Os03g0387900

From RiceWiki
Revision as of 12:41, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0387900| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001056797.1 GI:115453322 GeneID:4333004| Length = 5992 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0387900

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001056797.1 GI:115453322 GeneID:4333004

Length

5992 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0387900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:16018799..16024790

Sequence Coding Region

16019973..16019996,16021027..16021484,16021594..16021871,16021959..16022032,16022533..16022752
,16022857..16023128,16023435..16023583,16024056..16024185,16024281..16024394

Expression

GEO Profiles:Os03g0387900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:16018799..16024790 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:16018799..16024790 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgccagattggagggtgggcgagtttgaaggtaagctcaaggatggatttgctcggagcaataatagcgaacatgaaaatggagccgggactgtgagtatatccagcaagaagtcgaagcatcgggttgacagtgaaaaaaaaccccatgttgacatctctggagtgattgattcagattcgcagaaatgtaattcagagcaaatccattcagctaatgggatagtatcccgggatgtcaaccatgatcacatagaaaactgcaaagttgaatcaaatgattttcccttgaatactatctctgaaacaagatatccaacagacaattggaacagttctcagtttgctctgagcaatgatggttcacctgttctcaataatcagagtactccacaaactggtcatggctatggagataatgatctaacctacattgattggcctgctattgataattttgaggacgtcgacaacttattcaggaggtgtgattccacgtacggtcagcagcaacttccgaacacggatgaactgtcatggattccttcttcagatgccatgtactcttctgatgttgctatgcaaccagggtttgaatcctcgtattctgattatggtatcctggatgacctctccgcattcaattgtacggaagataaatccctgacaacagctgatccttcaagtgctgtatgtgacgagcaattcgatgactcttatctgttcaatgagcaaaaacctgaagatgtttatggcgaacaggcttaccaaagggatgcgatggaattgttgtccagcgaccagatatgcactgggcaggaaaacctagatatgattggaaatcgatattcatcggaaaatgccatggaacagcctgaagatcagaagttttctatagcttcaggttctcaactaagctcttctcagaatttattgaaccaaaagaaccacttggattcaacttcaccaagtaacataacttctgagtcctatccagaaagaaattgccagatcattccatctggggcttcctttgcagagagaaacttgaaggtgcagaagaaagtggccagttcggcatcaggacaacttatcagtgataatgtgactggacatcctggtcatcaaacattgacaagaagggcttcatatccttgtgagaatcatgaaattggaaagaggtccttaggaaaaagaggtttgggtcattctgatgttgcaatgggcacctcaatggtagttgatgggtccttcgtatcgtctatttcttctgataactcagttgaagagaacagctttcggcagcttcaggatgcagttagtcagttggatgtgaaaacaaaaatgtgcattcgagatgggttataccgcctggcaagaagtgcgcagaataggcaagtcttcccaaatacaatgaacaacaatggagatagccacaatgtaaaggacatgcaaaatgcagaaacttcgggaaagtttgttgatcctgggagcatcgagacacagacaaatccaattgatcggtccatagctctgttgcttttccatcagccatcagagcatgtcactggagctgttgatgaagcggcttcactaaagtcacataatgataaccaccaggctgctgctaaaaaccaaagagtgatgcatgcttcatctgtacattcaccaagagggcagggagaccccatggatgcaaaatcttgcagaaacaactga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPDWRVGEFEGKLKDGFARSNNSEHENGAGTVSISSKKSKHRVD SEKKPHVDISGVIDSDSQKCNSEQIHSANGIVSRDVNHDHIENCKVESNDFPLNTISE TRYPTDNWNSSQFALSNDGSPVLNNQSTPQTGHGYGDNDLTYIDWPAIDNFEDVDNLF RRCDSTYGQQQLPNTDELSWIPSSDAMYSSDVAMQPGFESSYSDYGILDDLSAFNCTE DKSLTTADPSSAVCDEQFDDSYLFNEQKPEDVYGEQAYQRDAMELLSSDQICTGQENL DMIGNRYSSENAMEQPEDQKFSIASGSQLSSSQNLLNQKNHLDSTSPSNITSESYPER NCQIIPSGASFAERNLKVQKKVASSASGQLISDNVTGHPGHQTLTRRASYPCENHEIG KRSLGKRGLGHSDVAMGTSMVVDGSFVSSISSDNSVEENSFRQLQDAVSQLDVKTKMC IRDGLYRLARSAQNRQVFPNTMNNNGDSHNVKDMQNAETSGKFVDPGSIETQTNPIDR SIALLLFHQPSEHVTGAVDEAASLKSHNDNHQAAAKNQRVMHASSVHSPRGQGDPMDA KSCRNN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1175..1198#2229..2686#2796..3073#3161..3234#3735..3954#4059..4330#4637..4785#5258..5387#5483..5596#gctggctactactactacttgcactccacgccctcatcccatcgacccacccatctctcctattctctcttcaaaaaaaaatcaggaaatttaatcgcgaggaggagagagaaaagaaaaaaaaaaggaaattcgcaggagaaatccctggaagcctctagagaccgcgcgaacaggagaccccgaggagcagagcagagcagagcagaggcggcgccagctttgggagctctcggttcgttcgctttctcttccgcttcgtcttcttccttccttgctaagcgcggaagcgctcgtttcgtttcggggattttttttaaattttttgggtgagaaatttcgattactccttgtgtgtttgtgtccttgtgttcggtgtggtttggtggtgttcggcctcggatgttgaagagatggttttagttcgttgtggtgggggtggggatttggatttgatgttctgatcttgctctcgaggtccgtcgttctgtacttctgtggcttttgcttcggcttttcgttttttgctggtgttaatttcttgttttttcgtgttttgtcggtgtaatttcttggttgatttatttttttcttttcgcggaagaacagttggatttggatctcttccatgtgttgaattttttttgtttcttttttctttctggaggtccatcagaagttgcttctaattctgggatttggaatttgattctcttttgcttcttaccttgcagggttttgatccagagcgtttggaattgggaaggtgagttaattcgttctcagttccctcttcttctcgctgtctcgcaggttcagtagttgttgctttgcctgtttttggttcatctcggaaaagtttccgtaggtttatttacttgttcatggcatacgatgaggaatttgcctttgcttttcttatcatttgacctagtcaaacgtcctctgggattgacttgttttttatttttattcaaaaactattcatactaatctgattgaaaaacatgattttttttgtttaatttacatactttttagttcgcagattactataatcacttttttacctctctgatttgcaggattgatcaagaactggggatcctgagttgaatatgatatcaaatccggtgaattggtacagtttcggtcccggatagaatttgtagtgatgccagattggagggtgggcgaggtaatctcttttttttttcaataagaaaattaatcattttcttgccttcttgattgtatatgggcatatggcatggtgataattcttatatgattgatctagctcaggaagaaaattcaaaacattaaggtaaattacagtggatatttctggcatgaagtaaaacaaaaatgaaaagagaatacgtctagggaattatactcggttctcttttgaggaatatggacttccaagtggtacatgtcgagaaattagtctgctcagtttctttattccccttttagtctgccaaattggttttactaatcctggtagaaatagaatactgtatatatgctgacatctgttgtacatcgaatataccagtatattctgagttaaagctaattttggattcaacagtaactaatggttttacttgaagtcttttccctgttattggttaacttaaattgtttactgttaggtgtcaattagcttttcttttgttgataagctggtgatccaaagaaaagaggacatgtggatctcgtgtaacaattctctttgttaagtgttaattttcatttgcatccaagtgtgctagccacccaagtagagctgaaattctttttgtcatggatagatgagtgctgttagtgggatagatagcccctcgtcaaaggtaccaagtgtcaatcaggggatagttctatttggttgaagcagagttgacaagtaatataatacaattggtgtttgattagcgtatacccttcactcctacagaaatagtgagttaaattcgtaggcaaagatagggcaatcctactaggcaatccaaccagatattgaattctgtcatggatcaaacctagtctatattgaattccgccaggaatcaaacccagtcaatcatttttgttgcattgaaccttggatgctctcttgtttctcttatcattgcactgatttttcatgtattagccccatgacatgtagactttagtcctttttcccctttcaaatacataacatgtagcttcttcagtttgaaggtaagctcaaggatggatttgctcggagcaataatagcgaacatgaaaatggagccgggactgtgagtatatccagcaagaagtcgaagcatcgggttgacagtgaaaaaaaaccccatgttgacatctctggagtgattgattcagattcgcagaaatgtaattcagagcaaatccattcagctaatgggatagtatcccgggatgtcaaccatgatcacatagaaaactgcaaagttgaatcaaatgattttcccttgaatactatctctgaaacaagatatccaacagacaattggaacagttctcagtttgctctgagcaatgatggttcacctgttctcaataatcagagtactccacaaactggtcatggctatggagataatgatctaacctacattgattggcctgctattgataattttgaggacgtcgacaacttattcaggtattcagaatgtttcccttgctagcttctaaagtcttgagacagattaactttaattggtagtaaaaacacaatgctatccttctaatatacattgttttcctggaaggaggtgtgattccacgtacggtcagcagcaacttccgaacacggatgaactgtcatggattccttcttcagatgccatgtactcttctgatgttgctatgcaaccagggtttgaatcctcgtattctgattatggtatcctggatgacctctccgcattcaattgtacggaagataaatccctgacaacagctgatccttcaagtgctgtatgtgacgagcaattcgatgactcttatctgttcaatgagcaaaaacctgaagatgtttatggcgaacaggcaagtagaatgattgctaggttgaattaactggcacaaagcattatgcttttttcattcctttttcttcttttttttttaccataggcttaccaaagggatgcgatggaattgttgtccagcgaccagatatgcactgggcaggaaaacctagatatggtaatttgaccttttcaattagttgaattaaaaagataaccacattaaaatccgtattttgtcattggtgcgtttcgaatagtacaagtgtaactaagataatgtttttcatattaagttctaactttctctatctgcaaccattctcttggaagattggaaccaaaaaatgattgagttcagcattagcctctttcatataaagattatttttaatttgtgtcctatttcccttctgcacagaagccacttaaatatgcttgagcatgatcctacagtgcagtaactacctaactgcattagttgtcatcaatattcatagtgcattttttatgggattgtttctgtagtgcagctttaggtatgcgagtaggcctgtaacatcacctattactattacttaactttctcttggtagaatgatgtccattagaatggatttttcccagtaaatcataaattttgatttcttctggtttattgtgatgatctttacgcagattggaaatcgatattcatcggaaaatgccatggaacagcctgaagatcagaagttttctatagcttcaggttctcaactaagctcttctcagaatttattgaaccaaaagaaccacttggattcaacttcaccaagtaacataacttctgagtcctatccagaaagaaattgccagatcattccatctggggcttcctttgcagagagaaacttgaagggtattatatgtgcaaaattgtcatacggaatgctttctagtatgttttccttccttgtggtgtaattatcttattcaacgtttaaaactctgtattgagtgcagtgcagaagaaagtggccagttcggcatcaggacaacttatcagtgataatgtgactggacatcctggtcatcaaacattgacaagaagggcttcatatccttgtgagaatcatgaaattggaaagaggtccttaggaaaaagaggtttgggtcattctgatgttgcaatgggcacctcaatggtagttgatgggtccttcgtatcgtctatttcttctgataactcagttgaagagaacagctttcggcagcttcaggatgcagttagtcaggtatagcagtttattttctgcaatgtggtccattttatggttgtgcatgaactacatatttgatatatctttcctccagctcgtaatttaattctagcgacctttttctccttgatgttcccactactacctccttatgtcttgacattatagctcccttaaaaaaacaatcatagcctggggattgattacattcatggtctgtaatagcgcaacatagttataactaaagttcatatttgtacctgcatcttggatataagctatatttttgcattactgagttctttttccttgctgtttcagttggatgtgaaaacaaaaatgtgcattcgagatgggttataccgcctggcaagaagtgcgcagaataggcaagtcttcccaaatacaatgaacaacaatggagatagccacaatgtaaaggacatgcaaaatgcagaaacttcgggaaagtatgttgatttctcagaaaacatgctctttgtacctctctaattgttaaaaatatttatgagttctattactggcattttccagtgaaatacatttctcatatcgtttgacctgcaaacttgtctgtgctatccaaatatcgccacttatgcatgtttgaccacatgctactaccttatatcattatgaagtgttgaatcttatttaaacgaactatttttcttaattgattcattttgaggattgatttttttatgatgtgtttaaaaaaaagctcgtttagcaattctactgaaacacaacctttttgaccatttaggtgagatctaggttattgccttattagatgttacccttctattattcagatagaagattatttgttgtttacattacttaaaattttaacacaggtaagaaggccgctttgtctatatgttgcctttccactttgatattcctgttttgtaggtttgttgatcctgggagcatcgagacacagacaaatccaattgatcggtccatagctctgttgcttttccatcagccatcagagcatgtcactggagctgttgatgaagcggcttcactaaagtcacatgttagtttatgttccattttaactcactgctcggatttgtttgctgtcatacttcccatggctagcaaagtcatgagttctttgttgccatgcagaatgataaccaccaggctgctgctaaaaaccaaagagtgatgcatgcttcatctgtacattcaccaagagggcagggagaccccatggatgcaaaatcttgcagaaacaactgaagttatctcatgaagcttcaacaactgtgactgttaatattgtacttgttgctgcaaacctttctccgttttgatccgatcatgcagttagcagctgtgtagtgtgtactactactctagtcgattagtcaggtacaggcaaacttgtaacaccaatttaacaagttagattggcttttgaccattagctttgtatcttaattattgagaaggtcgtctgtgccgtggccattcgtgtctgttctcactcacattttgtgtaatctcaaacatagattttttttttctgttttcagctaactatttttattttctgaactaacaccatttcatgttgttaaaacaagccaactctgtacttctgttttaaatgattgctggggtgtgttacatgtc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0387900, RefSeq:Os03g0387900