Os05g0163400

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Gene Name

Os05g0163400

Description

Zinc finger, RING-type domain containing protein

Version

NM_001061271.1 GI:115462272 GeneID:4337902

Length

7086 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0163400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:3696376..3703461

Sequence Coding Region

3696595..3696732,3696836..3696982,3697064..3697162,3697244..3697695,3698039..3698722
,3698819..3698900

Expression

GEO Profiles:Os05g0163400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MAGHQYNNSQMSRMDHMDRLNNEPPPFGQKLFMHPRSDPANGAG SSGYVGNTMRSNDLPSSSYAGQAYGQQNRAPIHASYSGHAPAGSSSGSYAPYNTQHMP ASSYPHGSEDNFIPSSHVDGRRVALKRRNPIIHPTDGFGVGNYYAGSSSNTQFSRPMP PNPIPPPESCVRMPSHLGSNHWNDHRYVNHEGSQRNVRGRHDHSTIHLEQSPAAACPS SSINVPPYHPNANGPFGSAPVQRDRAPLSVHPRILPPGPDGSSIAFRERPYYPAPQST NISAPVPTLPISCDSAPFAHGGYAPRSAHRNNLRTYPPPAFASSSNPGAVSHEPAIPS YPPAAPSYPPATSAASSSVQPFHAEAAAHLRHPRHVSVGGSGSARSRRMRDSYHGFHH LMIEDNNLGRSAAERFMMLDQLVIHESREAFDPHWDMRLDIDDMSYEELLALEERIGH VNTGLADEKISGCVMEVACCSSSHLQDDQDNERCVICLEEYKHEDTLGRLKCGHGFHC NCIKKWLQVKNTCPVCKAAAADEGS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6730..6867#6480..6626#6300..6398#5767..6218#4740..5423#4562..4643#tttcttttttatttttttcttcgaggaggaagcaaacagcgtcgctccacgaaaccatcgctgcggttgcgtgctcgcgcgaagaagaggagagagaggaccaaaccctcgtctcctcctcctccggtggtggggggagaggaggcggcggcggagaggacgagccgtctactggatcggccgcccacgaggaggtattgcccccgttcccctccgattcgctccccccaaattccccccgcgtaataatccaagggtttgtgttgatcgggtggggttttctcgccgggtagaccatttcctgcggttgattgttggtgcgtgacgggagcggagcgtgatcgggtatcggacgtggtcggattgatgggggaatttctgggattactcgtcgtcggcttaataatcgatgaggcgggtgtgatgtacagcggcgcgattggtcgattcaggtttcagagtgcttgagatcatgtgatttccgctgcgaaggaagttttcatctcctgtgactggaatcacgcgctaatccgtaccgaactctctctattggggcgtcctgttggtgtcaaacaagccgttcacagcgatcctgtctgttcataactattgtttgcctagttgcaattaactgtttatctttgtcagtctaatcttttggccataggttgttctcgccccctaatcagttgttggaacttatctttgtgctttagcttctatggatgagtcgtaggtgtgattgtttagtagtaaaattatttgagtttttgtcttgttcaaatcacgcatttaattggaaaatgttcctcaccaccactgagtctttcagttctatcaaggagtcagcatcttctggcccagccttttttgcgttgctacactttagttcgagagtctcatacatacttgagccaccaactatatacctttggagatttttcttattttccctcttaggcacaatattgacatagtaaaagtacatcataaatttaacttcaagagctaagctctactaattaaagtggtcctttattcttcttattgtccatgtaagaatagttcagtgagaagagttatttgacccgtgtaacttttaagtcagcaaacatttttgtttgactccttgtcctgtctattagcagcctagcatggcatctttagttgaactcttctacaagggactacactatctaatgtgttatcacagtttcttatgtaatagaaatgcaattcatgtcatttcttagcatctaaatgatcaacggatagaaaaaaaattatatgacgtgtataactcatgctatatctgaaccttcaagtgtaccttcttctcatgatgcttctcccaatggaaagcatccctttaacccttccatccatattggttcttaaatttccatgtcttccatcagacagagaacatataagttctacaacctcggtttatccttagaagcagaaatgttcaatatgtcaaaggtacaactccgtgtcctttgctttgaaattcaacatcacttgcacaacatgtcttctgcatcttcaggtactccttattaacatttcaagactatctatatagtattttattttattagaaatgccacgaaaccaccatttattatgcaaatgcaggctatagtgagattcggcttccacaataacccacgaccttgaaagctgttattaagatctattagagttggacacaatctttggaacatgattcagttatgttgtgtgtttgactccacatttgggacacgcgggaattaggttgggtaagcaattgccatttcttccaataatctgatggtcaggtattcaggttagtgaatggttccagacatattagttgcatatatataatgagtaaattggaagttatcacttttaatcatcttaatcctttgtgtcattctcacctttacaaaaggacatataccttctcattcttctcccttttctcaaactgttataaacttataatagtttcctttgttttctctagcccttatagtttgttgctgttctaactctaaaaatgaaaactaaaacaaggggaatttatatctttgggaatactacctagctttttatcatacaaatgttgtgtaatacctttaccagggtattataactgttaatactttgaactgagctactaatgacattgcaggtactaattgattcttccctgtaatggagagttttattttccttgatttaccaaaatcaagcttacattaaggtgtaacaaatgggtgttttgggctccataatcattttgttgatgctaaatgctgactactggtgcagcaaatggaagagctcttccagttgatatatgccatttgaggacatgtgctttgtcctcagtataagaacattggcctaacatcattgttggagttgcattgcccttagagtggggaaagcgacacctcttgcaagatagtaacagcaattatatcataaattacaagtcaggccttccaatgtggttttggatgaggcaattgatacattgtcatttgatgctgaattttttgttcgtctgacgactggaaagggggcacctacgacgattagcttagtacttagtgatggtgtatgaagagcattgatagtctcatggcccattgctaacatgtagagaaggattttgagttccttggaagtattgactggaggagtgtgaactacttcgcaaatagatgggtgtaaaatctgggaaagaaaacttaaagagctaaatgttttctaccatattagttgatctgaaggtgctttccaagtcaaaatcagcttagcatatagaattgacttggtgatggcggtacctggacccttgaagcagcagttcagaactgattgcactgagtattttctctggagatatccatttgatggaggtggaaggaaagagaggctagtcaatagtaggtcaactgatggtgtttgaaacaagatgcacttactcataagcagaataaacaagcacaacaatgccatgaagggaaccttagcaatgccgtacatctggcatcatttaaaacggggcttgttccactgttatactatgaccatccgccttgatggttttgcctggctattctgaagctattagttagcgttacaccttttaagttttacacatccagtgttgttcttttgtttttctaatattatgtacagatatctctcccacatgtcatagctcaatatgacaagggctttatccttttccatgtaaatatttgagattcagtcagattcttatacttgctacttgctagaatgtgaatgataactgtactgttggaagagtgttgtcatacatacaaattagttataaatttgtttctacttttgctacttgtattgtcattgttacataagattgcaatgcatttgatgttccttgatgttctgatgttgtcttgttatcggccatactataattggggaaaaaaagaaatataaagctattttagtatccacaaacacatttttatgttttttgtgaaacatggtattcatatgctgttgtaacatgtatgccaatattatgttggtttgtcctttggagaaaagatgaatgtagtcttgatatttggacctattttgtctcaaatcatgcctgaagatgtaaatataaccatattaataggtgaatagtgttgaaatgttgtatgtttttgagcttgaagtcaaaacatattaaaacaaccagaatgcttcttagaatctacacatgcagcacaaccaatgttttgagctatcacttttactgagactgctgcaatctatcaactctgccttttcttgattatatcttttcccccatgaaatataaccaacatcatgtatgaaaaggtgcaaataattttatgtgtacaacacaaacatggatttgggcacaatatatttttggtactgtttagactttaagttgtcatggggaaatgtaatcggtgtcatagttatcctgcaaagtagtcatgaaattttggtggatttcgaattgttcaacagctgcacctttatcaaagccatgtctttatgcattggttcttaaattaagtgtcgaactgttgcttcctgcaacagattggtatgcaattccatttctggtttatatctggaactgctattctgcggccaaaacagcctttgttttggcttattttttgtctgaatacaatgctcagatttccttcgaagtgttcctggatatgtatgacaggaactttcatatgtgtagaatgctttgtgttaaattaagtaagacactggacatgatgaatcatttggcccatggcatctcagatctgtgtgactcaggtctcaaatataacgcttctaaggttgaaatgctttgttcctgaagtttatgaatttgtgattatgcatatattatcttgcccttctttttctagtttaaaacttcatgtttacagtccatttgcagctgcaatagatttgctggaaaactaatagagcaacttgttttcccagattaagccaagtttgatcagattgttcacgtgttatggctggacatcagtataataattcccagatgtcccggatggatcatatggacaggctaaacaatgaacctccaccttttggtacatggactaaactgaattacttcctaagtgttcataatcctctcattatctcaagtatggtaaatttacttcactcgtgccttattatgccaggccaaaagttatttatgcatcctaggagtgatccagctaacggagctggatcgtctggctatgtgggtaacacaatgagatcgaatgatcttccgtcttcaagttatgctggccaagcttatggtcagcagaatagagcccccatccatgcttcatattctggtcatgcacctgctggaag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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0163400, RefSeq:Os05g0163400