Os04g0466700
| Gene Name |
Os04g0466700 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001059568.1 GI:115458865 GeneID:4336098 |
| Length |
7887 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0466700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:23717435..23725321 |
| Sequence Coding Region |
23718101..23718235,23718546..23718869,23719402..23719533,23719611..23719759,23719922..23720056 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:23717435..23725321 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:23717435..23725321 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggaggccgaagggcggcgccgcggcgtcctcctcctcgtcgaagaagcccaaggcgaagccgaagcagcgcggcggcgtcgacttcaagaagtacaagcacaaggtggggcggaagctgccgccgccgaagaatgccaccgacacggagatcaagtccagagcgatcgtgctgccggagcagagcatggcgtcggagagggctggcatggccgtgaacaagcgcgggctcacgctgcgggagctcttgcagcagacgggccactacaatgccaatgtgcgccgagctgcgctgaatgggataaaggatcttgttgctaagcatccatcagagcttaaacttcacaaggttgcaattgttgagaagctacaggaaagaatatgtgacactgacaaggtggttcgtgaatccttgttcagtatactgcagtctctcgtcttcccatctttgaaagaggacaatgcaatatcgacacgcagtacactgtttctgctgatggccaatattttgaacggaatgacccatctatccatggatatccagttaatgtctttcagatttttggagcttgttgttattaatttcccatcctcctttccaggatacgctgaacaggtcttcaacaactttcttgctgtactgagcaatgacaggattcatctccaggataagagtaaacttaacagtgtccttagtgggctcgggcagtgtctttctcaggttgcttatgcaacagaaaatggtgatgcatcaaatcgactggttcataatctttctggtagggaactttggaaatgtactcttgatgaagataactcaggaagtagagcatttgcgatgtccaatatattaatgaagcttcaaaacctcttccagattctcgttaattctgtagaggtctcagtttcagaactttttgcaaagtcaactattgatgctcagtcaagtgaagcattattatcagctcttcactgtctggatctaatatgtaacatatgtattcaagaggtaaagaaacctcagatgaaatttggaagatccaaaattcaggttggacctgaatggttgaaaagttccgtgttagtatatgcaaagaaattgtggggagtaaaccgttcattccacgaaaagggagatgacagatattatgttttcaatctgaagattgctgaaatatttttgtgcttgagtgcatgtatggacaacaccatatttccagctgatgaattttgccagtttgtatcttctctacttgcaaaggcaaaaacacttcgcaataaggataccatggaaaagcatttgagcccacttataactttcataccagatcttgtatccaatgccccagatgactcaaaaggatatttattagaggcatttacagatgcattctgggattgcaaggtggattgcaagctgattttcccatatttggatgcagtgggaaaaatgctgtttcctgaaaaaacaggaatattatttgtggaaaatgattcaggctctgaataccatggtgtgtgggtaaaagagctacctggaattctactacaatcaattgacaaagccccctcagtaacaaaggttgttttggagctacttctaagaattggacagtacttccccacaatggagtttggaaatctgcgttccttcattaagttatttggtgttaaatcatcatcaggaaccatagagcttggtccattcgttaaccttccacgtgattgccaagaacttgccatttcatgcctttattacttctccaacctgcttcccgacacaatggagctgttggcttcttgttgcttaagtgatgtgctggaacccaccatattgtttagaattattgaggttctacagtcaacatacaaggctgggaatttacatataacagagcaactcagtttcttgtcattgctaatggcacgattcagagttcatcctgggtctttctctacccaggataattcccagaagggctcaaatatgaatacttttaaatcattgaaccgcctaattttaaattctctatctgaaatgggtgatggctccctggttcttgagttaatgtgggataatttatctaaagagattgcacagataccatctttacataacatgaatggattgtttagaattattgtcacacttgatgcaggaacttgtaagctcatgaacgaagatgctataaaaattatagctggctacttgattgatgctgctatggatttgtctaaaaccattgagcttggctttcaatctgataggacaagactatttcaatactttataaagccttgcataatcatattttgccagaacgagaaggttctttgctgcgcattggagatgcttaaatctttcgcaacaggagatgaccacgtgctttcatctgcatccaagttaaactacccaggagagctttcacatcgaatttgtgttgtcacaactatactcatattcttatgcaatgatggaaaactccataaaaacctttctttgggcaaatgtgttattaaaggtatcctgcaacatacaaggcatctcatggattctaatgttcttgatgtaacatatgaggacaagcagaagttaagatttgcatttgagcaactaaagacgaaagcattgcagttgaactgctgggacagaagtgagctggaagggttttcaagcaccacgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRPKGGAAASSSSSKKPKAKPKQRGGVDFKKYKHKVGRKLPPP KNATDTEIKSRAIVLPEQSMASERAGMAVNKRGLTLRELLQQTGHYNANVRRAALNGI KDLVAKHPSELKLHKVAIVEKLQERICDTDKVVRESLFSILQSLVFPSLKEDNAISTR STLFLLMANILNGMTHLSMDIQLMSFRFLELVVINFPSSFPGYAEQVFNNFLAVLSND RIHLQDKSKLNSVLSGLGQCLSQVAYATENGDASNRLVHNLSGRELWKCTLDEDNSGS RAFAMSNILMKLQNLFQILVNSVEVSVSELFAKSTIDAQSSEALLSALHCLDLICNIC IQEVKKPQMKFGRSKIQVGPEWLKSSVLVYAKKLWGVNRSFHEKGDDRYYVFNLKIAE IFLCLSACMDNTIFPADEFCQFVSSLLAKAKTLRNKDTMEKHLSPLITFIPDLVSNAP DDSKGYLLEAFTDAFWDCKVDCKLIFPYLDAVGKMLFPEKTGILFVENDSGSEYHGVW VKELPGILLQSIDKAPSVTKVVLELLLRIGQYFPTMEFGNLRSFIKLFGVKSSSGTIE LGPFVNLPRDCQELAISCLYYFSNLLPDTMELLASCCLSDVLEPTILFRIIEVLQSTY KAGNLHITEQLSFLSLLMARFRVHPGSFSTQDNSQKGSNMNTFKSLNRLILNSLSEMG DGSLVLELMWDNLSKEIAQIPSLHNMNGLFRIIVTLDAGTCKLMNEDAIKIIAGYLID AAMDLSKTIELGFQSDRTRLFQYFIKPCIIIFCQNEKVLCCALEMLKSFATGDDHVLS SASKLNYPGELSHRICVVTTILIFLCNDGKLHKNLSLGKCVIKGILQHTRHLMDSNVL DVTYEDKQKLRFAFEQLKTKALQLNCWDRSELEGFSSTT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7087..7221#6453..6776#5789..5920#5563..5711#5266..5400#5041..5175#4846..4939#4618..4737#3754..3840#3550..3663#3288..3416#2666..2970#1913..1976#1599..1745#1142..1300#719..888#459..581#275..347#79..171#accacgccgccgccgccgccgccgtctcgtcagcaagcgctgcccggagagagagagaaagagagacgcgcccgcgccatggggaggccgaagggcggcgccgcggcgtcctcctcctcgtcgaagaagcccaaggcgaagccgaagcagcgcggcggcgtcgacttcaaggtgagttccccccctcccctcccccaactgaagcgacgcccgctccgacgagctcactggtgttcgggtgtgtgtgtgttttttttctcttcgtggctcgcagaagtacaagcacaaggtggggcggaagctgccgccgccgaagaatgccaccgacacggagatcaagtccagaggtgagctgcgggcgcctcttttttttttttttccctcggtggcctgaggttttcgcagcagggcgcgtaatttagggtttcggattgtgatgtgcgcgtgtgtggttgcagcgatcgtgctgccggagcagagcatggcgtcggagagggctggcatggccgtgaacaagcgcgggctcacgctgcgggagctcttgcagcagacgggccactacaatgccaatgtgcgccgaggtgagccaccgataggcagtctctgcgcggactgccacccagatggccagataaacagttgattcgatcgatcgattcggcctgtgcttgatgagactagctaacttgggctgcattgttatgttattttgttgaagctgcgctgaatgggataaaggatcttgttgctaagcatccatcagagcttaaacttcacaaggttgcaattgttgagaagctacaggaaagaatatgtgacactgacaaggtggttcgtgaatccttgttcagtatactgcagtctctcgtcttcccatctttgaaagaggtatttccccacttcttgccagttatttctgaattcgtgagagatctcacgaggttgctatgattcacaagctattggtaacttgatcactgtttttcttcccccaattgtctattttagtttcatcatgctgaccatacgggctcttctagctactaatggatttccatatcttattccttctatcatttccattttctagttctatgctattggctgcatatgtgagacaattggtatctatttatggcaggacaatgcaatatcgacacgcagtacactgtttctgctgatggccaatattttgaacggaatgacccatctatccatggatatccagttaatgtctttcagatttttggagcttgttgttattaatttcccatcctcctttccaggatacgctgaacaggtgaatgggtttctttcatgtattggtgttttgaaagttgaaaaggttcttgtgttaggaggcaatgtattggtggctacttgcccctgacatgtgcccttcttccttttatctctatttacagaagatgggaggtgttaaattaacataaaatatttcatagtctatctttcatcaactaattatatgtaccaaggcatatgctattgaaacttcttctaattcctgctaggatttatgtgagatttagcacattcatacctagtaataatctcagtttcattatttcttctgataggtcttcaacaactttcttgctgtactgagcaatgacaggattcatctccaggataagagtaaacttaacagtgtccttagtgggctcgggcagtgtctttctcaggttgcttatgcaacagaaaatggtgatgcatcaaatcgactggtttgtacagttgaatcatcattttatattattttactcttaaaattagttggagctatagcaactaacttagtgaaacagaaaatttgcatgttcagcaatgtatctgtatcaaacaccttctttgtcatattggaatgatcagaatattttctaatcgtctacaggttcataatctttctggtagggaactttggaaatgtactcttgatgaagataactcaggaagtagtaagtcttctacatgtttcccatgttttattggtccctaatttgatattcaatttatgttgctacgcctccttaaattcaaattcatttgtaagataaccagagaaagctctgcagtaaacatatcagaccactcaacttaatctatattcatttacaatttagccttgtttaccatgcatttctagcttgctagctttttcatgaaacaacacactaaacaacaaatttactatctccaatgaactgttgatttatttatttattttattttattattatttattattattttattattattttttttttgggggggggtcacagttgcactttccttttggttatgtggactggaaaatgtttaatcagaatagttaattgattgttaatggaaatttgtttggtttagtttagaatacagtggaagaacaatactatatggaaatgacactgttgtattataaaatatcttttacgcttttttaagttttatgcacatcctacatgaatactccctccgtccaaaaatataaaggattttgggtagatgtgacgcatcctagtaatatgaatttggactgactcccttatattttgggacggaaggagtacttgttatttcttttcttgtgccattaagttaagacaggcttgatattatgtcttataaacctgatgcactgcaggagcatttgcgatgtccaatatattaatgaagcttcaaaacctcttccagattctcgttaattctgtagaggtctcagtttcagaactttttgcaaagtcaactattgatgctcagtcaagtgaagcattattatcagctcttcactgtctggatctaatatgtaacatatgtattcaagaggtaaagaaacctcagatgaaatttggaagatccaaaattcaggttggacctgaatggttgaaaagttccgtgttagtatatgcaaagaaattgtggggagtaaaccgttcattccacgaaaaggtttcaatttcttccccttttcatttctacctccatactactggtatgataatatttaaaacgtttcgtgaccaattaatagataaaatatgctactaatatgatcaaccaatagataaagcatgccatttttgtgttctctactcatagtgatatctgactctctgtggtatcaaaacttttggaaccctggctggagattaatttcagattttgttctattccagactgttaattgtgttcttcagaaagcctggttatagcatatcttttgctgacaatctcagtgatttcttatggaactcttttcatggcagggagatgacagatattatgttttcaatctgaagattgctgaaatatttttgtgcttgagtgcatgtatggacaacaccatatttccagctgatgaattttgccagtttgtatcttctctacttgcaaaggttgtctgtggctgccagtttcaaggactgatttctatcactggctagttgaaagttctttagtccgcttgtgcatgttgttctatagctatcgtcttatagacagctattaattattcatttattttgtcaggcaaaaacacttcgcaataaggataccatggaaaagcatttgagcccacttataactttcataccagatcttgtatccaatgccccagatgactcaaaaggatatttattagaggtatgactaattttccttttactgatctctagaaagtatttgggttactttttaacgttacgaaaaatgagagactatattcaactgcaggcatttacagatgcattctgggattgcaaggtggattgcaagctgattttcccatatttggatgcagtgggaaaaatgctgtttcctgtaggttccttctatgggatacatactaaacttcctttgctacataacttcttctctctttttttcttttttttttttttgtgggtgacgtgttcaggttattaagaaataggacttgatgaagagcatgcctagtgaaaattgcctacttggtgctaacacacaaatatcttttagggagaaatgcatctccacatgtacatgcattacatgcactattataactgtaagtgcttgaagatttgggtgatggtatgaagatctgtaggttgatttgaattttcagtgttcgaatctggattctggaaccacatttgatggtgatgttagttcatgtacctgcatgaacattggtgggttgtcaaattagttattagttaaaaaaaaagatggtgaatagtccttgtaccaatttatatcacatgaaattccaaaataaatctttaaaccgctgtatagagaaacataaaagagaacctttgtctaatgatgaatatagatataatcaaacaaggcaaaacttgctgtccccaaacaccatccatgctgagatttgaaaatttacaggttgttaagtcacttggtagatcgtatgttcaacttgttcctggaggactttgcattcctccttattagatgctcaaagcctcaaactaaataattttgcatatttcatcatgctgagaattacctccctacagctactagcgccaaaaatgtgctagtggataacggcttacatatgctttctattaatattcatttgcctgtggttaggaaaaaacaggaatattatttgtggaaaatgattcaggctctgaataccatggtgtgtgggtaaaagagctacctggaattctactacaatcaattgacaaagccccctcagtaacaaaggtctgctataggtttatttatccagtatagagttggaatactcagattgggcattaatgaaaccttttcaataaatagtgtactttatgatcatatgaattatcataggttgttttggagctacttctaagaattggacagtacttccccacaatggagtttggaaatctgcgttccttcattaagttatttggtgttaaatgtaagtataaaattactggttgaagatcttttttatcctctatgatttatcgctttatgtgtaattccatttttcttggactaatgacattttgctaatagcatcatcaggaaccatagagcttggtccattcgttaaccttccacgtgattgccaagaacttgccatttcatgcctttattacttctccaacctgcttcccgacacaatggagctgttggcttcttgttgcttaagtatgcatttttgcttctctgttctgcgtttagtgtcgttatattctttcctttaaggattacaggtggtacataatttatggaatgcaggtgatgtgctggaacccaccatattgtttagaattattgaggttctacagtcaacatacaaggctgggaatttacatataacagagcaactcagtttcttgtcattgctaatggcacgattcagagttcatcctggtgagtacttttttttttggaaggcaaacttttcttagtttaagtggcttactttaggtgaaaatttcatactatgtgttttgctctttaagttttatcctctaatggttattttatctgacatttttttctaacagctttccttttgttttgttaaactagggtctttctctacccaggataattcccagaagggctcaaatatgaatacttttaaatcattgaaccgcctaattttaaattctctatctgaaatgggtgatggctccctggttcttgagttaatgtgggataatttatctaaagagattgtgaggattcaaaccatgctatgtttttatgttttcacccaaaatccattgaactcatatatgtttgttttgtgcaggcacagataccatctttacataacatgaatggattgtttagaattattgtcacacttgatgcaggaacttgtaagctcatgaacgaagatgctataaaaattatagctggctacttgattgatgctgctatggtgtgtactcttctgaattctaaagctctggactctggtatttgcagtcagtaatttggtaaatttgtacgctaattcaggagaacgtagtcgaaaatggcagattagtcgaaaatggcagattggcgtattttgatgttagaaaacctattgcctatagatctgatataatcggatctaacattattttatgcatattctttgaaaactatgagagttcactaacagagcatatttacgtggtagcatagggagagtatcgtgagtaataagctcttcacatcacctggtgaagcgcagagtgtcagattgaatgcattacggcataaacgtttttttcagttacactagcttatggatggtaattatgagtttgacacctgcaaagcttttggcaaacaggtgcattaattcattgtcatataaattagaagcgcatctccttgattagttcataagcattgctttatcgctgtacttttttgggttttgatgagaattgatttcacccaattttattgtgtacatgcaggatttgtctaaaaccattgagcttggctttcaatctgataggacaagactatttcaatactttataaagccttgcataatcatattttgccagaacgagaaggttctttgctgcgcattggagatgcttaaatctttcgcaacaggagatgaccacgtgctttcatctgcatccaagttaaactacccaggagagctttcacatcgaatttgtgttgtcacaactatactcatattcttatgcaatgatggaaaactccataaaaacctttctttgggcaaatgtgttattaaaggtatcctgcaacatacaaggcatctcatggtaagtggtgataacataaatgcctttgtttggtagccatattaactgatgagatttcagtttcctacattttagtcatttttcatattaatcttaaattcagggaggtcagaatatcaagggcaaaattgaacatttgtgcatgtgaatcgtatgtagactagtttgttgaatttgttcctactatgagagaatatttgtcctgtgctgtacctagatcactatcactagcttgctctattatgcctaaatgtcgttgttgtgaaactggccttcctaatgagtttgctctattcaatacttgctgcaggattctaatgttcttgatgtaacatatgaggacaagcagaagttaagatttgcatttgagcaactaaagacgaaagcattgcagttgaactgctgggacagaagtgagctggaagggttttcaagcaccacgtaaatagtaccaaatactaatggtatgtgggctccttcgtcattgtttgctaattatgttgatttattgtttttttttaaaaaaacgaatgaacttacttccatcccatatgataggtactgccgtaatgtgaaaccttactctgcacgggatgaaaattttgacgaactgaaggtgaagatggagagtggacatggtgactggtgaggggcagaaggatatgtgccatccgacctgcgtcagactccagtatacacctctgctgttcagctgttaccaacactttacgaaggtctgtactttacccaaagattaatttcacacttcgattctatcttaatcctatgtttcccaaacggtctacgatttgccataaacacacgagtttctcaggagcactaggtagatttgtcatgtttgacaacaacgtgcctgacagtaatatcttgctattgcaggtggccggaaaatgcattgttcacatgttgggaacgaggtggtccactggtccatgtatcattgtggtacagcgcttggttttgatgcaacagaattgcagtttagactgctcaatagaccataggttatttcaccgaaaggtttacatttcaacctacatgtccatgtaagaatcccgatgtaaatgtagaaattttgttttggaagttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |