Os04g0550400
| Gene Name |
Os04g0550400 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001060024.1 GI:115459777 GeneID:4336589 |
| Length |
8158 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0550400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:27949927..27958084 |
| Sequence Coding Region |
27953184..27953204,27953275..27953435,27953524..27953710,27953814..27953933,27954072..27954155 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:27949927..27958084 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:27949927..27958084 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ggggcccctgtttctcctgccaagcggctggcggttgcacccacctccgaagataagaagctcgattttactgtactcaaatacaaaaaccaaaagctctcagagcaactagaagcccacaagtttgagtatcgtgctcttgaaaataaattcgctgggctaaaagagaagcagaggactcataatgagacactttccttggtcaacagttcttgggaacaacttgtggcagacctgaagtcaagatctttttgcaaaagtggatctcctaattccagccctggttcagggcacaacaatgtacaaaaggatggtacttgtgcacccatagagagggacactcttagaagtcttgtggaatctggtgcaactgaaagttcaggttgtttgcctggttgccacttgggaagtgatgcccctccattacatctatccacagctaatgctcttggggatatcttttttccatcaagtgatcttttgcaagcaaatgaggagtgtgctttggctgctctcactaaattaccagaaaatgaccgcagtaagcaactacagagtactagtagcaacctgttgtccagcctcaataatgtcgtacaagcattaagtaatcttcagttgaagcacaagcagttagcagaggattatcaaaatcaaagagattccagtgcccgaaaaagagctgaacatagacgtctaaaagaggagttggccagtgctgcttctgagttggaagaaactaactacaaactggcagcacttaaagctcaaagagataatacacaaggagctcgaatcccatatcctacattaggaaacaaaaatatgcctgaagataaggtcagagataaacaaagagagatgcaggatcttgaagctactcacaaggaattatcggaattgatttcaaagcggttggtggaaattaagagattacatgaagagagaattgaaattttgaacaaaatagcaacttttcagaatatcttgatggatttcaagagcattcgttcttcaaaagcttttcagcttgttaatgatcgacttcagaagtcacaagcagaattggatcactaccagacattattagagaaattacaggttgataaggataagtttgtgtggcaagaaaggcaatttaatttgaaagttgatctggctgagattcctgagagggtttctacatattgtgagtctagcattgctgatctcaagaaggatattcagaaactatgtgatgaaaaaaacatgcttattctcaaacttgaagaggcttcaagagaacctggtcggaatcaagttattacaaaatttaaagctttagtgtcatcgataccaagggaaatgggcgcgatgcagagtgaaatgaccaaacacaaggaggcttccttggagttgaattctttgcgagcagaagtccattcactttctcgcattctgtccagaaaggctgtttattttgttttatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>GAPVSPAKRLAVAPTSEDKKLDFTVLKYKNQKLSEQLEAHKFEY RALENKFAGLKEKQRTHNETLSLVNSSWEQLVADLKSRSFCKSGSPNSSPGSGHNNVQ KDGTCAPIERDTLRSLVESGATESSGCLPGCHLGSDAPPLHLSTANALGDIFFPSSDL LQANEECALAALTKLPENDRSKQLQSTSSNLLSSLNNVVQALSNLQLKHKQLAEDYQN QRDSSARKRAEHRRLKEELASAASELEETNYKLAALKAQRDNTQGARIPYPTLGNKNM PEDKVRDKQREMQDLEATHKELSELISKRLVEIKRLHEERIEILNKIATFQNILMDFK SIRSSKAFQLVNDRLQKSQAELDHYQTLLEKLQVDKDKFVWQERQFNLKVDLAEIPER VSTYCESSIADLKKDIQKLCDEKNMLILKLEEASREPGRNQVITKFKALVSSIPREMG