagtttgcttatacaacagatggccttcttaagggagcatttctagatagctgtatctcaatgattcgagaaccacttaaacatccccatttctactgcaagatttgcccaaacgaacgaatgaagatagaagtaaattctgattcatcaaacacagaaatgaatcctggtccttgtaaaggacaccttacaaggaaattcatcaaggagtgctggagaaaatgcggctgcactagaaattgtggaaaccgtgtggtgcagcgaggcatcacacgccatttacaggtgttcttaacccctgaaaaaaaaggatggggattgcgcagtactgagaaacttcctcgaggtgcttttgtttgtgagtatgttggtgaaatattaacgaacattgagttgtatgaccgtacaattcaaaagactggtaaagcaaagcacacatacccattgttacttgatgccgactggggtactgaaggtgttcttaaggatgaggaagccctttgtctagatgccacgttttatggtaacgtcgcaagatttataaaccacaggtgctttgatgctaatattataggaatacctgttgagatcgagacgcccgaccaccattattaccatctggcgttcttcacaacaaggataatagagccttttgaggaactcacatgggactatgggattgattttgatgatgtcgaccatcctgtgaaggcattcaaatgtcattgcggaagtgagttttgccgagacaaaacgcgcagatctaaatcgagggcgcgggtttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAKPNGKEKTGDTGLSMAPPKISKDRFDAAIRAMADIGILKETA APVLNNLLNLFDYNWVHIEADNYLALADAIFCDSDPKEGQKRQANETNLDADQSNKKL KTKKRSQNPTSKMHGNDNREFVEAPPQQGRGTLSARTVNGKKVTRAHLELPSSQLLIK EPHTCPSIAKNTTIVENNSAVLCHGQDLQTFEVPVATTCPQVVAPSTRKDARRTSGAR HDQKHEGVSGAHERNRAVACSNQEIVSSKDSPSNIEVVLSNYGAGKLSFTYNSSLANR SDFHLPDIKLICKKMEARCLRKYKSLEPNFSFKNLIKDTCQCIVESSGPRHEGIIQTV PALDILSKPSVPQILQSNQANSAFMPPNNVMSLGGTSSSCTVAGVSQNSSNMPVVPHQ LHIGANRPPHDVNDITKGEERLRIPIINEYGNGILPPPFHYIPHNITLQEAYVNISLA RIGDDNCCSDCFRDCLAQSLPCACAAETGGEFAYTTDGLLKGAFLDSCISMIREPLKH PHFYCKICPNERMKIEVNSDSSNTEMNPGPCKGHLTRKFIKECWRKCGCTRNCGNRVV QRGITRHLQVFLTPEKKGWGLRSTEKLPRGAFVCEYVGEILTNIELYDRTIQKTGKAK HTYPLLLDADWGTEGVLKDEEALCLDATFYGNVARFINHRCFDANIIGIPVEIETPDH HYYHLAFFTTRIIEPFEELTWDYGIDFDDVDHPVKAFKCHCGSEFCRDKTRRSKSRAR V</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2785..2831#3617..3812#3966..4350#5866..6962#7155..7420#8099..8165#8256..8306#8567..8657#8854..8879#gcaggtggcgcctctaattcctcctcctcgcgccctagtcccctcgccttcccctcccgtctcctcgcccgccggccgccgcctgcgacgatccccatcccgcgagcggcagcggtgccggcggtcctctgccgcaccctcgccgcggtgagctcccgtacgcgcacatcctcatcctcctcatccctctctatacgcacctctttctctgaagcaaattggggttttggccgggtgggacatgcaccatgcaccacgttaggtccgcccctgttgtgatgcggggtgagggctcctcgtatgagggtttttcttcggcctatttctgcgaagtttcgatgtcctcccgcgttgcttgggtgtgcgaatgtgatcgctccgaggttgaggagctttgctcgtattgtattttgggtgcctgttcagtcgctttgagttgctcgtttgttgctctgatcacaataaggctgcttctcctgcttagttttcttgtgtgaaaatttgtgagatctgggcgtgcctttggcactattgcccccaaatccaccattgtgccgacttgtgagcttcctgttcgggagttggaggcgttctatgtgaagaattagatgcatgcaacattgagtacttgttcaaaaggtcataatatatcagaatgcagccttgggtatttgttcaaaaggctagattctatatacttcctccgtcagaaaatatagctacttctccacttactccctcatctcaaccatccctcatttaatttctgcatctactttcccatctcaaccaatcacaaccatccctaatgtaatttaacccctcttcttaatgtccgggaaaaactccaaaagtgttttttttttggaatacacgaggagcgtatctttgtattaagaaggaataaatgtatgtataaagcgggccaaaaagacaaaacgaaggggacagggtacaggaggagaacaaaaaactaaaagcctaatctccaactaaatttttgcgacccttctccactaacatgggctaccaaaacagggattgcagctcttgctagccgccacagctccgcttcacccgtcataacccttgcaacctccacccaagttctgctcttctggttgaagactcgattgtttctttccttccagatcgtccatgcaaccaatgttgcgatggtgtcgaaaccccggcgatgttccttgaccatcttcttatgacagtcacacaaccatgaaaagaaagagtgttaatgagcggtaagcactccgaatgcccgatagctttgaatgcaacccaccatagttgccgcgattccgggcattcgaccaagagatgatcaatcgtctcttcgcattgatcacaaagaacacatcgatccgggtgtgacaaaccacgactcgggaggcggtccgctatccagcaacggttaagggtgaccaaccaaaggaagtagcgacagcgagggggcgcctgtttatattttttttgacagagggagtattatataagttagtgaaggttaaatggagccaacatatttgctctcaaggcctagaaattaccatgttaatgaggtaaaaaaagagaaagatatatgccactagtcatggttggtctagattatagctatgtagattgaaaatagaagaaagaatatatatatatatatatatatataataaattatatattcaaataagctttaatggagttgcgcatagtttgggtgggaaatttgaccagatatcaaatgttttattaaagaaaatgattgcatgggaaatattgaaatatatttccataggtttgtagctacgattttcccactttttttttgctgaagcctttttaagcaactgtttggattaactcagtcaaatgcagcaggatataatatagctagggcagaaatggcattcttatgtttcagaaccacaatagacttggtgatgtgagtgatctagataggactgcgacttccttccatgacaattgcaatgggatatttgtagtatcaaatgggtggattcacccatgtaaagttttagactggatttcaaaaccaatattcaataccgatcggatagtactgcaatttcctgcgtttgttagtcacaaagttcccgggtcgacgggattgaggaacggggtcgagaaacgtggtatgctacttgtgagaggtttttacaaggtgggcacgaaaatgaccccgcgttcccttaacggggatggcgttcccgggtctaggattcgctgccactgaccccgtttccagtgactaatatgatctgaaattgattttactttgtttgtattcaatatgttaattaagaagggaatttatatcttttttgaggaaatcctatcctctacaaaccagatttatatgtttttgaacttgttcgtccattgtgaacaaggtaaaccacttgcccatattattagtcttatcaactcgacactatggcttacattataactatatttagtaaatgatcattatacacctatttatggactactgcaattcaaaaagagattattactactgtagcttgaacagttctctgaacagaaagtactgttcaaataacctaaaagtgccaatttctgacacagttttatagcatgatttccttatgatgtttgtttttgctactgcattctgatggcagagaaacatgaacaattgagctaaaggttatatgtattctgcttctgttcacggacactattgtatttgcagggtcagcagtttccacatctcagctaaggactggaatggccaaacccaatggcaaagagaaaacgggtgacacgggattgtcgtaagagttattcttttactcagcattttttaatacaattgtttttatgggcatccgatgatattatccgattccaaactctatctcactcagcaaaaaaaaaataattcacgaatatatgacatgtcttgcacactcagaattcttatactaaaccatagacacatcttacagaacattactgcctcatgtaacactgaacaaggtatacatttctgaatgctgctcaagttgtctaactttgcatgcacatggagagataataatgcagattggatgtcagctgctcaagtagtatgaattactcattttctgtttttcctgttgttgcactgctgtgtcatgaaaactagtcacttcccctggcatatataaccattctggttatagtgctatttgttaagtttattcctcaaaatatttaattttttcctataatcaagtagatggtatgtggcaattatccggtgagtaatctatttcaaatgctgactgaaagaataatattaacatgcacaatagattgaaaattcagcaataagcacagcccttctccaaggataaataagttagcttgtacctggagtactcttgtggttggtcctgtagcctagtgtgcttagtccacaacttctcgtaatgtatcacaatcttaacttcattgtacattcgtaagatgtttgtgataccatgcttagtatgtgtatatggtttttcttatcacttgctttctcaaaggatatcacgtgttaatgtgccatgctgatttgttccactgcaagcaggatggctcctccaaagatttccaaggatagatttgatgctgctatcagagccatggctgatattggtatcctaaaggaaactgctgcgcccgtgttgaataatctactaaacttattcgattacaactgggtgcatatagaagctgataattatctggctcttgctgatgctatattttgtgattcagatcccaaagtataatctttttgctttgttctggcatattattaaatatttggttctttaagtcagtagtgtagttttattctttattatgtgagcaccatatatcttattatttcattaatctgccattttgatttgattcaagttttggtgatgtaccaggaaggacagaaaaggcaagctaatgagacaaatcttgatgcagaccaatctaacaagaagcttaagacaaaaaagcgttctcaaaatcctacatccaagatgcatggcaatgacaatagagagtttgttgaagctccaccacagcagggacgaggcacactgtctgcccgaactgttaatgggaagaaagtcaccagggcccacttggagttgccttcttcacaattactgatcaaggaaccacatacatgccctagcattgcaaagaatacaacaattgttgaaaataattctgctgtattatgccatggtcaagaccttcaaacttttgaggtcccagtagcaactacttgtccgcaagttgtagcccccagtactcgcaaaggtaatatctttgtaggcgacatagtgttaataatttatatgaaaatgctaaccttttaatgctttgttgatggattcccacaaattaatctagttttattgtataaactaaaacatacaggtcgcccagcctattaatgttgtctacctgagtgtgctaatctaaatattcttctctccactctatccgttccaaaacatcttttgggcgtggtgcggtaacaacattttgaaatttgacaaatgtatctaaatcagctgcataaaagcaatattagtgtgtccatcatcaatttactttcataatgctgttaattcatagaccatccaaaattaatgactacttattgttgggaattcatggagtaagtttaattgttgggttgtattgttgtcaacttcagtgctattttatcaatttgttaacattatgttaatatagtcttggtctgttaatcagcttcctacctacacatcactgtagcgttttttttttaaaaaaaagatgaattacttatggtttagagttgaaaggaatactttatataaattccagttaatggggtgttgaggctttgagagcaagcgtgtattgtaaagcattttgctagacatgagtgcattattatttaaagagaattttttactactactttcacaataagaatcatgatcctcaaacttggatttgaaaaagacccgttatttaagtaatatttctgtgggattttgtggtcactccttttgaactagggttgtcaatatatccaaaagtaaaactaatattgatattcagatggcctccttcggccttcccggcgaaaaaaactaatattgatataatgttgttgccaatatattgcgatcagagaagttgtgaaaatcttgcattgtgactattaacttaaagaccatttatatttggccagagattatttcgaattgtgttgtcaattttggtcaaagagtggacgtatacctctataatggtatatatatagagagagagtaagttcacatagttatctgaaattgttgcttagaagtgtgatttttatagttttgtgaaaggtagtgttgtttttgtggaatttattcacatatcgtatacactttttgcaaaaagaaaaaaaaacatgtggctgttttttggatatatagaattttatgtgtggatgtctgagggattatgatcttatgtctgttattttgggggatggggcagggaggtctagagctctggatgttgatatctcctggcaaagaattggtctagaatttgatctctaataactgtacaaatgtcagtcctttaaatccctgttctactctgttgcgagcatgcttgtctagtgatactgaacaatattggagtattctagagatgtcctttgcttcctgcagaaagtgtcattgttgttgctgtcatgtttatattctttttttggcttgttgctagctctttacttcatttctaatcaagtcttttggattttctatttttcacgttatgaagatgcacgtaggacttctggtgctcgccatgatcagaagcatgaaggtgtatctggtgcgcatgaaaggaacagggctgttgcgtgtagcaaccaggaaattgtaagcagcaaggattctccatccaacattgaggtagttttgtcaaattatggagctgggaaactatcattcacatacaactcttccctggcaaaccgttctgattttcatctgcctgacattaaattaatttgcaagaaaatggaggctagatgccttaggaaatacaagagcctagaacccaatttctcttttaagaatcttattaaagatacttgccagtgtattgttgaatctagtggacctagacatgaaggcatcatacaaactgttcctgccctggacattctgtccaaaccttcagtgccgcaaatattgcagtcaaatcaagctaattccgcttttatgccacctaataatgtcatgagccttggtggtacttcttcctcttgcactgttgctggagttagccagaattctagtaatatgccggttgttccgcatcaactacatattggtgccaacagaccacctcatgatgtcaatgatatcacaaaaggtgaagaacgtttaaggattccaattattaatgaatatggcaatgggattcttcctcctccatttcactacataccacacaatatcacactccaagaagcctatgtaaacatctcccttgctagaatcggagatgacaattgctgttctgattgtttcagagattgtctggcacaatcacttccttgtgcgtgtgctgcagaaacaggaggagagtttgcttatacaacagatggccttcttaagggagcatttctagatagctgtatctcaatgattcgagaaccacttaaacatccccatttctactgcaagatttgcccaaacgaacgaatgaagatagaagtaaattctgattcatcaaacacagaaatgaatcctggtccttgtaaaggacaccttacaaggaaattcatcaaggagtgctggagaaaatgcggctgcactagaaattgtggaaaccgtgtggtgcagcgaggcatcacacgccatttacaggtaagtaataatatcaaagtttttgctagcttgacgataatttgtcaactgccaaatattgttgaaattatgatgttagctgcagcagtttgttgtgatagtgcatcatgtgtatgatcatgtgcttgtcacagtaaacatctcattgcttacgtgttttaataatttttcttgttctttctaaaatttcaggtgttcttaacccctgaaaaaaaaggatggggattgcgcagtactgagaaacttcctcgaggtgcttttgtttgtgagtatgttggtgaaatattaacgaacattgagttgtatgaccgtacaattcaaaagactggtaaagcaaagcacacatacccattgttacttgatgccgactggggtactgaaggtgttcttaaggatgaggaagccctttgtctagatgccacgttttatggtaacgtcgcaagatttataaaccacaggtatccatttattatttataataatggattctttttttaccagaacgtctaatgattgttatggagtcctctgtaatacatgaagctgttgcttctatgggatgggtaaaaaaagggatgagctggttcttgtcgctttctggttttcccagtgagaacctggtgatgtacattttctgactgttctgcgatttagtgagttctccatgatatgtgtgcttcaagttgaaagtgtaggaaatttcattgaaaattgacaattggtgtgactggtaaatggctaccagtggggtcccaactaaaacctcatggaccatagcgtttaaccctggttctgtgaactaacttaatatgtgcttttcagttgtcattatatgatatttctcgttacaaaactgtgaacaacatcgtagatttgtgattgtttggctgcacctatattattgcctgatgtcgtagattagtgattgtttggctgcaacctatattattgcctgatgtcagcacttaatcaagatagttaagtcaatgttactcttatttgaagctagctaacagaacaaagtcttatccaaattttgaatatataagtatttcttaaaaaaatgttgcttctgtgctctgctgaatctaacacttcttccttcttgacctggcatatcattgtacggttttcaggtgctttgatgctaatattataggaatacctgttgagatcgagacgcccgaccaccattattaccatgtattttttcaactttagcttgtaactgatatatattagtccaagttaaaccatattgagcttattctgtgtcttccattttttggttagctggcgttcttcacaacaaggataatagagccttttgaggaactcacatgggtaggttgtactccacaatttaaatttaagctccatttcatgtggactataaccattttcagacattctagttgaatttgctttcatcttatgttttgggctttttgaccttttggtggccaccttgtgacttgatactcattagtgcttttcccatagatagtatcccccctttgtttggttgaatcatgtagcatatggagcactacctgttgtaagtcatttttcgaagtttgccatgatcttgtgtttacctgcaggactatgggattgattttgatgatgtcgaccatcctgtgaaggcattcaaatgtcattgcggaagtgagttttgccgagacaaaacgcgcagtaagttcctgatggcatctatatgtgcatttaggaagttgaggttctcccctaaaatatggctttattaatgctgattctgtgaggcatttaccttgtgtctccatatgtatagatgagtggttctatgctgctgcactcgtctggttcatcaatgaaattgcattagctgacaaaagtttatatactgccacaggatctaaatcgagggcgcgggtttaacctatgaattctctactctgctattcaagtgattcaaggaagtcaatgcagagccattgatggtatcgtccagaaagatgatatagtaatttttctctggaataggataaacaatccagattccagagttacagactgctggttcagcacttaaatattccaacagctcatacgaactgctgtcctttttttccaagcttggttgcccgcaaagcagtatgcttggttgcccgttctttgttccttttaccaataccaagtgatgtaaagaattctggaatgtgaactctctgccatgatatagctctagctcaatgcattatattggggaa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
