Os05g0188500
| Gene Name |
Os05g0188500 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001061376.1 GI:115462482 GeneID:4338016 |
| Length |
8577 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0188500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:5406489..5415065 |
| Sequence Coding Region |
5406533..5406565,5406654..5406825,5408078..5408190,5408266..5408358,5408523..5408686 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:5406489..5415065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:5406489..5415065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgagaccctagcctccctgcgccgcccgaagcgcgggcggccgccgcggccgcgggaggaccacttggccgccgaggacttcgaggaggagggggaggatgaggaggccgaggcggaggcgctcgcgcggccccagacgaagcgcaagcgcgcggccagcgccgcggccgcggccgcgctggaggaccaaaccctcatcgatattattaaacataatggcaggcttatcagccatgctgtcaaaaaattggtcgaggattatgaatcagatccaaaatctgtgatgtttcagatattagcgatgctatttgaggcttgtggagctaggcataacttttatgcagactacctgtatgaggcagatgtggatggtgttgtgttttcccttgtcgagctagcaaaaaagggaatggttgaagataattacaacaccaaacagaaggatctcaagaacttcaaagaaaatcttgtttccttttgggataccttggtccatgagtgtcagaatggccctttatttgatggtagcttattccaaaaaatcaaagactatgtggttgctttgtcatgtactcctccaagggtttatcgccaagtagcttcattggttgggctccagcttgtgacgtccttaatatctgttgctaagactctcagtggacagcgtgagaccactcaaagacagttgaatgcagagaagaagaagcagactgatggaccgattgttgaatctctaaacaaaaagctagctcatactcacaaaagcattacttacttggaggaactaatgcggaaaatattcagtgggttattcatgcaccgctatcgtgatgttgaccctgagatccggatgtcgtgcataaaatcacttggtatttgggttgtctcgtacccatcacttttcttacaagatatatacctgaagtatctaggatggacacttaatgacaagaatgctggggttagaagaacttctattcttgccttgcaaagcctgtatgaagtggatgaaaacataccttctcttggtctctttactgagagattttacagcaggatgatccagcttgcagatgatgttgatatttcagtagctgtgtcagctatcggactcatcaagcagttactgaggcatcaacttttgagcgatgatgatttaggtccactatatgatttgcttattgatgagcctccgctgatcaggcgtgcaattggggaattggtttatgatcatctgatagcacaaaacatcaaaacctcccagtctggagcaagagatggaaacaatgattcatcagaggttcatattggtcgaatgctgcaaatcctgagggaattttcagatgacccagtcctgagctcttatgtcattgatgatatttgggatgacatgaaggctatgaaagattggaagtgtataatctccatgcttctggatgaaaatccattaaccgagcttactgacatggatggaaccaatctagttcggatgctgcgagcctctgcaaagaaggctgttggggaaaggatagttcctgcaacagacaatagaaagatgtactacaataaaggccagaaggaaatattggaaaacagcaagcatgaaataactactgctttgctgaagaaatatccacagcttttaagaaaatacatatctgacaaagctaagatatcacctctaattgatatgatgatgcttatgaaacttgagctgtactcactaaaaaggcaagatcagcatttcaaggctgccatagatctcattgcggatgccttctttaaacatggtgacaaggagaccttgaggtcttgcatcaaggcaattactttctgttgcactaactgtcaggcagatcttcaaaattatgctgaaaacaaactgaaggatcttgaagacgagttggttttgaaagtcaaaactgcaatcaaggaagtagaggcaggtgatgatgaatactccctcatggttaatttgaagcgattttatgagcttcagttgtcaaaacctgtcaaaaatgatggtttatttgaggacatgtacagaatcctgagtcatctaaaagatatggataatgaggtgaagagctttctcctccttaacatgtaccttcaattagcatggtgcctgaatgctattgatggtgaaaacccatctgaagcttccattgacgaacttttatccaggcaaagctctctttttgaaaaactctattattacttggtggttctgcctacttatcagaaagagggaaggagcaccactatactttcctgcagagtctgtgtcattactgctgagatgtggtgcctgtttaagaagccaaaatattcttcaacaaggctcgagagtttgggatatctcccgcaactagatgttgtccagaatttctggaaactatgtgaacaacagctcaacataccagatgaaatagaagatgaagatgcaaatgaagaatatattgaagacacaaacaaggatgttgtcatgattgcagctgcaaagctagtgctagctgatacagtttcaaaggattacctgggcccagagcttgtttctcactatgcatcccatggaacaagtactacagagataatcaaacatctaatcacctcgcttcggaaaaatgctgacaacaacatgggtgccttatttttcgaggcactgaaaaggggatatgagcggtatatggcccatgtaagtgatggggaaaatcaaaccctcattggcaagtcttattcagaatgccaagatcttgctggtcggctcgcggggtcctatgttggtgcctcgcgcaataaaaacaagtctgagatcttgaagataatccaagacggtgtttcttttgcatttgtggaccttccaaagcaattgtctttcctcgaggctgctctactgccatttgtttctaaacttccatcgtcagatataccagacatcctgatagatgtacagaagaggactcaagatactaatactaatgaagatccaagtgcttggcgcccgtactttacgtttgtagagcatctacgcgataagcatgcaaagaatgaggttttgcaggaggaaaaggaggaaaaacctgtaaagcgcaggggtcggccaaggaaggttagagatgtacctgcaaggaatctttttgatggacacaagtctagcgatgaagagtctgttagtgactctgatcagcaagggcatggtgaagacaatgacgacgatgacgcagatcagcctctgatcaacacgtttaggtcttccgcatccaagctaagatcactgaaggtttctcagcaaggaacaagcggtcagaaaggaccttcgagggcatcaggaagcaatagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDETLASLRRPKRGRPPRPREDHLAAEDFEEEGEDEEAEAEALA RPQTKRKRAASAAAAAALEDQTLIDIIKHNGRLISHAVKKLVEDYESDPKSVMFQILA MLFEACGARHNFYADYLYEADVDGVVFSLVELAKKGMVEDNYNTKQKDLKNFKENLVS FWDTLVHECQNGPLFDGSLFQKIKDYVVALSCTPPRVYRQVASLVGLQLVTSLISVAK TLSGQRETTQRQLNAEKKKQTDGPIVESLNKKLAHTHKSITYLEELMRKIFSGLFMHR YRDVDPEIRMSCIKSLGIWVVSYPSLFLQDIYLKYLGWTLNDKNAGVRRTSILALQSL YEVDENIPSLGLFTERFYSRMIQLADDVDISVAVSAIGLIKQLLRHQLLSDDDLGPLY DLLIDEPPLIRRAIGELVYDHLIAQNIKTSQSGARDGNNDSSEVHIGRMLQILREFSD DPVLSSYVIDDIWDDMKAMKDWKCIISMLLDENPLTELTDMDGTNLVRMLRASAKKAV GERIVPATDNRKMYYNKGQKEILENSKHEITTALLKKYPQLLRKYISDKAKISPLIDM MMLMKLELYSLKRQDQHFKAAIDLIADAFFKHGDKETLRSCIKAITFCCTNCQADLQN YAENKLKDLEDELVLKVKTAIKEVEAGDDEYSLMVNLKRFYELQLSKPVKNDGLFEDM YRILSHLKDMDNEVKSFLLLNMYLQLAWCLNAIDGENPSEASIDELLSRQSSLFEKLY YYLVVLPTYQKEGRSTTILSCRVCVITAEMWCLFKKPKYSSTRLESLGYLPQLDVVQN FWKLCEQQLNIPDEIEDEDANEEYIEDTNKDVVMIAAAKLVLADTVSKDYLGPELVSH YASHGTSTTEIIKHLITSLRKNADNNMGALFFEALKRGYERYMAHVSDGENQTLIGKS YSECQDLAGRLAGSYVGASRNKNKSEILKIIQDGVSFAFVDLPKQLSFLEAALLPFVS KLPSSDIPDILIDVQKRTQDTNTNEDPSAWRPYFTFVEHLRDKHAKNEVLQEEKEEKP VKRRGRPRKVRDVPARNLFDGHKSSDEESVSDSDQQGHGEDNDDDDADQPLINTFRSS ASKLRSLKVSQQGTSGQKGPSRASGSNS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>45..77#166..337#1590..1702#1778..1870#2035..2198#2282..2518#2693..2837#2936..3114#3951..4096#4193..4320#4395..4568#5173..5334#5414..5614#5687..5824#5928..6128#6258..6402#6529..6635#6784..6924#7228..7493#7575..7699#7797..8063#8204..8217#agggtttccccctcctccgctctcacactgcctcgcctccccggatggacgagaccctagcctccctgcgccgcccggtaaccctagcccctccgccgagctctcacccccctcgaccgctggattcgccatttttttctgattttttttttggatgaattgcagaagcgcgggcggccgccgcggccgcgggaggaccacttggccgccgaggacttcgaggaggagggggaggatgaggaggccgaggcggaggcgctcgcgcggccccagacgaagcgcaagcgcgcggccagcgccgcggccgcggccgcgctggaggaccaaaccctcatcggttcgccttctacccgttcttcccattctcctttgcgcgttggtcgccgtggtctcgctggagtgtgggggttggttgtgcttggggatgcactgcttagtgtgtagctgctgagttgacgagagtgagagctagttcgcagtgacgcgggataaattagtctatgtggctctctgggtggtgaattggtgattcctaaggttgaactgaggttgggctagtttagttcatcaagcagtgtgattttctgcttttgtagttggtctagagaattttgttaggattgtttcttttttcaatcaggaaattctaggttagctgaacaaaagaccattgatttcgattggactgttagttaccttggtactccctctgtcccagtttagagggcgcgcgtaaatttttttgacggtttaccagtttagagggcgtggttcgtttttcactgcttttcttcctggagtaccctccgcatgcatgcacatgacgcttggatatgcccgctcaataactgatcaagcgacgcaaccggccggcgcgtggagctgcacatgtgtgggaccacaaggttacatgcatgcagctgttactaatctgcatgtgtttggatcaaacccattttattaggggcagtttaggaaaaaataactctgcatgtgagctggtctcggtgaatttatttgtgcgccctctaaattgggacggagggagtactatcacctgttactggttcagtaccctatcaattcattggtagtgccaaaacctagccaaattttggctctaccaattatttggtagggtagagttcagattatatatgtttgattagctaccaatttgtttgatatagtgaagaaagttctagagtgttgccaaattaaatatgggcattaccgctttggctctaatccaaacaaatcacactactatttaagctgccaaatatttggtaaggcacattttggcatcaatccaaaatgacccatagtatcacaagccgatcttgaaactgcatggagagtcatgatttataaagatatgtgctgacctcagctggggttgccctaaccatagtcctgccagtactgtagtgcctgcccagaatgatgccagaggcttgtagattatgcatcgagatttaaaagatcctatcataacatgctgctcaaaatctatgacttagacacttactcggcaagttattttatcttcaatttgtgtcttattcctaaaaacttggaacttgcagatattattaaacataatggcaggcttatcagccatgctgtcaaaaaattggtcgaggattatgaatcagatccaaaatctgtgatgtttcagatattagcgatgctatttgaggtaatagatgttaacttcttaatgcagtttcttttggttgcttatttcataaaccagtgaatcttataatgacaggcttgtggagctaggcataacttttatgcagactacctgtatgaggcagatgtggatggtgttgtgttttcccttgtcgagctagcaaaaaaggtatcctgctgcgattttccctagaagagtgaatggagaataattttttgcagccttgtgattatccaatgtgcatgctatgtttatcctacatgttactaatcttgaaatgatatgcaatgctctcttttggatgatttcttttaaccttaacttgaaaatagggaatggttgaagataattacaacaccaaacagaaggatctcaagaacttcaaagaaaatcttgtttccttttgggataccttggtccatgagtgtcagaatggccctttatttgatggtagcttattccaaaaaatcaaagactatgtggttgctttgtcatggtaatttatctaagctataccttttattttctttgtgttagacacttggatgcatgtatctaatgtgctgtggtgtatttcagtactcctccaagggtttatcgccaagtagcttcattggttgggctccagcttgtgacgtccttaatatctgttgctaagactctcagtggacagcgtgagaccactcaaagacagttgaatgcagagaagaagaagcagactgatggaccgattgttgaatctctaaacaaaaagctagctcatactcacaaaagcattacttacttggaggaactaatgcggaaaatattcagtgggtgaggacctgaacttgcattttaatgtacactgtttactttcatatttctcaaatttgccattctgatgtggttcacttactggtatctggacaaaaatatttgcatgtggctgttttctgtacatatctcagtctactatgtccacttaatatattattttaccacttgcaggttattcatgcaccgctatcgtgatgttgaccctgagatccggatgtcgtgcataaaatcacttggtatttgggttgtctcgtacccatcacttttcttacaagatatatacctgaagtatctaggatggacacttaatgacaaggtacatattttagttctatgatttttggttgaaccttgtctgaccaatgagatgtgcaagttttgttatgtcattttgtgcaatctttgtttttgtagaatgctggggttagaagaacttctattcttgccttgcaaagcctgtatgaagtggatgaaaacataccttctcttggtctctttactgagagattttacagcaggatgatccagcttgcagatgatgttgatatttcagtagctgtgtcagctatcggactcatcaagcagttactgaggtgagttttgggcaaaatcttttgcctgtgaagagatcatttggtcactgctgggcaaccttacttttttttaccagagctttcctaagatatggtagtgagtttggggtgtataactttcgattgtacagtttgctattagggtttttgtagattggccatgccgctatgttttgagaactaaattttcaagcaataaattgtattttttagcattttccagcataatggaatcatggattttagccaggaaccggtgaattagcttcctttcatcaaataccatagagaaataggggatagttcatcactagtgttatcattagctttaggatgcaatagcgcagttcaataaatattctcagtattcacaattcaaaaatatttttgacctgcaccattgtagaaatacattcaacatgcatttacacaagcttttgatttggaaccaccataaatactcgcttgttgaatgaaaattggtccaaagaaatttgcagaaacacaggcttaaatgtgcactcttaattcacaataaaatacataagagttgcatattcaaaacaatgtgctatggacgaatggatcagtacgagtggtatatggtatttgacttggcattaatctactcatgtggtaattgattgacttgttgggcaccatgtgtgccttgtctatcctgaactttacctagcaatcacccttgttattatttactaatatcagtatttgtcttaccaaagtgtgctaggggaccatgcatttttttcagctttaattttttacatgcattactgcagcaaaacaaataacttttctgtttattccttttgcaggcatcaacttttgagcgatgatgatttaggtccactatatgatttgcttattgatgagcctccgctgatcaggcgtgcaattggggaattggtttatgatcatctgatagcacaaaacatcaaaacctcccagtctggagcaagaggtacttgtctctggaatgtttctgcttttatgccaccttatcttgctatcaaataactttcttagttcatctactgattgtactatctaattccagatggaaacaatgattcatcagaggttcatattggtcgaatgctgcaaatcctgagggaattttcagatgacccagtcctgagctcttatgtcattgatgatatttgggatgacatgaaggctatgaaagtatactcagttttgtttcaacttatattatcagtatgacttaaccgctataactgcaatgtcctattctgtaggattggaagtgtataatctccatgcttctggatgaaaatccattaaccgagcttactgacatggatggaaccaatctagttcggatgctgcgagcctctgcaaagaaggctgttggggaaaggatagttcctgcaacagacaatagaaagatgtactacaataaaggccagaaggtgtcaatgtcatttctgtcgtatcatatgttgctgctgcaagttgattgtttatttcttgatcgtatcatttgttgtattgcttgtttagtgttgctgccttagtggttatttaggacttgtaagtactatgcgtagaatgtaggtttattttgttggatattggcaatgtcctacacctttgaaagttagtctgacaagttaatctcttaaaagacctgtttgctagatacatccatttttaaatattacactgttagactttatttggtcaaacttttgaaacattgaccatcaatatctctcaaaatattttgtttgggaacataaaaatcatattggtagtttttttctttaattgtacttttacaatattaatttttttagatattattgttatattctaatagaaaatagtggtcaaagttgcacacccaagaccaaagaaaatcaacagtgtcatctatttaaatacggaggtagtaattgctagtcatgtagattgtagttctgaatctgttgcctgcttgttgaatctggtttgtttgtcgtaccattgttcatgtatttgttgaattgttactgaagcattattattctgcaggaaatattggaaaacagcaagcatgaaataactactgctttgctgaagaaatatccacagcttttaagaaaatacatatctgacaaagctaagatatcacctctaattgatatgatgatgcttatgaaacttgagctgtactcactaaaaaggcaagatcaggtcagttgaatagctatttattcttctgcacaaactttctgcttgacttgttgacagtttcgtgtacattttggttcagcatttcaaggctgccatagatctcattgcggatgccttctttaaacatggtgacaaggagaccttgaggtcttgcatcaaggcaattactttctgttgcactaactgtcaggcagatcttcaaaattatgctgaaaacaaactgaaggatcttgaagacgagttggttttgaaagtcaaaactgcaatcaaggaagtagaggtatgcatgtcttattcacagtctctttgttttaaagccatgaaggtaaatatgttacaatctacattgcaggcaggtgatgatgaatactccctcatggttaatttgaagcgattttatgagcttcagttgtcaaaacctgtcaaaaatgatggtttatttgaggacatgtacagaatcctgagtcatctaaaagatatggataatgaggtatgaactattaccttgattagctattactactccagtctccctttgcagagttcactgtcggtactgtattagctaatatgttcatgttttaaataattaggtgaagagctttctcctccttaacatgtaccttcaattagcatggtgcctgaatgctattgatggtgaaaacccatctgaagcttccattgacgaacttttatccaggcaaagctctctttttgaaaaactctattattacttggtggttctgcctacttatcagaaagagggaaggagcaccactatactttcctgcagagtaagtcttctgagttaaacattgaagaaaagaacacatttttttgtattatgttgtatgctgatctgcaggctgtatgtcttggctatgtttagcccactgacttgatattgccttgtttttttgtaggtctgtgtcattactgctgagatgtggtgcctgtttaagaagccaaaatattcttcaacaaggctcgagagtttgggatatctcccgcaactagatgttgtccagaatttctggaaactatgtgaacaacagctcaacataccaggttttgatgttacacagattctatacttcattcgttgtatagcttataaaaataaatttctaaataaaacctcatcatcatgttggtgctactcttttaattgaagttgatcatgttcatcaacagatgaaatagaagatgaagatgcaaatgaagaatatattgaagacacaaacaaggatgttgtcatgattgcagctgcaaagctagtgctagctgatacagtttcaaaggtctctgctacgttttctaactgtaatgaactgttaggtcctcaagcaatgttttcctactacatcttctgttgtaccataatttggtcaccttggcagcttcctattgtcagacaaactaagttttcaattttatttctgtgtgcaggattacctgggcccagagcttgtttctcactatgcatcccatggaacaagtactacagagataatcaaacatctaatcacctcgcttcggaaaaatgctgacaacaacatgggtgccttatttttcgaggcactgaaaagggtaggtattttgtcccaccttcaaatgcacacaattattatttattatagtaactattgagtaattatattatgttactgattgtcgattaggaatttacttgttccagcttttacaatgtttaacaaactttaaaggaacttctgactttgtcaaccatatcttgtattttggaagtattttgactaaagacacttatactaaactcacttttgtattagaaacttttgctttatctgcttttaactgattttatgtgtgtgactttcttttgtaaacttttctttattttcatctaactagggatatgagcggtatatggcccatgtaagtgatggggaaaatcaaaccctcattggcaagtcttattcagaatgccaagatcttgctggtcggctcgcggggtcctatgttggtgcctcgcgcaataaaaacaagtctgagatcttgaagataatccaagacggtgtttcttttgcatttgtggaccttccaaagcaattgtctttcctcgaggctgctctactgccatttgtttctaaacttccatcgtcagatataccagacatgtatggcatttactcttgtcatttatgatgcttccatttattttatttatgcacaattttcatttatttcattgtatgtagcctgatagatgtacagaagaggactcaagatactaatactaatgaagatccaagtgcttggcgcccgtactttacgtttgtagagcatctacgcgataagcatgcaaagaatgaggttttgcagggtatgttgaactcttcctgaattttcccttttttatgttacataactgcaaatctttcttattgaaagtatggccgattctattgtttcctatccagaggaaaaggaggaaaaacctgtaaagcgcaggggtcggccaaggaaggttagagatgtacctgcaaggaatctttttgatggacacaagtctagcgatgaagagtctgttagtgactctgatcagcaagggcatggtgaagacaatgacgacgatgacgcagatcagcctctgatcaacacgtttaggtcttccgcatccaagctaagatcactgaaggtttctcagcaaggaacaagcggtcagaaaggaccttcgagggcatcaggtaaatggtcaaggattttgctctttccacatcagtcggatgcactgacgaatctacagcagcaaccatggtttctttctctgtttccattctatttttgtgtggtgttcccattttctaattacagtgtgtattttcaggaagcaatagctgagggcacgcactgacgtcgttacgcatgactgaacttggcacaaatgaatgcagcagatttgtggcgttgtagatgatttgtacctaggtgctcacccttttggtaaacaacgtgacatagacatttgttaggtttttaccccttcgccatgtatattatgttcagtaataatatatgtagaaaatcgcatgttgcattgtaccaatttgatcgatgtatttctcctgggttccgagactaaagaacacttgcatgcgagagatagggagagcagcaaccattttttatttattcaatggagaatccgaaccttggattggtttgcatgggaaccaatgagcccggcaatccttgcatacc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |