Os04g0508200
| Gene Name |
Os04g0508200 |
|---|---|
| Description |
Isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, eukaryotic family protein |
| Version |
NM_001059804.1 GI:115459337 GeneID:4336353 |
| Length |
5753 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0508200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:25788188..25793940 |
| Sequence Coding Region |
25788237..25788477,25788595..25788638,25788732..25788841,25789938..25789975,25790577..25790654 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:25788188..25793940 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:25788188..25793940 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcgccacctgctgctcctgcgctgcggcatggctcctctctacggctcctcctcctccgccgccgcgaccaaagccctcctcttaaaccccgccgccgcgcacgccttcgtcccttcttcccccggaccccgcgcgctccgccgcggcggcgcctccctccgctgctatgccgccgccgccgcggcggtggccgagcagcaccgcatcaaggtccacaaccccatcgtcgagatggacggtgacgagatgacgcgggtcatttggaagatgataaaggataagctcatcttcccttacctggagctggatgtcaagtatttcgaccttgggctgctcaaccgggatgccaccgatgataaggtcactgttgagagtgccgaggctacgttggagtataatgttgctgttaagtgtgctaccattacacctgatgaaacaagagttaaagagttcaaactcaagtcaatgtggaggagcccaaatggcaccatcaggaatattctaaatggaactgttttccgggagcccatcttgtgtaaaaatgtaccacggatactttctggctggaagaagcccatttgcattggaaggcatgcatttggagaccagtatcgagctactgatacaataattaatggtccaggaaagcttaaaatggtttttgtcccagatggtgctgaacctgtggagttaaatgtttataattttaaagggcctggtgtggctttatcaatgtataatgtggatgagtctattagagcttttgctgagtcatcaatggcaatggcactttccaaaaaatggcctctttatctcagcaccaagaacacaatattgaagaaatatgatggcaggttcaaggacatcttccaggaggtatatgaagagaaatggaaggagaagttcgaggaaaactcgatatggtatgagcaccggttgattgatgacatggtggcatatgctgtgaaaagtgaaggtggatatgtttgggcttgcaaaaactatgatggagatgttcagagtgacttccttgcccaaggttttggttccttgggtttgatgtcatctgttttgttatcttctgatgggaaaacgttagaagctgaggcagctcatgggactgtcactagacatttcaggctacatcagaagggacaggagacaagtacaaatagcattgcttctatatttgcttggactcgtggactagaacatagagcaaagctggataaaaatgataggctgctggatttcacaaagaaacttgaatctgcatgtattgaaacagttgaatcggggaagatgacaaaggatcttgcactccttatccatggccccaaggtaacaagggagttctaccttaacaccgaagaattcattgacgctgtggctcagcaactgcgagaaaagattcaaataccagctgtggtttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRHLLLLRCGMAPLYGSSSSAAATKALLLNPAAAHAFVPSSPGP RALRRGGASLRCYAAAAAAVAEQHRIKVHNPIVEMDGDEMTRVIWKMIKDKLIFPYLE LDVKYFDLGLLNRDATDDKVTVESAEATLEYNVAVKCATITPDETRVKEFKLKSMWRS PNGTIRNILNGTVFREPILCKNVPRILSGWKKPICIGRHAFGDQYRATDTIINGPGKL KMVFVPDGAEPVELNVYNFKGPGVALSMYNVDESIRAFAESSMAMALSKKWPLYLSTK NTILKKYDGRFKDIFQEVYEEKWKEKFEENSIWYEHRLIDDMVAYAVKSEGGYVWACK NYDGDVQSDFLAQGFGSLGLMSSVLLSSDGKTLEAEAAHGTVTRHFRLHQKGQETSTN SIASIFAWTRGLEHRAKLDKNDRLLDFTKKLESACIETVESGKMTKDLALLIHGPKVT