Os03g0389900
| Gene Name |
Os03g0389900 |
|---|---|
| Description |
Cyclin-like F-box domain containing protein |
| Version |
NM_001056807.1 GI:115453342 GeneID:4333015 |
| Length |
7206 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0389900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:16165183..16172388 |
| Sequence Coding Region |
16165292..16165419,16166234..16166341,16166481..16166536,16166611..16166753,16166868..16167065 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:16165183..16172388 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcggggaacggccggatggaggcggcgctgggctgcctcgcggcgctccccgacgaggtgctctgcgccgtcgtcgacctcctcccgcccaccgacgtcggccgcctcgcctgcgtcagcagtgtcatgtacatactttgcaatgaggagcctctctggatgagcaagtgtctttcagttgggggtcttcttgtgtatagaggttcttggaagaaaacagcattgtctagacttaatctttgttcagaaaatgatgagatttaccagaagcctcgccattttgatgggttcaattccatgcacttatacaggagatggtacagatgttttactaatttgagtagcttttcctttgataatgggcacgttgaaaggaaagatgacctttctctagaccaatttcgcgctcagtatgatggaaaatgtccagttttgcttactaaactggctgaaacctggccagcaaggactaaatggacagcgcagcaactgacacatgattatggtgaagttccctttaggatatctcagagaagccctcaaaagataaaaatgaaactaaaagattatgttttttacatggaactccagcatgacgaagatccactttacatatttgatgataagtttggagaatcagcacctacactattggaagattacagtgtccctcatctatttcaagaagatttctttgaaatcatggattacgaccaacgaccagctttcagatggcttattattggaccagagagatcaggtgcttcttggcatgttgatccagggttgaccagtgcctggaatactcttctttgtggccgaaaaaggtgggcaatgtaccctcctggaagagtaccaggtggtgtcacagtacatgtcagtgatgaagatggtgatgttgacattgaaactcctacatctttgcagtggtggctagatatctacccaaatcttgctgagcatgagaaaccactggaatgcacacaattaccaggagagaccatatttgttcctagtgggtggtggcattgtgttttgaaccttgacatgacaattgctgtcacgcaaaattttgtcaaccaatcaaattttaagcatgtatgtttggacatggcacctggttactgtcacaaaggagtttgccgtgctggcttacttgctgctccagacaaatctattagagatattgaaaatcttcctagtataacgagtagattgaaccactctgacatggcctgtaaggaaaaaagactgaaaagttcagagcctataagaacttcaaataatgcaaatcagtgttctgcatttgagttctcagatgttcatgaaaacttgggggaccaagttttttcgtatgatatagatttcttatcccaattccttgagaaagaaaaggatcactattcttctgtctggagccctactaattcaattggccagagagaagcaagagaatggctacgtaggctatgggttcttaaacctgaattgagagaactaatatggaagggtgcatgtctagcaattaatgtagacaagtggtattcatgcttagaggaaataagtgcatgccatagtttaccaccaccttctgaagatgagaagcttcctgttggcacaggtagcaacccagtcttcattgtttctggcaatgtgatcaaaatttatgctgaaggagggttgggttattctatacatggtttgggcacagagcttgagttctatgatcttctgcaaaaacttggctcgccattgatcaaccatgtccctgagatcattgcaagtggctttcttgtgtacctggatggtgtctacaagacagttccatgggatggaaacggaataccagatgttctagctaaatactactctttggaggtgtcttatgcaaacggctcttttcctcttggattatggagcaagcaactgtttggattgagtaattcaactgatgctccagacagaccaatttgtccttacatggttaccagaaaatgcaaaggggatatttttgctcgcatacgtgataaattgaccaagactgatgttttgaatcttgcatcatccttgggagttcaaatgcgaaatattcatcaattaccccttccacatgtggaacacatatccaaatctgggaacgaagatatcaaagcaaaggaaaattcaatttctgatgtcactcatgttccgcctgaatggaaacaagtagtttctactctagacaggagaaagaaaagtataaagaagcatctaagtaactggggtggttcaattccacaggttctaattgagaaggctgaagaatatctccctgacgacatccgctttcttatcaagtttgttaaggacgatgatggtgattcagtctatgtggtaccttcttggatacattcagatataatggatgataacattctcattgaggggaccacagaaccaggaacttccactgattgcattgccgttgaagatctgaacaaaatggatgcaattcatatcattgatttcagtgatctgtccattggggatcctctatgtgacttaattccactgcacttggatgtattccgtggtgatattgatcttctcaggcagtttttacgaagctatcagcttccttttctgagagcagaatcaaataaagatatatacaagtcaatacaaaattctaaattcagcagggcatcgtatcgtgcgatgtgctactgcatacttcacgaggacaacgtcctgggagccatatttagcctgtggaaggatctgggcaccgcgacgtcatgggaagatgttgaacacttggtttggggagagctgaatcaataccagcagtcatgcagcgtgggcgaaattaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGNGRMEAALGCLAALPDEVLCAVVDLLPPTDVGRLACVSSV