Os04g0412900
| Gene Name |
Os04g0412900 |
|---|---|
| Description |
Sec23/Sec24 trunk region domain containing protein |
| Version |
NM_001059279.1 GI:115458287 GeneID:4335786 |
| Length |
7650 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0412900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:20420406..20428055 |
| Sequence Coding Region |
20420558..20420891,20420981..20421040,20421614..20421667,20421781..20421953,20422095..20422281 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:20420406..20428055 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:20420406..20428055 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggtgcgcgcgagcctcgcctgcttcccctccgacgcggcactccaggagtcctcgggcatcccgtggggcgtcgccgtgacgcccttctccgccgccgacgagcgcggcgcggcgcccgccaccggcgccgagggccacctcctcccgcgctgcgactcctgctacgcctactttagcaccctctgcccgctccaccgctggtcgtggtcctgcgccatctgctccgccgacaacgacctcacccccgacgcctccgcgcggtacgcccgcgacggcggccaggacccgcccgagatgcgctccgccttcgtggacctcctcctccctggggaagagggagaggcggcgacgacgacgccagtgtacgtggcggcaatcgacttgtcctcttcggaggagttcttggagctagtcaaaagtgctctcctagcagctcttgaagctatccctccaggatcattgtttgggcttttgacatttagcagcaagataggtttatatgatgttcaaggtccgataccgattgtgaagaatgctttcatccctcctgattctgatggtaccttacttgtcgaccttgaagatgtcatgccgcttcgttcctttttggctcctgtcgacgggtgcaaagatcgcattgctgaagcacttgaaacaattaaaccaacatcttcctgggaaataacagcaactgcctcagaagtccaggatcacgcgttgcatcatgcccgcggttttgggttagcaatggatgctgttgtcaactacctatgtacagagtacggaagtttgtttgaacttgcaaggatattcacatttttgtctggtccaccgaattacgggcctggccaaatagaaacaagaagtgacgtggaccataatgctgctaaaatgctgggatccgaccatacattcatttccgagcagacaaatttctacacaaatctggctgctagtgctgttcaagcaggtgtatgtgtggacctttttgcaattacaaatgaatacacagatctttcttccttgaaagttcttagtgttgagagcggtggctcattgtacatgtattcaagtacagatgaatcaacacttccgcaagatatatacaaaatgctaagccgtccttatgctttcggatgtgtgctgcgtttgagaacatcttcagagttcaagattgctgattcttatggccatttctttccggatcctcaatacatgcatgttcagcacataaattgttgtgactcatttgctacctacgtctatgactttgagtttcaaaaggattctcagttttccaggaagtcaagccctcctatacttcaaattgcattcaagtacacaacgattgtgcaacagggtgatacttctgatgatgtctcaaattctgtcagcagatcaaagttcaccttgcaaaggcggctaagagtgcggactatccagtacaacataactgctaatatctgggacctgtatgattttgttgatccagatgttgtattgactatactagtacaccaggttattttggcttcgttaagtgatgtgctagaggcaaggatatggctccgtgattggttggtgaatttcattgcccagtacaacaaggcatacaaggtcgttagatctggtggaactggaatgtctgatattgatgttgatttcatacactgctcacaactgcaacctctgtcaagacttgtatttgcttttctattaagtccactgcttcagcttcacggtcaaggtattcatccagattatcggacatatttgcaatgcctcttcagtgcactggaggcatcatcgcttcgccaagctatatgtcctacattgatttcatactcttctcctgatgtagaagcagaagtgcatcagtcactaagtcgaagtgtattcaacagtgagagcccgatattccttcttgatgcctacactgatcttctggtgtattactcacctacagtcagtagcacaatccccttccctcctccacgtgactgtctgttgagatccaagattgatagattgaagcaagaaaggaatataacccccaagcttgtctttatccatggtgcacacgatgatactacagcattcgagagatacctgattgaggatcaaagtgtcgatggttctttggtagctagcgccacaggttttagatcgttccttgagggcatccgaagcaggatagctgagtacagcagatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVRASLACFPSDAALQESSGIPWGVAVTPFSAADERGAAPATG AEGHLLPRCDSCYAYFSTLCPLHRWSWSCAICSADNDLTPDASARYARDGGQDPPEMR SAFVDLLLPGEEGEAATTTPVYVAAIDLSSSEEFLELVKSALLAALEAIPPGSLFGLL TFSSKIGLYDVQGPIPIVKNAFIPPDSDGTLLVDLEDVMPLRSFLAPVDGCKDRIAEA LETIKPTSSWEITATASEVQDHALHHARGFGLAMDAVVNYLCTEYGSLFELARIFTFL SGPPNYGPGQIETRSDVDHNAAKMLGSDHTFISEQTNFYTNLAASAVQAGVCVDLFAI TNEYTDLSSLKVLSVESGGSLYMYSSTDESTLPQDIYKMLSRPYAFGCVLRLRTSSEF KIADSYGHFFPDPQYMHVQHINCCDSFATYVYDFEFQKDSQFSRKSSPPILQIAFKYT TIVQQGDTSDDVSNSVSRSKFTLQRRLRVRTIQYNITANIWDLYDFVDPDVVLTILVH QVILASLSDVLEARIWLRDWLVNFIAQYNKAYKVVRSGGTGMSDIDVDFIHCSQLQPL SRLVFAFLLSPLLQLHGQGIHPDYRTYLQCLFSALEASSLRQAICPTLISYSSPDVEA EVHQSLSRSVFNSESPIFLLDAYTDLLVYYSPTVSSTIPFPPPRDCLLRSKIDRLKQE RNITPKLVFIHGAHDDTTAFERYLIEDQSVDGSLVASATGFRSFLEGIRSRIAEYSR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>153..486#576..635#1209..1262#1376..1548#1690..1876#2009..2154#2227..2381#2799..2880#2984..3099#3907..4002#4460..4583#5711..5979#6438..6649#7081..7292#accgtaaactgttactccacgctgcgctgcacggcttcctcttcctccctcctcttcttctcctcagatccctctcgcggtcgcggccaacaaccacagatccacatcccaaagctgcagcgcggggggccgcagcagccgcagcagcagcaatggcggtgcgcgcgagcctcgcctgcttcccctccgacgcggcactccaggagtcctcgggcatcccgtggggcgtcgccgtgacgcccttctccgccgccgacgagcgcggcgcggcgcccgccaccggcgccgagggccacctcctcccgcgctgcgactcctgctacgcctactttagcaccctctgcccgctccaccgctggtcgtggtcctgcgccatctgctccgccgacaacgacctcacccccgacgcctccgcgcggtacgcccgcgacggcggccaggacccgcccgagatgcgctccgccttcgtggacctcctcctccctggtatggatcatagttgtcgatgttctcatgtaatgcaatgtggttgccgtgtgatgatgaggagctgatgttttttttcctctcggcaggggaagagggagaggcggcgacgacgacgccagtgtacgtggcggcaatcgacttgtcctgtaagatctcaaaattccttcgtctcgaaacgttttagaggtggttggctataaaatgcatgaagcttgcttaatagtcactactcactagtcagcatgtgagcccctttttttttggggtgccataggaacgtgaatttgaactgaacataataacttgctatgctcatgccatggatttagtctagtaattgatcaacatgagcaatggttcctgtttgtaacacgtgtggatgtgtgtttgcaagcatgcttgaattgtagaaaaaaaaggaaattagcgttgcaacattttgttgattactgtgaacagttctgtcaagttctggatccatttagttgatcgagttggtttttgcatatgcattataccttgatggatggcatccaaattcatttgatcattccatcttaatcctattgctgtgataagttaaattggactcactgtatctattgaaagagtattgagatttacatgaaaataacattgatttctttcagctgcaatctttctagacttcccgactcattttctgtagatcttatttgtttaatcatattgtattttagcttcggaggagttcttggagctagtcaaaagtgctctcctagcagctcttgaaggtgagatccagccacaagtttttaggagctagtactaatctattgtggacatcataaagttcatgagcttcctgtgcaactatgtgtgcactgatccttgtgatcccatgcagctatccctccaggatcattgtttgggcttttgacatttagcagcaagataggtttatatgatgttcaaggtccgataccgattgtgaagaatgctttcatccctcctgattctgatggtaccttacttgtcgaccttgaagatgtcatgccgcttcgttcctttttggctcctgtatgtataccatgctgttgattgtagttttgcccttattcgcaattcctttaatctatgattttgtcttttactgtgctttctgccccttcctagaatattcatatctgtcgtatgcttatgtcagttatgtcttaacaggtcgacgggtgcaaagatcgcattgctgaagcacttgaaacaattaaaccaacatcttcctgggaaataacagcaactgcctcagaagtccaggatcacgcgttgcatcatgcccgcggttttgggttagcaatggatgctgttgtcaactacctatgtacagagtacggaagtttgtttgaacttggtatgtgatatcttgattacgctatcattctattgtttcatttgtggcttatcttctttttgaaggctgtactatgtttggtggcgattgaccttgccttctactataatgttctgtcctgattttaaacagcaaggatattcacatttttgtctggtccaccgaattacgggcctggccaaatagaaacaagaagtgacgtggaccataatgctgctaaaatgctgggatccgaccatacattcatttccgagcagacaaatttctacacaaatctggtaagtctctgtaatttttgctcaataaattacaagaatattctagaatatatcctaattggcatatcacaggctgctagtgctgttcaagcaggtgtatgtgtggacctttttgcaattacaaatgaatacacagatctttcttccttgaaagttcttagtgttgagagcggtggctcattgtacatgtattcaagtacagatgaatcaacacttccgcaagatatgtaagtttgctcatcatctgagttgtgtatctcaatgtaatcatcagttcaactttattgcttcaagatcataggtccttcaaattttccacagcccaaggttttgatttatgtatgcttgtactcttcttctctctctgtttgcagaacagttaaattgatagaattctgatgttcagtgtatcctgacagttgatcctaatattcctctctgttcaagttctggatcatatctgacttgtctaatccttaatagcctaatgaatatttaaatgatggttttgcagtaccctgaatgtcacatactataactatttgtatgtatgcgcagaatggcctaagtacaatgtactgtttatatgcgtagattattatatattacaaagcagcaattgagttttatccttcattttgcagatacaaaatgctaagccgtccttatgctttcggatgtgtgctgcgtttgagaacatcttcagagttcaagattgctgattctgtaagtattatgagggatgtgcaaccccttattcagttatttgaggtcttttttagatgttcttgtggctgatattgtttatttttgttttttttttcaacagtatggccatttctttccggatcctcaatacatgcatgttcagcacataaattgttgtgactcatttgctacctacgtctatgactttgagtttcaaaaggattctcagttttccaggtaaaaggcattctgtttcccgaccatttcctgaatatgtgctttgcatgtgttagtatgttatggtttttgtctggaagtaactgggcactttcctttgctgtggcagatggaaagttccatttgcagcattgatttttattactccctctgtcccataatataacaagctagtactggatgggacacatcctaggacatgaatctggacaagcttgtccagattcgtagtcctaggatgtgtcctatctaatattaggttactatattatgtgacggaggtagtacttcctccgtttcatatcatatggatgttaatgaatctagacacattaatatccatatatctagattcattaacatccatatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttataatatgaaacggagggagtagtaattttgtggtcaacaccataaatacttgttatagatttttgtaacagcattctctatttgttgtggcaatattgtggtcaatatcatatgatatgacgcatgagtgaggagttgcttactagttagcatttgaaaacaaaatattctggcataaagacgccaatggatctaaacccaatctattctgattcttgctgtattgtgtattcagcttatatttggttacccattagtttactataggctaaggtatcgtgtttaattgttagggccatttgtttccttaatgtggaatcaccgaatcagtacaagtcttcagccaaacagttaaattatcattctaaatgtatcttcaccatccttacagtatcatctttgtacctgcaggaagtcaagccctcctatacttcaaattgcattcaagtacacaacgattgtgcaacagggtgatacttctgatgatgtctcaaattctgtcagcaggtaactgcctacagctttttttttcgggagtacgcaaaaggcttgtgtatcattgtattaaggagaagaattaagagttttacaaccattggcaagctgggaacagcctgctccaaccaaattacggtattagccgatctggcccggtttttccccactaaccaattacgttacaaccactgaaatctcacgaaatatctggtgaccatagatacaatagaccatttgtaaaatgttactattcttgccatttgcaaatgtccatactgcgtttgcagtaaatttttcagtgatctttctttagtataagtttgtttttcttgcttggcaagttttcttttacttgttagtgtgcagatgtgatgtgcgagctacaattttatagataaactcccaagtatactgtacacattgtacctggatgataacatatttttaacttaaatacattgttcagatcaaagttcaccttgcaaaggcggctaagagtgcggactatccagtacaacataactgctaatatctgggacctgtatgattttgttgatccagatgttgtattgactatactagtacaccaggtacaaccttttcttttcacatattatttttaatgcaagttcaatgcataagatgtttgttgtaacgtgcaagtacacatgctcttagtggagcaaggatactctgcttgcataagcactttagttcagaacatgccagttaccctgttgcaaatattcaacccagtagctagcagcgtcatctgtatcaatgcaagcaagtttttaccacatctttatgtagtataactgcatgcattgtctagactctagaacaatgttgtggtatcatctgggtgctatgatcaaatgatgatattaccatcattttgattgtatcaaccatctgttgctacttgctacaggttatataacaacttatgattagcttaattgcaattgctacaagaaaagtctgaagatcaatgtctctgcatttatattgaacattgattttacagtaatgtagccaaatgtctgcaaatttatatgttcatttaaagcttctaagcttaggtatgattaggctacaccagtcagggctggtttgtcttgttccatttttttttaaaatgttcagcctggggtgtcttgtctcagtctgtagcttggcacatggctgatgctctggcagtctggtactttctgttttggcgtagcttcatccaatcccagtaagttttgaattactagtttccaaagtgcactgtgaggttgtgtcatgtctgtgtgcaaaaagtgagctaaatttgactcacagcataatgaattgcagtctagcttaacactaatgcttgaaatcagcttgtttaccgaatgcagttataaaggcgacatactatctgatttcattagcatccttaacctagatcttccctttctgacaaattagggggaactagacattaagaagagcgacacctaaatctgatttgaataaataggacatggacttggccacttgggtaatgtttgtacactcagacctcccagctaactaacttagctcagctccttaagcttaagcttgatgactaaacaaacaggaggaaaggttgttcatcaaacctattttgtatcgatacataacattctacaatgcaagttggtgctaccaaggaaagattatttgaggattgaatttccaggttattttggcttcgttaagtgatgtgctagaggcaaggatatggctccgtgattggttggtgaatttcattgcccagtacaacaaggcatacaaggtcgttagatctggtggaactggaatgtctgatattgatgttgatttcatacactgctcacaactgcaacctctgtcaagacttgtatttgcttttctattaagtccactgcttcagcttcacggtcaaggtattcatccagattatcggacatatttgcaatgcctcttcaggtaatatatatttttccaccatggaattactggaatgatgtagaaaaaatcaataggatttcatgatcttcttgtgctgtgatttttcttctctcaaattcctgtccactcccgtaatactgagttatatttgaatatagatagcttggatctatgtcacggcatatttcatagtaaacatgggtgcttatcatgtaggcaaagtatttatgtttccgcatatgacagcatagtacatgacattcgaaccaagtcttgggtgacgataaaattgtatatagataattccattctaccatatactgctgatcacaattatttcattgaaacatttaaaattcaaatgtttgatttgttaccattgtttcctatctgagtcattgccatagctttggcctattatctaaaaattttgtagtactctaaatagacttactttattatctctttatttacagtgcactggaggcatcatcgcttcgccaagctatatgtcctacattgatttcatactcttctcctgatgtagaagcagaagtgcatcagtcactaagtcgaagtgtattcaacagtgagagcccgatattccttcttgatgcctacactgatcttctggtgtattactcacctacagtcagtagcacaatccccttccctcctccacgtgactgtgagtcttccaatcccacataagttatttttaaggcagttgcagtcttgttttcactcgctgaatttttttcactccgcactgatgttttagacttggcctcataatattactgtcaattaattaaattgtcttatcaccttactaaaatatgtttgtttcctaaaccactcacgtttggtccaagtcccccaaaggattatcacagtggccaatgaatagacacagtgacatcagatttgatgaagtataggatgatggatgattactctcatttagtgttggaaacacagaacatccattaaaggatggtatttactctctttagttttttttttaatttttaaacaaaagaatggataggttactattaatgatcagtgatatttatctatatcatgcatgcactaaaactgagatggtatttataggtctgttgagatccaagattgatagattgaagcaagaaaggaatataacccccaagcttgtctttatccatggtgcacacgatgatactacagcattcgagagatacctgattgaggatcaaagtgtcgatggttctttggtagctagcgccacaggttttagatcgttccttgagggcatccgaagcaggatagctgagtacagcagataggcgcccgtttcagccgttgcttgagctgcccagtattcaaggattgatttttcttgctatcatggatccgctgctccctttgccttgaagccatgttgttcctcatctgctctgtatccatggaggtgatctaccagttctcgcgggactgctaggggaaccgatttttaaatgcatttgtaagttcagactctgcaatgttttacaatatgaacatccacaccggctgaccggctttgcatggtgggttggactgtatactagagagcatatgcatatttgatacatgtttgtttaggcggcgattttggccgtgtactgatgtgttcctcttacatagtacggttatggtgcatgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
