Os03g0143000
| Gene Name |
Os03g0143000 |
|---|---|
| Description |
SAM (and some other nucleotide) binding motif domain containing protein |
| Version |
NM_001055471.1 GI:115450670 GeneID:4331587 |
| Length |
4668 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0143000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:2358391..2363058 |
| Sequence Coding Region |
2360516..2360546,2360656..2360729,2360994..2361044,2361146..2361217,2361328..2361435 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:2358391..2363058 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atttctgcttttctacatttgatttgtcatgcatttgaattttttactgttccatttggacagttcttcaaggatcgacactacttggataaagaatggggaaagtactttgagggtcaaggaggggggaagatggtgattttggaggttggatgtggagctggaaatacaatatttccattgatttctacataccctgatatatttgttcacgcatgtgatttttctccccgagctgttgacttggttaagaaacataaggactacagacctgaccgagtaaatgcatttgcatgcgatattacatcagagcaactaactgagaatgtacaaccttcctctgttgatgttgtaacaatgatctttatgctttctgcagttgcacccgctaaaatgcctctagttcttcagaatgttagaactgttctgaaaaatggtggccgtgtgctttttcgggactatgcttttggcgaccttgcacaggaaagacttatgtctaaaggccaacaaataagtgagaatttctatgtcagaggggatggcacggtgagtgcatgcgagcatattacttttcaaatgagtacctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>ISAFLHLICHAFEFFTVPFGQFFKDRHYLDKEWGKYFEGQGGGK MVILEVGCGAGNTIFPLISTYPDIFVHACDFSPRAVDLVKKHKDYRPDRVNAFACDIT SEQLTENVQPSSVDVVTMIFMLSAVAPAKMPLVLQNVRTVLKNGGRVLFRDYAFGDLA QERLMSKGQQISENFYVRGDGTVSACEHITFQMST</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2513..2543#2330..2403#2015..2065#1842..1913#1624..1731#1375..1479#1092..1124#892..1005#acatatggccagggaagaagaaggaaacaggaaaccctcgccgtggagcctccaaaccaagcgaagcgccatggccgccggcgagcagcagccgcagcagcagcagatctccgcctcctctacatcctccgggaggctcgtcacgcctttctggaaaggttcgcgagcgagcgagcgtgctctaagttagcccttttctcaggtgattttatcgcggcttttacagcgtgttttttctcgatgggatgcagagaagtacgagagggatgcgaggaggtactgggacatcttctacaagcgccacgaggacagggttgcgattctagtttcctcccgccctcctcttgcatgtgatttatttagctcgtgcgagagcactgttggatgtggaagattataattggcagtgtttgtgttgcaaccctttcctttggtttcgcgttgtctcagtagtttctcgctggtcttattagttgtgatccacgaattcctgggtgtttttgtgtgctggcagtggcagacagctctctgatcttcaggtgaaaacaaagtttcaagcaaatcaagaatgtgtagaccgcttcattgtactgaaaagcctagcagcagagttctaattccctatattcatgctgttttgtatcgatagcgtgttcagtttacttgttcaaattgctagctggtactgtaatggatcccagatactcaattgttgaaggaacttctttgtttatagttctggtatatctctcaatgctaacaagaaatttcgtcaatattcttggtggataaatgtggtgtcaaacaatacagtgaatctggacctctggatcaaatatgccactacaacagattgttgtttctctactgcaaatgcttatggttgcttaaatttctgcttttctacatttgatttgtcatgcatttgaattttttactgttccatttggacagttcttcaaggatcgacactacttggataaagaatggggaaagtactttgaggtaaacaactaaacataaaagcctatctttttgtaccaaatttggccataagtttcacggaactgatttaattgtgatgaaaatagggtcaaggaggggggaagatggtgattttggaggtatggcactgatttatattttaggcttgtttctgtactaactattgtatggttgattctgataatttagcttagcagaattaattcatagcattcttttggtcgaactagccaactagggaatgttcataaggcatttcagattcaactctgctcacaaccttggccaatatatctagtaaattctgttgctatttctcattcttgtttgtttgtaacatgaatgtgactggtgcaaggttgactgcaggttggatgtggagctggaaatacaatatttccattgatttctacataccctgatatatttgttcacgcatgtgatttttctccccgagctgttgacttggttaaggtatactattcctcgatggtagctgaatgattaatccatttacccagttttctcttctaataatttgccactgcaatgaaaagatgtgcaactgaggatctacaaattcattccccattttcattgattgaattttacatgcagaaacataaggactacagacctgaccgagtaaatgcatttgcatgcgatattacatcagagcaactaactgagaatgtacaaccttcctctgttgatgttgtaacaatggtaatatgctgtacttctatcattagtctatctgtaccagtcattttaacttctttatttacatctatttatagacttttgagtgtgcaaccagctaacatattaagtagatctttatgctttctgcagttgcacccgctaaaatgcctctagttcttcagaatgttagaactgttctgaaagtaagtgcccctgttacttctaagtacagtatcattattttcttttaatttcttagaaattctattgactcaaggaactaaactcatgtattatgtattagaatggtggccgtgtgctttttcgggactatgcttttggcgaccttgcacaggtatgaatatcttcctatgtgtattttgatgccttctctaaaagtaggattgtttaatttgatggcttctacaaatcttctcttttccctattcttggtgatatgattttggtttagtgcatgcaagagaagaattgtttcaaactttccatatatcagatgcaagtctcaaactgtatgaaatattcccttaggtgtttacatcatgcagcataacaatccactaatccaccatcttattgtcttgctgtaaatattttgtaggaaagacttatgtctaaaggccaacaaataagtgagaatttctatgtcagaggggatggcacggtgagtgcatggtagataatcatattctctaatggaagtttatgcacaacaaaattaacagatactttttacctataaaataaactggtggattgattctgaaatgcgggctccatgcagcgagcatattacttttcaaatgagtacctgatggatttattctcaacatgtggatttactgttgaggagatttgtgtgcacaataaacaagtcgagaaccgctcacttgacttggtgatgaacaggtgatgattatttgctttgtacagatatctctagaatatatgcaccacctgctattgagaaagcatgtatatttttttgcctacattaataatgctttcagagtaattctatcgattgcagaacacatgtactttggtagccttgccctttttaatttgctctgttctctttactgtggttatcttccttgatttcaaatatgcccccactttttttttcacaacaacgtgattatttttatatatattgcttaggaactggatccaagccacctttatccttggctcagctggtcttcaaggcccaaatggccagcacgattcccacacttgtgaagatgaaaaggataagttaactgctaatgcttctcaggagaagagcaccagtgaagaaattgacctttctgaggattttaacaatatgtttggaacttcacacaaccttgatgaggtaacttttattaatttaagctgagtgttatcctttgttgctgtgagcatcagacttgtattggagtaaaaaagttggatttcctgccacgccttattaacgagaagctagtatccattacttttgtcttatctgaatgacatatcaaaagtacttcctccgtttcacaatgtaagactttctagcattgcccacattcatatagatgctaatgaatatatatatatataataatgtctagattcattagcatctatatgaatatggacaatgctagaaagtcttacattgtgaaacggagggagtaatgtataatataaagtgacacagaagagagttcagtaagtttggtagtgatctaaaagagcagcatgagaaaaacaatattaaacctttaatttggtttactcgggttcgctaggtgtggattacctgcaaagaaaaaggaagaacaaaaaaaaaagcccatttgtccttttcaatccatgtcattggtaagcaatacaattacccgatgactggcaaggcatgcatccagcagcaattaactgcaggtatgcagcatatttgcattatctgtttgacattagtcactgcaggtctgcagttgcagtgggatgtcaatgcaatggcatgaaactgcagatgtgatttctctttttcaatcacaaatctggaattgtttatctttatgtttctaatatactcttgacattacaaatttgtcattgtcttgtgaagtaatttcacataatatttctctgttttgcaggctcaggtccttcggatcaaagcaaaaggtcatgacttcgaaataaaaatgctcacaaaagaacaccagcacacctgcaaattaaccggtctaatgctttgggaatcagctcaattcatgtgcagtgttctagcagagaatccttccattcttgctggcaaaagagtgctggaactgggctgtggctcggctggcatctgctcaatggttgctgctacagttgctcagtttgttgtagctactgatggagacgcagaatctctcgatcttcttagagaaaatactgcctctaacttggagcctgatttgcttaaaaagattctgatcaggaagttattttggggcgacaaagatgatctgaaggcagtcagggagctttccagcgatggagcaggttttgattgcataataggaactgacgttacctacaatcctgacgctatatttcccctcttcaagactgctagggaactaatttctaataaggattcagatgcagcccttattctttgctacattcagcgccgagttgatgaggattctatcctttctaccgcaatggcccagggtttcaggcttgtggacaagtggataaatggaattcacgagagtaatggtatcattagctcttggttctgtggtaatgatgtttgcagttctttcaggaatgcaacgctttccatactgtattttcaggtgtgagactttgatgtttagctgaatttcatgcatttcattacttggtgatttcccaccattattgtaccagatgaatggacaagttttttttgtggcaattatattattg</dnaseqindica> |
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