Os05g0102800
| Gene Name |
Os05g0102800 |
|---|---|
| Description |
Similar to AML1 |
| Version |
NM_001060923.1 GI:115461576 GeneID:4337535 |
| Length |
6961 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0102800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:138804..145764 |
| Sequence Coding Region |
139154..139318,139465..139644,139878..139946,140031..140115,140220..140814 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:138804..145764 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:138804..145764 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgatagcttctggagccattgacaggaggcacctgtcgccattcaccccaacttcagacgactcctcatcttcattcttctctcaggaccttgtccctacagagaggcaagttggattttggaattcagagtcaatggtggatcacaaagggagcaagtcagtttttgcttctccacttgaaaagatccaacccaatggagcaaatcatgcaggagatccggaaactccaggaggtcaagccttcaagggcctggacatccttagcctcagcaatttgatgcggcaagaaaatgcttcaggttcaccgtcactttcttggggtgagatcctcacaaaccccatatcgaggcttggcttgtctacaagagaaacagcttttgttgaaccaactactgctgatcaacatgtgcctggttatgggaagggactttcatccagctccctctctgaagtattcagtggcaaatcgagagaaatagtaagtggtgttctttgtcaatctactgggacacatacctccatctacgacagtgatgaacctctagagtccatggaagcgatagaagctcaaactattggagatctccttcctgatgatgatgatgatttaatatcaggtattgccgatggatttgaatttactggcatgtcgaccaaccaggatgatgccgatgaagatatattctgcactggaggaggaatggaacttgaaaacaatgattccgtaaaaggtgacaaagttcaggatggatccttcaagagccaaatttcttcaggacactccatcaataaacaaccttcccgaactcttgtagtcagaaatattactgctaacatcgaggattctgatctgacggttctgtttcagcaatacggggacattcgcatgctctatacctccttcaagcaccatgggtttgtaactgtttcttattatgacataagagcagcccaaaatgcaatgagagcgctgcatagcaagcctctggggctgatgaaacttgatgtgcaattttcttttcctaaggaaaatgttccaggcaaggatattgataagggaatgttggtggtatctaacattgattcttccatctccaatgatgatcttctccaaatgctcagtgtttatggtgatgtaaaggagatttccagctctcctataagctgcaccaagaagtttgtagagttctatgatgttagagcagcagaagaagcactacatgaccttaataagggtggaatttcaggcccaaagttcaaggttgaacttagccaacatggagaggcaggatcttgcttgaggcagcaacattctagagaatggaagcaagacagtttgcctcaccaacctaaaaactcttcacctgggaccattggaaagttgggcaccaaatgtcaggacaacagcactgttcataatttattttctccagttaaccaacaattggagagcccaacccagtgcatctctacgactggtcctcaaattttatcttcacctatcagaattaaatctacacttcagcacaataatcaagcctctgttggcgatcttagtggacctcttggtcaaggaaactttggacgtggaatacaaaccctccacccacgctcattgccagagcatcacaaccgcatttgtaataactctaagtccatgacagtaagtggtaggaatgctagctctagacaagacggagtggatcacaatatccaaaaagtgggccctgctggtttttgcggtcattcttttgatcaaaataatgaagcatttggctttactgaaattggaagttgcccccttcatggatatcactacacctggaaccacacaaatgtttttccacaaagtccctcagctccaatactgtggtcgaacttgcagcacccaatgcacgtgcatagttatcctggtgtgccgcctcacatgctgaacacaggttcttatcccatggaccagcatcacttgggttcagctcctgacaatggaggcagttttggaaatgtgcactcttttcatccaggatctctcggaagcataggtttgcatggtagccctcagttatatccatcagaattatctgcctttgcatccagcagaggaaattttagggaggccttgttctccccagttggcggtggatttcaatcccttcagcaaatgtgcaatgcaatcaatggtcggaatcctatgatccatgtttccacttcatacgatgctactaatgatcggatgaggagtcgcagacatgatggaaatcctgcacagtctgaaaacaaacggcaatttgagcttgacattgatcgcatagcaaagggtgaagattcacgcaccaccctgatgatcaagaacataccaaacaagtacaactgtaagctgcttttggctgtcattgatgagaaccaccgtggaacctacgatttcatctatctcccaattgattttaagaacaaatgtaatgtggggtatgcttttatcaatatgactgatccgcagcacataatcccattctataagacatttaatggcaagaaatgggagaaattcaatagtgaaaaggtggcgtcgctcgcatacgcccggattcaaggaaggagtgctttgattgctcattttcagaattctagcctgatgaatgaagacaaatggtgtcgacctatgcttttccacaaagatggtccaaatgcaggagatcaggagccttttcctgtggggaacaatgtccggtctagggctgggagaaataggtcgctcatcagcttggacactaaagatgcaagtccatcaagctccccagaccaagaaagcaattctgtcggcaccgcgaactcaacttgccgtacgaccttggagcaaacctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVIASGAIDRRHLSPFTPTSDDSSSSFFSQDLVPTERQVGFWNS ESMVDHKGSKSVFASPLEKIQPNGANHAGDPETPGGQAFKGLDILSLSNLMRQENASG SPSLSWGEILTNPISRLGLSTRETAFVEPTTADQHVPGYGKGLSSSSLSEVFSGKSRE IVSGVLCQSTGTHTSIYDSDEPLESMEAIEAQTIGDLLPDDDDDLISGIADGFEFTGM STNQDDADEDIFCTGGGMELENNDSVKGDKVQDGSFKSQISSGHSINKQPSRTLVVRN ITANIEDSDLTVLFQQYGDIRMLYTSFKHHGFVTVSYYDIRAAQNAMRALHSKPLGLM KLDVQFSFPKENVPGKDIDKGMLVVSNIDSSISNDDLLQMLSVYGDVKEISSSPISCT KKFVEFYDVRAAEEALHDLNKGGISGPKFKVELSQHGEAGSCLRQQHSREWKQDSLPH QPKNSSPGTIGKLGTKCQDNSTVHNLFSPVNQQLESPTQCISTTGPQILSSPIRIKST LQHNNQASVGDLSGPLGQGNFGRGIQTLHPRSLPEHHNRICNNSKSMTVSGRNASSRQ DGVDHNIQKVGPAGFCGHSFDQNNEAFGFTEIGSCPLHGYHYTWNHTNVFPQSPSAPI LWSNLQHPMHVHSYPGVPPHMLNTGSYPMDQHHLGSAPDNGGSFGNVHSFHPGSLGSI GLHGSPQLYPSELSAFASSRGNFREALFSPVGGGFQSLQQMCNAINGRNPMIHVSTSY DATNDRMRSRRHDGNPAQSENKRQFELDIDRIAKGEDSRTTLMIKNIPNKYNCKLLLA VIDENHRGTYDFIYLPIDFKNKCNVGYAFINMTDPQHIIPFYKTFNGKKWEKFNSEKV ASLAYARIQGRSALIAHFQNSSLMNEDKWCRPMLFHKDGPNAGDQEPFPVGNNVRSRA GRNRSLISLDTKDASPSSSPDQESNSVGTANSTCRTTLEQT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6447..6611#6121..6300#5819..5887#5650..5734#4951..5545#4383..4775#4228..4307#3664..3815#3469..3585#2928..3086#2432..2832#1955..2272#1283..1328#1068..1175#gcgtgcccgacccgaacaagggaagaagagaagaggagagtagtggcaaactaggctagtactcctgctgctcgccttgttgtttgcgttattgtttgtttgcgtgcggcggcaaggcaacgcgaaaaaagatttgtttttttctattaatattattttggagggccaggggcggttctcgtctcttgtttgcttgcagtgcgggggaagaaggagatgaagcccctggccagggttccccgcctctctctctcttctccaactagttaagctaagctaatgtccatttccatctccatgtccttgcttcttttctttggaatcgctgccttacgctcaccgagaagcaacttgcattttcagcaagcaaccatttctttcatataagcaaaccccaatccaatccaatcccaaccccaaccacctctgctctgcttcctttccctccctgttactactgcattttgccattaatcttctctctccctttccacctcctgcaacctcttcatttctttgctgctgctgcttcaggtgagctgagtcgtcctttcctcccctcatgccaaaatttctagaggcttcagcttaatcgtcacatctttttcttacacaagttttattatgagatcaccaccacctcttcttgcctcaccacctgctggtttctcttttttttttcgaataagagggcaggagggctgcctctttttcattaataaagaaggagctggtttctcatttttaccctgcctttttttttccttctcttttggctcgattcagtttatcctctgctggtttaagagaaatatattttctccttgttggaatgggccatctttttgtacatgtgtagttgctctcctctaatccctaacccttgaggggcacacatcttctctctttcttttgggtgtcctgttgctaatctctcctgtccttgtgcaggaagttgatgaaaggggccaaaagtttgagagattgaggcggtgaagaaaccacaaaaacaggaatcccaaagtgacccaaggcaggaaaaaaaaaagggctcttccattgcacctatggtgatagcttctggagccattgacaggaggcacctgtcgccattcaccccaacttcagacgactcctcatcttcattcttctctcaggaccttgtccctacagaggtactagtaataaacaaaccagaaaaccatcctgcctgccactgatttctttttattctgcaagactgtagcacctcaattattttcccttccatgcttcattgcagaggcaagttggattttggaattcagagtcaatggtggatcacaaaggtgtggatcatgcttcatttgaaaattattatctcatggttgttgcttcttacatgatggaaattattcagattggtgctctcttctgtattcttgttaatagtaatctcctaaatagatcatacctgacttgccttacccaacttatgcttgaaagaacagttcgggaactcatctttcatgtttatgggagatattggtgattgcttgttattgtggtcacttcccgcccgttctttgccaccaatttaactaactaactataacctataaaaccagaatttttaggctgttgtatcattttattagttcagattatttactgccagggatttcctgtttagactagatactgcactggttggctaaaagtgatcaagtatccaattttggtaggtaaagatatccctgaaacagttcagcagggaatgagtaggaactttacttgtgggagaatgcttacggaattttgtcccaagacagtttggtaggaactagttggacagttaatttagcacagttcgatattaaatgatcaatttatcatatgatacatgtattgaaggttgtaatatggtgataggttaaatagttcttcaggaactgactgtgatcattaatggcagggagcaagtcagtttttgcttctccacttgaaaagatccaacccaatggagcaaatcatgcaggagatccggaaactccaggaggtcaagccttcaagggcctggacatccttagcctcagcaatttgatgcggcaagaaaatgcttcaggttcaccgtcactttcttggggtgagatcctcacaaaccccatatcgaggcttggcttgtctacaagagaaacagcttttgttgaaccaactactgctgatcaacatgtgcctggttatgggaagggactttcatccagctccctctctgaagtattcagtggcaaatgtgagttccctttgccttctttttttcccctacaagccatgttgatagtagaattttatcatcttagttgcactacaaccaaaagtactgtttttgaaagaaaccacaatattgttcattgaagattaatcttttctaagagttcatgatgttctgcagcgagagaaatagtaagtggtgttctttgtcaatctactgggacacatacctccatctacgacagtgatgaacctctagagtccatggaagcgatagaagctcaaactattggagatctccttcctgatgatgatgatgatttaatatcaggtattgccgatggatttgaatttactggcatgtcgaccaaccaggatgatgccgatgaagatatattctgcactggaggaggaatggaacttgaaaacaatgattccgtaaaaggtgacaaagttcaggatggatccttcaagagccaaatttcttcaggacactccatcaataaacaaccttcccgaactcttgtagtcagaaatattactgctaacatcgaggattctgatctgacggttctgtttcaggtattgaaccttttccttatttcatttcaaattttggttttagtttagtaaacaatatccttttgaacctatatacacacatatatatctttcagcaatacggggacattcgcatgctctatacctccttcaagcaccatgggtttgtaactgtttcttattatgacataagagcagcccaaaatgcaatgagagcgctgcatagcaagcctctggggctgatgaaacttgatgtgcaattttcttttcctaaggtatgcataataatatcagtagttttgaattaggcatgctacctaatctatatatcttccttatcatgccatttgttacttgggcaatgttgttctgtttcatttttcattctaacttgctacaaaatcatgctattacttttactggtgccccttgtttatttattggtttttgttccttttagcatgcaataatcatttatattctatgttttgaaaattaaatgctgttgttacatagtactgagacacgcagtcgttccggtaattgcgctacttctaacatgctatatatttgctctaaatctgtctgcatgccactttatgagttcaatagataaacacttaatatctgatgctgtcatgtcgcgtactttgctaggaaaatgttccaggcaaggatattgataagggaatgttggtggtatctaacattgattcttccatctccaatgatgatcttctccaaatgctcagtgtttatggtgatgtaaaggaggtagctatactgccataattgagtaattgactacaaaactgaaatccacacactatggtaatcatttgttgtttatagatttccagctctcctataagctgcaccaagaagtttgtagagttctatgatgttagagcagcagaagaagcactacatgaccttaataagggtggaatttcaggcccaaagttcaaggttgaacttagccaacatggagaggcaggatcttggtaatttgcttggctgaatttttttctacccgtttttggtattatcttttcatactcgtgctagctatcgttgccttccttcatactataggtttagtatgttagttacctttgggagatgggataatatcataataaaatatgttcactgttttcttaggtaaaattatgcaaatactcctagatgcaaggaatgtatctcaagttctcattcacggtttttctcatagctttgcagccactaacacacctattggtcgttctttcattttgtggaacagccaaatatcaactctatgtcaatcacttgaaccttttaaattttcattagggacaaaccaactgggcgtgtaacttttttttaagcgttatttgattagtgtggtgaagattttatttatgtacttaacagcttgaggcagcaacattctagagaatggaagcaagacagtttgcctcaccaacctaaaaactcttcacctgggaccattggtacaatatattacttggatatattttggaaattgttgatcattacttattttgccctttttcatgccaaaacaggaaagttgggcaccaaatgtcaggacaacagcactgttcataatttattttctccagttaaccaacaattggagagcccaacccagtgcatctctacgactggtcctcaaattttatcttcacctatcagaattaaatctacacttcagcacaataatcaagcctctgttggcgatcttagtggacctcttggtcaaggaaactttggacgtggaatacaaaccctccacccacgctcattgccagagcatcacaaccgcatttgtaataactctaagtccatgacagtaagtggtaggaatgctagctctagacaagacggagtggatcacaatatccaaaaagtgggccctgctggtttttgcggtcattcttttgatcaaaataatgaaggtaacagttctcagcttcaactgctcattgttggctttactaacctatgtttttattatcataacaacataatggtgaacctttttggaaatattggatgatgtagttgatgaattgaccagcttaatgattttttttgttagaatttcatcagcacagaaattgttttttgcagcatttggctttactgaaattggaagttgcccccttcatggatatcactacacctggaaccacacaaatgtttttccacaaagtccctcagctccaatactgtggtcgaacttgcagcacccaatgcacgtgcatagttatcctggtgtgccgcctcacatgctgaacacaggttcttatcccatggaccagcatcacttgggttcagctcctgacaatggaggcagttttggaaatgtgcactcttttcatccaggatctctcggaagcataggtttgcatggtagccctcagttatatccatcagaattatctgcctttgcatccagcagaggaaattttagggaggccttgttctccccagttggcggtggatttcaatcccttcagcaaatgtgcaatgcaatcaatggtcggaatcctatgatccatgtttccacttcatacgatgctactaatgatcggatgaggagtcgcagacatgatggaaatcctgcacagtctgaaaacaaacggcaatttgagcttgacattgatcgcatagcaaagggtgaagattcacgcaccaccctgatgatcaagaacataccaaacaagtaggttctgcacatcttgccaccggttgccagctgtcttgcacattactcaggtatcttttttttcttctgttgactcaagtcatacttgatgtgatccacaggtacaactgtaagctgcttttggctgtcattgatgagaaccaccgtggaacctacgatttcatctatctcccaattgattttaaggtctactttttttttcttagtgtaaaagattgcaactgtgagtacaatttcaggactgacttttgcaatgttcacttttctcagaacaaatgtaatgtggggtatgcttttatcaatatgactgatccgcagcacataatcccattctataaggtatacatatcatgcatgcattactagttaagcttctccgtttttaatgtaccttccaagatctaagcatagcatatgatataacagtatttttattattgtgttgcattcttttttgtgggaggaagattttttaaaaagtatttctgccctgtagagtactgccagttttcccctggcattttctaattgaaagtatgcataggattaattggacttgacatttgctgcagacatttaatggcaagaaatgggagaaattcaatagtgaaaaggtggcgtcgctcgcatacgcccggattcaaggaaggagtgctttgattgctcattttcagaattctagcctgatgaatgaagacaaatggtgtcgacctatgcttttccacaaagatggtccaaatgcaggagatcaggtgtgaatatctctagtgcttattgtatacactaaatataccatatgagtgaccacttctgactgaccctattcgcacaaaatgattgacatggcggttttatacatattattattttctgataaagatacatattattattgcaggagccttttcctgtggggaacaatgtccggtctagggctgggagaaataggtcgctcatcagcttggacactaaagatgcaagtccatcaagctccccagaccaagaaagcaattctgtcggcaccgcgaactcaacttgccgtacgaccttggagcaaacctaatcactaactggagggcacaagaagctgtaatgataaactagggaattcccagttttgctaagtatttatttgactatcagggagccaaagtttgtgacctgtgagtgtaatgatgaatgaaaggctctgccaggcaaggcatcacctccactaaaattatgagagggatcatcagttttgccctgtgtatggatggagctgtgaactggttggtattgtaacggtactactacttcagtagagcaacaagtgtgtgcgtgtgaatgtgattgactctctgagagatgagaactggaagctgtacagttgatgagttgagtagtcgagtctttggttgagattgaccaccg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |