Os04g0423600
| Gene Name |
Os04g0423600 |
|---|---|
| Description |
Nuclear protein SET domain containing protein |
| Version |
NM_001059332.2 GI:297602721 GeneID:4335844 |
| Length |
7851 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0423600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:20963388..20971238 |
| Sequence Coding Region |
20967320..20968240,20968621..20968719,20969551..20969651,20969730..20969769,20969885..20970649 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:20963388..20971238 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:20963388..20971238 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcaatggggatgagagcccgggaatctgtgaacatgtcggaggacctaactcaggccattgcgccttatgctactgccctgcacgatgcgtcgctccagtcccactgttcgtcatgcttccaccgcataccggctcaatccccccacgacatgtcttgcacgatgtgcggttctgttcgatattgctgctcggactgcttgatctcggactgtgaagtgcattcatcttctggtgaatgttgcttctttgtgaaacatctcagggaagcctccccatccactcttaccgaagaaacgagcgatatccgtgctgctctccgccttctctattcgcttgagacgcgtggtcttgtttcatctgattcggtcagcagctccaataggatcggcgggctttctgcaagtggtattagggaggttctggaggagggtggggagattgccgagggggtgctggaggggagtttgttgatgttgtctgccagaaaatcgaggatgaagaactatgttggtctctccaatggcttgacgatagagaaggtggcattgtgggcagtgatgacaaatagtgttgaggtgcagattagcgaagagcagtctctggggattgctgtttatggccctagtttctcatggttcaatcatagttgctgtcccagtgcttcttaccgatttgtattggttccacagaatgaagggtgtacttcaaacaaaccagaatcatgtgtagttcctgttagcaaaggagctgcgccagatgcgtggcatgcttggcagaatgaagaagctggttttgctcatgctcaatgtaaatatggtccacgagttgttgttcgctgcacaaagccaatcaacaagggagatgaagttttcataacatacattgatcttcttcagacaagggaagcaaggctttcagatctgtggtcaaagtataaattcatttgttcttgcgagctttgtactgcactaccaaaaccatatgtggatcttattctgaattgtgatgctaggaacttgaaatcgccacataatgctgttacagacccagcaattgaggatttggacaataacttacaacaggcaatatctgaatactcattccttgatgactctaaagcttgctgtgatgtaattgaaagcatgctttcagaaaacttgatgaatgatttgcagcaagaggaactttcaccaaggaaatacatactacaccccctacaccatatcagtgtcagcagtttcatgatacttgcctctgcataccggtgcagtgccttcaaatcaagcactgataatttgcatggagaaaattgtgatttcattttcagaatgaccaaagctgcagcagcttattcaatagttcttgcaggggctacacatcacttgtttttatctgaatgttcctttgtgacccttctgtcgcattttttgctaagcactggacagtccatattagattttgctgaatgtattaagggagaaacaaggaaaaacatgcctgaagctatcttcagctttgcttcatgttcaacaaattcggcaaaacatgattctgtgcggtacaatcaattcagatcaacttgtgagaagtttggcaagcccttgttatctttatcgttgcagtgctggccatttttagcccaaggcttaccctgcctggaaaagataaagaaccccatagatttcagttggcttggtccagcaatatttcaggctttccagctttctgaggaagattctttcaacctttctggtaaacatgcgccagcaactctcatcgagcaacagaaagagtgcattctgagcttagctgtttgctgcatcacctacagcaaataccttgcaagtatatgctatggtccagaacattatttggcaaatcgtgctaaagatctgcttgaatgtatcaatcatgtacaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAMGMRARESVNMSEDLTQAIAPYATALHDASLQSHCSSCFHRI PAQSPHDMSCTMCGSVRYCCSDCLISDCEVHSSSGECCFFVKHLREASPSTLTEETSD IRAALRLLYSLETRGLVSSDSVSSSNRIGGLSASGIREVLEEGGEIAEGVLEGSLLML SARKSRMKNYVGLSNGLTIEKVALWAVMTNSVEVQISEEQSLGIAVYGPSFSWFNHSC