Os03g0145700

From RiceWiki
Revision as of 12:19, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0145700| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001055486.1 GI:115450700 GeneID:4331604| Length = 6840 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0145700

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001055486.1 GI:115450700 GeneID:4331604

Length

6840 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0145700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:2509344..2516183

Sequence Coding Region

2512498..2512879,2512967..2513128,2513449..2513489,2513604..2513635,2515860..2516016

Expression

GEO Profiles:Os03g0145700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:2509344..2516183 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:2509344..2516183 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtcctcaacacagtccttcaagagtggcgccactcgcagcttcacaactactatgcggagaggggccaatggcgcccccctctgcttctccgggagcagggaaggaaagcggcgcgccctcagtttacccaatggcagccaaggaagaagcttgcgcttgcgcttgtgttgtgctcctcccgagtccaagtggtggacgacgccactgactcctgacgatctaatcgagccgacgggacatggccaggaggaactggaggctatatggaacgccctggtcgaagaacctctccggcccatcctgactgcctttcaggaaattaaggccactaatggcaacgtcttccgctgtcgctgcttccacgcgggcataacgtcaggtttattagttctcgtgattcgtatttgtcagttccacaaactggcgcctggcctttgcgtggattttgttctcggatatgtatgctacaggatgagtgttttagcagcggagctgaaaagaaatgggaaagcaaacaacatttgtgctaggatacagtttgttattatgcttttgttgttctgggctaacaatcctattaaggactcttgcttctacttcacacagttgatctggtactttgcactccatgtgtattcctgcgctgtgttctacgaatacattggtgtaaagcatcccgcacgctacctggaagcaatgttttatacaatactaacaaccaacggtggcctgatgaaagtacttaagttcatgtttttgggacaagaatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSSTQSFKSGATRSFTTTMRRGANGAPLCFSGSREGKRRALSLP NGSQGRSLRLRLCCAPPESKWWTTPLTPDDLIEPTGHGQEELEAIWNALVEEPLRPIL TAFQEIKATNGNVFRCRCFHAGITSGLLVLVIRICQFHKLAPGLCVDFVLGYVCYRMS VLAAELKRNGKANNICARIQFVIMLLLFWANNPIKDSCFYFTQLIWYFALHVYSCAVF YEYIGVKHPARYLEAMFYTILTTNGGLMKVLKFMFLGQE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3155..3536#3624..3785#4106..4146#4261..4292#6517..6673#gttttcccctcccaaaaatcctccgccgcctgctcatggtctcatggagcctgtggtcagccgccgccttcccctcgagcttgagaagccggagccgctgccttcctctcaagctcgctgaaccagccgtcgctgacgtcgtgtggagccagtggttaccgtcgctgtcttcccagcgagccagcggcagctgccgccaccttcttgcgagttcgatgtccactgtcgccgtcatttcgtctccttctccatcccacgcgagcttggttctgcaagatctgtgccgcatcgagcgcctacaagcacgcggtaaccaacaggtgaaactccacatgggtggcagcagccaaatctcctcctgctgatatgactcctcaaattgatttctcagttctctttacagtcctacatctcatgctctcttcttatcaaccttacataactggtggaaacctctacttgatttttctgtggtgcatggtcaatcaggtctgaacatatgaggttacaaatgccttacctgcattatgcttctgaaatttcactgttagaaggccatattccgttgattcagaactttttttttgatgtgcaggcctgcttggaagcacaaacgaaaggatcacatatgtatgtgagtatgtctatttgctaattactaccttttcctgcaaatacgcatacaccacttggatgtagatacccattctgcattgcttttcatgttaattaacttgattgggtaaatgtttactacattgatcggccggtatctcagagtacaatcaataagtgactgaagataattcattagccttttatgtctatatatgatcataaaaatggctgcagggtgcatcagacaagcaaaaggtatatggtaagtgatggcacatttcttagggaagggatttacgagttcaatgtcaaaatcctctctatcagtcgcctcacattttcaacttacctaggttgcttccctatttttagctacataagaactatatgtatgtcaccccatcagagttatttatattcacatgttatattctaaatccatatttgttgagatgtgttctataattgatctctatgcagagtatcctatcaaaacattaacaatgttagaccgtacttttagtgggtgttgcatgcagttattattatcaaagctatcaaaggtattttacattgttacatctccttcaccctttataggtttctatattacaaatgctcatgttattgttttaattctttttcgaccagtacaacctgattagctattcttactaattctatattacagatgctctgtgatattaattgtgatcctctttcattatacaggtatgattccttctatttacattttaaatttttttatccgatggatttgttttgcctcccttttactctacaattgataatttacatggctattgttccatacgcaggaaatgcacggacagcttgtaaagtaaacttgatgaagagtggtttcctatctccatcaaagtttgtcaaattcacttgtctgctgctgtattgtattgcttacaagctatttttcttataccatcatcccatacgcttagatgcatattgtacacccttgcctcatgtaatcatgtttgcagatatattttggtacatatatagtccagtgactctacgagcaactcaatttactactagaaaaaagatacccagtgttcttctcctttttatttaaatattttagtagctttcattttctttacaaccttacaagcaaaatgtttgatcttgatcatggtttagaaattggccgcctcttcgaaatacaaggtaaattaaccaaacattgacctactatatatgcttgcgtatgtcatatgtagatatactcattacttgaagaaatgcttgacggacatagtctacaggtattatatgcattattggttaggtactaaaaaaatgcacactgattttacttgattttagttttcccatacggccagtaatataaggtctcataggagttgttaaatattcaatcgttttgcccaaatggttcaattgagaagaacttaaagttagctattgcaggtagcctaggccaacagaaagtctgaagttgttatctccttattgtttgcagagatcacatcgcaaccaacttgagttgtatgttacctttagcttgatttggtcctgaaattgttctcacaatttaggaagcatttttactcagtgtatgcaccttaattttcttctagactactatgaagtgatgtgttcatagttgttttcttattaatcttaatatgtaaatttgctgagatgtccttcaaatatgatgacttcaaatacattgtgcatcttttattctctcagatttatattattatcccccacaatgatggcttcaaattaactgtgcaccttttactgatgttgatatatagttgtgattggcagatactctagccaacaatgagtctatcatgtgcttatgttgtatcacctctacaatttccaaaaggaaaccctccttagacacccaaagattttgagcaaatggatattttcatcagcaagccttatgtccacattcacctctttcatttggatagtagcccaagctaaaggagttaaaccaatcaactaaatgaactgcttgtgtattttaggatcatagccatcaaccttgatttctattttattttgttaatggataatttagtacatactgtaaaacatatgcaatatgagttacgtgctccgctgttgtaaaacatgtccacctgttcatgttctatttaattcttctgattaaaggttatatctaatgcccgcgcaacgcgtggggggggggggcacggctagtctggtattaaactcgttcccctcgtcccctctgccctccccactccgcgccgcggcaggcggccgcgcgcctggatccccctctccgccgcgcgaatcccttcctcttgtccgtcgcgtcgagcccaattcggcgcgccacctctcctccctccgccgccggctcagtcactctcgccataagaatcccggaaccaccgccgccgcataacctcttagccgccccaaggccgggtgttcgccggcacgccggtccaaggaaagccgtaggaatctaaccatgtcctcaacacagtccttcaagagtggcgccactcgcagcttcacaactactatgcggagaggggccaatggcgcccccctctgcttctccgggagcagggaaggaaagcggcgcgccctcagtttacccaatggcagccaaggaagaagcttgcgcttgcgcttgtgttgtgctcctcccgagtccaagtggtggacgacgccactgactcctgacgatctaatcgagccgacgggacatggccaggaggaactggaggctatatggaacgccctggtcgaagaacctctccggcccatcctgactgcctttcaggaaattaaggccactaatggcaacgtcttccgctgtcgctgcttccacgcgggcataacgtcaggtatgcatcttgcgtccctcagaaaagaaaaaaaaaactactgtgcatgtatatagcagttactgaacatgtcatgtatctgtgcaggtttattagttctcgtgattcgtatttgtcagttccacaaactggcgcctggcctttgcgtggattttgttctcggatatgtatgctacaggatgagtgttttagcagcggagctgaaaagaaatgggaaagcaaacaacatttgtgctaggatacagtttggtgagtccgaaattgtttctacacattagtgttcatagcaccaaacaatctgaaacgcgatactaactgtgaccataaattatgaactagcatccatctgtttattgggttatgggtacatggcaatgcacgtttgtattagtcaaagcgaatttactagtttagctttaactgatgaggcaaaggcaaacctttcagtgctgtcctactttgttttgagttttccatatactgagtttattttttgctggctacatgttttagtatcgcaaacagctattcgaacacactcatcttacatagttttctttgaaatgcagttattatgcttttgttgttctgggctaacaatcctattaaggtacttttttttttgctgaaaaagaagtacgcctaggctccattctttcgcatgagctcttttgatggattctttcaataattttactaaatgatccttccccccttctaataggactcttgcttctacttcacacagttgatctggtaagttcttccaatgtttcatgcatggttaacttttccttatcattatttgcgacagaaatccttttacgcatgatttatctgcattctgtaagtggaaaccattacatagtttttgcgcattgtggaaggaacttcattatctagtttgatatgttaaaaatatctagttttatacgatatttcttatttaggattgaagctctcagatacctgacacatttgtcaagttgctttagtagttgaaagttccaacaacaatgttaatgtcattttatatatattcctcatatggatctgaggattttgggagggattttacagtaaatgaactaattctggtcaaaatcctgtgttccaacggagcccttaggttatgcatcaatttatagcactctcatgttgattcgtcccttaatctaagaaaagaaaaaaaatcatcaaaggatggtagtatgcactgaaaatcactagggcatgttcggttaatccccagggagggattagaggagatatattccacacctattgtggtatgaaattattccccctcaatcccctccaaaacaaacaaggcctaattgtgtaggttggaagaacctaagattcattaaacctttggatataaaaatgggcgtaaattgtcattaaaatatttgtagcatagattatgttgacatctattatcttacaaaatcttgactggaaacgtcatttgtataggaaacaaaaggaaaataagtgaaatagtttaggggagtactgtttacccttctacttagaaaaataacataggaattaggaagtccatagttctctaatgacgcgtccgagagaaaaatagctctctattgactcacattgctttagaaattggaacatgagtaaaaacattatgtggcaagtagattgcataaaacaattgaaggcagtctgcctgcccactgcctcttatgtaagtgttcagtggctagttttcacagaattgcatgaagacctcttcgttaagcttcaaaatctgaaatgatatgtatgaatttcacttgtgtagctttggaagccagaacatgattaattcagtctaatataatgttcttattatttttttatgctgaaaagacccttgcacacattcttttacacttttattcttctcttcgatagcctttgctaatatatttgtgtatagctcgtgtggtgtgcacacgtcttctcatcttattttggcaataccgtgctatagcctataggctcaaactgtcccattttgtgaatcaaatccctatactattagattgttgatttgttgctttaacttttgagcctaaaactaactcttgtcatgtgagattaccaccaggtcaccaacatgtaaaggcgttgttaaaattgatggtctaattaaatagatgggaagtcattttctttaaaatttgtacagttttcaaggtttgctgtacaggaactcttggaaatacataaccaacataaaatcacagaactctgtatcaaaagtagccatttgtgtggaccaagctggctacaacttacagtatccagctagaaggcaaaacttgaatacaagaaggaacctttaccagatattaacatagttgttaacaaacacttcaaacccaaagtactccctccgtcccacaatataagggattttgagtttttgtttgcaccgtttggccgctcgtcttattcaattttttttttgcaaatataaaaaataaaaagttgtgcttaaagtactgtagataataaagtaagtcacaaataaaataaataataatttcaaatttttttgaataagacgagtgattaaacgttacaagcaaaaactcaaaatcccttatattatgggacggagggagtatatgacaatagtgaaacagggttaccacatatgtcgccaaagttttcgatgctctccaaaattactgtggcatctgtgttccaatggatcagctatagcacaaggaaatgggtaagagctgaatatggtggcaaatcttgcgcaaaataatttcaacacgccgtttgttactagcaatggcacaaagatgaacatttttagggttccaataaaaggatcagtagtgcacgtgcttaattgaataaatttgatttttgctttctgttgtatactaatttttgctttggaacatttggtaccatgatttgtttatacgtttaaaacaattatctgttgatacaggtactttgcactccatgtgtattcctgcgctgtgttctacgaatacattggtgtaaagcatcccgcacgctacctggaagcaatgttttatacaatactaacaaccaacggtggcctgatgaaagtacttaagttcatgtttttgggacaagaatgagaaacattttccttgtctggtgatatagaattagggggatattataagttcgatgtataaatcaaattcaccatggggattgccagatgtgatctacttaatgaaaatgggattttataacgttacatgttccttcaataattcattttagcatgaccaatttgatt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0145700, RefSeq:Os03g0145700