MYILCNEEPLWMSKCLSVGGLLVYRGSWKKTALSRLNLCSENDEIYQKPRHFDGFNSM HLYRRWYRCFTNLSSFSFDNGHVERKDDLSLDQFRAQYDGKCPVLLTKLAETWPARTK WTAQQLTHDYGEVPFRISQRSPQKIKMKLKDYVFYMELQHDEDPLYIFDDKFGESAPT LLEDYSVPHLFQEDFFEIMDYDQRPAFRWLIIGPERSGASWHVDPGLTSAWNTLLCGR KRWAMYPPGRVPGGVTVHVSDEDGDVDIETPTSLQWWLDIYPNLAEHEKPLECTQLPG ETIFVPSGWWHCVLNLDMTIAVTQNFVNQSNFKHVCLDMAPGYCHKGVCRAGLLAAPD KSIRDIENLPSITSRLNHSDMACKEKRLKSSEPIRTSNNANQCSAFEFSDVHENLGDQ VFSYDIDFLSQFLEKEKDHYSSVWSPTNSIGQREAREWLRRLWVLKPELRELIWKGAC LAINVDKWYSCLEEISACHSLPPPSEDEKLPVGTGSNPVFIVSGNVIKIYAEGGLGYS IHGLGTELEFYDLLQKLGSPLINHVPEIIASGFLVYLDGVYKTVPWDGNGIPDVLAKY YSLEVSYANGSFPLGLWSKQLFGLSNSTDAPDRPICPYMVTRKCKGDIFARIRDKLTK TDVLNLASSLGVQMRNIHQLPLPHVEHISKSGNEDIKAKENSISDVTHVPPEWKQVVS TLDRRKKSIKKHLSNWGGSIPQVLIEKAEEYLPDDIRFLIKFVKDDDGDSVYVVPSWI HSDIMDDNILIEGTTEPGTSTDCIAVEDLNKMDAIHIIDFSDLSIGDPLCDLIPLHLD VFRGDIDLLRQFLRSYQLPFLRAESNKDIYKSIQNSKFSRASYRAMCYCILHEDNVLG AIFSLWKDLGTATSWEDVEHLVWGELNQYQQSCSVGEIN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>110..237#1052..1159#1299..1354#1429..1571#1686..1883#1957..2156#2641..2740#2825..3406#3490..3612#4084..4164#4244..4551#4633..4872#5317..5401#5485..5662#6109..6283#6882..7038#agccgcgtggtctccgactcccctcccctaccctacccacgcccaccgatctgatccacctcgcccctcccctcctctccttgcccgcctcggcctccgggctccggcgatggcggcggggaacggccggatggaggcggcgctgggctgcctcgcggcgctccccgacgaggtgctctgcgccgtcgtcgacctcctcccgcccaccgacgtcggccgcctcgcctgcgtcagcaggttcgccgccgtggactctctctctctctctctctccttctgctgccttcccccacctccttttatttaccagtagtactactttgtttatgctgggttttctttctcagcctcccttttttgttagtttgctggaaatgctgaggttgtgatgcttcggtatgtgatgagtcatgatcgctctggatgactagtaaagtgtatctgattgcgaattttgtttgatcgtggtcagttataagagtggaaaatgagccaatttgcacaaattgtagtttaatctatttaatcagttgaactgattgaagagctgaagccatgttaaattattacacattatatgttttacaatatgatggtatatatggtatgtgtgtttggggaaaagaatcagagaggaaacatttacgtttcagtgagactcttgtggattttttttaggcatgggccatccatggaaaaaatgaatttgcactttaagtaatgtttaaaacatgcgactcatggaaaaaaatgaatttacatttaagtctaaattagatgtcagcagtttagtttttgatttccgcatgcttgttttggtttttcttctaggcagcactgtcatgccaaatgaatacactacatgctttctgtaattgtgagatgtaataaagtggttcatagggataaggaaataaatgctacactattaacttcttccctgaccttgctatgattatttgctttcttatagcatctgcgcagttgcactgccttgttgtgcaatagctaataggatgtgactgtggcattaacttaaatttcttgacagtgtcatgtacatactttgcaatgaggagcctctctggatgagcaagtgtctttcagttgggggtcttcttgtgtatagaggttcttggaagaaaacagcattgtctaggtatgtgccaattctatattgtgatgttacttttagcgcagagatatgtagttatgttatgctcagtatcttggaaaccatttgcatataactatgatggtcactaaaatgattacatactgtttgcttcgccttccagacttaatctttgttcagaaaatgatgagatttaccagaagcctcgccattttgatggtaagatacgtttccttttgttagcattcattttgcttatataatctgctgcttatacacttaatttccttcagggttcaattccatgcacttatacaggagatggtacagatgttttactaatttgagtagcttttcctttgataatgggcacgttgaaaggaaagatgacctttctctagaccaatttcgcgctcagtatgatggaaaatgtccagtaagaactggttaaccttttgtttacttcatattgaacaacgtagaatttgtacactcttctctttattgtgtttgtctccctgaaagcactttaattatgttgcactgataggttttgcttactaaactggctgaaacctggccagcaaggactaaatggacagcgcagcaactgacacatgattatggtgaagttccctttaggatatctcagagaagccctcaaaagataaaaatgaaactaaaagattatgttttttacatggaactccagcatgacgaagatccactttacatatttgatgataaggtgatcataactttagttttgcttgtgttgttgaagtttcaaaaagagaatcttagttgacaaatcattgcagtttggagaatcagcacctacactattggaagattacagtgtccctcatctatttcaagaagatttctttgaaatcatggattacgaccaacgaccagctttcagatggcttattattggaccagagagatcaggtgcttcttggcatgttgatccagggttgaccagtgcctggaatactcttctttgtggccgaaaaaggttaggatcattatttttacatatagtagttgttacccaacggtgctcctgagtcattggtgtgttcttataacacttttactatttttgcttttacaaaattatcgtggcaatatttacaccttgatatactgatattgattttatcatcaatcctgcaacttctgttttggatggaagaatgtaatgtatatgttggaggctcatctgtagatgatgaggcattcagatgtgcaccaaacccgatagtatttaagggttcaagtcgtagactggcgtccactaattttacacttttaggggcacattcagtgggaagtgtgtgcacctttggagaccctcagtcagtgggtgcgtgtagtggacacaagtgtgtgcttgtagtgtgtgttgaatgtgtgcacccacgccatgctatctttctttaaaaaatgttataaaactaaaatgaatagtccactaacagtgtccatctatttcataggtgggcaatgtaccctcctggaagagtaccaggtggtgtcacagtacatgtcagtgatgaagatggtgatgttgacattgaaactcctacatctttgcaggtgttttacttactactgcctttgctttccttcagacttctcttgtttctccatgttactcaaattaatttgtttgtcttgcagtggtggctagatatctacccaaatcttgctgagcatgagaaaccactggaatgcacacaattaccaggagagaccatatttgttcctagtgggtggtggcattgtgttttgaaccttgacatgacaattgctgtcacgcaaaattttgtcaaccaatcaaattttaagcatgtatgtttggacatggcacctggttactgtcacaaaggagtttgccgtgctggcttacttgctgctccagacaaatctattagagatattgaaaatcttcctagtataacgagtagattgaaccactctgacatggcctgtaaggaaaaaagactgaaaagttcagagcctataagaacttcaaataatgcaaatcagtgttctgcatttgagttctcagatgttcatgaaaacttgggggaccaagttttttcgtatgatatagatttcttatcccaattccttgagaaagaaaaggatcactattcttctgtctggagccctactaattcaattggccagagagaagcaagagaatggctacgtaggctatgggttcttaaacctgaattgagagaactaatatggaaggtgagctttgttctcacaattatatgaagttttatagtccttgaatttatgtgtatgcaaatgacatctgattggtcctgcagggtgcatgtctagcaattaatgtagacaagtggtattcatgcttagaggaaataagtgcatgccatagtttaccaccaccttctgaagatgagaagcttcctgttggcacaggtagcaacccagtaagtgtactcttatgagaatggttaagtttaaactatcgataagctattgtggcttgttagcactgcaaaccttaaagtaaccaaagcactgagaatatttatagtatcatattaattatatataattaactccagtaagtccatatgctacagatatcacaacagcgatgaatccataatttcatatacattttatttatattttttaggggcaaccaaaggaagatgcgctgcttatattgaaagcataaagcaagaaacagagttcattggccaagcatacaaacacagtaacagacaacacaaactaccaatttaaatgcattcggtccttctgtttagtgaagctaactcaagaagatttgtaggtggtacatagttgctctctatggtaccatgacatgttatagctcatatgtttgccggtcaatttggtaatttatttaacctatactctgaacttttcaggtcttcattgtttctggcaatgtgatcaaaatttatgctgaaggagggttgggttattctatacatggtttgggcacagaggtattgcatttcgtcctaaagcttaggaagttagtactcgttggatgccacacttctgattttttttttctggctgcagcttgagttctatgatcttctgcaaaaacttggctcgccattgatcaaccatgtccctgagatcattgcaagtggctttcttgtgtacctggatggtgtctacaagacagttccatgggatggaaacggaataccagatgttctagctaaatactactctttggaggtgtcttatgcaaacggctcttttcctcttggattatggagcaagcaactgtttggattgagtaattcaactgatgctccagacagaccaatttgtccttacatggttaccagaaaatgcaaaggggatatttttgctcgcatgtaagtttgtttacttgagggaagtgtggttctcctaattaattttagaaattgtacttaaaactttttaatttttttcagacgtgataaattgaccaagactgatgttttgaatcttgcatcatccttgggagttcaaatgcgaaatattcatcaattaccccttccacatgtggaacacatatccaaatctgggaacgaagatatcaaagcaaaggaaaattcaatttctgatgtcactcatgttccgcctgaatggaa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| External Link(s) |
