Os05g0109600

From RiceWiki
Revision as of 10:03, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os05g0109600| Description = Armadillo-like helical domain containing protein| Version = NM_001060971.2 GI:297603682 GeneID:4337585| Length = 599...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os05g0109600

Description

Armadillo-like helical domain containing protein

Version

NM_001060971.2 GI:297603682 GeneID:4337585

Length

5993 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0109600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:494992..500984

Sequence Coding Region

495678..495941

Expression

GEO Profiles:Os05g0109600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:494992..500984 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:494992..500984 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>tggaagttaactgcgctgcacctgttgcaggtaatgatgaaagatcagtttgcaaactatgtggtgcagaaggtgctagagacttgtgatgatcagcagagggaggcgatccttacaaggataaaagcacatctgaacacgctgaagaagtatacctatgggaagcacatagtagcacgcgtagagaagcttgttgctgctggaggtatgattgtactgtcttattgtcattcagccattgtttcttgctgccatagggactaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>WKLTALHLLQVMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQREAILTRIKAH LNTLKKYTYGKHIVARVEKLVAAGGMIVLSYCHSAIVSCCHRD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5044..5307#ttcttcttcttctcgcctcttctcttctcttctcttcccccacactctctcactagcttagcttagctaaaaaaaagaagaataaataaactaaaatgggagcttgaatccctcccaaatccgcaccattacgcgcaatccgtacacctgctcgacccgcacatggacctttcttctccgattcgcccgctctgagcaaccgggatccgtttctgctgcccattttttgttctgtttttgtttttggtttcttgggggtggaaatcttggccatctttcttgcgactgtaatggcgggggttttagcttggtgagacactgtagatctcgtcgtcttttttgatttgggtttttcggatggtgacggagatggcgacgcgcggggaggcggcggcggcggcggcggcggaccgggacatggagctcttccggagcgggtccgcgccgccgacggtggagggcgcgatggccagcgccgccgcggccgccggcgacgtgttcctggacgatgagctccgggccgacccggtgtaccagagctactactactccaatgcgcacctcaacccgcgcctcccgccgccgctgctctccaaggaggactggcgctcggcgcagcaccgcctccgctcctccgccctcggcgggatcggcgacggcaggaggcagccggccgcggcggcgcagggggatgggctcgtggggttgcccgggatcgacctcgatcggcaggggagcttctccagtatcttccaggttgtttgctcgcccttttgatgaattaaagatctcatcatcttcttcttctttttttacttactttttcagtagtatatgtccatcttgattcagtactgtatgctatgggagatgatattcttgaccttgcagctgtgtgcatttgttgactttattgctacatgtagtaatgtttttgtgttcaactaccatttcccctcgctgtctcactagtccaccttacccaatatggttcaaccacttaataagcttaattgttcttattgatggtcacaacttctatgttttttttggcttggtttgctgatcataagcattttagtacgcctttgtgaactgttggtttcctattattcagtttcatcttatccaatccaaggtaattgatcagagctgtacaacttgttgcatactatgcaggagagctcgtatcagctggacatgggtaagcagggcgccgaccgcaacattagtgactttctggattcttctcggccacagtatgctctgcatcgtgagactagtagagctatgggtggtctgcagagtgacagcaatatacaaagcttggctgaagttcagaacaatgattcatcagcacatacatatgcctctcttttaggatcatctctttctagaagcgcatctccagatcctgagcttgttaggagggtccccagtccttgcctccctccaattggtgtgaaagtcagtgctgatgataagaagaacaatggtggttcatcttccttccgtcgaagttcgtctgctattggtgaatctgataatctgatagctgctttatctgggatgaatttatcatcatctggagcagctagtggacagcaaactgtgacccagtctgagctctaccaggatgttgataatgtccgtaagtttctatttgatcgtcagggtgatcaatcaaatggcaaccagcaacactcctatatgaaacatcccgaacaaggacattttaaggcacctgatggttactctgcaaactcgcctaattcttctatgataagaaatcaaattaatgctgctagtttcacatcgtttgacaatctgtctgctggatcaggctttgcttctcctaggatcggttctaggtccccaggtgggactttatcttcaaggcagaatttggttggtggatctaactttctgaattacaatggaattggaagtccaaatgcagcaacttctcttcaaacagccattgatccgtcatatattcagtaccttcaggcagctgagattgctgcccaactcgcagctagctgtgatgatcctctcatggccagtggccatctgggaagttcttatatggatttacttggtcctcagaaagcttatgctagtccattgcttcagtcacagaagaactgtggctactatggaaaccttggatttggccttggttattctggaagtcctttgatgagtcctgttcttccctcttcccctgctgcacctggtagtccacttaggcatggtgaacgcagcatgcgcatgcaatcaggtataagaaactttggtggttcctttggttcatggaatcctgacctaggtggaaagatgaacatcaatatgatgccttcactcctggaggaattcaagagcaacaaaagcaaatcttatgagctctcagaaattgctggtcatgttgttgagttcaggtacacttgtcaatttcataaccttgtagcttctatagcctgctgaattgcagtactcaagtacagcgcggctactaatgcttttgactagtttttttttaatgatcaaccaaaaaaggcttgacatgaataataatatggttagatttatgatttggtttaatctagtttgttctccatttatttcttacaacatgtttctatctatttccggggaagaaaatgttagagatatgctttgacatgtgctacagtatgtaaaaacattagtacaagacatcaagacatgtgactgtttccatctgatctgtctcttgttaactatgattgtgacaacgcttttgtccttattgatgttacatggtttatctactaataattgacaaacttatagtgctgatcaatatggaagccgattcatacagcaaaagctagaaacggccagtactgaagagaaggacatggtcttttcagaaatcatgcctcaagctctcacgttgatgaccgatgtatttggaaattatgttgttcagaaggtaaaggggttaaggggaaaaacataatctcttcaagtgttactttgtgataaatattcttatagtttgtcatttgactagttctttgagcacggaagccctacccagataaaggaattggccgaccagcttattggacgtgttcttgctctcagtcttcagatgtatggatgccgggttatacagaaggtggttattactggatcttttctttaaccttggaagttattaagagttcttgcttttttggaattttttatctgattaatctgtgttattgcccttttgaatgggtcctagttgcatttactatttaatgcactgaaaacttgttctacctctcaatacttcccaaggaccataaacaactccttttgcttacttatacaaatacataaatggtcagaaccaaccattggaagagcagagcaaaacaaaattgtcgtgactgattgaggttgtgtgtatttttatcagtgaatggtacaattcctcacttctgatgtaagacacctcagatgtattctctgtcatccaataacaacagtaccaaactatggaacactttcaggaaatatttttataggcattgatgtagtcatgacttgctcttatctatacaaagtacagaccctttgttaagtgtatgaatgcataaatgattgaaggatatcaaggaaggcaaaatctgatgtcatggatgatatatatgcaggctatagaggttgttggtttagatcagcagactaaaatggttgctgagctggatggacacgtcatgcgctgtgtacgtgatcaaaatgggaaccatgtaatacagaaatgcatagaatgcatccctcaacatgctatccagttcattgtctcaacattctatggtcaagttgtgatgttatccactcatccatatggttgtcgggttatacaggtatgcatataatatgcgtgtaatcagtttatgttgaggtttacagatgttaatatgcaaactcacttgtcatccttcatgtgaaactcccagagggtgctggagcattgtgatgatcctacaacacagcaaataatgatggatgagattctccagtccgtttgcttgctggctcaagatcaatacggcaactacgttgttcaggtctgccccatgacattgttgcaaattgtatgatttgtatcatataccttttgaacctaaccaaacttctagattgttttaccatttacatagtgtaacgtaattacttcaaaatgattttactgcttcgcaattactatgtgtgttctagttgtttgatgctttcttaagatttagatatttctagtcttatgctttcttaatggtgacttgcagtgaagtgaggtagaccattttctgattttgcagtagcatctttaggttgtttttttcctgatcttccagtatcgtacccgtcctgtcacagtaatatgtaaatgaatggatggttactgctaactatctgctgttgttgaaacaacaattatgatattcctagtagtttttctagtttttaattaagccataattttgtaatccacggttattcaccctgtaaactctgtaagaattggttgtagcttctctgaagtaaagaccagaatgcattccattatctaaaaaaaaagtgtgctaatgttgaattctgcttcacttttcagtcttagttcttagaatcttggcatcctatgttagtttgaaggtattttattttcactctttttttgttttaacattgaacacactactttacagcatgtactggagcacggaaaaccacatgagagatctgctattatcgagaagttaattggacaaatagttcaaatgagccagcaaaagtttgcctcaaatgtcattgagaagtgcttagcctttgggaatcctgtagaacgacagattttgatcagtgaaatgcttggatccactaatgagagtgaacaccttgaggtttgcattcttaaaacttatacaaaccaaatttggcttaagatttgtccagctacaagtttgctaaatcttgtaagatggaaagctgattttagagacctgatggaagttaactgcgctgcacctgttgcaggtaatgatgaaagatcagtttgcaaactatgtggtgcagaaggtgctagagacttgtgatgatcagcagagggaggcgatccttacaaggataaaagcacatctgaacacgctgaagaagtatacctatgggaagcacatagtagcacgcgtagagaagcttgttgctgctggaggtatgattgtactgtcttattgtcattcagccattgtttcttgctgccatagggactaacaatgtttaatattcgttgttgcgacgcaaatgcagagaagcgactagggcttcaaccagcatgcaccagtgccgcctgaagggcaagcaatgctgtacagctaacagtggctaggtttggtttgcactcacgttttcgttttttgcaactaaaaacgtaggccagtatggcctatttgagaaataataaaaatacgcatcttaaaatcgcttgcactggagagtgtatattatgtagttgaggagcacgccgcaggcagcagggatggatgatggattgagtgagtgatgtgtgcaagtgctaatccaatatggaaggaagaagttgtaaagatgaggaggaagaagaagatgagtatacgtactctgctgtacaaattttatttagcactagagagatgaaaagaaaagagagaggaagctgttagctgtcaatatgagtgagtgatgggttgttgttgatgctgtaacataactagagtactactcagggcacaaaactagcctaagccctaagccttgtttttagtttttacagtttaagctgaagttattagtatcagctttgctgaactgtttgttaatttgttgtgtctgccgtgtcattgtgtgttgttaatccagtcatgtgtactgtactatggtgtaatgtaatgtaatccaggatgatgttgatgcactgttaa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0109600, RefSeq:Os05g0109600