Os03g0711200

From RiceWiki
Revision as of 12:55, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0711200| Description = Similar to Phosphatidylinositol 4-kinase alpha (Fragment)| Version = NM_001057589.1 GI:115454906 GeneID:4333883| Len...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0711200

Description

Similar to Phosphatidylinositol 4-kinase alpha (Fragment)

Version

NM_001057589.1 GI:115454906 GeneID:4333883

Length

6453 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0711200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:29450746..29457198

Sequence Coding Region

29451047..29451305,29451389..29451550,29451628..29451836,29452524..29452664,29452910..29453105
,29453241..29453413,29454129..29454176,29454335..29454412,29454560..29454826
,29455723..29455876,29455962..29456098,29457073..29457075

Expression

GEO Profiles:Os03g0711200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:29450746..29457198 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:29450746..29457198 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgctggatcagaaccaccctgtctggggctcagtggataactatacaactgtacgggaaaagcgtaaacaattacttcttatgctttctcagaatgaggcagacagacttgaagtgtgggcacaaccgataaatacaaaagatgcagcaacatttcgtggtaaaattagctcagataaatggattgatcatgccagaactgcttttgctgttgatcctcgaattgcattctcaatgattatgaggtttcccacaaactcggcattatcatcagaaattacacaattggtacagacacatatattggaactccgtacaattcctgaagcattaccctttttcatcactccaaaggcagtagatgaaaattcatcattgttacagcaacttccacattgggctccatgctctgttacacaagcattggagtttcttacccctccttataaaggacatccccgtgttatggcatatgttcttcgtgtcctggagacttacccacctgagactgttaccttctttatgccacagttggtacagtctctcagatatgatgatgataaattggttgaaggatacttgcttggagctgctcggagaagtaatatatttgctcatattttaatatggcatctgcagggagaatgtgttcccgatgaacctgggaaggaagcagctgcaccaaaggccactgcattccattccttgcttcctgccgttagggagaaaattgttgacggttttactccagaagctcgtgacatgtttgaaagagagttcgaattttttgacaaggtcacctcgatttctggtgttctttttcctcttcccaaagaagagcggcgagcgggtattaaaagggagctggagaagattactgtgccaggtgatgatctgtacctacctactgcaacaaacaagtttgtacggggcattcaagtagacagtggcattcctctccagtctgctgctaaagttccaataatgattactttcaatgtggttgatcgtgatggggacccaaacgatgtgaagccacaggcttgcatttttaaggttggtgatgattgtagacaggatgtgctggcactccaagttattgctcttctaagggacatatttcaagctgttggattaaacctttatctcttcccatatggtgttttacccactggaccagagcgaggcataattgaggtggtaccaaatactcggagtagaaatcaaatgggtgaaacaactgatggtggtttattagagatatttcagcaagactatggccctgtaggttcaccttctttcgaagctgctcgcgaaatgttcatgatcagtagtgctggatatgctgttgctagcttgcttcttcagccaaaggatcggcataatggcaatcttctctttgatagccacgggagactagtccatattgattttggatttattttggagatttcgcctggaggaaacatggggtttgaaagtgcacatttcaagttaagccatgagatgactcaattgcttgatccatctggaacaatgaagagtgacacttggaatcagtttctgagattgtgtgtcaaagggtacctagcaggaaggagacacatgaatgggattattactaccgttaatttgatggtggacagtggcctgccttgctttagcaggggagaacctatcgctaatctgcgaaaacgttttcatccagagatgaacgagcgtgaggctgctaattttatggtcagaacatgtgtggatgcctacaacaaatggactaccgcagggtacgacttgattcaatacttgcagcagggtattgagaaatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLDQNHPVWGSVDNYTTVREKRKQLLLMLSQNEADRLEVWAQPI NTKDAATFRGKISSDKWIDHARTAFAVDPRIAFSMIMRFPTNSALSSEITQLVQTHIL ELRTIPEALPFFITPKAVDENSSLLQQLPHWAPCSVTQALEFLTPPYKGHPRVMAYVL RVLETYPPETVTFFMPQLVQSLRYDDDKLVEGYLLGAARRSNIFAHILIWHLQGECVP DEPGKEAAAPKATAFHSLLPAVREKIVDGFTPEARDMFEREFEFFDKVTSISGVLFPL PKEERRAGIKRELEKITVPGDDLYLPTATNKFVRGIQVDSGIPLQSAAKVPIMITFNV VDRDGDPNDVKPQACIFKVGDDCRQDVLALQVIALLRDIFQAVGLNLYLFPYGVLPTG PERGIIEVVPNTRSRNQMGETTDGGLLEIFQQDYGPVGSPSFEAAREMFMISSAGYAV