REFYLNTEEFIDAVAQQLREKIQIPAVV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>50..290#408..451#545..654#1751..1788#2390..2467#2873..2926#3008..3109#3198..3283#3389..3492#3907..3975#4056..4171#4308..4342#4433..4575#4729..4851#5384..5477#gcgcctcttcgacctcgtgggtgggtgtgcgggtgcgggactcggtgggatgcgccacctgctgctcctgcgctgcggcatggctcctctctacggctcctcctcctccgccgccgcgaccaaagccctcctcttaaaccccgccgccgcgcacgccttcgtcccttcttcccccggaccccgcgcgctccgccgcggcggcgcctccctccgctgctatgccgccgccgccgcggcggtggccgagcagcaccgcatcaaggtccacaaccccatcgtcgagatggacggtgcgttgttccacccccgatcccaccggcggctcgccccgcttcctcgctccttgttgtacagggctctgttgtaaacctcgctcggatgacgactctcgtgtgtgcccttttcaggtgacgagatgacgcgggtcatttggaagatgataaaggataaggtgcgggattccgcgattgcctcctcgtttttgattctattggacttttctaccttgtttgatgctctgatgacgcgacctgcttcgtgttagctcatcttcccttacctggagctggatgtcaagtatttcgaccttgggctgctcaaccgggatgccaccgatgataaggtcactgttgagagtgccgaggctacgttggagtgagtggatccattccttgctctctgttcacatctcacgatctcagttgcaaccaattcgatgcaaacccttcatgccagcatcatagtaattagcataaattgaagatgaagtacacgcgtaattcattcggaattcgtatgccagcttttggagatgtcatttggttgtcatgtaagttaagctgtcgagttcgtaaatgtgaggttcaactagtatagagatgaaattatcacttacgtagctgaatgcaagtttccatggattttagcttcctgcagcatggaggctagcacctttttcttagaaatggtcgggcaatttcaaaccaagtctttattagatccaattattattggacctacctttgatttaaactagatgaccttaaaacaggcttacatgccccggtttttgggaggaaggcttaaagtgaaatggcctgatgggctggtattcaggacaacgaggggcatgccttttaatagggtcgtcttaattagactgaaagcagttagatcatgtggagtaagttcccacagaggaattgtgcatgtagtgaagtactctcacttcagactttggagaagtttgccctgcagaagctagattttggctttactgttcctttcttctctgctattcagtgtatttcagggatgttctattctatatccagcggtaggtttcttctctccaattcaatatctagcaataggttttcaatgacatgtctatatcttttgtactctggctccttaatggtggttctctttttttctacacatatctcattgtgtgactaactaattgaaacgagtgctctgttgcactgttgttattaagtaggactactgcagctatctcctgtctgtagaccttatggtgtaagtagtgtcatccttcaccaaatgcaacttcttacggaaactgttattctaggtagatagtcctgtgtaagagtgtcaatgctttgaaagagatgatcgtaagttggtcgcaaaagttacattgaacctttttgaagtaaatctctctttggattttcttgttgcttcagtttgtattcaaattccttctttatgactttaacaggtataatgttgctgttaagtgtgctaccattacacctggtagagtcccttaaacttttgttcccatatttgattatatttccttttgcattaaggtgcacatatttcactagtatttatgttttatttttccagtgtcccttttgaatttttttttatatatatgtgcttctgtcataagcatatgatttaatttctgtacctatttctgggacattatttgttctctgaatattttcccttgtcagcttggttttgatgagttcaaaagttacattttaattttcttatgatccccactattttcatgatgcagtactagcattattttgctagagccatagtaaaaaatgttatatatgtgacaatctttgagaaaaactattccgcatacttcaaaagaaacaaattaaaggttctatactttgtaatacttatttgagttatttgagctgtcagcaaagccaactatgattagccaccttttcctgggctacgcaattctaccttaaatgaagttgatagtacctatagatatactatttctgaacttcttttggttgagtgtatgtagattgtatttttaatcttgggtactttgtttgtcttattttcctcttctctttatgcctatatgcagatgaaacaagagttaaagagttcaaactcaagtcaatgtggaggagcccaaatggcaccatcaggaatattctaaatggttaatttttcaactcttgagatgtctttgatcttttatttacttggtgaaatgattctcgaactgaattgacatgcactctgtgaattttgttagtgggataaatttaaatttctagttaatgcttataataaaattttatggggtcaaaattgagaattctggttgccttaatgttggaaattttacacacacatattttcatatgtactatacttcatcctaatgtggagtgtttaaatatacctgtagattctgacaagtagcaataacatgaaatttacttgaaatatacttattttagcacagatactgataatcctgagtagcaataatatgtcaggaactgcaacaatataaaaaatattctgtaccatgatcactaatgttcaccatgacatacaggaactgttttccgggagcccatcttgtgtaaaaatgtaccacggatactttctggtaaggaattattgaaatattgtcatgggaacaagtgactaagtgactgttttccagactaaaggtaattttcttctataggctggaagaagcccatttgcattggaaggcatgcatttggagaccagtatcgagctactgatacaataattaatggtccaggaaagcttaaaatggtttttggtgagcttcagttgacagctacttatttgtataccatctaaagctgttttgttgctcatcagtttgttcttttggtactgaaaatcagtcccagatggtgctgaacctgtggagttaaatgtttataattttaaagggcctggtgtggctttatcaatgtataatgtggatgaggtatgatagaaaatcaatgcagttcactgccttattattctcttgaaagctatgctaacttttactctctctctctctctctctctctctctctctctctcacagtctattagagcttttgctgagtcatcaatggcaatggcactttccaaaaaatggcctctttatctcagcaccaagaacacaatattgaagaaatatgatggcaggtatctgggattgccattatttccagttatttattatgtaccagtactatagtcaagcactcttttgttgccacaaggagtgccttctgacttctattgcaaagttactctcttaacctttatcctctcggtacactgcttcatacgtgtctttatgatttctctggtctcttaacaatttataaattagtatgaggggcactaaatctcattgtaaattagtggacaatagcagtgtaccgagaggataaagcactctttagtatgatggttattgtcctcggtacatatgaaaatatcaagcactctttagcatgatggttattgtccaatgatttaaaaaccatactgcagctgattatattatcataaacaagtccaatcctgacataggcagttttgatatcaccaaaggttcaaggacatcttccaggaggtatatgaagagaaatggaaggagaagttcgaggaaaactcgatatggtatgtgatattttacattaccatattttaccactaaagttcttcgtgaattccaaacaatatttggatcatgcacccaggtatgagcaccggttgattgatgacatggtggcatatgctgtgaaaagtgaaggtggatatgtttgggcttgcaaaaactatgatggagatgttcagagtgacttccttgcccaaggtttgtgctttctagttgtagctttcatgaagctgaatggtgatatttggcagtataattgctttgcagtgtggatttttctcctattcctctttctcatttgatactttttcccctcactgagcacttgtttcaggttttggttccttgggtttgatgtcatctgttttggtaggtcacacgaatccttttgctccattgtagaatctattcatctattgtgttttattggtccctaagtaaacatgctttattctgcagttatcttctgatgggaaaacgttagaagctgaggcagctcatgggactgtcactagacatttcaggctacatcagaagggacaggagacaagtacaaatagcattgcttctatatttgcttggactcgtggactagaacataggtaatcacaatagttggtgtaaatgatgaattcaatgcacaagcaagttgatctgctaggatattcccccttttgcttcttgttcataatcaatagaaaaccggtataccttttcttacccacagatgtaatgactgcccttttctttttcagagcaaagctggataaaaatgataggctgctggatttcacaaagaaacttgaatctgcatgtattgaaacagttgaatcggggaagatgacaaaggatcttgcactccttatccatggccccaagtaagccaatttatgcatatgtgtgagttttttcatggtagttcagaaacttaaatgtgtaacagctcaagacaaagtgttaatataataatacaaagtagatagtcctacagtgacatggtttctcaaaaagtagagttgcagtgatcataatagaaaacttaggcagctaatattactgtagcttttctacggatggtgatagatcatagcaagcatcaaataattgttcttgctgattgcaaggcagttagtacaccaaatagtttaaatatttttcagaagtggaaattttaagcgcttgttctgctgcacatttttagaccaaattcctgtatactcgaaccttttctttttttggatctgtgcggtagggcagcctgtttcacatataacaagaaaaatttcggtgtttgtatcagtgtgttatactggttgctgctattggcttattgcctccgctgctctgttttatgtattgcctggttttcacataagcttgataacaagtgtgcactgttcctgttgtcagggtaacaagggagttctaccttaacaccgaagaattcattgacgctgtggctcagcaactgcgagaaaagattcaaataccagctgtggtttaatcctcaatatgcaaattctatgtctggttggaagcctatcattgggtgcagcaggttcactcgctgtgcattcgcgcgcattttgattggggtgatgagacggatgatcccatttaatagtttgcctcgaagcgatttttgtttcagcctaccattttatcatgttaaactgttaataatctgctagtgctaagtgaattggtgatttcgctactcaattcacaacctcgcatggttgggtaaattaccttgaggtcaatacataagcgtagtctc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
