Os04g0488500
| Gene Name |
Os04g0488500 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001059687.1 GI:115459103 GeneID:4336229 |
| Length |
3987 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0488500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:24797068..24801054 |
| Sequence Coding Region |
24797490..24797531,24798137..24800407,24800915..24801007 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:24797068..24801054 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:24797068..24801054 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatccgccgccgcgcggcggcggtagcgacactacgcgcctccctgcgccgcacctgctcccacgccgccggcgactccgaggaccccctgaaggactttgggtacaggccgtctaaggtgacctacaatgcactggtccaggtgctctcgagcgcggggcaggtggacttggggttccgggttcagaaggagatgtccgagtcggggttctgcatggaccggttcaccgttgggtgctttgcgcacgctctgtgcaaagaggggcggtgggctgatgcactagacatgatagagagggaggatttcaagcttgatacagtattatgcacacatatgatcagcgggctgatggaggcatcgtattttgacgaggccatgtcattcctccataggatgcgatgcaactcatgtattccaaatgtggtcacatataggacgttgctctcaggatttttgaaaaagaaacagcttggctggtgcaagaggatcattaatatgatgatgactgagggctgcaatccaaatccatccttgtttaattcccttgtgcatagttattgcaatgaaaaggattatgcgtatgcctataaacttttaaataggatgactacttgtggttgccctcctggttatgttgtgtacaatatttttattggaagtatatgtggtcaggagaaattaccaagccctgatttgctggatttagctgagaaaatttatggagagatgctggctgctaattgtgttcttaataaggttaacgttgccaattttgctcgatgcctttgtggtgtcgggaagtttgacaaggcatttcagctcataaaggagatgatgaggaaaggttttgtccctgatacaagtacatactctaaggtgatcacttttctctgccatgctactaaggtagagaaagctttccttctgttccaagagatgaagatggtcggtgtaactcctgatgtgtatacatacacaattttgattgacagcttttgtaaagctggactcattgaacaagcccagtggttgtttgaggagatgaggagtgtgggttgctccccaactgtggtgacatatactgcacttattcatgcttacctcaaagctaagcaggtacctcaggctaatgatatttttcaccgaatggttgatgctggctgtcgtccaaatgatgttacttatggtgcattggtagatggtctctgtaaagcaggcaacatcagtaaggcttttgaagtctatgccaaattaattggaacttctgatagcgccgattctgatttttactttccatgtgaggacagacacacacttgctccaaatgttgtgacatatggtgcactagtagatggtttatgcaaagctcacaaagtggaccatgctcatgaattactagatgctatgttatcttctggttgcgagcccaatcacattgtgtacgatgctcttattgatggcttttgcaaagctggaaaaattgacagtgctcaggaggtatttctgcagatgacaaagtgtgggtaccttcccagtgtacatacgtacacctcgttgattgacaggatgttcaaggatggaagacttgatcttgcaatgaaagttctctctcagatgttaaaggattcttgtactcctaatgttgttacgtacacagctatgattgatggtctttgtaggataggtgaaagtgagaaggcactaaagcttctgtcattgatggaagagaaaggatgcagtccgaatgttgtaacttacactgctctaatagatggattaggcaaagctggcaagattgatctgagtcttgacctttttacacaaatgagcagaaaaggatgttctcccaattatgttacgtacagagttctgataaaccacttgtgtgctgctggccttttggataaggctcgtttactgcttggtgaaatgaagcagacttactggccaaagtacttacaaggataccgttgtgcaattcaaggtttcagcaagagctttatcgcttctctgggtattctggaggagatggaatcatatggcacagtaccaattgcacctgtttatggaatgctgatcgattgtttctccaaagctggcaggctggagatagctatggagttgcacaaagagatgatggaagttccgtcatctgtaaaaactgacaatgacatgtacgcttcattgatccaggcactttgtttagcatctcaagttgaggaagcatttcgattgtatagtgaaatgacaaggagaggctttgtacctgagttaagtgtctttgtttgcctcataaagggattagttgaagtaaaaaagtgggacgaagccctccagttgtgctatggcatatgtcatgagggtgtgaactggcagggtaacaaatcttttcatggaggctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIRRRAAAVATLRASLRRTCSHAAGDSEDPLKDFGYRPSKVTYN ALVQVLSSAGQVDLGFRVQKEMSESGFCMDRFTVGCFAHALCKEGRWADALDMIERED FKLDTVLCTHMISGLMEASYFDEAMSFLHRMRCNSCIPNVVTYRTLLSGFLKKKQLGW CKRIINMMMTEGCNPNPSLFNSLVHSYCNEKDYAYAYKLLNRMTTCGCPPGYVVYNIF IGSICGQEKLPSPDLLDLAEKIYGEMLAANCVLNKVNVANFARCLCGVGKFDKAFQLI KEMMRKGFVPDTSTYSKVITFLCHATKVEKAFLLFQEMKMVGVTPDVYTYTILIDSFC KAGLIEQAQWLFEEMRSVGCSPTVVTYTALIHAYLKAKQVPQANDIFHRMVDAGCRPN DVTYGALVDGLCKAGNISKAFEVYAKLIGTSDSADSDFYFPCEDRHTLAPNVVTYGAL VDGLCKAHKVDHAHELLDAMLSSGCEPNHIVYDALIDGFCKAGKIDSAQEVFLQMTKC GYLPSVHTYTSLIDRMFKDGRLDLAMKVLSQMLKDSCTPNVVTYTAMIDGLCRIGESE KALKLLSLMEEKGCSPNVVTYTALIDGLGKAGKIDLSLDLFTQMSRKGCSPNYVTYRV LINHLCAAGLLDKARLLLGEMKQTYWPKYLQGYRCAIQGFSKSFIASLGILEEMESYG TVPIAPVYGMLIDCFSKAGRLEIAMELHKEMMEVPSSVKTDNDMYASLIQALCLASQV EEAFRLYSEMTRRGFVPELSVFVCLIKGLVEVKKWDEALQLCYGICHEGVNWQGNKSF HGG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3524..3565#648..2918#48..140#ggagctccaggccccaccgccaccgccaccgcccacgccgccgctccatgatccgccgccgcgcggcggcggtagcgacactacgcgcctccctgcgccgcacctgctcccacgccgccggcgactccgaggaccccctgctcggcctcgtcgagccacccgcgccgccgcaaccgccaccccggtctcgcctcggccccagagacttcgagtttcttcgggagcccgccgccgccgccgcggccggtgccctcccgccaccggaggccgtgctgatctccaaggcgatccgggcattcggcgccgacttcgacggcaaggcggagcgcgtcctgcggcggtgccgcgggttcctgaccgactccgtcgtggtggcggtgctcggggcggtgcgcgacgccccggagctctgcgcgaggttcttcctctgggccgagcggcaggttgggtacagccacacgggcgcatgctacgacgcccttgcggatgcgttgggtttcgacggccgcgccagggatgccgagaggctgcttagggagattggggaggaggaccgcgaggtgctcggcagattgctcaatgtgctagtgcggcggtgctgccgcggagggatgtggaacgaggcgctggaggagctcgggaggctgaaggactttgggtacaggccgtctaaggtgacctacaatgcactggtccaggtgctctcgagcgcggggcaggtggacttggggttccgggttcagaaggagatgtccgagtcggggttctgcatggaccggttcaccgttgggtgctttgcgcacgctctgtgcaaagaggggcggtgggctgatgcactagacatgatagagagggaggatttcaagcttgatacagtattatgcacacatatgatcagcgggctgatggaggcatcgtattttgacgaggccatgtcattcctccataggatgcgatgcaactcatgtattccaaatgtggtcacatataggacgttgctctcaggatttttgaaaaagaaacagcttggctggtgcaagaggatcattaatatgatgatgactgagggctgcaatccaaatccatccttgtttaattcccttgtgcatagttattgcaatgaaaaggattatgcgtatgcctataaacttttaaataggatgactacttgtggttgccctcctggttatgttgtgtacaatatttttattggaagtatatgtggtcaggagaaattaccaagccctgatttgctggatttagctgagaaaatttatggagagatgctggctgctaattgtgttcttaataaggttaacgttgccaattttgctcgatgcctttgtggtgtcgggaagtttgacaaggcatttcagctcataaaggagatgatgaggaaaggttttgtccctgatacaagtacatactctaaggtgatcacttttctctgccatgctactaaggtagagaaagctttccttctgttccaagagatgaagatggtcggtgtaactcctgatgtgtatacatacacaattttgattgacagcttttgtaaagctggactcattgaacaagcccagtggttgtttgaggagatgaggagtgtgggttgctccccaactgtggtgacatatactgcacttattcatgcttacctcaaagctaagcaggtacctcaggctaatgatatttttcaccgaatggttgatgctggctgtcgtccaaatgatgttacttatggtgcattggtagatggtctctgtaaagcaggcaacatcagtaaggcttttgaagtctatgccaaattaattggaacttctgatagcgccgattctgatttttactttccatgtgaggacagacacacacttgctccaaatgttgtgacatatggtgcactagtagatggtttatgcaaagctcacaaagtggaccatgctcatgaattactagatgctatgttatcttctggttgcgagcccaatcacattgtgtacgatgctcttattgatggcttttgcaaagctggaaaaattgacagtgctcaggaggtatttctgcagatgacaaagtgtgggtaccttcccagtgtacatacgtacacctcgttgattgacaggatgttcaaggatggaagacttgatcttgcaatgaaagttctctctcagatgttaaaggattcttgtactcctaatgttgttacgtacacagctatgattgatggtctttgtaggataggtgaaagtgagaaggcactaaagcttctgtcattgatggaagagaaaggatgcagtccgaatgttgtaacttacactgctctaatagatggattaggcaaagctggcaagattgatctgagtcttgacctttttacacaaatgagcagaaaaggatgttctcccaattatgttacgtacagagttctgataaaccacttgtgtgctgctggccttttggataaggctcgtttactgcttggtgaaatgaagcagacttactggccaaagtacttacaaggataccgttgtgcaattcaaggtttcagcaagagctttatcgcttctctgggtattctggaggagatggaatcatatggcacagtaccaattgcacctgtttatggaatgctgatcgattgtttctccaaagctggcaggctggagatagctatggagttgcacaaagagatgatggaagttccgtcatctgtaaaaactgacaatgacatgtacgcttcattgatccaggcactttgtttagcatctcaagttgaggaagcatttcgattgtatagtgaaatgacaaggagaggctttgtacctgagttaagtgtctttgtttgcctcataaagggattagttgaagtaaaaaagtgggacgaagccctccagttgtgctatggcatatgtcatgaggttggtctacttctttcatataccactcaaatatttctatttacctttgttgttattgttgttggttatggcaagaatatagaaccacaggttgacttaggggattcatttagttctttcacagtatcagcatcagcaagtaatctcaagactgctgtaatatgtagacactcacctattaaatttgacagtgttattttatgaaatatgcctgtaagctattcaaccatttgttgagcagctctagactgaaatattactttgcattattattttttacaaatagagaattgcacttgattcagtaatagtggtatactgatctgcttaaatatccttctttgtattgtattttgggtaagggcagcattttgttgatgcagcatatttgtgcacaattacactcctgattttgatacacctttatgaatcgtagatcctgacataagagcatcagtacagtattttctgctaacggcttccacaatttgttgttaatatgaccatttcacattttgagctttattacaataggtttcttcagtttcttttttcctttgggtgatttgcattgtaccactacttaatattgggtattggaccagggtgtgaactggcagggtaacaaatcttttcatggaggctagagctgttttgtcttactgcatcataaatcatgcaaatgacaacacttccacctaaggagtcatgttcttgtatctcaagattgttgcgagatgtggtgactcagagacctaaagtgcaattcatgatgactcaagaaaaataactcggaggccatggaataacactacagaatgaacaatcctgcatgaaaagatgtaccatgtatgcataaaccttattttttcaatatgggcaggcaattttttaggtttatgaactcctttgcctttgtaatttctgaccctttatttttctttcaattttatttagggatagctgattcatcttcagatgggcaaagccacaaaggaatctcgctatggttatcaagttcaacatttgtatataaggcaacgatggttatacaaaaggcatttgactg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