CPSASYRFVLVPQNEGCTSNKPESCVVPVSKGAAPDAWHAWQNEEAGFAHAQCKYGPR VVVRCTKPINKGDEVFITYIDLLQTREARLSDLWSKYKFICSCELCTALPKPYVDLIL NCDARNLKSPHNAVTDPAIEDLDNNLQQAISEYSFLDDSKACCDVIESMLSENLMNDL QQEELSPRKYILHPLHHISVSSFMILASAYRCSAFKSSTDNLHGENCDFIFRMTKAAA AYSIVLAGATHHLFLSECSFVTLLSHFLLSTGQSILDFAECIKGETRKNMPEAIFSFA SCSTNSAKHDSVRYNQFRSTCEKFGKPLLSLSLQCWPFLAQGLPCLEKIKNPIDFSWL GPAIFQAFQLSEEDSFNLSGKHAPATLIEQQKECILSLAVCCITYSKYLASICYGPEH YLANRAKDLLECINHVQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2999..3919#2520..2618#1588..1688#1470..1509#590..1354#gtagggcccagccacccagcccaggcaagccaaagcacacccccctctcgtctcgtcgtctccgttgccggcacgcacgccgccgccgcctcgctcccctctcttctggcgcggttgcggtgccgccgccccgtcctacgaccctgctgcggggacgcggcttcaaggtgagcagacccctcgccgtctcaagcactcgtgatatgttaactagagctactaactaactaggctggtttggtttggtttggttctcttccgtgttgctctaaaaggaaaaatcccgccatgaaatgaactggttaggcaggggtagatttgttgaggagtttctggtaaggttgtagtaataagttaagtttgggggcaaaaaggtcgtaggggtgtaagccgtcagaatgctgaatttagacccggataattcgatagattaagcagaggggaaatcccttttcaattttgattagtattgggtaatcttgttattccgggagatttgcaataatgacactacaaacattaacctttgcttattcctgattttaattttgtgcaaaataaaactttcgctgcaggaggacctgacaaaatggcaatggggatgagagcccgggaatctgtgaacatgtcggaggacctaactcaggccattgcgccttatgctactgccctgcacgatgcgtcgctccagtcccactgttcgtcatgcttccaccgcataccggctcaatccccccacgacatgtcttgcacgatgtgcggttctgttcgatattgctgctcggactgcttgatctcggactgtgaagtgcattcatcttctggtgaatgttgcttctttgtgaaacatctcagggaagcctccccatccactcttaccgaagaaacgagcgatatccgtgctgctctccgccttctctattcgcttgagacgcgtggtcttgtttcatctgattcggtcagcagctccaataggatcggcgggctttctgcaagtggtattagggaggttctggaggagggtggggagattgccgagggggtgctggaggggagtttgttgatgttgtctgccagaaaatcgaggatgaagaactatgttggtctctccaatggcttgacgatagagaaggtggcattgtgggcagtgatgacaaatagtgttgaggtgcagattagcgaagagcagtctctggggattgctgtttatggccctagtttctcatggttcaatcatagttgctgtcccagtgcttcttaccgatttgtattggttccacagaatgaagggtgtacttcaaacaaaccagaatcatgtgtagttcctgttagcaaaggagctgcgccagatgcggtaatggagtttaactgatggttttatttagtattcactaaacttttgcttgcatcatttggaggtatctattacacactgtagagtgagttattggactctgtattggttgcagtggcatgcttggcagaatgaagaagctggttttgctcatggtacttttttatacatgttattttgattctggaacttctaaaagcttcattttaagcttgtaccatctctatcttcagctcaatgtaaatatggtccacgagttgttgttcgctgcacaaagccaatcaacaagggagatgaagttttcataacatacattgatcttcttcagacaagggtactgttttcctttcacccaacagttccagtgtttcacaatagaagtgtatcatttaatagctttggagaatcaaaccaaggtttgcttgttccatgcttttgtaatttgtttgctactgtattccctgggacaccaaatgtttagtctttacatcacaagattttcctgtttaaggttagagaactgtagaaaatgtaattttatgtgcacctactttagtttgcatttgcagattgtaaagtactgttacagaattggcttggtaaaggtccaaggactgagggtaaggcactctttgctaagtccaaggaccaagggtaggacactgtatgaacagagtgggatggttgacagagaggaagagactagagactgatactattattttgcttaggtcaattaagtatattgcatcccttttatagggatcatttggttaacccctaggatatatttctaacttaatggaacaaactaacctgaggaaaaccatccaatctaattttcgcatattgctttcttggatcttaatcccatatgcccatagcggagtgcaatagtgcatgtaggttacacatttatatttcaacatcttagcataggttgatgtacagcattaccagtttttctcattgatgatcaattgatgcatgctgattgactcaatgaaatattcagctaatgttatgagtgtttgattaattaaggtccattatattttgtgatgttaaaaaagaaagccttgttttcttatctatttgcactagtagtttctgaccttttcccctactgtgatattgtcgccacactcgtaactaacctttccaggaagcaaggctttcagatctgtggtcaaagtataaattcatttgttcttgcgagctttgtactgcactaccaaaaccatatgtggatcttattctgaatgtaagattcaaactctgaagaaaatactgtcagtaattcgccatgcactttatttcacaaatttaagtttatcattacaagtttattcacctgccaatatcgtacaacgttctgagaattgttagggacatttcactgctttgctactctgtcttttgtaccatccttttgaattgaacttatgcatttcaacttctagataaatctcacccaacattagttgaactgttgaacgaataaaccacaagttcacaagtcaataatatcaacaatttctagtcgattttatgcattcatgctagcaaaatgtttcttgtcttctaaaaattaataaaaacaagctaatactttcttcatgctgacatgtctgtgctgatcagtgtgatgctaggaacttgaaatcgccacataatgctgttacagacccagcaattgaggatttggacaataacttacaacaggcaatatctgaatactcattccttgatgactctaaagcttgctgtgatgtaattgaaagcatgctttcagaaaacttgatgaatgatttgcagcaagaggaactttcaccaaggaaatacatactacaccccctacaccatatcagtgtcagcagtttcatgatacttgcctctgcataccggtgcagtgccttcaaatcaagcactgataatttgcatggagaaaattgtgatttcattttcagaatgaccaaagctgcagcagcttattcaatagttcttgcaggggctacacatcacttgtttttatctgaatgttcctttgtgacccttctgtcgcattttttgctaagcactggacagtccatattagattttgctgaatgtattaagggagaaacaaggaaaaacatgcctgaagctatcttcagctttgcttcatgttcaacaaattcggcaaaacatgattctgtgcggtacaatcaattcagatcaacttgtgagaagtttggcaagcccttgttatctttatcgttgcagtgctggccatttttagcccaaggcttaccctgcctggaaaagataaagaaccccatagatttcagttggcttggtccagcaatatttcaggctttccagctttctgaggaagattctttcaacctttctggtaaacatgcgccagcaactctcatcgagcaacagaaagagtgcattctgagcttagctgtttgctgcatcacctacagcaaataccttgcaagtatatgctatggtccagaacattatttggcaaatcgtgctaaagatctgcttgaatgtatcaatcatgtacaatgatctctctgtgatatatctctggagctgatgtttgatgtgctctattgtctttatcaaggtgagcagcttacttttaagattgttgtaggactgaactgatagtttcttttacaagcagaacttatcagcaatttttgtcaagggggagttacatggatgctattaacgttttctgttttattgtgattaacaaagctactatagattaacagtgacaaaatcagtttgtgggaacagtctgtgcaatgcttccgcggttttggttcacttacgatttttatgtggcgctgtaacagaattgtcttgaattgttgttaaaatggatttgaggatctctgtccaaacatttcaggcagaagatgagtttaaagttacaacacctatcccataaaggaatcaccgaggtgtaaggttttccaaacctctatatctgaaattaatcacagtacatatcaaatggtgccttttctattataactttttttctggtcaggatcaaaatctttcttgtttgttactcttggaagattggaagaatcatcatcagattgggctgtgaagatcttcgatttaaataatggtgcaaaagtttactcaagaataaaggtccaaaacaaagctaaattcttcgttgctttagaaagagtcaatttgtgattggaatatactctcaattccttggttgcaatctgcatcttgtcggcagctcatggaagaataattccatctagcaataattcaagatatttgcagtatttaattgagaaaaacaaatgaatatttttaagggaaataaagaacaatagcgctactttttcaaggcataaaaattgttcttataagaaacactcctgacaggctgagatgctcttcaagtgataacaataattgttttggacttggaagacaatgtgacagctgcttgctatgcataaaacagagtgtcttattcaatataattggacgaaattaccctctctgaagttattggaagcgacgttgacttgtaacagcttcagatccttacaaatggacagcaatcatggatttctgttgagtcatgtggtgtgttctctttatttacttttcttttctgcctttcaatcttggtgtgaccaatagaattttccttcttccgtattattactttataagttaacttttagccaatttcaaccatatatgcaggaatattatcttcattttgccaagtgcgtaagcaaatgaatggttatcagttgcagttcattctagtatccatatgaccacagtttgatgcagctgcaagcctgcagcaattattttgtgtttgttagttgctcattcctacatcaattaacttcttccgagtaagtgaaggtaacttgtggctcaattatagaactgcaagaaatacttttcagcagcaatattcaaaatattactgaggtgcatgttttagctaatagctttagctagccactcatttagattcaactacagtctcctgcaaccacaaaagaaacaactacagttgctgataaacagatgacactatgacactgtgatagcaagttgaattagtgataatgccataatttgccaaacaatattgctgattctggtgacaaataattgttggaatatgctttcgcattttccttcccccgtaatgtttcttctactgacataatgagtggggagttaaactgtctccattaataggccagcttgtgagttaaactgtctccattaatgggccggtttgtcttttcccggcacggatctgtctactttaagctagtggtgctgataaaatctaaaatttctcttatgtgtgttaaaatgtctcgtatgttcgtggatatcacaacttgcttggcattgtctgtgatgtgccgtgtacatgcaagcatgcaacttgaaagtaggagttgtctggttggactgcgttgaaatatttgtaatgtgtagggttcttccttttctttacggtttaagcttttgcagtgaactacttgagtgcataaacgggtgtagtttgcaaaataaaaatttcctgtattgtccagatgtcatgattttgagacatgtgagctaattttccatttagtataatgaaactatacaagcttgatgaggtttgcggcgtttgcctgatcaaagcatgtagtgccttttctttttttcccttgctctgcttaggcaatttctgcatccacttgtgcaagatgtgattatccattgctttgcaggtaatgtccgtgcctaatgatcaattaacgaatataggacccacatacaaatatgggaaaaatcacttcgaacatgtggacaggagaagtggttttccggtgtgtttacatcgactaaaataatttgtggcacatttgaaaattttctgtattgaagcatgtatttttgtggtcagtgaatgctccaagtccaatttgcccatttgccccttgcttccaaatatcacaaaaaaaaaatcctcacctagactacaaacaaactgctttcagttattgattgtgcaccatattatatggccatctgtaattctgattgctggagctctgatcggatacaacaatttatttctcaaaatgcataaatgtacctagctactgctataaataactcctactgcacctcttgcaaatcatagtgcaactaagcatctccctgatttttgtgtgctctcttttcattttagaatggcagatgagtatgatcgcagcagctacagaaggtctggtgctgatgacgaggaaggtggcatacaacaagaccaacactggagattatggccgcagcggtgacgactatggtcgtgacactggcctcttcaacgagtccggcaacgacgacaatgagagtggctacaagaacaccaacactgatgaatatggcagcactggtagctacaacaagtccaacaccgacgacttaactggcggcttcaacaaatccggcacagatactacagtggtggcggcggctacaacaaatctggcgccgacgactacagcagcagcggtggctacagcaaatccggcactgacaactacagcgggagcggcggctacaacaaatccggcaacaatgactacagtggcagtggtgttggctactactagtccagcgctggcgactatggcagcgagtacaaggactccagcaccgtcgactatgtcgtgtctggcgattacaggactccagcaccggcgactatggtcgtggtgacgaatacaagaaatcaagctcagacgactatgatggtggctacaagaagtcaagcagcaacgatgatggctatggcggaagcggctacagcaagccgagcaccggcgactacgacagtggtaagaacgcctccaacactgatggatatggtggcagtggctacaacaaatcaagcacagacaactctgagagtggctacaacaagtccggcaccggtgaatatggcagcggcggcggctacaacaaatcaagcacggacaactatgagagcggctacaacaagtccggcaccggcgactatggcagcggtggtggctacgacaagtctgacgccggtgactacactggtggctacaacaagtcgagcactgatgagtacgcaaccggaagaggcaagaccagttctgacgactactagataattatcgcttatcaggaaagcgaatcagggtactcttgatgctgaagtactaaatatgctcgaatacagttggtccttgctaaaaaggatttcgtatgtattccctcttatttacaggatgggttgatcagtttgtctctgatatgcaaggttgatcacacatctcagaggatgtgtgatgtgcgtaatatgctctgtatgtgtatgtacctgaacgaaaatgtaatactactctgctatgtttgcacatgaataaaacgtgatatatgcagtagtatcaagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |