Os04g0568800

From RiceWiki
Revision as of 11:23, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os04g0568800| Description = Protein of unknown function DUF810 family protein| Version = NM_001060127.1 GI:115459983 GeneID:4336702| Length = 48...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os04g0568800

Description

Protein of unknown function DUF810 family protein

Version

NM_001060127.1 GI:115459983 GeneID:4336702

Length

4819 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0568800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:28981955..28986773

Sequence Coding Region

28982639..28982863,28982948..28983133,28983227..28983313,28984663..28984755,28985601..28985732

Expression

GEO Profiles:Os04g0568800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:28981955..28986773 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:28981955..28986773 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggctctaagtttggttgacagtgctattcttaaaataaataagtggtgttttagacaattggagaattatcattcatactttaataaggttggccacctccattgtttggatcacagttttttttcagctgttgacaactcaatctttgagggcatgctaaacttggtagttatttcagaaacaagccgcactgatgatgatgatgatgatgaaaaagccatgctcattgggaccccactagatgctacacaagaatctaagttgattcacattcttgttgtcagatccattcaagctgcatataagcatgccctaatttcatcagattgccaatcaaaggcagaatttaagcatccattaataattcttgcaaacgaattaaagctagtggcggagaaagagtgtactattttcagtccaacactttgtaaacgataccctgaagctggaagagtagctctggttctcttgcacctactgtatgggcaacagctggagctatttttggaaaggatggataattcagaaagtttgaaagagatactggcagcaacaaataattttgagctttgtgtagctaagaagctttacttaatgaatgagggagctgttggttctttgctgtccaaatatttaaagccatacatggtaaggcatgacttatatttgatttttctcgttgtgtttttctatcacaaagacattattcattgttggtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MALSLVDSAILKINKWCFRQLENYHSYFNKVGHLHCLDHSFFSA VDNSIFEGMLNLVVISETSRTDDDDDDEKAMLIGTPLDATQESKLIHILVVRSIQAAY KHALISSDCQSKAEFKHPLIILANELKLVAEKECTIFSPTLCKRYPEAGRVALVLLHL LYGQQLELFLERMDNSESLKEILAATNNFELCVAKKLYLMNEGAVGSLLSKYLKPYMV RHDLYLIFLVVFFYHKDIIHCW</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3911..4135#3641..3826#3461..3547#2019..2111#1042..1173#tgaaagatacaacgcaaaattatgtgaagccccaaagaaattcaaccttaaaggcgagacctatcattggatccagagctatcatctcaactttagactatatgagaaattactttgcatcgtgttcgatattctcgaagatgggcagcttgtggaggtttgctcttctttactctctatacatcattatttccttgttggtcagcttaaaaatgaaaatgtctaggttttgttgaataagtaaatgactaaatctgaaacattcttggactgccttgtgacagtaagtcaacggttttatcctgagttgctgatattgttatttgattttacatccaggaggctgatgaaatactggaaacagtaaagctgacctggactatattgggtatcacccagaaattgcatgacacactctttgcttgggtgcttttcaagaaggtctgtttactgctatatatcatccttttcttctttaattggggtgttttatctgttttacgattttaccttttagaattcagaatgagcacattgtgaatagatagacttcctatcaagtcctctacatttcctttgttgctgaagtgcctagatttgtttatatggacaagtggtactgctgatatgcaatccgataatgtgccaacatgtttgataccaatagcacattgtttgacagggtctttctattcagaagaaaaagagttacagtttgttgtcgttcaattaattatcttctgaacaatgataaattaaatcgcctttactctgcttagtccgtgtcttatcttagaggaaaagtttccttctttcattcaaagtgccaattttgatctctgagcattttgtcagttctaatacccaccacactaactcttatgattattttccttctttcagtttgctgaaactggggaaattcttctacttaagcacacatgccttcaaacacagaagcttcgattacataatgatgctaaagaaatagagttgtatacaaacagctttgtttgttcagcggaagcctgtggcggaaacatggctctaagtttggttgacagtgctattcttaaaataaataagtggtgttttagacaattggagaattatcattcatactttaataaggttggccacctccattgtttggatcacagttttttttcagctgtttttttttcttttccatccaccaagggctcactttttgtgctctggctgcttattgaaaaagctattaatgaatattaaacctcacttgctgccagtaatatgagggccatggtcacatgatgttaattagcggttagtcttctagtacattacctaatcagccatgcaaactgcttaagcttgtggcattaagtcattgttgggtaccacatgaaagatgatcagtcatttgatcactcttgccaggtcctcaaaatttccaagagttgcttgttgacccagggctgtcttatgattgaatcaatattcattccactctaaaagaagttatatccatgttcagattacaagctttatcactgatcaaacatgcaatacaagtatgattcatcgaattagagccattggtcatcggtttctttttttctttttttggttatgcaaaggtataaggcatatgtgcagaacttgcaagacagtttttgatgtaggtagaatatccttcattatttgtcttatgacctgactatgttagcgacctgctgtgcccatacaagtcatgaactgaaaaaggttaatcgtcaactgtataaatacataaagtgatatgtgacatacgtgtataactagtatgactagtatgcagtctgcataaccaagaaagcatgaaggggaaatttattgtgaactggaaaaagacccatgattgttcttgattgaattaacggtgcaaattattttattaggatcaatttgcaatatttttatttttttttgcaaaaaagttaaattctaccataaagcttttcacataagtttctttgacttgacttctgtaacaggttgacaactcaatctttgagggcatgctaaacttggtagttatttcagaaacaagccgcactgatgatgatgatgatgatgaaaaagccatggttagatttattatacttatgctaaagtactggcataatatgcttcactttttgaaactcaaaacattacgaattatgggcttgccacttttcatccacaaagagcatgggaatgttttgctctttggctagctttccctagccttgatagtgagcaaggaaatctttgctaggaaaggagagacaaatagattgtcttctccaaagcagggaagccttcttatgttccccaaaacaaaatcaagcgtggaaaccaaacatgtattcttgtctgctaaccttgctaggcaagagggggagagaaaccagtatgcagtatcactctcattcaattacagagaacagtataatgttgtttaagccattttgtttgaataaaaacaatcacatgtttaaaactttttggaagtgtttaaatcatagaatattagttttactatgcttgttgaatgatgtaaatatttttcttgagttctgtataactagccagccatcaaactagttgtcccctaggatatgtttaccatacatggcaagtctaaacttggactggggtgtcatctaggtccttgaagttgtaaaatgcgtatttgggtccataatcttggtttaatgtatcatccgatgtccaaagtgcagatgacgcagcttgggtgctgatgtggcaatccacggtggtgagaattttgcatttagccccctcatgctacagtatgccttcaagtctactcccaccactcccaaatcttttggtgcatggcttaaactatgaatttgctggatgctgagaaatgcatatttgttgatttggggtggtaggagtcgatttcggggcatactatagtgaagaggcgtaagtgcaaaattctcgtcactgtggacaagcctgagttgcatcctctgcactttgggcctcgagtgatacattaaaccaagattaagggtgttttttagagggaaaaggagaagattgagaagataagtaaaacgaggtgagccattagcatatgattaattgggtattagctatttcaaacttgaaaaattgattaatacgatttttaaagcaacttttctatatatttttttttttgcaaaaaacacaccgcttagcaattcgggaagcgtgcgcgcagaaaacgagggacttttcaccccttgtgcttcaaaccaatgcaccctaaggaccccgttttacaagttcatggacctagatgacaccctagcccaagtttaaggactggccttgcattttactcttgatcattgtgtcatgctactaaaattctcaattttccttatgaggttcttctaagtactatgctttgatgtgtttttgtcaatttcagctcattgggaccccactagatgctacacaagaatctaagttgattcacattcttgttgtcagatccattcaagctgcatataagcatgtgagttaaatcatctgatgggccacttaaataacaatccatttggtaataaaatatttattggatttctgatatcataccatgcttcattaggccctaatttcatcagattgccaatcaaaggcagaatttaagcatccattaataattcttgcaaacgaattaaagctagtggcggagaaagagtgtactattttcagtccaacactttgtaaacgataccctgaagctggaagagtagctctggttctcttgcacctactgtatgggcaacagctggttagtctagtaactcccttctaagctgtaacaagtttgttctgtccacttcaaatgatgtttactattctcattggtttcaaggagctatttttggaaaggatggataattcagaaagtttgaaagagatactggcagcaacaaataattttgagctttgtgtagctaagaagctttacttaatgaatgagggagctgttggttctttgctgtccaaatatttaaagccatacatggtaaggcatgacttatatttgatttttctcgttgtgtttttctatcacaaagacattattcattgttggtaagctacctgtaccttggatgtctttactttttattcaaccacaaaagataattaagaccttgggttgacaatggctaattggctgcaattatctgtggaaagaccctgcagaattttattctgctaccgttttacagtaaaactataataacatgcaatcctgttagtttaggcagcagtcctgctagatgttagggtcacggtaaaatcatactaaccttttttggtgtcatttggcatttccatggatacatttacattgaactaaatgatatttctgtaattccaaaacagatcagtcaattttcttcacctctcattcttcaatggctgcatgttcaacatgagaatgtcttggagtggacaaaacgtaccattgagatagaggtctgttgctacatgcaaagttcactactagctttttctttttattaaataactaattgttcttcaactgcctcaaaattcttatgagcttctgctcatttacactcacatatagcataaggaaaaactatgtatgttttttttggtatgaactggtatatgtatctgtgtttggtgcaaagtagatcggatttaacattgccatccacacggttttatgtagtaattgcaataactagcaatatacgtcttgcaagttaaattgataattgcaatcatgttgaatcttgcaagaaag</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0568800, RefSeq:Os04g0568800