ASLLLQPKDRHNGNLLFDSHGRLVHIDFGFILEISPGGNMGFESAHFKLSHEMTQLLD PSGTMKSDTWNQFLRLCVKGYLAGRRHMNGIITTVNLMVDSGLPCFSRGEPIANLRKR FHPEMNEREAANFMVRTCVDAYNKWTTAGYDLIQYLQQGIEK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5894..6152#5649..5810#5363..5571#4535..4675#4094..4289#3786..3958#3023..3070#2787..2864#2373..2639#1323..1476#1101..1237#124..126#aaaagttttgctcagagagaggcccaatccgtgtcaatatttgtccattgtctacaaaatgagcgccccagtggttctgctgattctgctccgaagtcacagggacgtgaaggtgaacccaatatggtatggtgcaacttgcatctttgttccctttttgtttctttgcacttacccacctaaataactatcaattgtatggcgtagctggttgggtatggttcaaagaccatgggtaaggggccatagggcttgcctcacatctagcttctggcaaagcttcttgctgacgtggtagagaggttgtcgggcttagttcaacttcaggtctcattgcttaaaccacaatgggagtacattccttttatgggagattcccgtgataacagtacacttaagaatacaatttcaacttcccttacaagccatatctcaaagactaacttcatattaaactgataattttcctaagtaattgatagagtactaatttaactaacccctttgttaggaaacttatttatttattcaaggaaataggaaatgtagtatgctggtatttttcatgcgcagtaccagctaccataatactccgtataatttatcgccacttgttgactgcttacagtacagaccactagtgatgactgtcattggtatgtggatgaggtccaagtatgttgtggcctggtgccgtgaacccatggtgaggagataaagaagagatgagtaacaggcagatagagaacaagataaacagggcttggcaagaggggaagatgcacaagtgagacggagagagatggagataaatggcatttagtttgttcttctatggtttaaactgaaggataatggcttgattcataggagagtcctgataactagttgattattgaatccaactaatagagaactaacaggtaacctaagggatgaatatgcctagtctgctgacacatgctgatgcctaatgctgctgtcgctgccctccgtgtgcattgacctaaaataattgccatgaaaatcacttctcatccatcttcactaactacttttaaaacttttctcaccttgtcgcttcattcatttatttgcagctggatcagaaccaccctgtctggggctcagtggataactatacaactgtacgggaaaagcgtaaacaattacttcttatgctttctcagaatgaggcagacagacttgaagtgtgggcacaaccgataaatacaaagtaactatcgtcgtgatttttttttatttattcttgactctgctttgagttcaaatttacatgtatagcatgttatatatggcagagatgcagcaacatttcgtggtaaaattagctcagataaatggattgatcatgccagaactgcttttgctgttgatcctcgaattgcattctcaatgattatgaggtttcccacaaactcggcattatcatcagaaattacacaattggtacaggtatggttcttgctgcgttcagctgctaccttctcagacaacagtttctacccatttttccttgtcatgcaagttctgtttcaaaatctatttattcttgtttatctttaggggtgttttcaggctttcagctacagcaagagaactcttggtgcatttcttcaattaactttaattcaatatggcatatttgtttatatttagaatatattaagatgccatcttcaagaatattataaagtaatctaaaagatatagcatcataaatccccttaaagcaaccatgcaaccacattgaggacagtaattggaggtgtcaaaaattaaaataattttagggtgctattacggtatattttacccctatgggcatgtctactggtaagtcgaagaatgatatgacaactggtgcagctacgagagttaaatagtaattcagtctattgttaagaacggtagctaatgtaacatactattgctttccgatattgccagtttaatttttttttagtgatattttcagaatgtaagggtagaaccaaatcttcttttgacaacagtgtgttgtgcaatgtttgtttattttttgtttctgctatgtcttaccttaaatactggaattttggaactagcggatgctctcactgtgttgaacacttgaacttccacttgaactcatgtaaccaaataaacagtatctgagtgtagtaaaagtcagattttctcctggcttattttgttagagtcgaggtagtaggtgtatctgctgactgagtgatagtgttttgtgtttgattttttttcgtgtatttcgtaaattgttcaactgctattttctttcagtaagaagggtgccatatgctgttatgtcttacaatgctctcttgtccctgtagacacatatattggaactccgtacaattcctgaagcattaccctttttcatcactccaaaggcagtagatgaaaattcatcattgttacagcaacttccacattgggctccatgctctgttacacaagcattggagtttcttacccctccttataaaggacatccccgtgttatggcatatgttcttcgtgtcctggagacttacccacctgagactgttaccttctttatgccacagttggtacagtctctcagatatgatgatgatgtgagaatttcttccagtgatatatatttattatgttatgaatgcaccctaggaaaacatttattgcttcaatctgcgcccttactttattactcgtaaagaatgtaatgcattcgtctcattttttcttgcctttgaactcatcagaaattggttgaaggatacttgcttggagctgctcggagaagtaatatatttgctcatattttaatatggcatctgcaggtaaattttattttatttttattctgttataccatgttatcatattctactctattcaaatataaaaaaacatgtttcattcttcaatatatgcctagtgcgatgttcgataactgagttatttgaatatctaattgagttagaaatgtaaattgcagggagaatgtgttcccgatgaacctgggaaggaagcagctgcaccaaaggtatccatgttttaagatttatgtacctttgcttcgactttcatattctgttgcatcatcaacaccaccttgaaaaagaaaccatgtctttttttttcttgaccaaacatgtcattctattatatcccttgtctgaaagtttattgagaagagtggtgctttttaaagacaaagtcatatatcttcataagttaaaaatgagttatgtttgtttgataaggcacatggcaattacttgttgaagcctttatgcctttttagtttttaccccattttttaacctcacggtgaagcaccatttttctttcttttggaactctttttttttttgtgatggtaattgataatctgagtttccaaaagttttctagcccttcatggaactgtactattgtttctgtttgtattagttcattaataaagggcttgaacaattcattatgcattattcttgtgcgtatgaaaaacctcatatcgtagtattacatttaaacttgcggtaggcatgatgcatttgaaacatgagattatttgtccttgtgcttcttgcccttccaatgtgatgcttttctgactaaaatggtaactttgacttgtaatttgttcatatgaaatgttttataaaactgtggcaatgtcatacagttttgtttcctgccctccttcaagctcgaagatatgcaatgtggtgttaatagctccaattatttttcaggccactgcattccattccttgcttcctgccgttagggagaaaattgttgacggttttactccagaagctcgtgacatgtttgaaagagagttcgaattttttgacaaggtcacctcgatttctggtgttctttttcctcttcccaaagaagagcggcgagcgggtattaaaaggtacaaagtaaaaaccactgtaatgtttcattgaagatcaagagctttctactgatataatttcaatcttctcatgcgggttccaattaaatatgtccttattagtatctcattatcctaaacttgtccttgcagggagctggagaagattactgtgccaggtgatgatctgtacctacctactgcaacaaacaagtttgtacggggcattcaagtagacagtggcattcctctccagtctgctgctaaagttccaataatgattactttcaatgtggttgatcgtgatggggacccaaacgatgtgaagccacaggcttgcatttttaaggtaaatatatcttttgcagtgaaatctcatggttgtaacctatggatataacgagttatggagctataagtctcaattcatgtttactatggaatttcagttcataaattaactgaacataaattaaaacttgcattggataagtaaatctattgaaggatgcagcaaatgtggcaggaaccatcttagtgtctagcatccaacgtgcttcacagttgacatgagcattttctatgttacaacaggttggtgatgattgtagacaggatgtgctggcactccaagttattgctcttctaagggacatatttcaagctgttggattaaacctttatctcttcccatatggtgttttacccactggaccagagcgaggcataattgaggtaagcatccatctgtagttatttagttccttgtatctatatggactagggatcacttattactgatcttgaacagcagttaatcgacattttattacaccgttatgtcatgtttagcagtataatatccctgcaaatgtgaatagtgaattcaacaagaaaactttactttgttattactccctccgtcccataatatagctacctttctagttcaaattaggagtatgttatatttgacaatagaacaactaaaatgagcatggttcaaaacatgctctggactcttttctccaaatttaatcaagtgatctctaatgtctaagggcctgttcactttgatgccattttcaactataccattatttttggcaaaattgcccaaaaaaaatgtctatatttagtttgttgccaaatttggtaaatacataagaaatcctgccaaaatttggtaaggtttattttggctacaatctgaacaggccctaagatattttaaaaaaacaactctaactctggtttattttaaatgaaatatttggagctaccatttttatgacaagttgacacctaagtaatgagtcaagtctacgtctttcatgactgagcaattgtcgttgtgtatttgttgtttacctgttctattggtttcctcttgtcaaccttcttgatctgaccacactgcaggtggtaccaaatactcggagtagaaatcaaatgggtgaaacaactgatggtggtttattagagatatttcagcaagactatggccctgtaggttcaccttctttcgaagctgctcgcgaaatgttcatgatcagtagtgctggatatgctgttgctagcttgcttcttcagccaaaggatcggcataatggcaatcttctctttgataggtacgatttacttttctgtcctaattgtaatgagtaaacctggaattacctggttaatcatcatcttgcttgtgcagccacgggagactagtccatattgattttggatttattttggagatttcgcctggaggaaacatggggtttgaaagtgcacatttcaagttaagccatgagatgactcaattgcttgatccatctggaacaatgaagagtgacacttggaatcagtttctgaggtaaatattttccatgcattttcttctaattaactagaattggagttgttgcacatgctctgagtcaagcattgttctttcagattgtgtgtcaaagggtacctagcaggaaggagacacatgaatgggattattactaccgttaatttgatggtggacagtggcctgccttgctttagcaggggagaacctatcgctaatctgcgaaaacgttttcatccagagatgaacgagcgtgaggctgctaattttatggtcagaacatgtgtggatgcctacaacaaatggactaccgcagggtacgacttgattcaatacttgcagcagggtattgagaaatagtctatttctccttttgtaaatggggggtcgtgtacatcaattgtatgtagccactaattcttttatgtagaattatgttgttgagcggttcattgtatggtaagaacggtgatttcaagcgactaacagagggtgtatcagtgtaagttaaacagtgcctattcatttttttgttccttttgtaagacagccgagctagtaattctattggatcgcgtcttacagaacgaatgggtctttgtattggcatgtggatgtattgttatcttcttttcgcgaatatgtgaacatctttttcact</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0711200, RefSeq:Os03g0711200