Os03g0580800

From RiceWiki
Revision as of 12:46, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0580800| Description = Lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein| Version = NM_001057087.1 GI:115453902 GeneID:4333323| Length = 6816 bp| D...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0580800

Description

Lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein

Version

NM_001057087.1 GI:115453902 GeneID:4333323

Length

6816 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0580800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:22066857..22073672

Sequence Coding Region

22067114..22067334,22067766..22068015,22069559..22069798,22070353..22070483,22073356..22073653

Expression

GEO Profiles:Os03g0580800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:22066857..22073672 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:22066857..22073672 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcacacccgctgtgaacgaaggagcgagcgagcgacgatgggttcttgcacattgtcctccggcggcgtctgcgtcgtcgtcgtcctcctgtgtttggctgcttgctgcctaacgtgcgcgcgcggcgctgtcccggcgatctacgtgctcggagactcgcaggcagacgtagggaacaacaactacctgctgcactcgctgctcaaggccaacttccctcacaatggcatcgactacccggggggaaagcccaccggcaggttcagcaatggctacaacttcgtcgatttaatcgctatcagtctcggggtgcccagccctcctccatacctctctataagcagcaaaccaatgaacagctccgtatatctgaagggtgtcaattttgcttcaggaggagcaggggtgtctaatctcacaaacctggcccagtgcatcagcttcgacgagcagatagagggggactaccacagagtccacgaggcgctggggaagcagctgggcattcctggggccaaggcccaccttgccaaatcgctcttcgtcgtcgccatcggcggcaacgacatcatcaacgacctcctgctgagtcccgtcagcgagctcctacgctcccgagatgagatcgtcagcaatctggaaaataccctcaaacgccagctgcagaccttgtacgaccttgggatgcgacggttgttcttcgtggggatagcaccgctgggatgttgcccgttgatacgggagctgaaccccaccaaggaatgtgatgctcaggccaactacatggcaactcggttaaacgatgcggcggtcgtgctcctccgcgacatgagcgagacgcatccggacttcacctactccttcttcgacacatacaccgcggtgctccagtccattcgttacccagaggcacatggctataaggaggttaaagcagcgtgctgtggcctaggagataacaacgccatgttcctatgctcgccggcgagcgtgtactgcgacaaccggacgagctacatgttctgggacgtcgtccatcccacgcaggccgcggttgagaagcttatgaagattgcgtttgatggatctgcgccgttggtttccccgaaaaatatcaagcagctcactgagagttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHTRCERRSERATMGSCTLSSGGVCVVVVLLCLAACCLTCARGA VPAIYVLGDSQADVGNNNYLLHSLLKANFPHNGIDYPGGKPTGRFSNGYNFVDLIAIS LGVPSPPPYLSISSKPMNSSVYLKGVNFASGGAGVSNLTNLAQCISFDEQIEGDYHRV HEALGKQLGIPGAKAHLAKSLFVVAIGGNDIINDLLLSPVSELLRSRDEIVSNLENTL KRQLQTLYDLGMRRLFFVGIAPLGCCPLIRELNPTKECDAQANYMATRLNDAAVVLLR DMSETHPDFTYSFFDTYTAVLQSIRYPEAHGYKEVKAACCGLGDNNAMFLCSPASVYC DNRTSYMFWDVVHPTQAAVEKLMKIAFDGSAPLVSPKNIKQLTES</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6339..6559#5658..5907#3875..4114#3190..3320#20..317#agcttcagcatacacatgcatgcacacccgctgtgaacgaaggagcgagcgagcgacgatgggttcttgcacattgtcctccggcggcgtctgcgtcgtcgtcgtcctcctgtgtttggctgcttgctgcctaacgtgcgcgcgcggcgctgtcccggcgatctacgtgctcggagactcgcaggcagacgtagggaacaacaactacctgctgcactcgctgctcaaggccaacttccctcacaatggcatcgactacccggggggaaagcccaccggcaggttcagcaatggctacaacttcgtcgatttaatcggtgagtatatatccatcatcatcgatcgatcgctgcgtacacgtacgtacggccattgtccacagcgtatttttatgtcaaactgttttcatgtgctatggacgctcgcaccctacgtggaggatatgtgtcgtcctagaatgtttaagcatgattgcaaatctaagtgcctcatcttttcgtttatacttatacttatcagctaaaatttaaattttcaatcttaaatttgaagttgattttgaggtttttcatcaaagtttatttgctagactttgcttttaaatcgataagaatacgtatataaaagttttattcataaattacttttcgtttttaaatatgccgtttggcttattccatgaataagcaatggtcacctaacacaataggtgttttcggtagtgcttgctattacagcagcgtgcaggcgacagcaactaaaaacggccacagcctagcactgcagtagctagcgtttcaatcagcccctatgttgacgagagtatggtttttttttttttagtttttcagttatcaccaaatgtattcatgtgcatatgcatatgtgttttaccgatatttatgtattgtattaaaagtgttactccctctgtattttaatgtatgacaccgttaactttttaacaaacgtttgacctttcgtctaattcaaaaaaattatgtaattatcatttattttattgtgacttgatttatcatcaaatgttctttaagcctaacataagtatttttgtatttgcataacaaatttgaataagacgaatggtcaaacgttagttaaaaagtcaatggcgtcatacattaaaattaaaatacggagggagtatataatattgaaatatacaaacagtaaaatgggattttcgcaggcaccctcctaagctgcagaggcaacccaaaagggaaagcgcttgtgcaacgcttagatcagaaaatccagcttagtaggaattatttaatgacagagagttcgagtttatgaaattaaaatgaaacttccggacatggggttgcatatatactggaacttaagtctaaaattaatggaatcttccggacgaattgtttgaatcaaatagtagagagctcgaggtttgggaaaaccagatctgagccccctccgtttaatttgtacgccaatatgaacatgttggcaggtccgatccagcactgactgattgttattctcacaactaggatggtagctcgcgcattcgcgcgggcattcatgaatcattgcttaaatgtttcttttaagatatttgttagtttacaatatgtaaatttgattcatctatataagcacctatctataaagttaatcatctttatcatttaagaagacgtaggtcttaatccaaattaaagtaaggtgttgtttttatttttaattaaatgttttgggctcttatttaaaaaaaattctcaaaaaggttatttataataaatgtgttttattccttcttttaattggttcacaattgatgcaattttttatacgtacttatgtatgaatcaataaaaatatagagtagatatattctagacctcgcttcctataatatgtgtgatctatatatttgtttaaatacatttagtcaacccgagtgttaaaacccaaatttaatagtaagaaatataatattcaaagccaactatcttctgctatggcatagaacagagagaagtctattgatatgtagtcacttaaaaatgatgaagtggttatgcatggttatctcaatttaagggaaagttatgaaccacaatggttctaagaaattataaggttttctagaattggttcattttacacttttgttttattttatacaaatattattttaagttcaaatgtatgatatgacaaatagtgacatcattacaccctatgtgtcaactttttttaaaaaaaaattatcaataagcaagtaagattggtatagattttcattatttattaataaatggattatatgggacataaggctatggtaaattgatgggtttgtatactccaatatatttgcattatgtgatagataattcatttgggaacgttttatatataatgtgtgaggctctacacaaccattgtgaatacgatttgatggctaataatacatcatagagagagggaaccgaatgggtagagggaccgatatatacatgtatgtactaagtacgcatgtacatgatggaagggaggacgtggcacacgtgggcctttcaattgtttaataacaaaaatctaattagtccaccatgttttatggaaaatcaatggttgtgaatggacttgaattatttattttcgtttttcatctaatctaaataaaaaagaaaaaaatagaaaaagaagtagggtgggatgatacgtacgtacaaacgtacatgctgtacaggtacacggaccgagggataatttaagagagataaattgatttggtaattttgtactcgcaagatagatctaacggtggttgatttggtaattttgtaaaatagatctaatggttgaaaataatgggtctacccgattaaaagaaaatcaacggttagatgttttgttttttacttagaatttttaggatttatcaatacgccacgtggcgactttggagcgtttttagaagcaccacgtggcagcttgagagcgtttgtaggaagtttcatggacttttagtatataaaataaaatagaagatagatagatcttttgaaacttgacattatttttgctttatctctactcaaaaaaaaatttcgttggtgtgtgtgtgtttatatatatatatatatatctctttttgttgtctttttttttaaccttttttccacattgcagctatcagtctcggggtgcccagccctcctccatacctctctataagcagcaaaccaatgaacagctccgtatatctgaagggtgtcaattttgcttcaggaggagcaggggtgtctaatctcacaaacctggtagtactacaacttaatactagggtcgaaataaagaaaattgagtgatgtttcggtgctctctacctataatattatactaccagtatattattataggtaaaatagtaatttactaatacaataattatgatttactttgtcatttatatatgttttttcccggctaaatatatttcatcgaaaaagccaaaaaagagggaaaaagtttagttactgctaatgatgattatacccttttatacattttttgttacaatatacccctccacatttctattactgctaatagtggtagtagtacaaataaattttaacacttcgattaaatgagatcaacggttcatactgtcttccaataataatagagagcaccacactgaggctcaagaaaattttgaatatatttttagtgtaacacgaacagaatatgtatgaatcagaaatttaattacaggttacatacttattaatccatcaattaattattacatgagtatttaattctatattaattattacatgagtatttaattctagtacggcgcatgcaggcccagtgcatcagcttcgacgagcagatagagggggactaccacagagtccacgaggcgctggggaagcagctgggcattcctggggccaaggcccaccttgccaaatcgctcttcgtcgtcgccatcggcggcaacgacatcatcaacgacctcctgctgagtcccgtcagcgagctcctacgctcccgagatgagatcgtcagcaatctggaaaataccctcaaacgccagctgcaggtacgtatacttatgcttgcaaaacgatcttgcaattaaggtcaacgtaacatcaggccgggtttttgcagtttcggtttcgaaacagtaatttcagacacccccaccggccggctggaccaaaattttcgaattttctcaaatgtttatggatttagtaacatcacatcaccttcgttgctctccatacaattctccatgtgcttactactatctccatttcattttataaatcattttgatatttttttttcatttcaaactttcttaagtttgaccaagccttctacctattatatactaaaattttattaaacttcttatgaacgcttctaagccaccatgcgtcattgcttccgagtcgtcacatggcactttaataaaatagagtaatataatcatcgatttttatttaatttggtgtaccattattttagatcaataaatctatttaaaaacaaaactaccttgatctatatatattaaaaaaaacaaaaactcccactgtcccagctgcctaaatgcggcgtacacatgtatgtatgctccctccgttactatatcgctctcctctttctgtcctcgtaataattgaaattaaaattactttcacggggaaaaaaacccacatgtagacctcgacctagctaataagtccagccagctttccctctatccctttatccattaatatttatagtctattaaacaacatacaaatatttctaaaccactacgtggaactacggaattaaaaaaaaaatttgaccatcggtttctaattgatttgataggcacattattttaggtcgttagatctatcatttttcttaaaaaaagcatcccaaacctccatccccagtaaacatcctataagcatttctaaatagatacgtgtactctaaaattagataaaatcttaatattcaaacattttaccaggacaaataaaattgaaatatctaaagttttatatagaatctatcaaaaaattggactttttggtaaatttttttggtacgatatccttctggggagacgaaatacccaaaattttctcattagaatcacatatattattttaacacagtattttctcataaattgaaaattgcacggtttcaaataattttagtatagaatttatatgctgcaatggtaataattagaaaaaaaaatcataaccaacgttcaaaacacatcaaataagtttaattttagtttaggatatagtaaaagaatatttaaattaacagtcactctaacatgaacattcataataaaacttcacgcacattaaataagatgcccacgtatatatgcgggctaccttcgtactttatagaaaaaatttacaatacctaaaatgccaaattagtttatgtaatatagaattcaatatattttgttaatttgtttgttttctattggaaatgctactatattttttttataaaattagtttagacttaaataagtttgataaaagaaatcaaaacgacatgtaatatgaataaggagtgcaaatctatcatgattttagaccttgtacgaccttgggatgcgacggttgttcttcgtggggatagcaccgctgggatgttgcccgttgatacgggagctgaaccccaccaaggaatgtgatgctcaggccaactacatggcaactcggttaaacgatgcggcggtcgtgctcctccgcgacatgagcgagacgcatccggacttcacctactccttcttcgacacatacaccgcggtgctccagtccattcgttacccagaggcacatggtacgtatgtactccttccattttaaaagtatagcaaacctactatactccctcttccactttttaatatataacatcattgttttttaacgtgatatttgatcattcgtcttatttaaaaaatataaatattatttattttgttttgacttattttatcataaaagaaattataattcgaacttatcctttcacatatttatactaaaattttaaataggttgaatgatcaaatgttacgtgaaaaagtgaattgtgtcatatattaaagaaaaaggaggtagtacatatattagacggcaccggggtagtactataaatctatacaggaattagattactatatatattaaggtgaagagaatatggtttattaggattaagattctccacatttgtcactttattcagtgattttgtttttttaataggctataaggaggttaaagcagcgtgctgtggcctaggagataacaacgccatgttcctatgctcgccggcgagcgtgtactgcgacaaccggacgagctacatgttctgggacgtcgtccatcccacgcaggccgcggttgagaagcttatgaagattgcgtttgatggatctgcgccgttggtttccccgaaaaatatcaagcagctcactgagagttaggcattatataaagccaagagtacgtgtctactggtactactatactatactactattatcaccactggagaaattttgaatcattaatttaggagttatatttagtgccagtaactaacgtggtaaagtaaacaagggatttgctagatttgaggtgactgatattaatttgtaaatttacagtctcctaaaattacacattttgcaaagtttaaaattgcatagctatacaatgtgaaactttacttattttaact</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0580800, RefSeq:Os03g0580800