Os03g0119500

From RiceWiki
Revision as of 12:16, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0119500| Description = Similar to Callose synthase 1 catalytic subunit| Version = NM_001055314.1 GI:115450356 GeneID:4331423| Length = 8262...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0119500

Description

Similar to Callose synthase 1 catalytic subunit

Version

NM_001055314.1 GI:115450356 GeneID:4331423

Length

8262 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0119500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:1045702..1053963

Sequence Coding Region

1045703..1045726,1046171..1046286,1046378..1046461,1046546..1046658,1047209..1047261
,1048124..1048300,1049670..1049717,1050310..1050468,1050866..1050979
,1051065..1051153,1051229..1051387,1051474..1051576,1052116..1052235
,1052496..1052546,1052637..1052819,1053473..1053709

Expression

GEO Profiles:Os03g0119500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:1045702..1053963 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:1045702..1053963 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gtgcaaaccattgatatgaatcaggataactattttgaggaggcactcaaaatgagaaacctgcttgaggaattctatcagaatcatggcaagcacaagccttcaattcttggtgttagagaacacgtgttcacgggaagtgtttcttcgctggcctcgtttatgtccaatcaggaaactagttttgtcacattgggacagcgtgttctggccaatccactgaaagtaagaatgcattatggccatccagatgtttttgatagaatttttcatataacgaggggtggaataagtaaggcctcccgtgtcatcaatatcagtgaggatatttatgcagggttcaactcaactctgcgcttagggaacataactcatcatgaatatattcaggttggaaagggaagagacgttggtcttaatcagattgcactgttcgaaggaaaagttgctggaggaaatggtgagcaagtgctcagccgggatatatacagacttggacagctttttgactttttcaggatgttgtccttctatgtgacaactattgggttctacttctgcaccatgctaactgtttggaccgtgtacatatttctctatgggaaaacctatctggctttgtctggagttggagaatcaattcagaatagggtggatatattgcagaacacagccttgaatgcagctctgaacacacagtttcttttccagattggtgtatttactgctattcctatgattctgggtttcatcctggaatttggtgtcttgacggcttttgtcagcttcatcacgatgcagttccaactttgctctgtattttttactttctccctgggtacaaggacccactattttggccgcacaatactacatggtggtgcaaagtatagagcaaccggtaggggttttgtggtacgacatatcaaatttgctgaaaactaccgtctttattccaggagccattttgtgaaagggttggaggttgctcttttgttagtgatctttttagcgtatggttttaacaatggtggagcagttggctacattttgctttccataagtagctggtttatggcagtttcttggctttttgctccatacatattcaatccatctggatttgaatggcagaaggtcgttgaggatttcagagactggacgaattggctgttttaccgaggtggtattggggttaagggagaagaaagttgggaagcctggtgggatgaagaactggcacatattcacaatgttggtgggaggatactggaaactgtactgagtttaagatttttcatcttccagtatggagttgtttaccatatggatgcaagcgaatcaagtaaagcactattgatatattggatatcatgggctgtgcttggtggcctttttgtcctcttactggtattcggtttgaatcccaaggcgatggtgcatttccagttgttcctccgacttatcaaaagcattgcgctactgatggttttggcgggcttggttgtggcagttgtgtttacaagccttagtgtcaaagatgtgtttgctgccatcttagcatttgtgccaactggctggggagttctttcgatcgctgtggcgtggaaacctattgtgaagaaactaggtctatggaaaacagtgcgctctctagctcgcctgtacgatgctggcacaggaatgatcatttttgtcccgatagccatcttttcctggtttcctttcatatccaccttccagacccgacttctatttaaccaggctttcagcagaggtttggagatctctctcattcttgctggcaacaatccaaatgcgggagtatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>VQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFYQNHGKHKPSILGVREHVF TGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRIFHITRGGISKASR VINISEDIYAGFNSTLRLGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVAGGNGEQVLSR DIYRLGQLFDFFRMLSFYVTTIGFYFCTMLTVWTVYIFLYGKTYLALSGVGESIQNRV DILQNTALNAALNTQFLFQIGVFTAIPMILGFILEFGVLTAFVSFITMQFQLCSVFFT FSLGTRTHYFGRTILHGGAKYRATGRGFVVRHIKFAENYRLYSRSHFVKGLEVALLLV IFLAYGFNNGGAVGYILLSISSWFMAVSWLFAPYIFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLF YRGGIGVKGEESWEAWWDEELAHIHNVGGRILETVLSLRFFIFQYGVVYHMDASESSK ALLIYWISWAVLGGLFVLLLVFGLNPKAMVHFQLFLRLIKSIALLMVLAGLVVAVVFT SLSVKDVFAAILAFVPTGWGVLSIAVAWKPIVKKLGLWKTVRSLARLYDAGTGMIIFV PIAIFSWFPFISTFQTRLLFNQAFSRGLEISLILAGNNPNAGV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2..25#470..585#677..760#845..957#1508..1560#2423..2599#3969..4016#4609..4767#5165..5278#5364..5452#5528..5686#5773..5875#6415..6534#6795..6845#6936..7118#7772..8008#agtgcaaaccattgatatgaatcaggtatgctgttgtctttatattttgattattgacgagctctcgtacgaagtttggtccttatacatataggagcaaatattatgtatattatatttatttgatggaccttccttggttttccccaatatttaaataaaagcacttgctcagctcatttctttgtaatcccttactatatgtttagcctcttttattgaatggtacagatctaaggtgactcaatatatatcaatacaatgtttttcacattttttgaagtttttattatgcgcatattttttttatttctaaaaaggctatagttatgggaaaaaatgttattgaaatagctcctataccgcacctcttcttactattgccaagataccatttttgtttctgaaatagctcctgacttctttgttccatcagttttgagtttttcttttggttgtcctattgaaggataactattttgaggaggcactcaaaatgagaaacctgcttgaggaattctatcagaatcatggcaagcacaagccttcaattcttggtgttagagaacacgtgttcacgggaaggtgttgtttcactagatttttgttcagtcgttttgttgtggctttacttcagtagtcatctcagttcaaacttacaatctctcttttgtagtgtttcttcgctggcctcgtttatgtccaatcaggaaactagttttgtcacattgggacagcgtgttctggccaatccactgaagtaagtgcttttacataatatatattttctatttcatgagtcatttcaagttacatactgtcaacatttggaattcttttgcagagtaagaatgcattatggccatccagatgtttttgatagaatttttcatataacgaggggtggaataagtaaggcctcccgtgtcatcaatatcagtgaggatatttatgcaggtagggctagtggccttattattctgtctttttctcaattctggttgttgcatgtttagtctatttcaggttgcattattaataatagcccattacattctgtgaaattggcatttgctgtgtggacagcctgtgtgctagttagtagggcaaaaatgactttatacctctcttctcgctagtgaattcgatgtagtattattctaatgctcagcgtgtgtttctgtaaatgaggctatttggtaacctagagactaaaaaatgagtataagctgcttgcgcattgtaaactatcatatttttacctgtagttctctgtgttgttaatgctgtgcatattcttatattgttttagttgtagggggtctctctctcaggttctgtcaatgcatatttttgtttggttataaccatatcactttgtccatatatgctcaataatcttcctgtttctgcctaccatttacaaattgcagaccacaacagttagctgtaatttagttacattcatggtattgtatctttttactgatgcatctatgaactccagggttcaactcaactctgcgcttagggaacataactcatcatgaatatattcaggtctgaattttcttcattcgtgttttgaattttctgcgctaacatctagcttatcagtcaagaataccttaatctctgaatggtaggccagaaaaatcttaaaaaggaaattccatttgttatcgcctatttgtcaattggtctcataatctgtttactttttttttttttttggggggggggaggatgttttggtatttaaaagtaacataacagaggattgatttaatagcaaaagtgaattgactcatttacctttggaagaagtatgtcatacatcattgatgttcatgtaaaatgagatagttaaaactcttgatctgaggtcatccagtaatgtgaagaagtattatcttccatttggtgacagctagctatcgctatcagtatctgaggaaaattcacaatgccagagttctctgtaattggacaaattctggggtttcttacatttgggagttaatattctcagtaaactcaagactacatcgatttgcccttgatttgttggcgattccaacatcgcactgttgatttgctatccaaaattgttcgtggcgttaccacaaatactaattattgttcgtggtgatttttttcccgaactaattgttgctggtgattagggagagaattggtgggaaaagccttgttcacctggttcaaaatgttttattacctgcaaccttctattctgtatgtacaccaggagttctatgctgatattgtttcacaggctctcctgctaccaatgtgaaacaaacttgttcgctgcaccatctactctagcattatataactgttgccaacactcttgctgtcttgcgagcattatattgatgttccaaacataattctgtaggttggaaagggaagagacgttggtcttaatcagattgcactgttcgaaggaaaagttgctggaggaaatggtgagcaagtgctcagccgggatatatacagacttggacagctttttgactttttcaggatgttgtccttctatgtgacaactattgggttctacttctgcaccatggtaattagattttccttgcttgttattccctcattcacgaatagatgtcactttagaatgtctttagttgaacttttaaaagtttggctacctccattttttatatggcgtaatggtgttgattagttcaatgatgctaaacatcatataaaaaatggagtataatgcaaaattgaagtcagtagattctcttttttttttcttttgaaatagagaggtctgatctccatttcagtagaactggtaacggccatcaggttacagctcaagaggaaaaacaaaaccaaaatgccagcagcttgtcacaattgtgatgccatccgatccctgtcacaactattgatgccaacaagactaagaaaactcaataaagttgctacaaacacaacctgggacgatctgaaagcaaaccagaagtaattctgggggactggtggttgatcacatgattatcctgggcaactaaatatctcaaggccttcgataccttgtgcctgatgatctattggttaatttggaaagaaagaaatgcacatatcttcaacctgaagtacaaaacagcgaatcaacctgtggctgagatcgcagatgatattttagtctggagagaagcaggtcttttcactttagaaaatgactaatcttgctgcttgaggctgtgggggtgctggtgctgacctgggcactgccttgtaatttctctctcgacagcttactgtttgtcctctttaaattttctcccacaatcttaatctattaggttggcctgttcttcggccaacccagctaaaaaagatttgaaattcaactagacaaccaaaggaacaataagcccagcaactacttcccaggcagacaaacagcagcatctttcagtaatttctaatttttacctctctgccttcgggctccatccatcattccagccatctagcccctggtctccatccaaatcttgataattagacctcatctgctaccttgattagtagcatgatgccccaacgtagcttttctgccctttcttgcgacatcttcagtattgaccaggaggaaatctaaaaacatatgaatctaatcagctcaattgggtgatttagaacatatgaattaaaacatgcattattccttgacttcagattgcccacaatacagcagcttgacctaaaacaattaatatatgcataggattttgaacggtaccatttttattatattattaagtacatgcataaaattaaatttgtacaaaaatagattattgatgctacatattgatcttgttgtaggtgctatccccctgaatctgcaatcatgattctattattctaaaataaattctgatcttaagttgtttgctcttttgcagctaactgtttggaccgtgtacatatttctctatgggaaaacctatctggtaaggcagaaaatcagttctactttctttgatattaacatctctctataataacatgtcactttacttgcttattgtccaccttttgtaatgacttcactcagattgctctatgctgtcaattgtatgaagtttgttattaagatttttttttggtaattaacgcatcttgcttgcattgttctatgtctgctatgttctttattttatcttttgtatattaagttggaaacattcctaaccacgcaagacaatatattttttaagtaaaatgtgctggaggcataagcactgttttattgggtggtgcaacgcttgcatgctgtgtgccttctatattctacttttgcacctgtaaagctaatagatgttataacgcacgttaactttcttgctagtaccttctagaaaatcctgttataaatgttcactcagtgtgttccttttatgttctaccctttcacgattttgcactttcgttaccttacgttccagtttcttgggttcagtttgtgacattttttttctgccatatctgaccaggatattatattgtactagttgacatattccttctatatttgtttcgtaggctttgtctggagttggagaatcaattcagaatagggtggatatattgcagaacacagccttgaatgcagctctgaacacacagtttcttttccagattggtgtatttactgctattcctatgattctgggtttcatcctggaatttggtgtcttgacggtattccttttatcttgccaacaaataacctaagctgttccatctgagcactcatggtcaattatcttccatggaattattttcctaagaaatgttttcaacatcttcttaatgcaacacagtatttgatataactcaagtcatttttcttctggtatcaacaaagtcttcatttattcaatcttgtgtttttgaattcaatgtgcttcactgcaacataaagagtcttcacctattggctgttgtaataaagttggttgttgttgagtggagcttacctttctaatctcgtatagatttttctgcatttgttagctttatttgcctatgttgttttttattgtctaatatattttgcctggagaaatgcatttttacatttgaatgtgtgacacaggcttttgtcagcttcatcacgatgcagttccaactttgctctgtattttttactttctccctgggtacaaggacccactattttggccgcacaatactacatggtggtgcaaaggtagggtcctttgtttttaagtgatgcttatctacttctgatttttactctgtattgatctgatgtgtttcttctggattaccagtatagagcaaccggtaggggttttgtggtacgacatatcaaatttgctgaaaactaccgtctttattccaggagccattttgtgaaagggtttgttatcacctgattttgctctcaaaattgtgtgcaactacagtctgtgatgattgcttttgtttttcacaggttggaggttgctcttttgttagtgatctttttagcgtatggttttaacaatggtggagcagttggctacattttgctttccataagtagctggtttatggcagtttcttggctttttgctccatacatattcaatccatctggatttgaatggcagaagtaagctgctaagcattctatgcatgtgttactctgcgtaattatatttgaaattcgaattatcaggattaaaatacctctctcagggtcgttgaggatttcagagactggacgaattggctgttttaccgaggtggtattggggttaagggagaagaaagttgggaagcctggtgggatgaagaactggtaactgaattttgcctgtatatgattagcatttttaattgtgtctaatattttgttccatacaatggaaaaactagttcttttcactagttcatatgtccacaaatgtaagcattccagagtgctacttgtcacataaatcacctctcactcaaatttattcccatcttacccccaaccatcctcccatctccatccatccctcatttaaggagggccaccaaagtcttttctcctcaaccttaatatctactaaacagcttagaaatgcttatattcgtggacggagggagtaatcttattgcagcttgacagtatcatgagaatctactgtcacatttgttgtaaggtcttgaggccacttttgttattcttttcgttgattcctcttctgcagttactggcacttatattggcttctatttctactcttagcatatgactgaattgacgaaagtaatgatgagctccaaaatggatgcttttaccaagcttgaagtcattgaatgatagttaatatcagaacatttctttttcaggcacatattcacaatgttggtgggaggatactggaaactgtactgagtttaagatttttcatcttccagtatggagttgtttaccatatggatgcaagcgaatcaagtaaagcactattggtatgttttcagcatccatttgatttgcttgttggcatgaaattcgttgaccaaatatgtttcagtttttttttttttactttctgaaagtattttttttatttgaatgtgctattaatactctgatattgaacacaaagaactgatatatttttgtaatcagaaatttggtaacatactatttgattatatattttgatcttcacttattggtctagttaatggagacaatataatggaacatttaatttgatttgtagatatattggatatcatgggctgtgcttggtggcctttttgtcctcttactggtatgtgaattccttattactgtatgaggtatctgagtaatatcacatatctggatattaacttgttttctttattgtattaatctgcaggtattcggtttgaatcccaaggcgatggtgcatttccagttgttcctccgacttatcaaaagcattgcgctactgatggttttggcgggcttggttgtggcagttgtgtttacaagccttagtgtcaaagatgtgtttgctgccatcttagcatttgtgccaactggctggggagttctttcggtgagtttctatagaaacatcaatgtccatctgagacaggatggtgcaaaagtgaactcagttttgaaaattgttcctgcgtagcagataatatgtttcatgaagttcactattctcctaaagtatttcacagaagtactcaacctcccaaatttcttttggccttactccttgcactattaaagctgctttctctggtcaaatccctagcgtttgatgttttccagataaactttggaagctttgagtatcaataaatcgtgaagtgcttggtttgaaaacataaaattggtagtatagatttgtcttggaaactacgcataatctcatattttagattttataaactcgcctcgaagacagtaaaaataaagtcgagcttcctatatttttctatactgttaaccggagggagtagttatttacccaatgccaattgtcctttttacttctctttatacaagtggtattttaagtttaaattttgtactattttctttgtttgaagcacctaacacctaccccctccgtcccaaaaaaaaacccaatccggttggattctttttgggatggagtagtacttcatgttcctttttgtatttgttttctatcattaatattcgtgcccatgcttttttttatatataatacagatcgctgtggcgtggaaacctattgtgaagaaactaggtctatggaaaacagtgcgctctctagctcgcctgtacgatgctggcacaggaatgatcatttttgtcccgatagccatcttttcctggtttcctttcatatccaccttccagacccgacttctatttaaccaggctttcagcagaggtttggagatctctctcattcttgctggcaacaatccaaatgcgggagtatgactgtagctgctcccatccatctaagcatctccattcagatcgtggagctttacaatcactgttgttctctcttagcagtaggatgtatatatttcatggacggggagtcgtggatgtatcctgttggccacattgttgtattgatcttagtgcttctaattgtgattgctactgttgttttgtagctttagttgtggagttagcttttcatgtttgctaatacaactgattatattatcctattagattttgtt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0119500, RefSeq:Os03g0119500