Os04g0353600

From RiceWiki
Revision as of 11:05, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os04g0353600| Description = Similar to Fatty acyl coA reductase| Version = NM_001059073.2 GI:297602527 GeneID:4335559| Length = 7442 bp| Defini...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os04g0353600

Description

Similar to Fatty acyl coA reductase

Version

NM_001059073.2 GI:297602527 GeneID:4335559

Length

7442 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0353600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:16903586..16911027

Sequence Coding Region

16903628..16903706,16904810..16904913,16905524..16905751

Expression

GEO Profiles:Os04g0353600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:16903586..16911027 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:16903586..16911027 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggagacaggaggcatagcggagcgtttcagagacaagactatactcatcaccggcgctactggcttcctgggaaaattgctggtggagaagatactacgagttcagccggaggtgaggaagctatacctgctagttcgtgctccggacgccatagctgccgaggaacgtgttctcactgaggttgtaggaaatggtctatttgatgttctgcgagaacaatacggtgctgggttccactccttcatcaaggaaaaaatatacgctctacctggagatgtgacgcatgaaaactttgggcttgagagttatgacatcctgcagttatcccagaaggtagatatcatcgtcaatggagctgcaacgacaaactttatggagaggtatatatatatatctcttgaagattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>METGGIAERFRDKTILITGATGFLGKLLVEKILRVQPEVRKLYL LVRAPDAIAAEERVLTEVVGNGLFDVLREQYGAGFHSFIKEKIYALPGDVTHENFGLE SYDILQLSQKVDIIVNGAATTNFMERYIYISLED</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>43..121#1225..1328#1939..2166#gacagagaggttgcgagctctaggaagatatatcgatacgccatggagacaggaggcatagcggagcgtttcagagacaagactatactcatcaccggcgctactggcttcctgggaaaatgtactctctctagctaaaatatgtcttcatattatgtgtgttcatctctagttttggtgattttcatttcgcatatataatgtcatatggcttcattgattggtatttatacattatctcaccgtgggcagtatataaacttttcgactgatcatcatcgatccagagtatatagaaagctatcattttctgcaaactcgattgcacgttctggcgtggagttggagttgtaaaaaataatccactcaatagtgtaaataaaatgttattgggccttagtgtaaaaaaagatgaagctgtttatactttgcagttattggataaggatgaatacactcgaccccatattaattggtaccgattagaagcccaccatagatgttggttatcctctattaattgacaccattggaaatttatcataggtgtcagtttcatagctggtatcaatgtaaaggtgtgtggtcactgaactataggtgacagttcagttttaggttaacaaccgacacctatattatatatgttggtttttttttctaatctgtacctatactatacgttagaaaagatgtcggtttcggttgaactggcaccaatgggccatcccataagagggattctgcagtagtgcttgacgacatgtttgtaaagtgttttacattacaaattagctagaaacattctgctttgaggaaaaagtaaagacgagctaccttgatgttaatatgtatagtgagaaaaaaatgacttgtagactactataaaaaaatgttttcgtagatgccctccattttgctgcatagagggttttctaggccacaattctacatgtggatgggttaggctatttaattttttgagatgattgttttaacatactctctataaaagtataatattttcatagacggtcggtcaaagcctgttgatctaaaagcacataatgtaaattcccttttagcctgctataaaaaagctttaattttattggtggaaaataattaatgatgtgggtttttcttattttcaaaagaacttgtatgtccgtttgtacatatgtgaatgctacacatgtttattactgtctacgacgtacgcagtgctggtggagaagatactacgagttcagccggaggtgaggaagctatacctgctagttcgtgctccggacgccatagctgccgaggaacgtgttctcactgaggtacaagtacaaacgagcccacagatttttctcagtttttgaactggttctggacgttgaaatgtgttactatcctaacatatatatacagcttggctaatcttaattaattaattcgtagtaacagaagctggatgcttacgggtccatggaataagccaaacggcatatttgcaagcgaaaaataatttgtgaataaaacttttatattcgtgtttttagcgatctaaaagtaaaggctgaaaaataaacttaaaatcaactccaaatttcaggttaaaaatttaaattttggctgataagtataaacataagcgaaaaaatgaggctgttaatttcattgccttaatgaaatctctactgtcagcttaccggcaaaaggcatccaatatagtattgcacagtatattacaaactttgaaaactgaatttaagaaacttccatatagaatgttttccaaaagtggcaccttttatcggttaagaagcatgcccacgataatccaataggcagtagctaaaaacaagtgcaccttatgtataatatagccagagcttcggtgaaataaataagaggattaatcaaactggtttacttgttgccgtataggttgtaggaaatggtctatttgatgttctgcgagaacaatacggtgctgggttccactccttcatcaaggaaaaaatatacgctctacctggagatgtgacgcatgaaaactttgggcttgagagttatgacatcctgcagttatcccagaaggtagatatcatcgtcaatggagctgcaacgacaaactttatggagaggtatatatatatatctcttgaagattgatatataacatcgttctcgtggggatttcaatttgttatttccttgtgtactgcctcataatctaaagatgtttgggttgctgaatgaaacaaatgtgtcttcaatgcataattttatttcgtgatctcatatgcttttcatagcatttaattattgaatgatgttatgaaactatttaattacaatgaggtttaatttatttccatttccaatgcataggatgtgaaataattcagtcccaaagtggtttcattaattctgtttataaggcatagttaaatgtgtaaaccaagtttcatctagatgaaactcatttattctatctcgacatgtcgtaagtttaccctgtatgacatttcatttagtgagattaaaaccctacaacatgacatatcttcacatttgtcagaatataataattgatagaatacgatccgatgaccatgaatggatctctttctactgcaaagcaatcttgtcaatttgtggagtctaatgccttatctctgaattgaaccctcccctttttctttgctgcaatgagagggtaatgcaaggatccgaattaagaaagatatttggatatgtgatggagatctatgagctgatcaacgtctccgcaacgcaatcgatcagaccaattagttgaacgcatgagaaggccgggctatatgtatgtacctggatatatgtgttattctatattatgagtcgaatgatatgaattctagggttgagtgttggtgaagctgtgcctgtacaatcgcaactaatccttaggttgtaaagagcgatggaggtcaacgtggacgctatcccgatggcaggagcacaccactccggccatcgtgtgtggcactcccatgatctaatctgctaaattacatccatgtgcctacgtgaatgatgggcattgtgtatctagacgatgagatgagataggccttagatggttttagaagaacatagtaataggcttataatgacgaaggttataaaaaatcaacagatatgattaaacaattttcttaattaatggttagatctttctgattaacgtgaaagctcattgaaagtacctaattagtataggtatagatatgccataatctcattggatcactgtgtgcaggtatgatgtcgctttagcaacaaatacaacaggagtcgtgcatttatgtcagtttgcaaagcagtgtgataacctcaagatggtgcttcatgtttccaccggtaagcttatataaatacttcatctaccccaaaacagaccaaataatagcatatcacctaacagtaccatatatctgaataggacctatctcatcttatcctaggatctattttaagacagaggagtagtattcaacgttagaacatgcaaaacctctagttctgtaaatgggagttcatcacagattttcttgattagttaactactaccgatagaaatcagttaattttccaccttaagttctataaaccgtcatttcctacatgttttacacttcattcctgacatctttgccaacacatcccaacctacatgttccatatagaatagttcggaacaaaatttcgaaaactttagtatccctctatagggtactcctttggttagtattttttgtcatgcaaaatttattctaatttcagttttaccgctcaaattttgagcaactttcagaattttgattctcagtcatcataatgttttatttcctcaatacaaaaccctcgtcccaccactatataaccatctcctaccccttgcctctgtaacaacctattttccaaaatccacaatagcttagctcagctcttacagtggccagctgatgcatagcatcacatttaaactcatggcttcacttcatacaaaaggttctgacttcacctatccgtgcatgcatgacgagtccagccaatatcacaccacggcccatgtcctccatacaaccacagctcacttccttaccaccaaaagtacacaactctgattggcttaccatgtgatccctcaaatcttatcgacccacttatgttttaatatgccctctctgtgtggcaccaccactcatacaacatctttggctcttccaacctttccagtatcatagtttaccctaagcaacaaaatcctaatattagtgatttgcttgcaaatccaccactgcaccacaaactggccaatgtaaaacgaaagtttctatgagcaacacttttatagtacattgtatcacacacacacacacagatacacacacacacacacatatatatatatatatatacatatatatatatacatatatatacacatatacatacatatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacacatacatatacatatacatacacatacacatacacatacatatacatatacatatacatatacatatacatacatacatatacatacatatacatacatatatatacatatatatatatatacatacatacatatatatatgtatatattgtgtcaaagaggcgatgttctgaatttgctatcaacagcttatgtagccggtgagcaagcaggccagatattcgagaaaccattccagatcggtacagcattacgactggattaccagttggacattgaagctgagctgcaactagtggacaagatcaagtcagaactcggaataaacagtgacagcaagttagaaaaaataaccatgaggaaacttgggcttgaaaggttttaaataaagaatctttttaatttctcatagctttcaaataatgccatgggtatgaataatatgatataatgatgatttttgtgaagggccgtgcactttggttggccaaatacatacacactgacgaaagctatgggggagatgttacttcaacaattgggacaagaccttcccgttgtcatcgtccggccaagcatgataacaagcacttttcaggaaccaatgcctgggtggatagaacaaactaggtggatatattctattgtgttatacgtcgttgttagttgctacacttggttataaaaaataattgtctaatttattaactccaaccctttgaccttacttgtctgcagtataattagatgctatttgagaaataattaccttttgagaaatttagggtccttaaggagttacttgattgtacaattctatttttaaatgtaatatttttttgatgtcttaggtactaggagttatttttttttaaaaaaaatcactcttgcaattttatttgcagaattatttatcatttgtaaaagaaaacatatattgtgctgagtgccaattatttgttttttgtcttactagtccaattaattgaatattttgatgctacaaacttttattgcaggacaattgatgtcatatttgttgcatacaatgaccaaacccttccatgttttatatttgatggtagtgttatatttgacctggtgagtatttcccaaccacaatatacactatatatatatatatatatatatatatatatatataggacactcatatggggcaccatggtttcaaatgcacaaaatcacttaaatttttcaaaattttcaaattgtgagtatatacctagttataagaattcgattcatacctatacctatcaacaaaacaactcaaatttaactttatttcacaatccatgattacatacctaactaattatatgtatggatgctatatacctagaatcaaaatctaacaaaaacaagttcaaattcagttcaaacttgctttgaactagttagtaaagtagttaatgttaatacctaagtaattgaaaaagtttcatactcatttgaattgggtatatactcaatttcaacaatggtgcccgggcaccatggagcaccaaacaaatttactatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatggttatttatcgaaatttgtaaattacacagatacctggggatatggtgatcaacgcaatgatggcagccataaacagtcagtggaataaacaagctcaagtgatataccatgtgacttcctctcaccaaaatcccgtaccgttatctcttattgaagaatcattgtacaaatactttcacaaaaatccacgtacaagtaaagatgggaaggcaatacaaaatgaaaaaattttaacgttcaataggttagtatacttccaggcatacatgattctacggtacaaggtaccattggaggtatagacaatacctttcttgattagttccagaaattaaatccccagcctagtttgggtacaaattgatttgacttgctgactttggcatgttgatcgtgtgataataagcagatgatgcgtgcagcaaatgtactgttgggagggatatacaccaagaactactatgagcttaaccgaggctacaacattttaatgactgtggcaaagctgtatgccccatatgtattcttcaaaggatggtgagcttatttcttatgtgcatttagtagaccaaaagatggaaactgtgtattaatttctggtacgttttaatttgaggttcccctgccactctcatttacagaagaaaatagcacattctttttagcaagacaatcttcctatacttctctagaactaatgatgttcctataattgagaatgccccttttagaattataataaattacacatgctttttaacatttatttactaaaaaatctaccattcattgaagtaggtaataaatcaataactgcattctttcttgatttacctacacgctgattttccttctgcatgcatatatacattttgatgaaggtttgatgacaccaacctgaggaaactgtggaaggcgacggctatggaccaaaatgatgatgcatccatatttaattttgatcctaagtgcattaactggagctcatacctcgtgaacacccacattccagctgctataaagtatgccaataaccagaagacgaaagcacgcagtgcataaaaacatatttagatgatgatgtacatgcaaggtgttagtttgcatgctgaaaatattgctattattatatgaaaaaatagtgtggaataagtgatctatgtcgggtgggaactctcatctatggcagtgagagcgcttactatcactgttgccattgctattataaaacattcatgttataaatattggtgctcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0353600, RefSeq:Os04g0353600