AMQSEMTKHKEASLELNSLRAEVHSLSRILSRKAVYFVL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4881..4901#4650..4810#4375..4561#4152..4271#3930..4013#3518..3711#3003..3170#2542..2766#1907..1994#1665..1826#3..62#gcggggcccctgtttctcctgccaagcggctggcggttgcacccacctccgaagataagaaggtatttgcgcatctcgagccagctctgtatcgttttgagttaatgtttatggtggtaccgtgttagtactgtttgtttgagttcatgtttatggtggtagtactgtttgatatgttgttgtatgatagctagatggtggcatggtgactgatttttagctgttttgttatgtcatggaatccatacatccgctaaaagatctattgtggactgtttgagtatagatcgatgagtttattcttgacaagtgtttgatgcttttgtacttatgctgagctctatgcaattgcaagtcttgctgtgttgtggtcgttagtggaagaagccctatgtatattgcctcctgtcagagtgaaaacaaaaatactagtaggaatgagctatgcattatccgtttcggattctgcaactattgcacgattgtttatggttctttagagcaattgatgtattctataattattactcggtgatagatgggaggctgacttgtgaaattgttacttgacttacattgcattcttgttttcccgtgttcatgatagcagaaagtggcaattccttggtaaaccttcgtattttgagttttttaaatgatcttagttttttgtggctacatttatggatattgaaatggttaactttggactagtagcggatctagaagttctcttgagcttgggcaaacctaaacgaatgggctagattataggattaataagtattatttttttgtcaaaagtagataatggctgttggagaactgtgtagctttggccttaggctgatggcagcaaacattggtgtgaggctgtgtcttgactcctttgttgcttgcatagctgatttagcctctattaaaagaagcagattaagcaggggcattaagtggtaatccactggctaatacggtggagcccgggcacctgcccgtggtggccgggccctagctccgctgctgctttggacaaatttaattttcttgctggcaatgataccataatgtgccaatgcttatttacaatcatagcgccttttatttttccatagcatatgctattgttttttgatatagataaaggtctaaattgggtcgttaaattaatattaatgaaatttgtcaccaagttactactggtgacaactgacaattaatcgctgttactaccggtgacaactggcaattattcgcctactttgttatttaattttacaagagggaaatatgggaaaagattggttaaattttgggagggataggtcaagggtataatggcatgttggatgataccttttatgcgtttactcatgtgttaccgtatttggtccaatatggaatatccatgcacaaaaccttttttttcttttgtcctgtagcatgaaatgaacctatttatcatgttggtgatatcatcagtacggctccttttgtgtttatgttctgttttggctctgctcttcttcaagttgtaaataaaagatacttgaatgttggttcagcttttctttttatgcttgaattagtgatttctctttgttgccaaacacatatctttagttttgatttcgcacactgcctacttatattgtcttgtttggcagctcgattttactgtactcaaatacaaaaaccaaaagctctcagagcaactagaagcccacaagtttgagtatcgtgctcttgaaaataaattcgctgggctaaaagagaagcagaggactcataatgagacactttccttggtcaacagttcttgggaacaagtaagctattattttgtgcatgttttaccaaaaaagacagactttataatgtttcttcctgaatccctttatttgatcagcttgtggcagacctgaagtcaagatctttttgcaaaagtggatctcctaattccagccctggttcagggcacaacaatgtacaaaagggtatgacttcctttattttctaaaaacatcccaactacattttcctagacaggttttgaaatatgggagtgccatctactccctctgtctcctcatataagggattttgacattttgcttgcactgtttgaccattcgtcttattcaaacatttttggaattagtttttttgtgacttattatccaaagtactttaagcacaacttttcgttttttatatttgcacaaatttttttgaataagatgagtggtcaaacagtgcaagcaaaatgtcaaaatcccttatattatgggacggagggagtatttaagtagcaaatgattatcactatggaaaaaccttttgatctggtcatctttgtggtccattgctcttgtggcaattgtttaagataatgctgcttggttgcaaaaactgcacttttcagattatgtaataagttataagttatttatgttaatgagcttgatatgcattttaacgatggccgctcctattcttttccatagttgcctatcaggttaactataaaccttctcttttcagatggtacttgtgcacccatagagagggacactcttagaagtcttgtggaatctggtgcaactgaaagttcaggttgtttgcctggttgccacttgggaagtgatgcccctccattacatctatccacagctaatgctcttggggatatcttttttccatcaagtgatcttttgcaagcaaatgaggagtgtgctttggctgctctcactaaattaccagaaaatggttcgtcttctagttcatatattctgttaactagtactcccttcgacccataaaaaaccaacctagttttggatgtgacatatcctagtacaacgaatttggacatatctctgtctagatttgttgtactagaatgtgtcacatccagtctagattcgttttttgttggacggagagagtatagctttcagttgtactaatacaaaagaagtactaatttcatccatgttctgtagaccgcagtaagcaactacagagtactagtagcaacctgttgtccagcctcaataatgtcgtacaagcattaagtaatcttcagttgaagcacaagcagttagcagaggattatcaaaatcaaagagattccagtgcccgaaaaagagctgaacatagacgtctaaaaggtatcttgtttagagattgtgctgatgtttctttacagttgttttaactttcaaataagcatccatgccatttaaaggaacatgtttcgcaacatttgagacctgctatacatcttgaattatcaaacatgttgccatcaactcctatctatcctccctacgcattaaccagcaatcttctggagagcattcttgcgataataggctgtactgttgcagtactcttatatttactgcgccagcgcttcagacttgtaccatattttccctatacatttttttacctagatacgttgtcctaatacattgggtaaaactaaccagatgttttggtttactttgtcaagaggagttggccagtgctgcttctgagttggaagaaactaactacaaactggcagcacttaaagctcaaagagataatacacaaggagctcgaatcccatatcctacattaggaaacaaaaatatgcctgaagataaggtcagagataaacaaagagagatgcaggatcttgaagctactcacaaggaattatcggtaactgccatcgttcatttttaaagttccaaattactacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgttaatgaatctagatatctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtacctgtgatatgtatgatctgacccaattatcaaccaggaattgatttcaaagcggttggtggaaattaagagattacatgaagagagaattgaaattttgaacaaaatagcaacttttcaggtttgttgattggtcaagcacagaatgcatccttgcttagccttgaaggcccatgcttaatatttattgcatgggagaattttttagtatcagaacctgtatgactaactttgtgtgtgtgtttttaatctcctccagaatatcttgatggatttcaagagcattcgttcttcaaaagcttttcagcttgttaatgatcgacttcagaagtcacaagcagaattggatcactaccagacattattagagaaattacaggtggttactggtcagtggatttgttggattccagagttgtatagcaaaaatgtctcgctagagcatttgatcttttgttgaattcctatttgatatgtttcaggttgataaggataagtttgtgtggcaagaaaggcaatttaatttgaaagttgatctggctgagattcctgagagggtttctacatattgtgagtctagcattgctgatctcaagaaggatattcagaaactatgtgatgaaaaaaacatgcttattctcaaacttgaagaggcttcaagagaacctggtgcggtagttactattcactttaccaagagtaactttcaaacttgtcttgctaaagcaggtaataaggaattgtttgcacttgtcaggtcggaatcaagttattacaaaatttaaagctttagtgtcatcgataccaagggaaatgggcgcgatgcagagtgaaatgaccaaacacaaggaggcttccttggagttgaattctttgcgagcagaagtccattcactttctcgcattctgtccagaaaggtaaattgcttgttattggcttgcacatatgactcgcaagtgttatggcattgattcgccaatgtgtcaggctgtttattttgttttataggaacgtgataatgaagaagcatcatgcagatctgcccgtgcgggatctgatataacacaacttcaatcagtggtatcttgtttgtttagactcagcttattttttctcttcattaaggtgttttgtttagctattgcaggaatttgtcctcccatgataatttgacatattgaaaccaaaaccctgtagatttctgatctgaagcaaactaataaggagcttaagttgttcgcggatatgtataagcgtgaatccactgattccaggtatttcaattttatatcatatataattctcaacacaacttttttttttggctaagacttgtgatattttgtagagatagatgcatctcacttcttaggacagagtgcagtgtaatgccgtgtttaattgtttacctatcatgtatttaattcattgcacggtcactctactatggccatgacatttcatcactcatcaccagtaacttaagtttatttattttgtgatggaaataacctttttttgtgtgtgtggcagggaaataatggaatccagagatagggaattccttgaatgggctcatgttcatgccctgaaatcatctcttgatgaaagtaagctagagcagcgtgttaaggctgccaatgaagctgaagcaatcacacagcagaggctagcaactgcagaagctgagattgctgaatcagggcagaagcttgggacttctagaaagtacagaattatgcttctgaacattgtttctcttagaactgttgaagtaggggtcacttctcttttagggttactaaaggaaattgatgcttactgctgaatgttcactgtgttcagggatctagtcagtttatcccatatgctgaagtctaaacaggaagaatgtgaagcttacagagtggaggtcgaggtgtgtgccatcttttatgcatgcagttcaagtatggctttaaacatatattaaacattgtcatcctgagtttgaaacttttactaacctattccagtgtatcgggcaagcatatgaggacatacaggcacaaaaccaacaattgctacagcagattattgaaagagatgatgataataccaaggtagtgactcaatgatttctttaaagctattatctcagataatcctctcccaagcttatagttttataagagttcccatttaccactgtaccaaatctggttgcacaaatagctttcatgtttctgatatattcataggatgttagatttggttatattgttaatttgattgttccggagactcagtacttcattgaaaagctgtttacttgcgttaagttggtgatgcggaatttcataaaataggccaaagttccaaacccttgtggacagcaactactggttgccaaaaaaaaatccttgtggattcctggatgagtattgcctgccctttatttagatatctttttgaaaagaaagttagaacatttttctaaatgaccatcaacagttttttttttgggtaaatggtgttgtttcaaggtcaaagaaccagagaaaatcaggacgactgcgccttttaatagtagagataaattgaaaatttttagccgtgctatttgtaccatagctccttactctttggagtgcccttgataatccaggcagcctatccaagggtcctgaactcctgataaatctacagttccagtgattgtgtatgttttgatccaaaattttagtttgatgttttattgaaattttactgatagtaaagcttgtttacttcggatgtattgaataagaaatgtgctaactctgcatttggtatttcaatcccattgaggaatggaagctttaggatgaatcaatctggtagtaaactattttttcagtagtcgtaacatttttgtttggtgaaatctacactgcagatttttatggagggtgttaaagcaaaacagacacaagatgctttgcatttggaaacatattctttgcgcagaaacttgcagcaggaaagctctttgatggatctgtacaaccagaaaattgtttccttagaagatcaggtaggttgaacgcaaatattgtataatccaatacaatccttccaggaggtgctgaatattattttcccctgattcccagcttaaaatgtggtctgatcgggttgggaaacttcaagaggatggatggcaacaatctgtttcattgagtaattaccaaagaaagctggttgatgtgcacagagatgctcaaaagcttatgcaatcattggatggaatacaagcgaatgttggaagcagtcgtttggaagtcgctgatctgcttatagaacttgagaaagagaggtgctctataagaatattttacatttctatgggctaattttttccaatagctgatctaacgagatgagttacattccaggtttagtaagaagagaatagaggatgatttggaggttatgtcaaggaaagctagctctcttagagccaaggcacgtgaatcagcagtcctggaaaagcttcgtcatgaggtcaaggagtatagggggatattgaagtgtggtatctgccatgataggcagaaggaggtaaatgatcttgatttcgttctttgacactcttgacaatataacctgtccttttaacaatataacctgtcaaaagacactttaacagtgagcaatcaacattggatattcagatctaatatattccaattgcaggttgtgattaccaagtgctaccatctcttctgcaatcagtgcatacagaagtcccttgggaaccgacagaggagatgtccttcatgtagcttgagttttggggctaatgacgtgaaacctatctacatatgaggttgttaatttcaagatggtatcgcaggcatctagatcaagctactttgatggtcattacttggtcatatggttagatgaccatgcgagttgaagatatgacaagtactagcttgtacaaccaaacatataagcagaatgtagtagcctaatttggttggctacatggaattgcaggtgtctggcattcgtgatgctaatgtttattcctgctcccttgtatagttcgggattctcctggagtagttaagtcgctagattagtctgacttttgctatatccattctgttcttttggggaaaaaacatccaacaaaaggggtggtgcttcccgccatactgaaacattgtaccatatatagcttgtagttccattgttgtagcagacaataagaatgtaggtcttacgggttttcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
