Os04g0682400
| Gene Name |
Os04g0682400 |
|---|---|
| Description |
RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) domain containing protein |
| Version |
NM_001060831.1 GI:115461391 GeneID:4337438 |
| Length |
5291 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0682400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:35231918..35237208 |
| Sequence Coding Region |
35232286..35234815,35234888..35235120,35236934..35237197 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatccatttcctcatgctgctgctgctctcgatccatcctcagttctcaacgcacaatacaaacacacacacacagagggagagggagacgcagggtcaccacctaatcaccaccaccacctccaccacctcctctcttctcgggattgttactgctccactcactgcttggcccttctctcaccttcttccaacttccccctctccttctactcccctccaggatcgaaccccgcgcgctgcaacaagcctggcattttgaacctcttctttgtgaaccagttgcaggcacaattacgaggtggaaaagtgactttggctgctcagcaggagggtttcagtgacaagatgaattctggtgctgaatatgaagatggcagtgaggaagaagaaccatatgaacgtgtgttttatgatgatgaagacgatggcaatgatgattcaatatgtggggatccctgtgatgattcagtaccaaaagaggaggtgcacaggaagcttatgcatgaagcagagccatatgatgatttggtggctggtgaggaggaatctgttgagaactctgctctgcaagctttcaagaaggaacgaaatgagcaagagctcaagcaggcccagaaaatgggttacagcattaagcaaaaggagataccagtggacatggaaatgggaatgaaaccgttcaaaaaacggcttgtcaagtttgctgatgatgtatcatgttacacatacagtaccgagagttttgctgctgcaaagttggagaaaaggaaagctcagtttgatgaccaggacaagcacctccataagaaacaggaacacactccaccttcgtttcctcaggatggtggcaagctgaaagaagtggacaacactaatctgtatgtgggcaacctacctgcttctgtaggttctcacaagctcatcgagctatttctacctttcggtcaaattgtcagatcaagagttgtggatgattgtttcactggtttgagccagggatatggctttgtgaagtattctgatcctcgctgtgcttctgaagctattaagcgcatgaatgggcgcttggttgaaggaacagctctaaaggtcagagtaactggttttccatcatcagaggataatagccagcagccttcaaaggaaactgacatggctaaattgtatgtgtgcaacctttccttgtccatgaacacagacaggctgattcatctttttctgccttttggggaagtaactaatgcaaaggtggccaaagatcacacaacaggcttaagtaaaggatatggctttgtgcagtactctagtcctcaccatgcagctgaggctgtcatccatttgaatggacgtcttgtcgatggaagaaagatagaggttcgagtatctggcataccttcaacactgccaaattcagctgttgaatcacccagcaccaccagaaattcagctgttgaatcacccagcaccaccagaaccgtcaaggaaattgacatgtctaatctgtatgtctgtaacatgccatcgtcaattgacaccaagaagttggttgagcttttccttccatttggtaagatcacccatgcaagagtggtggcagatcctgacaccttttcagccaaaggatatggtttcatcaagtttactgattctgaatctgctaccaaagctattgcagcaatgaatggagcattggttggaggagaaatgataattgtcagagttgcaggcctttccccatcagcatccatctcagctgtacagaccactcaagacatcaacaagtctagactatacatcactaatcttccacggtcgatgactgccgataagatggttaatcttttcgcgccctttggtcagatcactaaagtcctgatgaatctggagtatagtctagtgtggtatgcagatgcaccctcagctaccaaagctgtccaacacatggatggatacatggttgaaggaaagaggttagtggtcaagagatcagagttatgtacaaccaacgcttcacaagcaggtggcaagccaatcaaggaaatcgacatggccaatctctatgttggcagggttccatcaagtttaactgaagatcaattcatcgatctcttccgcccatttggacgagttgttcaagctagaatgtttcgatttcagaggtatggcatggttaggtttgataatccttcatgtgctgctgcagcaattgatcatttggatggctaccagattggtggaagcatactggctgtgagagtcgcggggcttccagcagaatccaatgcagccaagggtgctctgacatcacagatgtcttctaatgagcagggacaaatcgacatgactaacctttatgtgagccatctcccgagctatgttaacaacgaaagacttatcgacctcttcctaccatgtggccaaatcactcaagcaaaagtagttgttgagagatacactggtgtgagcaaaggatttggatttgtcaagtttgctgatgcttactctgctgctgtggctctcactcacatgaatggttaccctctggatgggcatgtgttggaggttaggatagctggtgttcatccagatgctatgagcagttacatggcgcatttctactcccacttcacaatgcatgatcccgcaaaggcggctgtcggaatacctacgtcctattggccgcactattacgatgaatccgcatacaatacaacagctgagaacctgggccaagtcaccactacatctgcaaccgatgcttctgctgctcaaacatctcagaaggaaaggttgcctggatctaaatcagtcgatttggttgctgagaaagattgctcttctgcgtcgaacaaagttgccaattgttctgagtcacagccaacagcttgggctggtccacctggctttgagcctcatgccatctccaagaaatgtactgctgggtccaatgcttctcaagcttgttcaaaggatcattttgcacagtcaggaggtggccacaaaaggcgttcaatcgtctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNPFPHAAAALDPSSVLNAQYKHTHTEGEGDAGSPPNHHHHLHH LLSSRDCYCSTHCLALLSPSSNFPLSFYSPPGSNPARCNKPGILNLFFVNQLQAQLRG GKVTLAAQQEGFSDKMNSGAEYEDGSEEEEPYERVFYDDEDDGNDDSICGDPCDDSVP KEEVHRKLMHEAEPYDDLVAGEEESVENSALQAFKKERNEQELKQAQKMGYSIKQKEI PVDMEMGMKPFKKRLVKFADDVSCYTYSTESFAAAKLEKRKAQFDDQDKHLHKKQEHT PPSFPQDGGKLKEVDNTNLYVGNLPASVGSHKLIELFLPFGQIVRSRVVDDCFTGLSQ GYGFVKYSDPRCASEAIKRMNGRLVEGTALKVRVTGFPSSEDNSQQPSKETDMAKLYV CNLSLSMNTDRLIHLFLPFGEVTNAKVAKDHTTGLSKGYGFVQYSSPHHAAEAVIHLN GRLVDGRKIEVRVSGIPSTLPNSAVESPSTTRNSAVESPSTTRTVKEIDMSNLYVCNM PSSIDTKKLVELFLPFGKITHARVVADPDTFSAKGYGFIKFTDSESATKAIAAMNGAL VGGEMIIVRVAGLSPSASISAVQTTQDINKSRLYITNLPRSMTADKMVNLFAPFGQIT KVLMNLEYSLVWYADAPSATKAVQHMDGYMVEGKRLVVKRSELCTTNASQAGGKPIKE IDMANLYVGRVPSSLTEDQFIDLFRPFGRVVQARMFRFQRYGMVRFDNPSCAAAAIDH LDGYQIGGSILAVRVAGLPAESNAAKGALTSQMSSNEQGQIDMTNLYVSHLPSYVNNE RLIDLFLPCGQITQAKVVVERYTGVSKGFGFVKFADAYSAAVALTHMNGYPLDGHVLE VRIAGVHPDAMSSYMAHFYSHFTMHDPAKAAVGIPTSYWPHYYDESAYNTTAENLGQV TTTSATDASAAQTSQKERLPGSKSVDLVAEKDCSSASNKVANCSESQPTAWAGPPGFE PHAISKKCTAGSNASQACSKDHFAQSGGGHKRRSIV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2394..4923#2089..2321#12..275#tgcgaaagaaaatgaatccatttcctcatgctgctgctgctctcgatccatcctcagttctcaacgcacaatacaaacacacacacacagagggagagggagacgcagggtcaccacctaatcaccaccaccacctccaccacctcctctcttctcgggattgttactgctccactcactgcttggcccttctctcaccttcttccaacttccccctctccttctactcccctccaggatcgaaccccgcgcgctgcaacaagcctggcattttggtatgtatttcttttttcttttaatttttgtgtactagttcatccgcttggaacatggtacatggttcttggccttctgggttcatcttcttgctgggaagcaatcggtttgattgttaaccccccgcgatcttcagccagcgtgcgtgcttcttttgtttgtgctgtgcgattgtgccgtggggtttggttatagtttgattctttgctcttttttttctttttctttttttagggttttgtgtttgatgcaaggattcagttagcgcacacctgttctcttcgaaagctttatttagtgatgtttgcgttggtgtaaagcatggagagttcttgcgaattaatgggttgtgatggaaatgctaaaaaaatgtaaagatcattaattattggcgttacagaaaccacaaatttgttgcagggggctaactagagatgtggagtgttaaaaatgtcatggtatcaccgtgctgcgggttttgtgaaattgtttccttgtttttttccttttggtaatattttggaggaagatcgtgtgaaatcactagtattaattgttttgtgaggaaggttatgtaaaattgtggtgcctcttgaatcttgatgccataaccagcgtatgacttataagttaaataaagcttccattatctaaaaaaagatgacttataagttataacatgtcgggatttttgactatttcatcttaagaacaaattaaaagcaagacaagtactaacaagtttacatgggtgcaaagattaataggcaagggcgccaagctgtgaggaactagatagatttcacagctccccgttgggaggcacactgcttgcttattatagctgctgcatgtgtactgtttgtgttactgcgcacatatttccttgagaagctttctttactactgtttgtgttggtataaagcatggtgagttcttgagaatagaaggtctgtgatggaatgataatatgcagagatcatggattattgacggcaaagaaaccacaaatttgctacaatggggcagctagagatgtgtaacgcgatgtttgattatttgcactttgtcatctcaccggggtgtcactgtgctgcagatcgtatgaaattattatatttttaggaaggtgtgtgtatgtttgcttgttttgcacggataaatgtgtgaaatatggtgtcatgatggcatcaccaatgtgtgccctataacatgttggcattgatgttaaaagcaacatagaactacaagagaagtaacaagttgtgcagtgcaaatttacatgagtttgaactatatataaacagatttcacagctctctgttgggaggcacattgcttacttcttataagagcaggatcaataataccgcccgttgctggctataaaattcgccatgtcatttagtaggctatatagtatatagatgtagcttgcgttttcttcccttgggcaggccaaaagctgcatgcacaaactgattgctgtccaatcaccatttatcctgaacagctagtacccaatcactatgcgtaagcaagggtatggccaattgcagtaaatcacctagtcttggaggctgcgtgcatccggcgctaatatagtcgcccgcttaagttctctgtcgttgattccctccgccaactcagcttttttgccatgatggatatattatagcctgcttaattctcctattgtacttgctctaagcttctgcatgtgtactgttactcaaacacttgttaatcctcctttttttttgcatgtgtactgttactcaaacacttgttaatcctcttttttttttcagaacctcttctttgtgaaccagttgcaggcacaattacgaggtggaaaagtgactttggctgctcagcaggagggtttcagtgacaagatgaattctggtgctgaatatgaagatggcagtgaggaagaagaaccatatgaacgtgtgttttatgatgatgaagacgatggcaatgatgattcaatatgtggggatccctgtgatgattcagtaccaaaagaggaggtgcacaggtaaagtggcaaagacacatttcatgtggagcatttcatcaatctggtgcttaattctcgcagtacttgcaggaagcttatgcatgaagcagagccatatgatgatttggtggctggtgaggaggaatctgttgagaactctgctctgcaagctttcaagaaggaacgaaatgagcaagagctcaagcaggcccagaaaatgggttacagcattaagcaaaaggagataccagtggacatggaaatgggaatgaaaccgttcaaaaaacggcttgtcaagtttgctgatgatgtatcatgttacacatacagtaccgagagttttgctgctgcaaagttggagaaaaggaaagctcagtttgatgaccaggacaagcacctccataagaaacaggaacacactccaccttcgtttcctcaggatggtggcaagctgaaagaagtggacaacactaatctgtatgtgggcaacctacctgcttctgtaggttctcacaagctcatcgagctatttctacctttcggtcaaattgtcagatcaagagttgtggatgattgtttcactggtttgagccagggatatggctttgtgaagtattctgatcctcgctgtgcttctgaagctattaagcgcatgaatgggcgcttggttgaaggaacagctctaaaggtcagagtaactggttttccatcatcagaggataatagccagcagccttcaaaggaaactgacatggctaaattgtatgtgtgcaacctttccttgtccatgaacacagacaggctgattcatctttttctgccttttggggaagtaactaatgcaaaggtggccaaagatcacacaacaggcttaagtaaaggatatggctttgtgcagtactctagtcctcaccatgcagctgaggctgtcatccatttgaatggacgtcttgtcgatggaagaaagatagaggttcgagtatctggcataccttcaacactgccaaattcagctgttgaatcacccagcaccaccagaaattcagctgttgaatcacccagcaccaccagaaccgtcaaggaaattgacatgtctaatctgtatgtctgtaacatgccatcgtcaattgacaccaagaagttggttgagcttttccttccatttggtaagatcacccatgcaagagtggtggcagatcctgacaccttttcagccaaaggatatggtttcatcaagtttactgattctgaatctgctaccaaagctattgcagcaatgaatggagcattggttggaggagaaatgataattgtcagagttgcaggcctttccccatcagcatccatctcagctgtacagaccactcaagacatcaacaagtctagactatacatcactaatcttccacggtcgatgactgccgataagatggttaatcttttcgcgccctttggtcagatcactaaagtcctgatgaatctggagtatagtctagtgtggtatgcagatgcaccctcagctaccaaagctgtccaacacatggatggatacatggttgaaggaaagaggttagtggtcaagagatcagagttatgtacaaccaacgcttcacaagcaggtggcaagccaatcaaggaaatcgacatggccaatctctatgttggcagggttccatcaagtttaactgaagatcaattcatcgatctcttccgcccatttggacgagttgttcaagctagaatgtttcgatttcagaggtatggcatggttaggtttgataatccttcatgtgctgctgcagcaattgatcatttggatggctaccagattggtggaagcatactggctgtgagagtcgcggggcttccagcagaatccaatgcagccaagggtgctctgacatcacagatgtcttctaatgagcagggacaaatcgacatgactaacctttatgtgagccatctcccgagctatgttaacaacgaaagacttatcgacctcttcctaccatgtggccaaatcactcaagcaaaagtagttgttgagagatacactggtgtgagcaaaggatttggatttgtcaagtttgctgatgcttactctgctgctgtggctctcactcacatgaatggttaccctctggatgggcatgtgttggaggttaggatagctggtgttcatccagatgctatgagcagttacatggcgcatttctactcccacttcacaatgcatgatcccgcaaaggcggctgtcggaatacctacgtcctattggccgcactattacgatgaatccgcatacaatacaacagctgagaacctgggccaagtcaccactacatctgcaaccgatgcttctgctgctcaaacatctcagaaggaaaggttgcctggatctaaatcagtcgatttggttgctgagaaagattgctcttctgcgtcgaacaaagttgccaattgttctgagtcacagccaacagcttgggctggtccacctggctttgagcctcatgccatctccaagaaatgtactgctgggtccaatgcttctcaagcttgttcaaaggatcattttgcacagtcaggaggtggccacaaaaggcgttcaatcgtctagcaccattcacttcaggccacttgtggcttgatc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